EMLSAT00000008471, EMLSAT00000008471-704318 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000008471
Unique NameEMLSAT00000008471-704318
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s51supercontigLSalAtl2s51:550670..568620 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000008471 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000008471EMLSAG00000008471-691237Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000037657EMLSAE00000037657-746585Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037658EMLSAE00000037658-746586Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037659EMLSAE00000037659-746587Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000037660EMLSAE00000037660-746588Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778531auto778531Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000008471EMLSAP00000008471Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000008471

>EMLSAP00000008471 ID=EMLSAP00000008471|Name=EMLSAP00000008471|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=984bp
MDRRRRGSNSGCGELTIFFILNLLLFKYRSLEFLVFFLSAFDYPYSVHSS
PVSSRKNKTQRMPRSYDVYHTPKAQNYVYREQNGAVLYGKGTENDGHYIE
SNPSGPYEEYSNYYPSFDSHKLSSLPSSEEEYTGTHTPSGXFVXGTHLSQ
STQTYHHALKTKARRPSIPHYNVEKGSRGSLEHSNYPVVQYNESFAYSYN
PETNTYYFYIIPPAMNHQQKRLDSFNNYPNYKKWNNQQRQYFAVFPTGTN
QGITQSPFHAPPFRKDLRKLYRPSFLNENDILRITQTTISTTRGFIGPLL
PSNFKSKISTTDKPTGTLETTTHAFELVDSEELRVMEQEEETTSKNGGSK
TIMDIFPTXLFNSKTTTPSTTTVKEASIETITSIYLEENFTSETPLSTET
TNSDVFTTGLSSTTPIFDREGIRTTSLDKIASLPNGSKDDESVEFITEVH
QTTTIDYTMKDFMDKTTTPQSSSTVPNENDSMLFVTPGKKFKSKKHNSEK
TLESFPSALEVKELRTTTFLPSSVVGVTESPSTSTMNIEELTTQSLDYIN
VEGDFQSTTTTTIVWEDKSQVTTTVSTIASTTESELRTTVSTIAPTTESQ
ETENTTTTDTNESATLKEEKLTTQELVETTPEPKVTTPSGNNESPANLIT
TTLDPVDGTTTMSSSETTINVTPHAEKVKLELSEKGNAASNSTTTSKPSF
VESTIKTTQNIIESTTTKKAKSSRSKNKAKQDQAPSRKNQTLKKKSKENE
KKDLSSDKSSTVESKKIKATFSSTNKKEKKKSNGVIKSKMTLINKSEKHE
KLPMKGMSKKFPLKKSSKNKSKTKSRKNLSKKQSVMXTTISGTTITTGSM
QYDQGSNKDINSIDDEVTIDNTTTERPELLDENIFETTTVRMFHAGSALL
LFIGSVTMISDAIGMRPKWIRQILLEMIXXSHYINTMVKEKFLRNLYRIV
TLYYEEGCSTALSRWLKEWTSGLVTASSVMITIE
