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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s537 | supercontig | LSalAtl2s537:130430..177832 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000008660 >EMLSAP00000008660 ID=EMLSAP00000008660|Name=EMLSAP00000008660|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1063bp
MSLEREKTNRISDPFFVDGSILXSVFCLTEYTCDGNQNISLKEESIILKS PNYPQFYKGIINCSFNIKTSPNQNVTMECSIFRVTGLGPKCIFGGVEING QGHGEDHELLCGSYSTLKLSRRNVLYFDFYNKYFQNKGFMCVIKAQEEEF KCKCGTKNVNSRIVGGKEVEENEYPWQIGIVKIGKNKPFCGGSLVSDRHV VTAAHCFKTLYKVEVLLGEHNIQNSNDTALRIPVKKVEVHKEFGVLAFND YDVTLLTLEQPIKFRREIQPICLPFKDEDFVGTMCTITGWGRLSETEPQP DILQEVNVPVITNDVCNKAYETITPRMICAGYEKGEIDSCQGDSPLSCPQ NNRYVFTGITSFGHGCARPGFPGVYSRITLLQDWIKERIGDGAQISXCLT EYTCEGNQNISLKEESIILKSPNYPQFYKGRIDCSFNIKTSPNQNLTMEC SIFRVTGLDPKCIFGGVEINGQGHGEDHELLCGSYSKLKLSRRNVLFFNF NNKYFQNKGFMCIIKAQKEEFKCKCGTKNVNSRIVGGKEVEENEYPWHIG IVKIGENLPFCGGALVTDRHVVTAGHCFQTFRKVEILLGEHNIRNSHDTA LRIRVKKVEVHKEFNIIAKNDYDITLLTLERPIKFRREIQPICLPFKDDD FVGTMCTITGWGRLNETGPQPDILQEVNVPVITNDDFQSAFCLTEYTCEG NQNISXKEESIILKSPNYPQFYKGRIDCSFNIKTSPNQNLTMECSIFRVT GLGPKCIFGGVEINGQGHGEDHELLCGSYSKLKLSRRNVLFFNFYNKYFQ NKGFMCVVKAQKEDFKCKCGTKNVNSRIVGGKEVEENEYPWHIGIVKIGD NKPFCGGALVTDRHVVTAGHCFQTFHKVEILLGEHNIQNSNDTALRIPVK KVEVHKEFSVLAMNDYDITLLTLERPIKFRREIQPICLPFKDEDFVGTMC TITGWGRLNETGPQPDILQEVNVPVITNDVCKKSYETLTPRMICAGYKKG ELDACQGDSGGPLSCPQNNRYVLAGSTSYGFGCARPDFPGVYSRITLLQD WINERIGDGAQCD back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s537:130430..177832- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000008660-704507 ID=EMLSAT00000008660-704507|Name=EMLSAT00000008660|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=47403bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s537:130430..177832- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAGCCTTGAAAGAGAGAAGACCAACAGGTGCTTTTCACTCCAATTTTG
TTTTTGTTTTTGTTTTTTGCTCTTCAAAAATAGTATTTTTCTGGAAAAAA
AAAACTAATCAAAATCATAACAGTTTATTGTCAGTCTATAAATCAATATA
CACCTGAAAATTCATCATGATATGCAAGGGAATTTTGTTTTGCTTAATCA
TATTTAAGGTAAGCTCCAGTTATTCCTTTCATTTTTGGATTCATTAAATA
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TCTATATTTAATATCATTTTTAAATATCAGTGAATTGTTATTCCGCATGG
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ATGTGAACTGAATAAGGTGAATGGAACTAATTTCTGAGTCAGATACCAAC
CGTGACTTCTCCTTTTCTTCAGAACAGAGGTTGACAGTTCATTATTAACA
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GTATTGTCCGGGTCCAAACTCTTGCCAAAAATAACCTCCCATGCTCCTCC
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AACCGGGCCAGCCCAAAAATACACCGGATTTTCATCATTAATTATATACT
GTATGCAGGAGCTGTAGTCAATATAATGAAATAAATCCTTAGACTTTCAA
ATGCTACAATGTGTTTACTGTTTATCTATTAATATTAACTTTTATTTTCA
TCGATAGGGTTCTTTCAGTTCCAAATATTTCTCTCAATTGTAATTATCCT
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TTAGAAAAGTTTATAAATTCTGTAGATGGTTAAATTAAACCCTTCTTAAT
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TGCAAAATCTCCTACATTGTAGTTTTATTTTCATCGTTCCTACTAGATTC
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TGATTCTACAACATTAGGATGAGAGTTAGTCCGTCCAATATATCTAATTC
