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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s498 | supercontig | LSalAtl2s498:206287..219492 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008247 >EMLSAP00000008247 ID=EMLSAP00000008247|Name=EMLSAP00000008247|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=835bp
MYDEEDGLENDQTLRKNKSGFKKAFRFKNFSKIKQSSFSFKKEELLDKEN TSSADEFSTEEPIDYSKPLSRKSSFSKPXKLNNLFKKELIPSTTTFLGGP KEESDDTETRLPETSSHVAPSIPRIIIEDFDHLGGREPYSRPSNDFGRSG DRRNFGRGFNPYRWGTNWSETVSTTPESSILSNQANVIEPSETASTFKEE SLNDTSKYQGLIKGFINSILHFLPSVVDSPPESNTQSFSTGSKIEKKIPF SFQSMDRRNSTPKEDSNNPTGVAMEEINSQKEQRKSGPVPMVMASIKRKI DRKVSIEEIEEFYKKHDFIGWTETSAKNDLMVKDSVKFLVDVMLKQHDED YFKFRSKSNFEEGSEDEAPTLRLDRKKYESXSSLSNFEEGSEDEAPTLRL DRKKYESPSSLSKKVNHIMRRKKKTPQKSEGNEIHFYKIGIFGGGGVGKS CLTFRFQNKQFLELYNPTILDSFINKSFMVDGVIRPLEIMDXAGQDEFKN MRDLYLKTSDGLFFVYDVTNRDSFREISELINCLKLSREVETFDEIPPTI IIGNKCDLNAKRKISFEEGMGDKSKYTYHSPSDGKPRQDESVCCSQDCLR FSTHLFNFLLFLTGIALSGVGLWTIIVKDPSLVLLTSGLYDVIAYALIIM GLFVLVLSIMGCCGISKRSPRLMLIYSICLXIMXLAEXAIGALAYCYRDY INSELRVNLFDKYQREYGNEDSITKAIDQLQVGMKCCGVDSFEDWKKTEW WNQTDIRQKNLVPDSCCLTPSAFCGVRDHPSNIRYTGCIDRIGKIASDHM IIIGAVSLGVCIIQIFGVCLSCLLHRKMKKMEHYV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s498:206287..219492+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008247-704094 ID=EMLSAT00000008247-704094|Name=EMLSAT00000008247|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13206bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s498:206287..219492+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGTATGATGAGGAGGACGGATTGGAGAATGATCAGACTTTAAGAAAGAA
TAAATCTGGTTTCAAAAAGGCGTTCAGATTTAAAAATTTCTCGAAGATCA
AACAATCTTCCTTCAGTTTCAAAAAAGAGGAACTTCTAGACAAAGGTATG
AAAAAATTATTTTTCTTCATAGTTATACTCATTTGGATTTCAAAATTTTC
ATTGCATTCATCTTAAAATGATTATAAACATATATTATTTCTGTGAAAAG
TATTAATCTAAGATAATTATCCATAGTTTAAATCAAATAAACCTCGTATT
ATAAAGAATGAATTGATTTTGACTATTTTTTAATATTTGATTCAGAAAAT
ACGTCAAGTGCTGACGAATTCTCAACTGAGGAACCAATTGACTATTCGAA
GCCTTTATCTCGAAAATCGAGTTTTAGTAAGCCCYTCAAATTGAACAATT
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TGATTCACCACCAGAGTCAAACACTCAAAGCTTTTCTACCGGCTCCAAAA
