EMLSAT00000009008, EMLSAT00000009008-704855 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000009008
Unique NameEMLSAT00000009008-704855
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s565supercontigLSalAtl2s565:344055..376006 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000009008 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000009008EMLSAG00000009008-691774Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000039986EMLSAE00000039986-748914Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000039987EMLSAE00000039987-748915Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000039988EMLSAE00000039988-748916Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000039989EMLSAE00000039989-748917Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000039990EMLSAE00000039990-748918Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000039991EMLSAE00000039991-748919Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000039992EMLSAE00000039992-748920Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000039993EMLSAE00000039993-748921Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776894auto776894Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000009008EMLSAP00000009008Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000009008

>EMLSAP00000009008 ID=EMLSAP00000009008|Name=EMLSAP00000009008|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=604bp
MLIHFLQSSIFLIGIKGVFGQGTHEGIPSIPSSSDETRSVFIVNASQIRH
TPVMSEGALKTAALKYTSNSPQYYPPGSSIPSSSNMECCKCYQQEVSSSF
IQDKREITNIPSPNTISYSTTTKISTNPEPVLANDRVXSGAINLLLLQAL
AQAQQTQEKPKVNPLEEKIQGYYNKIISIFNLDLEILRETIDLIRKANTT
VLPLIQNVFLPLVNQAQSTSSSLNLENVIRPLSFRDSTNFTVPENAIREI
SNMLTAEFDRSGLGFPIRAFFLGKDAFRTLKSKHSREIISNIISHKLSHF
IKGSDAIIEVKHGEIVFDALTPQTELTNNCEFGLTLGNARNRMIIRRNTQ
FKGGVRLSLITGGVVDLNLDLNARVHARVGKRLFGKCFGKMRKNLPLRSV
SRGKAQIGVQFHASHVRIERRRFQGKPLNLEYDEFLAFTKGQKYASHQTH
QTYKSVMEKIRAKEEEENIPHLVFKLNIRLQAQILRWHVNSIYVNNCNVK
FFGVKVFSFCSFIKRKTQSIIEGFGRRTFNINSPKILRRIEKLFAERIGN
EIAIPLLLVDENTKIVQSLLVKAITIASLKAELGRDIGELAGQLTTPEVP
TYGG
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mRNA from alignment at LSalAtl2s565:344055..376006+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000009008-704855 ID=EMLSAT00000009008-704855|Name=EMLSAT00000009008|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=31952bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s565:344055..376006+ (Lepeophtheirus salmonis)