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mRNA from alignment at LSalAtl2s51:550670..568620-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000008471-704318 ID=EMLSAT00000008471-704318|Name=EMLSAT00000008471|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17951bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s51:550670..568620- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGATCGACGTAGAAGAGGCTCAAATTCAGGATGCGGAGAATTGACAAT TTTCTTTATTCTAAATTTACTTCTATTCGTAAGTAAATTGGGCGCCATGT ATTAATGTTCTACACTCCACTTTTTAAAGTGGAGGGTCATTTACAGTATT TTTTTAATATTTTTTTTTTTGCATTCTTCCTTTTTGCTGCGTTATAATAT ATAAATTCTCCAAGATTCGAAGGGGCGTAGCCCCAACTCCCTCACTGTTG CGAGGCTTCTGTTAAGAGATTCCGAGATTCGTTTGTTTTTTTACTATTGG GAAAATTCCTGAGAAGTTATTTATCCCAATATACTAAAAACAGATTATTT CCATGTATTTATGATATAAAAAACTACCCTACATATAAACAGCTTTTAAG GGCTTATTTTAAGTCTAAATATATCTGTATATTTATTTTGGACTTAAAAT AATAGCAGAATTAATATTATTTTTGTTTTCTGTCAAAATAATATTTTATT TACAGTTAATAAGATTGAAAAGTAATGGCTCTATCCCTAAAAGCTCTTTC CCTTAAATCCCAAGCCTCTCGCTATTTTGGAATCAATTTGTAAATTAGAG AATTTAGGATGAGTTTTGTCAAGTCTGGGAAGGGTTTCAAACATATGTGT TCAAAAAATTATTTTTGCTTAAGATATTCAATTCAAGGGTTCAGGCGTAT TTCACACCCTTAGAATAACTTTCAAAAATGCATCAGTATTCTGGTAAAAT TTTGTCCAATGTTATCATAGAACATTCCTTTAATTTCTTTAACTGCGAGC TTAGCTCTTCTATTTTATTGTGGAAAGTAGGCAGAGAATGTTCTATGAGT TATTTCCAACTTTTCTAAAAAGATTTTTGCCTCTCCAACACACGAACTCA GATCTGTTATCACTCGACAACACTTTGGGACTCCGAATATGGGTAAAAAA AAAAATTCTAAGGCTTTTCAGCAAAGACCAGATATTTGTTGCCTTTAATG TCACAATGATCGGCAAAGAAAGCTCCCAATAGTAAATTTGGAACTGTGGA TATGATTGGTGGACATTTTTTTCACTTCTTCTATGAACTATTCTTGAATT CGTTTTTGACAGACTTGAAGCAGAAATTAAGTACGTTGAGGCTTCCGAAT TTCATTTTTGATCAAGTGATAGTCCAAATATATCTTTTTTGAATTGATTC CTTGTTTTTCTCAAACAGTTTATAAATTCCTTATGAGGTTTTTGTTAAAT CCCTTGACACCCTCAGAGTATAATTTAAAAATATTCCCATGCAGTGGACA TTTACCTGAATGTGAAACTTGTTCTTGACTTTGATACGACTTTTGTTCCT TGCAACTGGATACTGAAGCTGATACATCTGTGGCAACCCTTGATTCTATC ATTTGAATCAATTCATTCATAGCCTTTTCATCAATATAAAGGAATAGTTA TGATCTCCCTAAAAATGTCCTGGCCCGAAATTCCCGTGAACAGTACGATC CTAATTACTCCATCCGTAAAGTCGTTTTCTATTTCACATTTATATTTTAT GAGGAAATCACAAGTGGTTGCTTAACTAGGCACTTTAGTTGCAAATGTTT TTATGGACTCACCATAAGACTGTTTCATGGAAAATAAGTAAGTCTGCTAT