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ACCCCCAAAGAAGACAGCAACAATCCTACCGGAGTGGCTATGGAGGAAAT
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ACTCCAGATTGAAATTTTGTCATTAATTTTGATATATTTTGTGAAGAAGG
TAAGTTTGTTGGCAAGAAATGAAATGATATCGTCAACATATAAACTTTTT
TGCCATCATGAGAAATGATTCATTATTAGTAAAAAAAAATTTAAAAAACA
TTGTCGTAACAAAAAAGTCTTTGAAGAAATATGTCTTTATAAAGAAGATC
GTTCAAAAAATAGGTCTTGATAAGGAAACGTCAATATAGGCTTTTTATAA
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TTGAGATGGGCTTAATTTTGTAGAAGAGACAAAATAATTTTTTGAAAAAA
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AGGTATATGACTAAATAACATTTTGTAGGTCCAGTCAATGTTCAGGTGTC
CTCAATATTTCTGAAATTAATTTACAGATCATATAAATCTATTTATGTAC
AAACTTTTGAATCATGGGGTACATCGTGTTCCCAAAACTCTCCCACAGTG
GACCACATTAAATACACTCATCTTTTCCCTTTTTTAGTATTAAAAAATTC
AGCAGGGAGGCCCTATTTCACTCTCACCCAGAAAATAGTTTAGATGCCCC
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ATGTATCAAAATGGATATACAAATATTCAAAATTCTTCACTTTTCAAACA
GKCCCAGCCATACCTAAAGAAAGATTATTCAAAGTATTATTGATTGGTGA
TCCCGGTGTGGGAAAAACTTCCTTTGTCCAACGATATACAACGAATCTTT
TCCGAACGGACTACAAAGGCACTGTGGGAGTGGATTTTGCTTTAAAGCTA
CTCAAGATTAATAATGAAACAGTTGTTAAACTTCAACTTTGGGATGTGGC
AGGMCAAGAAAGGTTTACGTGGYTGACTCGAGTGTATTATCGAGATGCTC
GGTGTGTATAAAGAGAAGTGAATGACTGAGGCGATCTTTTATTTTTAATC
CATCTGTATAGGGGATGTATCATCATGTTTGATCTTAGTAACCGGAATTC
CTTTTTAAATGCATCTCGTTGGAAAAAGGATTTGGATAAGAAGTGTGTTC
GACCAGATGGAAACGTAATTCCTTGCTTACTTTTAGCGAATAAGGTAATA
ATGTCCTCTAATAGAGGGGTTCTCGATATTATTGCTTACATCAAGGATAA
AGATAGAGTAATTGTAGGTTTCTATAAGCAAGTATAAGTGTTACTTGGAT
AGGGAATGATTCTCTTACAACGGGCGAATGGAATTACAGGTTAAGTTGAG
AACCCCTACTTTAATAAGTATTAATACTCCATTCATGTAGCATTAGCAGG
GACGTTGCTAGCTTTCATCAATTAGGGGGCTTAGCCCCAAAAATTATCAA
CACAGTAATATAATTACATATATCAATAGGTTTATAGTATATACAGTAGG
GAATTTCTTATTTTTCATTTTGTTGAAATGTCCGGGTCGCCGGGTCAAAA
TCTGTTCCTTTTGAGAAAAAATACATTGGGGAATGTTTAGAGGTAGCTCA
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ATTCTTGATTATCATGAAAACAGTTTTGGATACAGCTTTTTATTTTCTAT
AACTTTTTTAAAATTGTTTTAATTTACTTCAAGGAATATGAGGGTCGTTT
GAAAAGTCCATGCAAAGTCAGAGAGATGGCCCTACTGGGGCGTATCTAAG
TTATGTTTAGTTAGTAGCATCTCTGGGAAGAACATACACCAACTTTCACC
CAGATCAGTCTATTTCTTTATGTTTGGCATTCGTTTGAATCGAGGAAGTG