CCATTCATGTAGAAACCACCTTTGAATATACACTCATACCAATGTCGTGA ACTTCTCCTCTTTTAATAATCTTTATACCCTATCCATATACAAGAATGTG CCTTAGTTATTAAATCCTTTTCACAATACGTCATTATACATGAAAATTCC ATGTATACTACTTGAATAAGGACAGGTAAGACATGACTTATTTTTCTTGA TTATAAATTCAACTCCTCTAAAAAATTTACGTATAAATACATGCAATTAG GCAAAATATCACGCGGAACCATGTGGCTCTTATTCTTAGTAAGTAAGAAA ATACAATCCCCTTTTCCTTAAATTATGTTTACTCTCTTTTTTGCTCTATA GTCAATGAATAGATCAATCCTTTTTGGGGATACAATTATTCTTTCGCATA ATTCCAATCCGTTTTCTTACCTACATATTATTATACTGATGTGATACATT TTCTTAAGAGCTGCTATAGAGTCATTTTGCATGAATTCGAATCCGATCAT CATATTTGAGTCACTATTATTTCTATTAGGGCTGTATCAGTCCTTAATAT GTGACTTAAAATCAATGCCGCTCCTGTTATTGGTCCTTTAAGAGTGTCCC ATATTTCAAAATGGCTTTTATATCATTGTCAAATACATACATAATTTTAC TAATTGAATGTGTGAAATAAAACATCATGTATCAATTCATACATGAAAAT GGTTGCCAGTATTTTTATATAATTAGGGCTTAAATTTATAGGTTTTGTTA TTCTTGTTTATTCCAAGGCAAATCAATCACTCAAAAACAGCATCCTCTTT GGCTCTTTTCAAATTTGGCACATATTACATATAATATTAGTTAAAAACTG AAAAATCCAAAATTTCAGCCTTTTTGTCCTCCGGTTCAGGAGTTAGAGGC TTCTAAAGTTTTGGCCTCGACGACACCRACCCRATTTTTAAATTGCTGTA TTTTGAATGTTTTGAAGATATGGATCTACTTCCATAACCATTTAATAGAT AACTGTTATAACTCTTTTGTTGTACTTTATTGTATCAGTCAACAAAATGA GTTGTTACACATGAGGTCAATATTTTGACCTAAAAAAATCAAACATGTCA ATTTTCAATATCACTCTTATTATTTTATGTTAATTTGTAATACATCGTAA ACATATAGGTACAATACGTATTTAGAGATACATTTGATTCCACTTAAATA CTACAGATGAAAACATGTGCGTAGGTAGAGCAAAAAAGGGTCAACTTTTG GATTTTTGAGTTTTTAACTAATATTTAAATATGGGCCAAATTTTACAAAA AATCGAAGATGGTGTTGTGAAAAATGTCTTTTTTATCCGGTAAGACTCAT CTGCAGATGCACAGCGTATCGTGGCAAAACTTTAATAGGATTCTAAACGA TAGGTATGATTGAAAACATTATTAAAGCCAATCACAAAACAAAGTTTATA TCGCAAGAAAATGTCGACGTGGAGTAATTCGAACTTTTCAACAGAAATTC GACTTCTTCTTATTGTTTAAAATTAGAGATCCTGTCAGATTTTGATTTGA TAAAGGTTGCCCTAATGGCTATTCTTGTACATCAAACAGTCCAAGAACCG ATGTAATCTACTTGGGAAAGGTGTACCACGGCCTTGAGCTGTTAATTTCT CTATGATATATGGATATATTCGATATCTTATTTCAACTCACGGACTTAAA AGTGTGTTTTTAAAAAAAAATTGATTTGAAACATTTTGAAATGAAGTAAT AGACTATAGTCTATGAGCTTGACAGTGGTGAATAGTTTTAATCTTCCTTC TGTTTAATTCTGCCGATTAGTTGGTTATGTATWAAAAATGCCGAAACAGC CATAAATTTAATATGCTATTAATCCTGTATATTCTTTTAAATAGAATGAA GACAATGTTTCAAATAGTTAAAGATTTGCTCATTTATATCAAGTTCGATT ATTTTTTCGATTTCTTCGATTTGCCTCTGCCTGACCAACTTATCCAAACA GCTGAGTAAAAATCCTTTTCGTCCTTTCCCTCTTCACAATCGAGGTTGAG AGTTGATAAAAAAAGCTAGTTGTGATATAATAAAGATTGTTTCGTGTGAC TCTTTTACGTCCAGTTTATAACTTTGCTTAAGATTTAGGAAAGGAACAGA GGGAGCTTTAAAATAGTAAGACCGAAACATCCTTACTTTTCGCTATGTAT TTTAACCATGGTGTTTCAATTCGACTCTATTCTAAGGAGTCGTTTGTTTA