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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s51 | supercontig | LSalAtl2s51:614969..620395 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008472 >EMLSAP00000008472 ID=EMLSAP00000008472|Name=EMLSAP00000008472|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=174bp
MDSTIYYPLKDLAVNTDESWINSEKGLQRFREEQKQRGCCYQIKKMTLRG
CFGCLKFLVFVANFLFWCLGLGVMAVSLWLLFDAKLYLQSLGSHRVDYFI
GTYIILGFFVFLVFILVAEFGACILVYFKEAPYQGVIENSVKATVMKKYH
QNSTATTQTFDLIQQGVSSNILFY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s51:614969..620395+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008472-704319 ID=EMLSAT00000008472-704319|Name=EMLSAT00000008472|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=5427bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s51:614969..620395+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGACTCCACCATTTACTATCCCTTAAAGGACCTTGCTGTTAATACGGA
TGAGTCTTGGGTAATCGTTTTATGTACATTCATAATATATAACGTAACAA
TAGAGTGTCCCTTTTTGTGTGTGTATAAAAACTGTTAAATCATTTGTCGA
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GGAGCATGGAAAGAGTCGCCTTGGATGCTTGGGACGGTAAGATTAAATGT
GTTTTGTTATATTCTATTGTTGTTGTTTTTTTTGTATCTGGAGCATAAAA
AAAATCAACTGGGAATGATTTTCTCAAAATTATGTCTGGACACATTTGTA
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AAACTATATTCGACATTCTAAAGTAATTCAACGTATCCCAAGAATTTGAA
TATAATGTTATAATTGACTGTAATATACCAATGAAATATTGGCCTGTATA
CATTATATCGTGGGCATGGAGCAAAATCCTTTTCTTGAGGATTGTTCAAT
ATTGTTTGATATTTTTTGACGATTACTTACTTAAAAATATTTACTATTAA
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TTAACTGCTAGTGTTGAATTTTAGGATTGAAATCTGTTATGATTATTGTT
AGATAAAAAAACGGGCAAATTAGGTATAGATCAGTTCGAAAGATAAACTT
AGTCTGGATCGGTCTAATTTAAAGTTTTATAGATGAATTGTTGAGCACGT
CAAGTATGTTTCTAAATTTCTAAAAAAAAAAAAAAATGAAAATCGGTACA
ATGACGTCAGAATTTGAGGTTTACGTATACATCTCGTATAACTGAGATAG
GGAGAAAAGGGGTCCAAGGTCTGAGACTGCGGTCCCGATCCAAATATCCT
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TAATTTTTTTTTTACCCTATTAGTATTTCTAAAATAAACCCAATTCTAAC
CACTGAATGTGGACAAATCGCACTAATTTAAAAAAAATAATAGCACCAGA
CCACGCATTATAAAAGTAGGTTACGTTGTTGCGGGGTAACGGGGATATGG
ATACATAAATTTTTATATTTTCTTCAAAAAAAACTCTGTATTTGAGATTT
AATTCAATTTCTCAATTATTTTTTCAAATAAAAATTAATTTTCTGGGAAT
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ATGGATTTTTGAAATTTTTTTCTATAGAACTAAAAATTTGATTTTTTTTT
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GAACAGCGAAGGATTTAGAATTTTTTTGGACAAAATTTACTATTTGAACT
TTTTGCGTTTTATAAATTTAATTTTGGAGTCCTTATTTAGGACTGAATAC
TGGAGTCTTGTCTAGTATTGAATATCAGTGCTAAAACTTATAAAATTCGG
TCCTTGATCACGTCACTCAACTTTTTTTTCTTTTCTGTATTAAATCAGTT
TCTAGAACTGAGAGTCTGATAGACCGGTCCTATAAGTAGTAACTGGACTG
GACTTTACCGAATAAATAAGAACTGACACAAGACTATTATTGCATTTATG
GATATGTTTGTTAATTGAAACTCTGCACGTTCGTTTCCACTCTAATTCAT
CATTAAAATTACACTCGTAGTTATAAATAATGCACATGTAATCACGTAAT
TTGTCTTCCTCTCCCACTTCTGCACACACGTGCATTTGTATTCCTATATA
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AAATATATAATATGTAAATTAATCTGATGCTTACAACATGCTTTAAAAAT
CTAATTCTTTTCGTCACTTTAATTTTGTTAATGAGTTAAAAAAGATTCGA
GATTGCTTGGGTATTTTGTATGTTATTTTGTGTAGCACAAGTACAAACCA
ATTTGATTATATGTATTGGAAATGTGTAGTTATTATGTAAATTTTTTTTG
GGGAGTTGGAATGATTATTATGTAAGAGTTAGACTCATTTATTTTAAGAA
TAAATGATATTTAAACACTCTTTGATTTATTTATAAAAATACACTATCTG
ACACATCAGTATTGACTATGATTGTTATTTTAGAATAGTTATTGTTTGAA
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CTTAAGAATGAATCGGGAATACGTTGATATTAATGAACTCATCATCTTTT
ATCCTTTAAAAGTGTGGCAAATTGCACTGAAATTCCCAAAAATTAAAGGA
AGAAGAATGATATTCTACATTTGAAAGGCCATATTGGAATCTAAATAAAA
CAAAGACTTTAATCTAATGCTAATATTTTTGGTTATCGTAGTTCATCACA
CAAACCTAAATATAATGATTGGTCATAATAATAAATTTATAGATTGTTGG
GTCGGTTATGTACAAATCATTAATGAATAGCGTTCAAAATTATTGAACGG
GAGCGTGCTTATCATTTTAGAAGAGTGATACAATTTTCGCTGATTTATAT
ATATGTTTTATTACTTTTTCTATTTCGACTTCCTATGAGAAAACATCAAA
AAAATTGAGAGATAAATAATAATTTTACGGATTGCAAAAATAAACGGTTA
AAGTTATATCTCAAGATACGGTAGAATCTTTTTTTCCATGCTGTTTCTGT
GATTATTTGCAGTTTTTGGTTGACGAGTTTGCTTCTCATGTAGYTAGCCA
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AAATCTCACGCAAGAATAATTTCAAAAACTTTAAAAACCTTCATACAAGC
CAATTATCGGGCATACCTAATTTTAGTTATTGTACGAAACCTCGTAAGTG
CATGTTCCCCTGGTCAGTGGTTCCTCGTCCAAGGTACTATGAATAACTTA
TAAAAGCTACAACTTGCATAGATCATATACATTTATAAAGGAAAAAAGGA
TTTTTTTACAAGATTGCTTTTGATATTTAACCTACCACATATTTTGTTAA
TATTGCAGGAAAGGTTGCGTGATTGCAAAATTATTCACATTATTTTAATT
TATATAATACATTTTTATTCTAGTTTTTCGTGTTCCTCGTCTTTATTTTG
GTTGCTGAGTTTGGAGCTTGCATTTTGGTCTACTTTAAGGAAGCTCCGTA
CCAAGGGGTAATAGAAAATAGCGTCAAAGCGACAGTGATGAAAAAATATC
ACCAGAACTCTACTGCAACGACTCAAACCTTTGATTTGATTCAACAAGGG
GTAAGCTCAAATATTCTCTTTTATTAA back to top
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