EMLSAT00000009176, EMLSAT00000009176-705023 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000009176
Unique NameEMLSAT00000009176-705023
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s57supercontigLSalAtl2s57:696472..732745 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000009176 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000009176EMLSAG00000009176-691942Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000040732EMLSAE00000040732-749660Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040733EMLSAE00000040733-749661Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040734EMLSAE00000040734-749662Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040735EMLSAE00000040735-749663Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040736EMLSAE00000040736-749664Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040737EMLSAE00000040737-749665Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040738EMLSAE00000040738-749666Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000040739EMLSAE00000040739-749667Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779496auto779496Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000009176EMLSAP00000009176Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000009176

>EMLSAP00000009176 ID=EMLSAP00000009176|Name=EMLSAP00000009176|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=970bp
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TLSPNDEGVTLSPITDYHQNNKGRVGIQIGSKESMNHFLLHLKYLDVKMV
KMYTGHINFQPPFQDENTDLINQEVSLLSTFEYKKHEFFVFKTVDIMEAN
NYTLYLEFNGSLTRGFVGFYKSTYQNGNGRMVPIATSKFQPTSAREAFPC
FDEPSFKSTFTVSLIRPSDNYIALSNMPVEESVKDYPSHGSTLVKFRKSV
PMVTYLACFIVCDFEYKEKYTALHGTKFRVYAPPNQKHRIKYALDIGANV
SDYYVDYFQISYPLPKQDMIAIPDFVSGAMEHWGLITYRETALLYDNLES
SSKNQQRVAAVISHELAHQWFGNLVTLAWWDDLWLNEGFASFIEYKGIHH
YHPDWHIHEQFLTSDLHSVMELDSQITSHPIIQDVAHPDQISEIFDKISY
NKGSSILRMLENFMGDEEFRIGVSRFLDKYKFDNAVTEDLWTELEKISSQ
NLPIARIMRTWTKQMGFPLITVSRIKDNMYRCSQSRFLSNPESESLSTSS
PYNYKWEIPLTWINENKEVQRLWLTPEEEFVEISIPSSLRWLKFNEGQYG
YYRVNYPTNEWEEFAKLLETKSDVLGVTDRSNLINDAFALANAGLLNYSI
TLSLLKYLPKEFDYVPWATAYESLISVGNLLRETRAYPGYRKFVLSLTRE
HYVRLGWLDEGSHIEKLHRIKILSLACRFGDKDCLKEAQKQFERWVLEKN
IYIPPNLRSLVYKYGMYSDGSFESWNILFERYKNEINAQEKSKLLYGLAW
PRDPWILNNFLQLAKNESVIREQDYFTTLTYINSNPIGKPLVWNFIRDHW
SQIIDRFSISARSLXXXYPNLQLNLIWKKLIAFFSSIPREGLEQGVESRV
LKKSTITSTGSKSIKKTLNLGYHQTATPKKFLLFFFYITELLNYYPYKIA
YLYKIIMINYVIIIITSINT
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mRNA from alignment at LSalAtl2s57:696472..732745+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000009176-705023 ID=EMLSAT00000009176-705023|Name=EMLSAT00000009176|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=36274bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s57:696472..732745+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATCGTAGAGTAGAATCCATCCATCCACACGCATGCATATCCTCTACTGAA CGTGTACGCTTTTTTAAGAAAAACGTTTTTTTTTCTTTTTTGAGAATGCC CAAGATTACTACTTCTTCATAGAAGTATTACTACTACCTGGTTATTATTG TGAAACCTTTGCTTGAGTGGGCAAATAAAGATTGAATCTATAGCATTCGT TTTCCTTGTCAAAAAATATAAACTCAGCATTACATAAAACAATCTCAAGG AAGGACGGTGTGAATTTTGTGTGTTTGTTAGTGTCCTCTTCTCTTTTCGG ATGATGAATGGAAGGGATAAGAAGGTAAGAAAGACATCTCTCCTCGGATT TCCTTTAAGACAATTAACCATCAAGAAAAGAGAAACGTTTTTTTCTCTCT