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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s570 | supercontig | LSalAtl2s570:251412..259143 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000009085 >EMLSAP00000009085 ID=EMLSAP00000009085|Name=EMLSAP00000009085|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=499bp
MFLNLGQGHASTKMTQILXXDVNTNFIKSHTLMDETVPPLFGSPVVIRTG
LSSRFTTLAVDPQISTTDGRHYDIIFTGTTNGYILKSINALGPSSNDRVE
SVIIEELKVFEKPTIIKKVQVVGGEKEGGRSLGKLVIMSDDEIRSFPVQR
CDRATTCPECVALRDPYCAWDVRSARCGSGDWTQNMAXXFIXSXSXGEHS
HCLAEIVVQDGEEDNKGKWYDRIQPVGLVINIVNREKNSLSKPETKDRTV
SQNNPSGVQGVEPNTVLFSLETLVITVSAGAVAALVVGFVIGYCCGRKCG
KESGVXLPYPDTEYEYFEQRQGLARPLAPLLPTSSDKLDPRDQEEVTYAE
PELVSRPVPSHLNALNSGGGKYYDGDRFGSSHYSSSLLQPNKFNTIHSSV
SKRNKAHNDSLMLGGGGGVGGGLHFINXPPGVPATLFNAGNRRENIGPNV
NFQMSTLGRSSMRNNGKSSVNGDSSNDGSQPQVVDSAYGTTRSVKKVYL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s570:251412..259143+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000009085-704932 ID=EMLSAT00000009085-704932|Name=EMLSAT00000009085|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7732bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s570:251412..259143+ (Lepeophtheirus salmonis)
AAATTAAGAAGTTGTGAATGAAGTTTGATTAAATAAGACAGACAGCAGCT
GCTGCATGTAAAAGACGAGTTAGTTGGCTAGTTGGCTGTTTATGTTTTTG
AGGCGTTTGTGGTAGGCTTGGCGGGTGAGGAAAGAAAAGAAAAGAAAAGA
AAAGAGAGAGAGAGCTGATCTCACACACCTACACACAGACAGAGGGAGAG
AGAGAAAAAGAAAGAGCTGAAAGAAGGAGTGTGATCTGTGAAGGGAGGAT
CCTTCTTTATCCCAAGATTCAAGATTGATTCCATTGTGTTAGAGATCCTC
ATCTGGGCGCAGGTCTTGTTCTCCCAACGGAACCGGATGTCATGCGTTCC
TAAGAGCGGAGCAGATTAGTGGGATATTTGTGGAGAGTAATTGTGAACTG
AGTCTCAATGTGAGTGTCCTTATTATTCCGAGCACCTTTGTGGACGTGAT
TCTCTCTCCGGGAAGGTTTTTGGAAGATGTCGATGGGCGGGAGAGGCGGC
GGYCGTGTCATGCATTTGACGGTTGCGATTGGGGCTTGTGGGAATTGATG
AAGAAGTGTTTTTCATCATGTTTGTGTTGTTGTTGTACTTGGGTTGGTTC
TGGATGTGGACAAGTGGGATGGTGTGTGCGTGGCAAAGGAACGAAAGACC
TCGGCTCTTGCTGGAAATGTCTCCTGGGGACTACGTGTCCTTTGGGGGGA
ACGAGAGTGAAGTGGATTACTTCCGCGTGATGCTTCCCATCGAAGAAGGG
AAATATCTTTTGCTGGGTGCGAGGAACGTGCTCTACAAAGTGGAGCTGCG
AGACGATCTTCGCCTTCGCCAAAAGCTGGAGTGGAAGAGTGAGGAGCGCG
TTCGAGAGGATTGTTTGGTCAAGGGGAAAACGCAGCGCGAGTGCCAAAAT
TACATATCGGTCTTGGCGCAGTACGATCAGGATCGCGAAAAATACATTCT
TTGTGGGACGAATGCCTTTAAGCCCCTCTGTCGCGAATACACGGACGAAA
GGGGTTCTTATGTTCCCGGGGAGACAAAAACGGGCATAGGGTTATGCCCG
