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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s47 | supercontig | LSalAtl2s47:304551..317770 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008071 >EMLSAP00000008071 ID=EMLSAP00000008071|Name=EMLSAP00000008071|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=508bp
MSRIIVMKIGQFGELWKIFDKVSPNGVSIEDNNSENNNNLSKNLLLDSTD LSLHKSSPGGSSGGGKLLXQLLDTDPESSSERVHKGNKIGIALKNKILSS SVGEDVLNSPPSPLDSLKGKNVCSPSTSVSTSFNRNDTSNNNXTITSSSE EQDSIYLLNIIKDEAAPSYEDNEILYSLSNSSTMTLLQNNEMEIADSCEV NANSPTTSMKDSDVHSSRDPLNXQLNVTTTTNIASYAPPGSPDHHLCSST SETNLFSRDIIKEEEGQRRTCLVCGDIASGFHYGVSSCEACKAFFKRTIQ GNIEYTXPASNECEINKRRRKACQACRFQKCLRMGMLKEGVRLDRVRGGR QKYRRMIESSPYIQPPPKKTLEDNKLLQVLRHCEPEAFLVNMDMTLPNYK IRTISTLSDFYNRELIGTIEWAKQIPGFSNLTINDQMKLLQSSWSEILVL SLVYRSLPYNGKISLTNNFSLDESQARLCGLSEFFFQVWKPKYQCTKYTP STAKYQAG back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s47:304551..317770+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008071-703918 ID=EMLSAT00000008071-703918|Name=EMLSAT00000008071|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13220bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s47:304551..317770+ (Lepeophtheirus salmonis) TTTAAGTATATAAAAAGTAAATACCATATAATTTTCCTGTCTTAGTTAAG
TGTTGAAAGCGGATCGAGTCGAGGACTGAGCTCCAGTACTAGAAAGACAG
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ATATCTAGTTTGCAAATCGTTACAAAATAGGAAACCTGGTTTAAGAGGTC
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ATAAGTTTGGCTCTATCTCATTTTTGCCATATACAACCATTTTTACGTTC
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CAGTAGAAATTTTTGTATTGTAGTAATATGAATGTTCTCGCAACTACATG
GCAACTAATTTAGTAAATTCGGAGCTTGTGAATATAAATTTATAGTACTA
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GGAGTATGATTCTTATAATTTGGTCAATTATTGTAAAGATTTCTAATCAT
ATTCTTATATTATATTATGTAGGTCTGGAAACCCAAGTATCAATGTACAA
AATACACTCCTTCTACTGCCAAGTATCAGGCAGGCTGACATATTGATACA
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TATGCTTTGTATGCACATATTAAGCGCTTTTAAGCTTTATTTCAGGATAG
AAAATTTTATTTATGTTATTATGAGAGAATTTTATTACATATAGTGAAAG
AAAAATTGAAGATGATAAAATTATATTTGAACTTTTCAAATAGTTGATAT
TAATTGATATATTTCAATATATTGTATTGTAATATATCATTTTTATGTTT
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ATCCTACGATCAACATAAAACATCAATTCATTCATAATATATTTTTTAGT
CCATTTGAAGTTGATTCTATAGCTAGATCAGCGTAATGGTCAGCCCACTA
ATATCTTTTTAATAGATCTGCGAAAATGGTTCAATTGATCATGGAACTAA
AATTAATTCATTTGAGGAAGTTATTCCTCAAGATGCGAATAAGTATATAC
TTAGCTCCGATCGATATATA back to top
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