ATCCTATATCTATGAAGATAAATGATCGATAGCGAATAAATTATATCAAT CATTTGAGTCTCACTCATACTTTCCAGAGTCTTTTTAAACTGAGTCGAGG TTGAATTTACAATGTAATTATTAGACTTAGAAGCGACTCAAGCTCATGTC CTTAGCTCCATGATGACTACTATTATTTTTCCTACTAAATCTTCTTTTTA GTTCATGGTAAGATCAATCCATTGAAATAGTGAGTAGTCAATCTTTTTTG CATCATTCAAAACCTGTTTGACCCATATTTATATTAAATACTTATGTACA TAGGATATTGAACATCCATCACGTTTTTACCTGTATTGTATCATACAACC TTTCTTCCGAAAATAAACATAGAAGAAGGCCAAAAATCAGTTAATAGTTA TTCAACTTTTCCCAACCATGAAATTATTATTTTATAATTGTTGGGAATTT TTCACAACTTAAAAGAGGATAATTCAAATTCACCTTTTAACGTTTAAAAC ACTGATTAGTAGAAAAAAGCAGAGAACAAAATCCATACTAGTGAGGTATA CCCATGCCATTGAACCTATGTGTTGCGTCAACATAAAACACAATATTGAA 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GTGGGTTTCGTTAATTGTTGAGTAATATTAGGTAGATCTTAAATCTACTG TTGTTTTATAAATTCAGCTGTGAAAAGGCGTAGTAGTTACTATTATAAAG GTGCATTCGATTATGCCGGGTTTTTTTAAATGTACAATTTGTCAATTCAA GATCTTTTTTATAATGAAATTCACACTCAATGTAAGAGTATAATAGTTCC TTTAACAATATTAAAAAGATCCGTATACCCTCGAATCTAATTATCTAGCC CGGAGCTATAAACCAAATTGCGAAACGCCCATCTCCCCTGTTAATTTGAG TAGATTCATGGTTTATGTAAAGTCTTTAATTTTTTTCTCTCCAAAGATGT GGTTTTTCATAATACCACAGAGAATGTTACTTTATCATTTTTCCTCACAA CATATGTAGGTATGCAACTTTTTCTTCCCTTTTCCGAATTCACCCTTTTA ATTCAATTGAAAAAGGTTGAATTTATGGATGTTTCATAATTAGATATTCA TGGCATTTCTAAGCCTCTAGCGGACAAAAAACTGTCTCATAGCCAGCTAC ATTTGGACTAAAATTAATCATGTGGTCTTCATTCAGTCACTTGTTTTGGT TTAGTCATTCGCAAACCCTTGCCTTATTTTTGTTTTTCCGTTTCTGAAGA GCGTTTTCACATGATTTCATCATCATGGTGCAAGTCGGTCATATTGAAAA AACAACCAATTTTTGTAAGAACAGAAATCCTTGTTTCGTTTGGATTCCGG GAAATGGATAAATATTTCTTTGTATTTGGATGGTATAATATGTTGAATTG ACTAATATTAAGAATTCCTGTCTATCAAAAAATAAATTTCTTTTTATTTG ATTATTATTTCACAGACCCTAATATGTATAAAAATAACTTATTAACCATT CAAAACATTGTGAATTAATGGAATTGCATAATTCCTTTTGCAAATATCAT ATATGTTTTTCTCCAATTATCCTCTTTTTCTATTCACGAATCCATCCGGA ATATTATTCATTCTAGAAATCTAATTATTTACAAGGAATTTTCAATACCT ATTATTTTAATTGTATTTCATTTCACAATTTTTTGTTCACATCAAAAAGT ATTCTTAGTAGTTTTCCATTTTTAAAGACATTAAATAAAGTTTTCTTCGG ATTTTATTTCTTGAAATTTCTTCATTCCATTAAGCAAATACGCATATCAA CTATATTTTTCCCAAATAGGGTCACTTTCTCTGTGTTCTTCAAACGGTGA CGTCGGCGTTCTATAAAATAGAGTTGTAAAAACATTAAACCACTCGCGCA TTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTGTGGTTAGCAATCTGAAGAATATTTTTT TTTTTTCACTTTCCAAAGCTGTTATTATTATTATTGAACTTTTGAGAAGA GTACATCTAAGTATAAAGTATGTCTGCTCATGAATGACAGAGAGTGACTC TGAGAATTTATTGGGGAGTTACAAACTTGTCTTTTCCTAAACATTCGTCA AATTGTATAGGTTACCATACCAATATTCACTTCCCTTTTTTCCCATATCA ACAGGGCATATTTTATAAAGGATTTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTAAAATATTACATTTTTGA AGAAAAATCCACAGCTATATACATAAAATTTCAAATACTACATTTTTTGG AGAGAAATTGCAACAATAAACAGCTATTCAAAACAAAATCAGATATTAAA TTTTTTGTAGTAAAACTTCAAAAACCCACAGCTATTTCAAAGAAATTAAA CTTCTTGGAAAAAAATTTCCAATATTTATTTTTTTACGGAAAAAAATTCA AAAGTCTATGGCTATTCTAAAAATATTTTAAAAATTAAATGCAAATATAA 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TTCAAAAAAAAATCTATCAATTACTTATTCTTTGATTATGACGATCCCTT TTGGCTACTGAAAGTTCAATTCAAAAGTTTAATGGTTATTATTATTTGTT CATAGAAATTCGCGATTATTCGTCGAAGAATACAAATATGTATAATCCAC ACTTAATTTATGGAAGAAAAAAAATCATTGTAGTTTGCTTTTCTGATGAT GGATCACATATCTGTTTTCTTCTAAGTATATAATTTAAGAAATATTATGT CATTGATTATAATATAATATACAGTCAACTTGGTCAAGGCCTATGATGTA CGACGTCTTTTTTTATTTCGTTGAAAGAGATTGAATATATGATTGTACAA CATTGAAATATTTATTTTTTATTTAAAAACCTAAATAAAAACAATTTTCT AGTTATAATCAATTCAATATGCTTTTGTGTTATTTGACATTATTATTTAT ATGCCATTGAGAGAGAATTAATGTCAAAGTGATCTTTGAGTCATTGATGG ATCTCAAAATACTATATGGTAAAATTGTATTACACATTTTTATCCTCTCC AAAATCCTTATGATAATATAATGAAAGGTCGCAGTTAACATTTGACTGTT CAAAATCGAACAATTACCTACTTTACAGATTTTCACTCACATCACAGATA GAAACTTACTTAAAAGAAACGACGCAATGTTATGGGCCTTTTTTATAAAA TGGATACATTTCCAAAAAAATCTTGAAAAAACCTGATCAAATGCATTTAA ATATAAAAAAGTAAATGAAATAAGCGTTCCGTCAAAACAAAAGCTAGCAT GATTACTCTCAAAATTGAGTGTGCATTACATTTGTATTTTTTGACGAATA ATTATTATTTTCTATACAAAAATATATTCTTATTATCACTTTGAGTGTGT GGTTAATTGCACTTGGAATAGCCTAAATTGATTTTGACAATAAAATAATG 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CTGGAAATAATTGACTTTTTCTGCATAGTCATGGAATTAAAATTACGCAT GAATTACAATTTTAAATATATAGTACTTGATTTTCTTTGACCTTGACCAC TACGTCACTATTTCTTTTTCACATTAATATAACCTTCCTTTGTACAACCA TACATATACATTGAAGAGGACACTGGTTAGTAATAAGCAACTATGCATAG TGATGAATAAAGTTTGKCCTGCCGCTATGTAAAAATAAAAGGAACCGGAA ATTAAAGTGGTAATCTTGACAATTTGAAGAATGTTTCGGAGGAGAGCATC TGTAAGAGGAAGGAAATAAATACAAATACCACCTTGTATTAAGTAAGGGR ATATGTATATAGTTGTGAAAATCTGGAGTATTTTTTTGCACKCTCATTTT TTTTTTTTTTTTTTTGGYGTTGCTTAGGGAAAACTGAATTTTCTTTTCCT ATGCACCTGTAATTATTAAGGGTCTTACATTTATGACATCTTGGAGGGAA GGGGGGTAGAGGGTTATGGAATATGTTAGAGCCCACTATATTGAGAACTG ATCCCTGTTTTACACATCCCAAAAACCTTTTCATTTTGCTCGGTTTTTGA TTTTTCTATGGAAAAAAAATTTATATATTAATTTTTTTCAAAATAAATAC AAAAATTAAAGTTTTTTGTCAAAACATTTGAAAAATAAAAATTTTTGGGA AAAAATTTCAAAAAACCACTGCTATTTATAAAAAGTTAATTTTTTTTTCA AAGAAAATTTCAAAAAATAAATTTCATATGATAAACTTTTTCGAAAAATA TTTCATAAATTAAATTTCAAATGATACATTTTTTGAAAAAAAACCTTTTG TAAGTGGGAACCCCTGGTGCATGAAATCTATGATAACGGAAGGATGAAAG ATTTTCTAATTTGTTTGTTTTTATAACCACAAATCTCCATCTTGAGATGA 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