AAGCATCGTATTTTTAGAACAAAAGCGAGAGTTTCAATGGCCAAGAGCAC AGACTCTTCATCTTCCTCAAATACCTTTGGGTTGACCTTTAGAATATCGT TACCCAGAAAGATTGGAAAATCTGATTGACAATCCCATCCTCGCTGACAT TTGCAAACCTTTTAAACCATTTTCAGCGGTCTAGAAAACAGTTCCAACCC TATTCTCAGTTTACAAAATCGATTTTAGGTCTTTCATTAGGCGAAGCCCT GCACTTTTTATTTGATCTGTAACTTGAGTTGACTGATGGTATAAAMAATG TKTATTAAAMAAAACGATAGCCACTGGCCCTGACTCATGCCTNNTAATAA AATACACGAAATTTGGAGTTTTTTCGAAAAATACAGTAATACCTTGACAT ACGAATTTTTAATGATTATTCAATAATCATAATATTATTTTAAACTTAAC TTTAAAGTCCAAGTCTCTTTAATTTGTCGGCCTCATTTTMGAAATCCAAA TACACAGCAATAGTTCACCAATTTTTCATAATATCAATAAAAAAAGGCTT TAAATTTTTTTTATAAGCATATATTTATGTTTAAACCCCCAAAATGGACG GCATCAACAATGTCATGTCAAAATTTTCTATTATAATTCATAAGGCCTTA AAATTGTCATTTTTTATTGCTATTAAACAATTTTCTTATTTGCTAAACGT ACCGAAACACGGGCAATTATTCATCATTCACTAACTTTATCAAATCAATG ATGTGTGCATATCAACTTTGACTATAATTTAATATAGCCATAAATATAAA GAAATTATAATTTAATACCTATATCTTAGGAAGCCAATTTCATTGAAACT AGAGATGGACATTATAATAGAGATAAAAATTAATTATAAATTATCAAATG ACAATGAACTGTTAATCATATTTGATATGGAGTATCCAAAGTATAAAACA ATAGTTTTGAAAGGTTCTTAAAAATATCTCTCAATTAAAGTTATAAATGA AATTTCAAACCTATCGTATTTTTTTTNATTTTTATTTTTTTTTGGTAGTG GTTTTTTGACGAGCATTTTAAAGATTTTGAAGAAATAGCAATGTAGCAAC GAGCGTGTTTATCTAAAGCTCAGAACATTATATTAAAAAAGAACAGAAAA GGAGAGAACATATCTCTATTATTAAAGTAAAGTATGTAATATAAATCTAA 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CAGTCACCTTAATTTCTAATGAGGTTTTTCTTGTATGCCTGAGGAGACAA ACTAGACCTATTATGCCACAGTTTTATAACAAATTGCACGATTACTAGTA CTCATAACAGGGCAAATACTGGAGGTGCGAAAAAGTAATTAAGTTGCAAG TCCAAATAGAGTCTTACATCTTTGCTCGCATGTCCAAGTGCTTGAATATT TTTTTTCAAGTCCAGTTTGAGTCATTCAAAAATAAAATATATTTTAATGG GTACTTTATATCCAGTGACGAAATTGACAAGACTAACGACTCTAGTCCAA GTTTCCAGCTCTGCAATGTACACTCTGAAAGTACTTTATAGAATAGAAAT TATTTTATGGGGATTGGACAATGAAAGTGCATAGCCAGAGTTTTATTTTT TATGCTCTTATTTCACATTTTCTCATTTATCGAGACAAGAGTCGATCCTT ACCAACTCGGTTTGACTATACTCAATTTGACACAACACTAGTTTACATAT ATCTTCAAAAATCGACTTGATTCACATCCTAATTAATTATTATTTATTCC TCATATAATACATATAGGAACGATATTTGCGTTGATTAACTGCGGTTTGG GAGGATTTGGAATATTTCAGGGATGGTCAATATTTTTGAGTTTTGTAAGT AAATTATATTCATATATTTAAATTGAGACAATGATTGAAAAATATTGCAA ATCCACGAGTAATAATTATTATTATTAATTAATTAATTATGAAGTCCACT CCTTCTCTCTCCTCTAAGAAAGTGAACTATTGAATGAATTTCTAATCTAT