GAGTGATTTTCAAAAAATGGACGTAAAATAATTTCGTGTGTTGAGTAAAC
GTTCCTTCATGAAAGGTAAACCACCTCAGGAGACGTTAAATAAGCTGGAT
AAAAATTATGGGAACGCTGCACCTTCGATTAAAAGAGTTGATAAGTGGTT
TGAAAATTTTGGGAGTGGATATATGTGACGCTGAACGTTCTGGATGGCCT
GTTGAGGTTACTATTCCAGAAACCATTGATAAAATCTATGATATGGTGAT
GGATGACAGAGAAGTGAAAGTGTGTGAGATTTTTAATGCTGTGGGCATCT
CGAGTTGGAACCCTATCTTCATTAATTATGCGACCACAACTGCTGAATTG
TGAGCTGGTGCATTGTCATGATGGAAAATAATTTTTTTGTGGGTCAATCG
TCGCATTTTTTTGCAGCTTGGTTTTCAAACGCTCCAATAACGATTAATAA
TATACACTTGTAATAGTTTTACACTTTTCCGGATAGTCGATGGAAATTAT
TCCTTGCGAATCCAAAAGACAGTCGCCCTAATCTTCCCGGGCGATTCCTC
GATTGAAACGAATGCCAAACAGAAAGAAATAAACTGATCTGGTCGAAAGT
TGTTGTGTGTTCTTCCAAGAGATGTTACTAACTAAATATAACTTCGTCAT
ACAATATCAGTAGTGGCAGCTCTTGGYCTTTGCACGGACTTTTCAAACGA
CTCTCGTATTAATATATTTTCTATGGAAAATATTTGCAATGGGAATATCA
ATTGTTGAAGATAAAACTAATAAATAAATATGATATAACTTTTTTTGGAG
GGGGGAGGGGAAGCTTCAGAWCTTGTTGGGAGGGGGGAATCAAGCACCCC
CAAAAAGAGGCTAGCGACACCACTAAGCATAATTATCGTGAAAATTGAAG
GGTAATCTATATTGTCTATCTAGTGTGATCTTCGAGATAGAAAAGTATCC
ATTGAGGAAATAGAGGAGTTTTACAAAAAGCATGACTTTATTGGATGGAC
AGAGACTTCCGCCAAAAACGATTTAATGGTAAAAGATAGTGTAAAGTTTT
TAGTTGATGTTATGCTTAAGCAACACGATGAAGATTATTTCAAATTTCGG
TCAAAGAGTAACTTTGAAGAAGGCTCAGAGGATGAGGCTCCAACTCTGCG
ACTTGATCGTAAAAAATATGAGAGTSCTAGCTCTCTTGTATGCTCATCTT
GTTAAAGCTTTGATTTCTTTCAAAATGTATTTANNNNNNNNGTCAAAGAG
TAACTTTGAAGAAGGCTCAGAGGATGAGGCTCCAACTCTGCGACTTGATC
GTAAAAAATATGAGAGTCCTAGCTCTCTTGTATGCTCATCTTGTTAAAGC
TTTGATTTCTTTCAAAATGTATTTATAATATTTAAGATATAATGTAGTTT
AAGGATCCGCTAATATACATACATAATAATATATAATTCTCTTCAAGAAA
CGTATTAAAATAGTAATGTACATATTATTTACATGTATTATGTTTTATGA
ATATACAATTGCATACACCCATATACATTTTTATTATCATCTATCCGGCT
TTTTGTTTCTTATTTATTGAATAATGGCTAYAGTCAATGTGATAAGGAGM
GCATCCGGACGCTTCTTCATTCCTTTCAGTTACCATAGTCCAAAAAAGTA
AATCACATCATGAGACGTAAGAAGAAGACTCCGCAAAAGTCTGAGGGAAA
CGAAATCCATTTCTACAAAATAGGGATTTTTGGTGGAGGAGGAGTAGGGA
AGTCATGTTTAACTTTTCGTTTCCAGAACAAACAGTTCCTTGAGCTCTAT
AACCCCACCATTTTAGATTCTTTCATTAATAAATCCTTTATGGTTGATGG
AGTCATACGACCCTTGGAAATTATGGATAKTGCCGGACAGGTTAGTTAGT
TCTGAATTTGACATACTAAAATTACTATATGCTATGCTTGATTCCTATAG
GATGAATTCAAGAACATGAGAGATTTATACTTAAAGACGTCAGACGGTCT
ATTTTTTGTTTATGATGTTACAAACAGGGATTCTTTTCGAGAGATATCAG
