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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s492 | supercontig | LSalAtl2s492:23239..38755 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008182 >EMLSAP00000008182 ID=EMLSAP00000008182|Name=EMLSAP00000008182|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=516bp
MNSNKSDRFHLSFLKDRNNSNNLNNTNKSTAANHKSAERKSIGNPTSFDD EESDDMDEESASKTPFYITVETLEGALEQVPVEVDASNFSANKPILTYLA DVGEISPPKKEKNEVSTPLSLASNEDLEKELEKRAREVRSDSIVTPNLIA SLKSNKRRLVSKNGQCNIELKRVPKKNMKLIKDIFTTAVDMRWRYTLFFF ATSFFVSWLLFALIWWAIAFGHGDLEWKNLPGGPMQANGSFIPCVWAIQD FTSCFLFSIETQHTIGYGSRSTSEECPIAIIVMCLQSIIGVVISACMAGI VFAKLARPKLRSNTILYSKNAVITMRNDELYLLFRVGNMRKSHLIEAHLR AQLVYDRSFTDEGENMHYKHEELSICTQADWNSEDRTLIIWPIIIAHKID EESPFFSMSPKDILSSRFEIIVSLEGVVEPTGNSVQALSSYLPNEILWGY HFDNMMSYSRKRGVYIVDCAHLNALIQDDTPRISAKELKEINSSKSTPST IKFSECNADNVSNAHV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s492:23239..38755+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008182-704029 ID=EMLSAT00000008182-704029|Name=EMLSAT00000008182|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15517bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s492:23239..38755+ (Lepeophtheirus salmonis) GAGCTAAAGTCTGAAGAAGAAGAAGACAACAAAGTATGAACTCTAATAAA
TCCGATCGTTTTCACCTATCCTTTTTAAAAGATAGAAATAACAGTAATAA
CCTCAACAATACAAATAAATCAACAGCTGCAAATCACAAATCTGCGGAGA
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ATGGATGAGGAGTCTGCATCGAAAACTCCATTTTATATTACTGTAGAAAC
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GGTGCACTTCTCCTCCTTCTTCTTCCTATCAACAACGTCCATCGGGTCCG
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ATATATACTAGTGCGTACTGCACCGAAGGTAAAAACGTTCAACCCTGGAT
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TTCCTGTTATATACTTTATTCACTTACAGTTTTTAAAGTTTTTTCAATTT
TAAAAACGATAGTTCCACTAAGTTCAAAAATTATAGTTATAATAATCCAA
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GGGGGGATTTGTAGCTCCACCCCTCCCTTAAGGAATTTTTGCTTTTTTAC
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GTGTTAACATTTGTGTATTTTTGAAAAAAATTTCTAAAAAAATTCAATAT
TTGAAATTTAATTTTTGACATTTTTGTATCATTTTTGGTTTTGTTTTTTT
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CATTGTGGAGCTAGTTAACTCCACATCGTAGGAGATACGTAACTAGTAAC
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TTAATACTGTATTTTTTATTCGACWTGTCCTCCTTCACAGCCAATAATAA
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TCCATGGCATACCCCACTGTCATGATGGCAGAAAAAAGCAAATCCAAAAT
TAACGTTATAGTTGGATATACCGAGTGGTGCATTAAAATCTAAACACTTT
GAATTTTAAACTTTAACAAGATATAATTTGTTAATTAACAATAGAATTTC
AACAAAATTAATACTATAAATAGATGTGTGTCTGAGCTCTCTTAATGTAG
CCGCCCTTAGCTTGATGGTGTCCCAATGCTCTATGACATTGGCTTTGATG
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CCAAAAAGGTGTAGTCGAGGAGGCTGACATCAGGGATGTAGGCGGGCCAA
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TTCTTCACCCGGACAATATTCTTTCCATCCACTTTTTTTACAGCTCTCTG
GACAGTTTAGGTTGAAACCTCGAGATATCTTGCATGGATCCTCATGGACT
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GACATTTTCAGATGTCAATCTKCCTACCGGTACAAGACATCCGAAACTGC
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GGTTGCATAACGACACATTCTAATTTAAAATAACGATGATAAAAACGTAA
TGAAATGTTACTCCAAGTTTTAGGTACACACGCAATTTATATTTAAAAAA
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TTGGTTTTAAAAAGATATATACTCACTCGAATGTTACTTTCAATCATTAC
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TGAAATTTTTTTGTCAATAAACTTCTTTCTATTTTATTTGAATCACGTGA
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TGTGTTTCTGTTTTTTTTTTTACCTTGGAAAACATAAAAACAACTTTTAT
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ATATATAGCTATCAATAAGCCTTGATAACTTAATAACTTGATAAAAAATC
AAAAATCAAGCAGCAAGAATAAAAAAGTTTTCAAATATATTTTTTTTAAA