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TAGACACTTGTTTAGAGAATAATCCAGGACTTTGCACAATAAGTCCTCCA
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GACTAACACAGAGAGGCCAAACATAACTTCAACTTCCTCAGTTTGTCAGT
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GAAGATTATGAATAGCTCACATCATTTTGGATCAGGGTTTTTAAAGAGAA
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GAACGGGATATTGTTTTCATGAAGTTGGAATTACAATGATTTGTTATAGA
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GATGTTATTTTTGATTTCCACACTATGCAGACAATTTCATAATTTAGGAC
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GCGATTTACATCCCTGAATGCGTAGATGATTGACAATGATTTAAATCCGG
TGTGTTTTTTAGCTCGCCCGTTAATTTGTAATTGGTTTTTATAAATAAAA
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GCTTTTCATTTTTATTTTTTAACAAGCCCGTTCTACACTAGATTTGTATC
ATTGATGATCAACTTATTCCTTCCCCTTGTATTTTTGTCGTTGTTGTTGA
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AGATCTTGATGATGCAATTTAAAATTATAATTTACTTCCCCGGAAAATAC
AGTACAATGCGATTTTCAAATTTATAGCCATGTATCTTGACGCAGCTGCA
ATAAGTATGGCTCTTAACTCCATGCTATCCATTGGTTCCTTCAAGGTCAA
CTTTTTTCCAACTTACGAATTAGAATTATGTATGCCAAACACCTTTTTCG
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CAAACCTTTTACTAAATTTCGTTATATGCAGTTAAATGCAGGCTAAGGAA
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CATTAATTTTCTGTGAATAGATATAGTGTATATGATATTTTAATCTGCTT
CTATCACAATGGTACAAAAAAGAATATCAATAACAGCTGCATATTTTTGT
GGCTTAATAGTGTTTTTTGAACTCAAATGATTTTCGTTAATCTGTAAATA
CTCTCACAGTTCAATAGAGTTCAACACTTGGAGAGAATGACAGGTATATA
AACTAAGCCTTTATTTCTATCTCTCATTAGAAAGGTTGAGTGAATCAATT
AACATTGTCATATCTTATTCAATATTGATAAGCCCATCAACAATTGGGAC
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CTAAATTCAAGGCATAAGAGTTGATAACATTTTTGTAATAGGTTTAAAAA
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AAATGAAAAAAATAAGAGGATGAGTTTACCTATTATTATTTTTACCCCCC
TTTCCCTATCAAACTAACAATTGGTACTCATTTAGTGAAATCTGGAATCT
CAGACGTATACTCAAGTTTATGAGTAAGGGCGTTTTAACACTGAAAAATA
AAAAAATAAAGACAATCTGGACATCAATAACTAAAGACCAATAACGGTGT
TGAAAACTTCCTACAAGGTACTCACTGGTATTTTAAATAACAGACTGGTC
AAACTTCTTCCACAATTCATCAGATATGTGCAGAAGGGGTTTATGAAAAA
CAGGAGAGCAGAAGATATTCCAAGCTCTATTCAAGACGCTATAGACCTTG
AACACAGTAATAATCGAAAATATGCAGCAGTGTTCATCGACTTCCAAAAG
GTCTTTGACTCCTTATCACACTTTACCCTTCTACCACCTTGATCTGTGCC
CAGTTCTTATAAATAATTATTTATAAACACTATGGTTGAAAACAGTTGAA
GCACCCCAAAATGTATGTCAATGAAATAATCGAGTCCTGACTTCGTTATT
ATAAAGCCCAAAGTCTGGCTAAAGTATAAAATGCAGATACCTTTCGTGAT
GAAAGTGTGAGCTTTTAGCTAAGTCCGAGTTGTCGGTGGCATAGCCACGC
TCCAATCTTCTTTTCTTAGCTCTATATTTAAGGATCTGTTCTGCGATTTC
CCTTATATTCCTACTACATTCATAAAAAAGATAGAAGGAGGACTCCGTTT
GATCCCAGCAGAAAGAGCAGGGCCTCTCCATTTCATCTTTTTTTGACTTG
TTGGTGAGGACTGTTGATGCAGCAATTCGATAACGAAGCCATCTGGAATC
GGTGAATAGATTTATCATGACCAATCTCCAACCTACTTTATCGATCCCCA
TGTTCATTCTATTCAGCTTTCGGAGTCATTTGGAAACTAAAAGAATTGGG
GAGTCGGATACTGTCATTTTCACAATCTCTTTTCAAACATATTGTAGATT
GAGATCCTCCAATACAATGTAAAACTAGATGTTTGGACACATACTTTTTT
TTATTTTATGTAGTACGGAAATGATACGGTTGGCCGTTACAAAATTTAAG
GAAGACAGCAATAGGAATGAGGTTATTTTCCTACAGAAACAATTCCCGTA
TGCTTAGCCCTTTGCCCTTTGCAGTAAGCCTCATTCTTAGGTATAGCTGA
AAAAAGCTCTCCTGGGCCCATGGTCATTCTTTCATCAAAATAGTAGCCCG
GGTTGTTCTTAAAAAAATGTATTATTCTTTTAGTCTAGAAATCCGGACAC
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