AGATACGGCCATATACTGTTACAATTTATATCCCCATCTACGCTAAGGAA ACTTTGTAATTTGAAACAAAATTTATATTCTCCTCTTCAGTTGTAAGTTC GAGATTCTTTAATTGAACGAAAATGCGATTGATAAGTAATTTGTCCCTCT TTTTTCTTAAATAATCTTATCGTCTTATATTAGTCAATTTCTTCCTCAAT TATCTAATAGTTGTTAGACCTCTCTCTGTAGTAGTTAACCAAAAAACAAA CCATTGTATTTGTCATTTTTGCATTTTTGAGTTTCTTCAAATTAAAATTA AGTTGTTTTTTGTGCGTGTGGTTGTTTAAAAAAAAAAACATGAGTTTTTG CTCAAGAACTTGGTTCCTGGAGTTTCTAAGGATTTCACAGAAGGAAAAGT TTCTCTGACAAAAAAACTAATTGTTATTAATATTAATTATTATATTATAC TCCCTTTGATTATTCGAGGGTGGAGTCGTACTGGGTCTAAAAAATCATAC TGCATGCAAAAACTCTCATTTGTAATTTTTTACCACATGCTGTATTATTA CAAACCACTACAACACCAACAAAAAAACATTAAGAGTAGGCCTTTTTTGT TGTTTGTTATTTTTGTTTTTTTCTTCTTTTTAAATCAATAAGATACAAAA GAATTGCAAAAGTGACTTCAGTTTTGAAAATTCACACGAATGGTTAAAAA GAACTTTCATCCCAAAAAACGAAAAATAAAATTGAATCAAGATCTTCAAG AGTGGATTGATTGATTTTTGAAGATATACATCGATACATACATTTATTAA AAGTGTAGTCTGCTATTGTCACAAAATGGTGAGTTTTTTGTATACTTTTC AAATCCTTTATAAGATTGTGATGGGGGATGATTCCATCATTATTTTCAAA GTGAAATGGAAGGATAGATTAATAGGATGAGAGGAGAGCCATACTTAAAA TTGATCGGTCGATTGTCCAATGGGACAGACATTGACATTGTTTACTTGAT AGTATTTTTTACATAACCAAAAATAGTGTTACCATCTTGCGGATAAGATA TTGGGGAGAGGGGTGAGCACAACATAGGTTAATTTTGTTCATTTATTAGT AGCTTCTTTACTTATTTGCATAGGCGTAGAAGATAAAAATGTTTTTGGGA ACAACATCAATTTTGCACGTGTATTAATACACTAACAATTTAAAAAAATA ATTAAGAACCTTTTTTAAAAAAAGAAGACATTTCTTTGATGATCTTTTTG TATTGCTTTGGTGAGGAAAAAAATTGTTTTTTACCTTTTTAAATAGAAAA AAAAAAAAGTAATTAATTACTTGTACTTAACATATTAATGTTCCTAATTC CATAAAATCCCTGTTTCTTACGTCTATGATTATTTTTTTATTATTATATC AAAGCTCAGTGACACCACCTTGTGGAAACATTTTCTTTTAGTTTGCTCAT ACCCCATTTAAGTAAACTTTAAGTATTTATATTTAAGTACACTTTCAGTC CTTATTTAGGACTGAAAACTACAGTCTCGTCCAATTCAATGTCAGTCCGG TCCAGTTTAGTCCTAAAAACTTCGGTCCTTGATGACGTCAATCAACTTTT TTTTTTTTTCAATTGGTTCTTGTACTGAGAGTCTGAAGGACTGAGAGTCT ACGAACCAATTCATAAGACTGATAGGATCAGTCCTAAGACTGGGCTAGAA CGAACAAATAAGGACTGACACATCACTAGTTATATGATAAAGCCATTATC AGATTGAGAATCAAAATGGTTTTTTCTCCCGTATCTTTCAAAATCAAAAC AACCACCCCAGCCCACCACCCCCTTTTTAAGTTTACCACATTATTGTTTT GAGTAAATACCATAATTGGAACCTGAGAGTATAATCTCACTCCTGTGGTC AAAATTATAATAGCATCATTTATTTAAGGATGCTTCTTCCTCTTTCATTA ATAACTCCTTCTTCCATTTCCTTCATTAAATATTCTGCAATATACATAGT