TATTCCCCCGATCATAACAGTKCCGCCATACTCGTGGGAGAGGACTTATT
TTCAGGCACGTTTGCTGATCATGCCGCTGTCGATCCCATCATTATAAGAG
GGTCTGTCAAAACACGACCCTTTGATTCCACGGTGCTCAATTCTCCGGAC
TTTGTGGGATCGTTCTCAGACTCGGATTTTGTGTATTTCTTTTTTCGAGA
AGGTGCTGTGGAATACTTTAACTGTGGAAAAGCTATATTTTCTCGCGTTG
CAAGAGTCTGTAAGAATGATCCTGGTGGAACAGGAAATCATTGGATGTCA
TTTATTAAGACTAGACTTAACTGTTCTGTGCCTGGAGCTTATCCTTTTTA
CTTTGATGAAATTCAAGGTGTATCCGAATTGATCTTAGGTTCATACGGTG
ATGATCCTCAAGAAAGTCTTATATTCTACGCTACTTTCTCAACACCCTCG
AACTCCATTGGAGGTTCGGCTGTGTGTGCTTWCAGCKTTAAAGATATAAA
TAAATCCTTCATCGGAAAATTCAAAGAACAACGAGATACCTCCGCCAACT
GGCTTCCAGTTTCAGAAAAAGATGTAACTATTTTTTTAAAAAAAAGATAT
ATAACTCACTACTAATTGAAATTAATTTGTTTTACTACATGAYGGGGWTT
TTTTTTTTTTGTCGAGCATGGATTACAATGTACTATTTCTTGAGGCTTTT
AATTGTATTTAATATTTCACTCTATTAGAAAATTATTTGATTGAKCTCTC
CTTCAAAAGCCTGCCTCCAATTTTCCACCATGAAATCATGAGCTATAATA
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TCCTAAACCTCGGCCAGGGACATGCATCAACGAAAATGACACAAATTCTT
TNNNNTGATGTCAATACAAATTTTATAAAATCGCACACTTTAATGGACGA
AACGGTGCCACCTTTATTTGGGTCCCCAGTCGTTATTCGCACTGGATTGT
CTTCAAGGTTTACAACTTTGGCCGTTGATCCCCAAATTTCTACTACTGAC
GGCCGACATTATGATATCATATTTACTGGTAATTATAAAAAGTGTTTATT
TGTTGCTTCTTTAGCTCTTGATTGTTGTAAAGTCTCGTAAGGAATTTTTA
AATTTCATTTGTTTGTTTTTCTAACTAAGAAGTTTCCTCATTTACTTTTC
CATCGTTCCAATAAGTATTATTCCTTAATTATGATTGTAAAGAAGTTGAG
CGTCAGCTACTTAAGTTTACTCACTTTCCAGTCAAACAATTTATGATTTG
TTTGAACAAAAAGAAAATTGTTATATTATATTTCTCACTAATGGATTAGT
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TCATTTTTATTACTATTCTTCATTGGATATTATATACATTCATAAAATAA
TATTGTAGAGCATTCTCATGTGACGTCAACACTATTAAGGTTGACCATTT
TGGGAGCCTAAACAACCAAGTTATATAATATTAAATACCCAATAATATTA
AAGAAAGTAGTGAGCTATTGCTGTTTATTTGAATGACCAAATGGGACTAA
CAAATAAAATGACTTTAACCTTACAGTCAAAAAATATATCTCTCTAATGC
CTATTTTTGACACTTATGGCTCCTTTACACCCCTGATACTAACCCCGTAT
AAATTTCGAGTGCATGTCGAGGGGAAGGCCTGTAGTATCCTTAATTCAAA
CACAGAAGCCCTTAAAGGCACTGTCAGTCAGCATTGGGACGCCATGACAG
AGGATTACATCCGAAGTGGGAGCTAGGCCTTCCGCCGCCGCCTGGAAGCC
ATCATTGCCGCTAATGGCGGSTAGATTAATGTTTAAGATGGNTCAAATAC
AAATCTATTTACAGTATTAATTGTGTTAGTTACTTTGATAATTAGTAAAT
TATATCTTGTTGAAGTTTAATATTTAAAGTGTTCAGATTTTGATGGACCA
CTCGGTAACTATAAGCCACCAAGATGGCGTGAGTCAAAACGCTTTACAGC
ACTAATCATTAAATCTGTAGTTAAATAAGAATTATTACACCAATTATAGC
AAGATTTATTTACATAAAAAAATAAATTAGTTATGCTTATCAAATGCAGA
GTTTAATAATAAAACCCTCATAGTATTTTATAATAGTTGTGAGATATTTT
TATTTGGTGATATTTCATACTACAAAGTCCAAAAAATATCACACTTTTCT