AGCTAATTAATTGTTTAAAGCTATCTAGGGTATAGACATAACAATTTACA
TTGAAAATTATCATCCTATTCTTAACTCACTTTTTTTTTTAATTTCAGGA
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GCGATTTAAACGCTAAAAGAAAAATATCCTTTGAGGAAGGTCAGAGTTTA
GCGGATAAATTTGGACCTAACGTATGCTTTGAAGAAACATCCGCCAAAGA
GGATATTAATATCATCAAGGTAAGTCACTTGGGGTTGTTTTTAATTATAA
TTCGAGTAGATTCGCTCGCAGTTGCCTGGCACATTAAGGAATTCAAATTA
ATTCTGAACTCTTCTGATTCATATAAAAAACAAAATAAGGACCGTAAAGT
ATTAAGAATTATTCTCTCTGCAAGTTGGTCACGTCGTTACTTTTATTATA
TCACGCAACCTTGCATCCAAAAACAAACAGAAAAAAAGGCCGTAGTAGTA
GTTAGACAAATAAGTCAATCCTACCAACTCCTATATATCTCTTATTACTC
CCAGACCATCACCGTCATAATATTTCCTCACCCTTTTTTAAAATGAATTA
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AGATAGCCAAAATTTCTTCATATAAATAATAAAATGGCCTATGTACATAT
TTTTTAAACGACGAAGGATCAATAACAAATTGTATTCCTGTTCTTTTAGA
AACAGAGCAGAGCATAAGTATAAAATAACTTATTACTTTGTTTATTTATT
GAAAAGATTACATAATGAAGCCATAACATATCAGGAGATAGGAGGGAATC
GACACCTGACAACAAAATACACTGGGTGTACCACAAACCACAATGTATGT
AGAGAGTATAATTCTTAGAATTTTACGGGCTTTTAAGGCCATGCTGGCCT
TAAAAGTCAAAAGAAAATCTTATAAAAGCCATCTATTGAGCCTTAATAAC
TTACATAAAAAATTGCATCAAAATTTATTAACTGGTTTTGCACGTAATTC
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GTAGGAATATGGGCTATCGTTGATGTTTTTATATAAATTTTATGTAAAGT
ATGTAAGTCTGAAGATGATAATTAAAAATAATGTGAAAGATTGTTTATCT
TGAATGTTTTTTCTTCTCTAAACCTTATTCGTAGCATTTTTCAGTCTTGA
TTTCTGAATGTCCCGGGCAAGGTTGGGCAAATCTACTCTATCTCCTATTG
AAAAGTTTCTAAACCATGCAACACAAATACTTCTTACAATGTTACGGTCT
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ATTAATGTCTCTAGTTGTAGTGAATGCTAGAATATTTAGCCTGGACCTTG
TTTTACTCTAAGCCAAGCTTGAAGCAAGGAAAAAAATGCAAGGTCATTTC
AGAACAATGACTAGGAATTTTGGTTTTATCACGGATATATTTCTTCCTTA
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AAGTTTGTTATTTTTATCGATTTAAAACAAATTCAATGCCATTATTTACA
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ACAATTCTGTGACTACACGACAAAATTTTTGTTTATTATTTGAATGTATT
ATGTAAAAGACAAGAGTGTTTGTCAATGTTGACCTCTTTGCTTCATTAGT
AGAAATAATTCATTATTATAAATAAAAAGTCATATAAAAATATATTTGAG
ACGATTATACAAGGAATAATTGTTGTCCTGTGTGTATCTAGACATCTATT
TCGATCAGTTATAGAAATGAAATTTCAATCACTACTCTTTATAGATTTAA
CTTATGATGTTGCAAGAAAAAAAACATTTATCCACTTTTCCAATGATTTT
GCAGGGGCGTCCGCTAGATTATATTTTGGGAAGGCTTGGTTTATGAGATT
TTTTTTTGAAAAAAAATTGAAAAATTTAAACTTTATGAAAAAAAATTTGA
