EMLSAT00000009140, EMLSAT00000009140-704987 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000009140
Unique NameEMLSAT00000009140-704987
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s575supercontigLSalAtl2s575:76921..96103 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000009140 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000009140EMLSAG00000009140-691906Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000040578EMLSAE00000040578-749506Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040579EMLSAE00000040579-749507Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040580EMLSAE00000040580-749508Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040581EMLSAE00000040581-749509Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771510auto771510Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000009140EMLSAP00000009140Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000009140

>EMLSAP00000009140 ID=EMLSAP00000009140|Name=EMLSAP00000009140|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=269bp
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IGVDFLEKHITASGEDVRLMLWDTAGQEEFDAITRAYYRGAQACVIVFST
IDRPSFAAVKKWKRKVEDECGHIPMVLVQNKIDLLHETQVDNTEIEKFAR
NMGLKLFRTSVKENLNVNKVFQLLAERHIESVSRWSNEDPDRVEIGGFFG
GGEGVRVTFAGGSPTILNGHESSRRIWSSSSPPTMHRQLHHPSCCSNRNQ
KNRRKRIHNNAFHSACKMI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s575:76921..96103-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000009140-704987 ID=EMLSAT00000009140-704987|Name=EMLSAT00000009140|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19183bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s575:76921..96103- (Lepeophtheirus salmonis)
CCTAGGAACATCATCAAAAGGGTTGTCGGTTCTATTATTATGATATTAGG GGAAGACAATGGTTTCGATACGGATGAAGACTATGAAATTGCAATAAAGG TATATACATCATACATATACGGCTGTCAACATCAACNTCATAATTAAGTT GAGTGACTTGACTTTAATTCATGGTACATAGGTAAGATGTAAGAACAACC ATCTGTTTTCTTTTGAAACATTTTTCTCTCTTTCGTTTTTATTTATAAAA AATGAGAGTTATATATATATTAGGGTGTCAATCCATTTGAAGTGAACATT ATAAGTATTATAAATTTTTTGTACTTTTTAAATTTCAAATGTGTTCATTT TACTGTAAAATCGTTGTATTATTCAGAAATGAACGATTTTTTATTGTCCA TCTGAGTGTAAGATGTGTGTTCAAATTAATGTAAAATCTACTGAATTAAA TTTTTCCACGAAAATTCAATAATAAGTTATGATTATAAGGAAACTTTAGA TAATTATTTGATTACAATGAAGCTATAAAGCAAATATTTAATTAAATAAG AAAATAATTATTTTGACTGAATCCTTAAATTATTTGGTTTAACGAAAGAA ATCAGGAGGAAATAATGAGTTATATATTACTTATCCTTTCATTAACATTA CAAAATACCATTTTAGAAGAAAATTATTGATATAATTTTGTATGTTCAAC TAAAAAATAAATATATATTTCTCCATGTTTTTGGATGGTAATGAAAAAAG AGGACAATCTTGGTGGTTTTTACGTTATTGGTATAGGGGAGTTAGACCAA TTAGATATAAATAAACATTATAGTATTACAATTAATTCATCTGACCTAGA AAATATTTTACAAGTCAATATACATGTATATTTCCTTCTCTATGAGTGAT AGGTAATCAAAACTACACACATTGAATTCAAGAGAATAACTTCTCCTTAG 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