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GTCAATTTTTAGTTATTTTTTACTGACAAAATATTTTCTTCTTTACTTAA
ATATTAGGTTGGGGAAAAAGTAATTTCGTATTTTCGGCTTTATTTCAATG
CTTTATAATATATGTTACACTAATCTTATTTAAGCCAAATATCCCTCGTT
CTGCTCGATAACTTGTTGCCAAGGAGAGTCCAACTTCATAGTGCCCTTCT
CGTAGAAGTCCTTGTCCCTATTGAGAAAAAAAACTACGACCACAAAATTG
TCACAGGTCTTTATTGAGGCCAAATTTATTGCCTCAAGCGTGTTGGTCAT
ATATAAGAACAGGTGGTAGTCAGTTGGTGCTATGCCTAGACTCTAGGGTG
GATACATAAGAACTTACTATCCGAGCTTCCAGAGCTTCTTGTACATCATC
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ATTTGAGTTTCTTTTTGTATTCAGCCAAATGTTTCAAAACGGTTTTATGA
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TTTGATATTACCCATGATTTTAAAAAACATTTTCGACGAAAGACCTGCTA
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ATATAAAATATCGCGAATTTCTTCCTTTGAAAACTTATTTACTCGACGCA
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TGACAAATAATGAACAAGATATATTTTGTCAAAAAAAAAAAGAGTTCTAA
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GGAAAAATTTAATTACAAACTATATTTTATGTTTTTTTTTACTTTATGTA
GATCTTTTAAGGTTAAAAATAACACTGTTTGGAAAAATATTTTAAATAAA
ACACTTTGTAGGCTATAAAAGAGACAATTCGTGCTTAAAGATAATTTTAA
TCTTTCCCGGTGTAAACGCAATCCGGAACACACCATCCCAATCAAAGGCC
TAAAAGAAGTCGAAAATTTGTTGACTTGTGTTATCCATTTGTTTTGTTGA
CTATTTGAGTTCTGCATAGAGAATTTACTTGGGGTATATTTCAAATCAAT
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TGCAAGTTTTTGAAAGACTTTGTAGACTTGTAGCCCTACCATTTTGTAAT
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TTCAAAAATATTGATGACTCTGCTGTGTCGTGCATTCATTTGAGCCAGGT
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ATATATATTAAAAGATGTCATTATTAGATAAAAAAAGGGAAAAATAGCCC
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TGGGAGCTGATACGAAATCTGACAAGTGCCTCAGTTGTCCATGATAGACT
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GCAGTAATTCATTTTCTCGCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAACCCAACCAT
ATTACAGGCAGCTGATATTAACAATGGTTTTAATTCAGTTATACCATATG
TCACACTCCCACTTTCTCCTTGCGTTCTTACACAAATCCCATCTCTACTA
TTATTAGTACGTCATTCATTTTGTAATGTCTTTTTATGAAAATACCACTA
AAATTAACCTTGCTGAAAAGAAGCTCGCCCAAATGAATGTTGCTAAGATG
ATACTCCTTGAAAATATTCTCGCTCAAATGAGCAGACACGCTCTAATATA
CCTGCCTACATGCTAAACTATCGGTTTGTGTCGTTATTAATCATTATTAC
GTATACCGATAACTCTATTCATTCTTGCATTACTCACATCTTTTGATTAC
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CATACAATCCTAATTCTAATTATACAATCATTATAGGTACGGATCTAGGA
GCACAAGTGAAGAATGTCCAATAGCCATCATTGTCATGTGTCTACAATCC
ATAATAGGCGTCGTGATCAGTGCATGTATGGCAGGGATTGTTTTCGCCAA
ATTAGCCCGTCCTAAACTTAGATCAAACACTATTCTTTACTCTAAAAATG
CCGTCATTACTATGAGGAATGATGAGTTGTATCTCCTGTTTAGAGTTGGT
AACATGCGGAAGTCACATTTGATAGAGGCCCATTTAAGGGCACAATTGGT
GTATGATCGATCGTTCACAGATGAGGGGGAGAACATGCATTATAAGCATG
AGGAGCTGAGTATATGTACACAGGCGGATTGGAATTCAGAGGATAGAACC
CTTATTATTTGGCCAATTATCATTGCCCACAAAATTGATGAGGAGAGCCC
CTTTTTCTCCATGTCACCAAAGGACATTCTATCTTCCAGGTATCATAAAA
ATACATTTGTTTATTTAATACAAGTTTAATTATTATTATTATTTTAAAGA
TTTGAAATCATCGTAAGTTTGGAAGGAGTTGTTGAACCAACTGGGAACTC
AGTTCAAGCATTATCTTCCTACCTCCCTAACGAAATCCTATGGGGATATC
ATTTTGATAACATGATGAGCTATTCACGCAAAAGAGGAGTTTATATTGTT
GATTGCGCTCATTTGAATGCACTAATTCAAGATGATACTCCACGCATCTC
TGCTAAAGAACTGAAGGAAATCAATTCATCAAAGTCCACACCATCTACAA
TTAAATTCTCCGAGTGTAATGCCGACAATGTCAGTAATGCTCATGTATAG
GAAATGTATAGCTAATTCTGAACATTGACATTTGTTTAAAAGCTAATCAT
AATTATATAATAACTTCCATAATCATATTGACTGAGAAGAAATATTATTA
TTTCAATGCACTCAAAGACATAAAAAAACCAAGATTTTTCAATTGCTATT
TTCAAAAACTTGCATTCAAAATTATTTTTCAGTCCTAAACTAATCTATTC
TTCTAAAGGATCACAACCATACTATTGCATAAAATCCAAAAGAAGAACAA
CTATGAGCGTTACATTAAATTATGTTTCGCATATTTTTGCATTTATCACA
CATATACTTCATGTCTGAATTAAATAAAAGTAAATATGTACGTATATTTT
TAAATTTCCTAAAAGCTGCCTCGTATCTTTAAAATATGTATTTTTATAAT
TAAAAGTTTGATAATTA back to top
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