AAATTAAATTTTTTGGAAAAATAAATTAAAATTCCACAGCTGCTCAAAAC
AAAATCTACAACTATTCTTTAAAAATGTCAAAAATCTACAGCTGTTCACA
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AATTTAATCAAATTTAAAACATTAACTTTCTGGGGAAAAAATTGAAAAAT
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GTTTCGGAAAAAAATTCACAGCTATTCACAAAAAATTAATCTTATTAGAA
AAAATTTCAAAAATCCACAGTTGTTTAAAAAAAAAATTAATTTTTGGAAA
GGAAATCCCAAAAAATTAAGTTTTTTGGGAAAAATATTGTAAAATTTGAT
TAAATTTTAAACATTAAATTTATTGAAAAAAAAAAATAATAATAATAATT
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GCCCACCCTCTGCAGGTACCTCCGTTTTAATATTTTCATTCTACCAATTA
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GCTCATAATGAAGCTCTATCTAAAAAAAAGAAGAAAAAAAATAATAAATG
TAACATCTTATGATGGCAATATCACCATTTAAAAAATATCTCTTGGGGTT
TAAATGGAAATAACGAAAAATAAGTAAAMCCTAACGTGAAATAAATATAA
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AAAAAAGCTTAAAATCAGCTTGTAGTTAACCAATTCTTCTAACTATGGAG
TTATTATTCAATACTTGTTCGGAAATTTCACAGTTTAATAAGAGTTAAAT
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TTATGTACTCCCAAGGTGAATAGAAATAAAAGGTTATGATACCATAAGTC
ATAACCCGTGTACGACTAATGTTTGACTTCCACCACGCTTTTAATATTGA
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ACATGATGGTCTAACATGGTATTTCTATTAACCTTGATGTACTCCCAGAC
ATATTATTTCTTCCCCCTTTTTAAAATTAATTAAATATTATTAATTTATA
CATAGTAGTATTCTATTCGATACTGCATTATAATATTGCTTTGTAATATT
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ATTTAGAATTACGTAGTAATATATAAAAAGATAAAGGTTAGGAAACCCTG
AATTTGACTGTGAATAATCCTGCATGTATAGGTTGAGATACTTTTATTTT
CAAATCTTCCGTGATTCTTTTATGATAAGATAATTATTAATTAATACTAA
AACAGTTGTTAAGATATTATTGATAACTGACAAAGATTTAGATTAGAACT
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TAATCTTCAATATTGATTTCAAAAGTTCAATGATATAGTTAGTCCAGACA
GTTTTGTAGACTTATTCAAAGTGTTTAATCTAATATATCGTCCTCAAGTA
TGACAGGGAAGATAATATTTATAATATTATTTCTCAAAATTATGCATGTG
ATTTTATTATTGGTGTGATTGTGAACTGTCCTCTCTGATTCTCTGGGCGT
TTGAAAACTTTAAAAAAATCTAAACACATGAAATGTCCGTTTTTTGTGTG
TTTTGTCAAAAAAAAAACTATATTTTCTAAAAATACCATTTTTAGTTTTC
AAGTATAAATCCTCGAACTCTAAAAAAAAACTTATCTTATAATTAAAAAA
TGTATTAGAATTTACATTGTTTCAAAAATTTGGATGTAGAGTCTATACTG
ACCATATTTTGATTTTCAAAAAAAGAGAACGTATTTTAAGAGAAGTATTA
ANAATAATTGGAAATTAARAAATTAAANAAWAAGTTATAATTYTGWTTYT