ACATTGTTCTCATGCATACTCCCTTGTTTTTCATTAGAAATATCGTTCTT TGGAATTCCTTGTATTCTTTTTGAGTGCCTTTGATTATCCATATTCAGTT CATTCATCCCCTGTCTCTAGCAGAAAAAATAAGACGCAACGAATGCCAAG ATCCTATGATGTATACCATACTCCAAAGGCACAAAATTATGTTTATCGAG AGCAAAATGGAGCTGTTCTTTATGGTAAAGGGACAGAGAATGATGGGCAT TACATTGAGTCAAATCCTTCTGGTCCCTACGAGGAATATTCCAACTACTA CCCTTCCTTCGATTCCCATAAGTTGTCATCACTCCCTTCCTCAGAAGAAG AGTATACTGGAACACACACACCAAGTGGCAGSTTTGTTTYAGGAACTCAT TTAAGTCAAAGTACTCAAACTTATCATCATGCCTTGAAAACGAAAGCTAG ACGTCCATCCATTCCACATTACAACGTAGAGAAGGGAAGTAGAGGTTCTC TTGAGCACTCAAACTATCCTGTAGTTCAATACAATGAGTCTTTTGCCTAT TCTTATAATCCTGAGACGAATACTTACTACTTTTATATTATTCCACCTGC GATGAATCATCAACAAAAAAGACTCGATAGTTTTAATAACTACCCCAACT ATAAGAAGTGGAATAATCAACAACGTCAATACTTTGCTGTTTTTCCAACT GGGACCAACCAAGGAATCACACAGTCTCCCTTTCACGCCCCTCCATTTCG AAAGGATCTAAGAAAGTTGTATCGCCCTTCATTTCTCAACGAAAATGACA TTTTGAGGATTACACAGACTACAATATCTACCACCAGAGGGTTCATTGGT CCTCTCTTACCTTCAAATTTCAAATCAAAGATCTCAACTACAGATAAACC AACAGGAACACTTGAGACAACAACACATGCCTTTGAACTTGTTGATTCGG AGGAATTAAGGGTAATGGAGCAAGAGGAGGAAACTACATCTAAAAATGGA 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TATCATTGTATTCATAATGGATGTTTTGTAAATCCATTTTCTAACTATGT AATTAAAATGAAATGAATAATGATACAATGAAGCTTTTTGTGTACTATAT GGACACAGAAAAACTGAAYATGAGGGGCATACCCCCCCCCCCCTTACCAC AGGCTGACTACATTTATGACACTTTATAAGTTATATAGTTGCTAGAATGT GATCTTCTAGTTTAAAAATCATGTAATAACTTGTAAGGATTGCGGATCGG CAACCATTTTGAAAATAAATTACCTGCTCCATACATAGTTTATCACGGCG TTCTTCCACTAACACAAAAATTTAAACATAACTTTCTTGTCAACTGTCGA TTTTTAATACATATTTCAGAAAGTTGATTGGTTATACTCAAATTAGCTGT TGTTAAGTAGTTAATAATTCCTTGCTATTAAATTAAGGATAAGGATAAAT ATCCGAGTTATGTAGCAGTAACAACTGATTTTGTCCTTTTTTATTTCATT TTTCGAAAGAAAGGTTGCAAATTACAACAAAGCTAACTACGTATTAACAG AGCCATCAACACAAAATAAAGTTTTAATTCTTTTTAGCAAAATTGAGTGT AGATCTCATTTGTATTTTTCGACGAATAATCGCCAGTTTCTATCAACAAA TTGTTATTATTATCCCTTTGAAGGCACCACAAATTGAACTTAAATTAGCC TAAATTGATAAATTTTATTTAAATGGCTATATTGGGGTCAATATAAGTAT CTTAAATCAAATAAAAGTAGTAAACTATAGATAAATTCTTGGGTATCTTA ACTCATCCCAGTAATTTGCATAGAAAGTCTATAACTGTTAAAAATATGTC TATGAAATATTGGGCTGATCCTTTTCCGGATTTTGTTCAAGATTACTTTA TGCTGACGAACCACATACTAGAAAAATTGCAATTTTAGATTGATGTAATT 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