TCTTCTTTTTCACTGAGTATCATTAGCCAAAATTTACAAAGAGAGATTGA
ATTAATTAAATAATAGTATTTATTATTTATGTTTTTAGAGTTGCAATGTT
CAATATCGTGTTTTTGAATAATAATTATAATTTGATATCATAGGTACAAC
GAATGGTTATATACTTAAGTCAATTAACGCCTTGGGCCCTAGCTCAAATG
ATCGTGTGGAGAGTGTCATTATTGAGGAATTAAAAGTGTTTGAGAAACCT
ACTATAATTAAGAAAGTTCAAGTTGTTGGTGGTGAGAAAGAGGGTGGAAG
ATCATTGGGTAAATTAGTTATCATGTCAGATGATGAAATCCGTTCTTTCC
CAGTTCAAAGATGTGATCGAGCTACCACATGTCCTGAATGTGTAGCTTTA
AGAGATCCTTATTGTGCTTGGGATGTACGTTCCGCCAGGTAATTTACTAC
TTATAAACTTGATACATTTTGGGATATCTCTAATTAATAGGTTCTTAATT
TTGATAGGAGTCATTTCTTGATATTAATTTTTGTCGGGAATATAAAGGGA
CTGTTACTATAGTTATTTAACATAAAAGAAGCAAAGCGGTTAAAATGAGA
GTTTTTTTATTATTATTAAAATGGTTAAATCACATCTTAGATCGCCTTTA
AATATCTTATCTTTAAATGATCATTTATGCAAGGAATTTTGCATTGTGGA
CTCATATAAATCAATTAAATACTTTCATTAAATTAAATCAATGTATTAAT
TAAAATAGTTAATAAAAGGTCATGCGAAGAGATAGTAGTTGGGATAGACA
GAGGAAAGAAATACAAATGCCTTAGGCCCATGTATTAAGGTATAATACAT
TTGAAACATTCTTCGGACAACTACAAAGTTTTAAACATTTGATTATACTC
ATGAATTTGTTTTGTTTGCTCATTATAAGACAAAGCTCCACTCTAAAATC
AAAATTTAAGATGTATCATATATTTAATTTAGAAACTTTTCAATCTTACT
CACATTGGTACTAATTAAACGAACGTTGATCTTGTTATTTATTTTTTGAT
CAAACAATAAACTAAACAAGTGTCATGACTTGTAATAGATGCTGAGATAT
AATTAAGGGATTTAAAAACTAGAAGATCAAATGGACAATGATGAATCATG
GAATTATAGGCAAAATATGAATTCCATGGATCAACCAAATATCAAATGAA
TTAAAAAGAAGAGGAGTTATTGCACTATGATTGAAATTCAAATGACTCCT
GCCTTAATCCCCTAAAATCTCATTAATACTTTCACAGGGCACACAACCTT
TATGGGCTACTTATTTTAAAATGATATATAGCTTTTTTCTTAAAACAATC
TTTCTGATTATTTTTTTCTGAACAGCCTAAGGTGGTCACCACATAAATCA
GAACAAATCCCAATCGCACATTATTATGCGACAACAATCTAGTTGAATAC
CTTATGCCAAACGTCAGATTTCTGAAAAAAACAACTTTAGTGAATTTAGG
TTGCTAGTGGATGATTTTATTTTGAAGCGTATGGATAAATAATTTTAATT
TATTTTGTTTCTGTATTTGTGAGAAGGACTCGTTCTTGCTATCTAAGATT
TGTGATGTCCTCTGCAAACATAAGATACTCGTGAAATAATGATAACTTAC
TATTAGATCCTTTGTGTTTATACTAATAAACAGGATTTGAAAGTTGCGGT
CAATTTGACCACCATCGCTATTTCAGGCATTAAGAAATTTCCTTGGTTCT
AATGTTAATATTTATATGATGGCTTTTTTCTGTTTACTGACAGTATGGAT
TATAGTCTCAGCCATGGTATTCTATAGATCTGAAATATTCATGTAGAATA
TTTATTCTCACATAGGGAAATATAAAAGAAATTGTTGGTTGAAAAAAAAA
GTCTTAACTCATTTTTTACCCCATCATTTCTTTAAGAGGGAGAGGAAAGA
AAAACAAGTTAAGCTACATGTGTGATTATTGGATGTGTCTGGAACTCCAT
GGATTAGACCTATGTATTTTTAAAGAACAAAGTTTGTCAAATTAAGATAT
CAGGAGTTACCTACAAACACTTGAACATTGTACGTCATGTGATCAGTCTC
AAGATTGATTTTTAATATGTAGACATATCACAAATCGGATTTTATTCTTC
TAGACTTCTTCCTTTTGGGGCTACCTGAAGGACTAGAGAGGGGTAAGATA
TCTTGAAATGATGTTTATCAAAATTTGGTACCTATTTTTCTTTAAATTTG