CCTATTTTTTTTTTTTTATTTTTAATTAAAAAACTTATTCTGGTTTTTNN
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CCTCATATTTAAAAAAAAATATTTTATTTATTTATTTTCAATTAGTGGAA
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TTATCTACAAATAATAATTTACAAGTTATATGATATTTAAGCCATACTTC
TTGGCAGTTTATTCAAATTGTGTATAAGTTATAATATAAGCCTTTTAGAG
TGCATCGCAGATCCACTATTTTAAATTACATTGAATGCTACTATTACATA
TTCTATCTTTGCCAACTAATTTTAATATAACATTTTTTTGATAGACATAA
AATTGGTTTTGTTGTCGTATATCCAGCAATAAAAAAAATAATGAAGGGAT
TTTCCTTTTATGAATTACTAAAGGGACTGTACCACGTTCATTTTCAATTT
TTTTTTTTTTTGACATTCCTTAAGGTATACATGCATACTTAAACCAAGGC
TCATATTCAAAATATGTGTGTGACATGTCTCCCCTACAATTGACCCCGAC
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TCTCATTTTTTCAACTTCTCATCATCCGTAAAGCATATATATAATAATAT
ATTCATTGAAATATCAAGGGATGGGCGACAAGTCAAAATATACGTATCAC
AGTCCAAGTGATGGAAAGCCCAGACAGGATGAAAGTGTTTGCTGTTCCCA
GGATTGTCTCAGGTTTTCTACTCATTTATTCAACTTTTTGTTGTTCCTAA
CGGGGATAGCTCTCTCGGGCGTGGGACTATGGACGATCATTGTCAAAGAC
CCGAGTCTAGTGCTTTTAACCTCTGGACTCTACGATGTTATCGCCTACGC
TTTAATTATCATGGGTAAGAGAGAGTTTGAATCCATGAACGGATTGAGCC
TTTATTTAATGAAATGGGGAATGTTGCAGGGCTATTTGTATTGGTATTGA
GTATCATGGGATGCTGTGGTATCAGCAAAAGGAGTCCTCGACTCATGCTA
ATTTACTCCATCTGYTTAKTCATCATGWTTCTAGCTGAASCAGCCATTGG
TGCATTGGCCTATTGCTATCGGGATTATATCAACTCGGAACTGCGCGTCA
ATCTCTTTGATAAGTATCAAAGAGAATATGGAAACGAAGACTCTATTACC
AAAGCTATCGATCAACTACAAGTGGGGTAAGAGAGACTCGTCAAGCAAGT
CCAGCCTTAAACTTAATATCCAAGCATCCCCCAACAAATTTAATTTCTTA
TTCTTTCAGAATGAAATGTTGCGGAGTGGATTCATTTGAGGATTGGAAGA
AAACTGAATGGTGGAATCAAACGGATATTCGCCAAAAAAATTTAGTTCCA
GACTCTTGCTGCTTGACTCCAAGTGCTTTTTGTGGAGTACGGGATCATCC
TTCAAATATTCGATATACAGGTATAAAATATAGCTGTGGAGGCGTGATAG
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GGTAAAATTGCGAGTGATCACATGATCATCATTGGAGCCGTGTCATTAGG
AGTGTGTATAATTCAAATTTTTGGTGTGTGTCTGTCTTGTTTACTTCATC
GAAAGATGAAGAAAATGGAGCACTATGTTTGAAGGGTTTATATCATCGAG
TCCTTGATATAAGTATGAGTATACAATCTCCTCACCTTTGATGAATCTTT
TGTAGTAATATTTATTTATTTGTATTATGATATGACCAACATCTTAACAA
GAAAGTAAACCCCAAGAGGTTTTGATGTAACCAACTGCCTATTTGATTAT
TATTTATTATTAATAGTCTGATAATATTTTAATGTTTATTTTTTTACGGA
TGTCATTCGATTCTTAAGTGCCTAGATATTTGATTTGCTATGGAAGGGCA
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