AAGTATTCTAATTGTTTTATGACTGATTTTTTCCATTATCGATCAAATAG
TTGTATGGTCAGAAATTATGTTTATTATGATTTTTATAGGTGCGGATCGG
GTGACTGGACTCAAAATATGGCTTRTWGTTTTATTRAATCCSTGTCTWCT
GGAGAGCATTCCCATTGCCTTGCTGAAATTGTTGTTCAAGATGGTGAAGA
AGACAATAAAGGAAAGTGGTATGATCGTATTCAACCAGTTGGTCTAGTCA
TTAATATTGTAAATAGAGAGAAAAATTCTTTGTCAAAACCAGAAACAAAG
GATAGAACAGTCTCTCAAAACAATCCTTCTGGTGTTCAGGTATTTTATTT
TCAACTAAATAACTATATATATATATGTATTAATCTACATTATTGTTAAT
TATAGGGAGTTGAGCCCAATACTGTGTTATTCTCTCTTGAGACTTTAGTC
ATTACTGTGTCTGCAGGAGCTGTCGCTGCTTTGGTAGTAGGCTTTGTCAT
TGGTTACTGCTGTGGMAGGAAATGTGGGAAAGAGAGTGGTGTTCKCCTKC
CTTATCCTGACACAGAGTATGAATACTTTGAACAACGCCAGGGCTTAGCC
CGCCCTTTGGCTCCTTTATTACCAACATCATCTGACAAACTCGATCCAAG
AGATCAAGAAGAGGTAAGGCTTTATACAATGCTCCTTTATTTAAATACAT
ACCTTTCATTTATACTTCTAGGTCACATATGCAGAGCCAGAGCTTGTTAG
CCGACCGGTTCCTTCTCATTTGAATGCCCTTAATTCGGGAGGAGGAAAAT
ATTACGATGGTGATCGCTTTGGCAGTAGTCATTACTCTAGTTCCTTACTT
CAGCCCAATAAGTTCAATACTATCCATAGTAGTGTAAGTAAGCGTAATAA
GGCCCACAACGATAGTCTGATGTTGGGAGGTGGTGGAGGTGTTGGCGGAG
GCCTTCACTTCATCAATGAMCCTCCTGGTGTTCCAGCCACGCTCTTCAAC
GCTGGAAATCGAAGAGAAAATATTGGACCTAATGTCAATTTCCAAATGTC
TACATTGGGACGTTCTTCCATGCGAAATAATGGAAAATCTAGTGTAAATG
GAGACTCTTCCAACGATGGGAGTCAGCCTCAAGTAGTGGATAGTGCTTAT
GGTACAACACGCTCTGTTAAGAAAGTTTACTTGTAAAATGATTTTCTTCT
GTTATTACTACTACAACTATTATTATTATAATATAAAAACCGTGAATCTC
TCTACAAGTCTGGCCCCCTTTCCTCCTCCATGCAAGCTATTTTAAATACT
TCTATTACTATCATTAATTACCTCTTTAATTCAAAGAAGCTTAAAGTTGA
GGGAATACAGATTTTTTATTTTTTTTTTCCTTTTTGCTGATATCCCCCCC
CCCCCTTTTTTTTTATAGAAAAAAGAAGAGGAATTGCATTATAATAATTT
AAATGATCTCAAATGAATGGGACTAATGGCGGCAGTGATGTGATGCCCCT
TGTGAAGAAAACTCCCCACGACCTTCCATTTTTTGTACTCAACTRGTGCA
ATATTCTTACTACTTTATAATATTACTTCTCATTCCTCCTTTCGGATGAG
GGAAGGACCCTTTCTGCGCGCAACACTTTTGAACTAATAATAATTGCTCA
ATCATTTTATAAGCAAATGGTTGTATGCAACTCGAGCCCCCATCTACGTC
TATTTTATACAAATAATATGTTATTTAATAGTTATATATTATACGTATAT
ATTATATTAACTCTCATCTTTTTTTTWKRTATTTATAAAAGTAAATGGCT
GCTCCATTATTTTCTTTATTTTATAATAATTAATTAATTCTCTTATCAAC
TAGAACATCATCATATCATTGCTGCCATCAACCCTTTCTCTCTCTCTCTC
TCTATCANGTCCCCATTTATCTCATTATTTCCTTCAGAAACATGCCTCAA
AGAATACTCTATCCCAGTGGTTCTTAAATTCTTATGAGTTCCACCCTTCA
AATATGTGGCTAGACAATGTTCGATCCCTACACCTCTCATTGAGAGATGC
ATTTAAAATTTGGAGTGCATTTTACGCAAATAGATGACTTAAAGGCCATA
TAATCCATATAAAGTTCAACCCAGAGGATGATAATATAAGTTATTTAATT
TCATTGATCGAAAATAAAGATTTTAATTCTAC back to top
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