CCTTTTATACGTAATAGTATTTCATTGAATGCAAAACAAAACTAGTTATT TTATATTTGGTAAAATTTAATTGATCGCCCATTGATTTATATCATTCTTA AATTTATTGCTTACAAATATTATCTATTTTATAATTACTGATCATTCGTC ATTTGACATCTCAAGTGCACAAAAATACTAGTTTCATTTTCTTCAAAACT GATAGTACTTACTTGTGAAAAGGGAATATTGAAATTATTTTTGTCGGCAT AAGAGACAAATGATTTTCTCAATACACAGTTAGTTTTGAACAAATTGTTT TTCAAGTCCTATCTATATGCACGTGATTTTACTGCGTAGCATAAATACGT AAATGAAGGTCAAAAAATGATGCATGCAGTAGAAAGGGCTTGAAAAATAG CTATAATTTGTCAAGAAACAAAATATGCCAAAAAGATGCAGTCATTTTCA TTAAATACATGGAGGCAATAAATAATTCACAAAGAACAGTGGTTCTCAAA CCTTTATCGGTGTGTAACGTTTATCCACATACCAATGGATCAAGCCTAGT TTCATTGAAATATATCAATATTCTGTGGTTTTGTTGCTATTTAATTTTCG CAATTCTTATTCCAAGGGTTAATCTGTACATTTTTACGTATTGCTATAAT CAATTTTGCAACAAGTTTCTTGTTAAATATACTTACATTTTAGAATTAGA ACGAATTGATCATGTAGAGATGAATCACAGTAAGGTCTATTTTTTAACTT CAGCTAGGATACAAAACACTTGGAAAAAAAAAATATTCACTTCTATGTAA AGTCCTTCATTTGACTAGATTTTTTAGAAATTGGATGGATTTTTTATTAA TTGTAATCAAGATTAAATAATAAATAAGTCATTTTTTAAATGCTGAAATG TTTGTATCAATTTGTTACTTACTTTGATTTTCATCTATATAGTTATTTCG TGTCGAAATATGGCACTGAATCGTAGCTATGCCCAAAAAAAATTGATTTT TTTTAAAGCTTAAAAAGTTTTAATGGCCATTTTCGTGTTCGACGGCTTAA ATAACAATAGTGTAGGTGGGTTTCAGTCTACGGGCATTCCATGACCTTCA TTTTGTTACATAGTGTAATTCATCAGCGCAAATCCATTTTACTAATTAAA TGAAATAATTAATGTAGCGAACTTTAGCGGCAATTATGGCTTTCAGGTGC TGGAGGATGGCGTGGCACCCGCTGGGGGMGTAGTCTTCTGTAATGACGTA CAGTACATGCTGTAGTCGAAAGGTTGGGAATAGGGTAGTAAAGGGGGGCA AAATTGTCAAATAAGAGTGCAAAAAAGAACTCAAAATAATCATTCAATGG AGTCTTGCAACAAAAGAGATGGGTTCTTTCATTTCTATGTTAAATGTGAC CTATCCACTCCATAAGTCTTTTAGCACCCACTTTTTTGATAGCTCTTTGG ATAGTCCGGTGTGAAACTCAGAGATCTCTTAAATGGGTCCTCATTGACTT GAGGGAATTAGACTAAGGTGTTGACTTTAAATCTTCCGGGTCCATTTTGG CCTATTTTGACAACGTTTCGGACCTGCTGACGACATATAAGGTGGTCCTG GAGACGCTCAACAACTCAGAAGGCATGAATGGAAATTTGTCGATCACTTT CAAGTGTCATTTTCTCAACTTGTACGTAAGCTATAGAGCGCAAGTGTTAT TTATCTTGTAACTAACTTTTCTTGCTTTAATATCTCTAAATCTAAATTAA TCTAAATCACTCAACCTTTATTAATTATTGATTTATAAGGTGTTTAGATT TCAATAAACCGCCTTGCATCCCTCAAAAAAATTGAAATTATATGTCCGTG GATGAACTTTATTTGGAAAGAAAAAACAGGGTTTACTAGGAATGTATTTG CCTAGTACCAATAACTCCATTGATTGAGAATTGGCTGAGAATAGTTGGCT AACAACTGATTGTGTGCCTTTTCCCTCTGAGGAAATTTTGTTATATATTA AAAATATCAAGGGGGGGGGGGGGMGTTATTTAAATATTTTTTTCTCCTTA TTCAAATTTGTAATAAAAAGATGGATCTAAATAAATTGACGATTTCCCCT CATATGTAACTCCATTTTTTTCTATATATAAATATAAACCTTGATTCTAA GTCTTTTATATGAACACATGCATTAACTTTTAGAAAACCATGTAATGGTT TGTTGAAGTAGTTCATATTTTACTTACTTCAATTGTAATAGAAAAATAAT TATATGCCTAGAGAATATACTTACAACTCTATAAAAGCAGGTAGATTAAA ACAAGAATGTGTAATCAATTTGAAAAAGTAAATCTACTACTTAGTCCCAA GAAGAATAAATATATAGTGTACATATAACTTTATGTTAATTGCTGATAAT GTAAAACTTAATCGGATTAACTCATTACTAAATTTTAATTATGGAACACT AATTTTTACCCTCAAATCGTTACCTTTTTACCTCATATCTGATGCTGTAT AGCATAAATTGATTATGAATAGACAACTTTTTTTTTTCATATTGGATCCG ATTTTTGAATTTTTTCTATTTTATTTCTTATTTTATTTAGGGAAGACTGA GCAATGTTGTAACAGGGAACAATAGTAATATGTCATTTTTAATATTAAAA AAACAACTATCACAAAGTTTGCATTACAGCTTATTATTTCTTACTTTCAT CATTGGGGTGGGTTTAGCCCCAAAAATTATCAACACTCTTATATAAATAG GTTTACAATATATACAGGGTGGGAAATTTGAATCCGGAACAAGGTTAAGG CTCAATATCTTGGCAATCCTGTGATCTATGTGTATGAAAATCTGCTCATC CGATTCAACTGACAAAACTATACATGGAAAAATCGAAAATATTTGAGATG TCCTCCAAAGAGGAACGCCCTGCATTCATTATTATGTGCATCCATGTCCC AATCAGACTATTGAGTTTACGAAGCTGCCTAAATCAACTTTTCCCGAAGT TGATAAGACTTTCAAGGAGTCTGATGGGTCGGAAACGTCTGCAAGGAAGA CTCAAGATCGTTTTGAATGCAAAAAAAAAGAAACAAACTCCAGACTTCCT TATGCAAAAAGGCAAAGGAAATGTGGTCTTCTACCTCGCCGAATCTGAAC TCCTTGTACTATTATGTGTGGGGCGTTTTGAAGGGAGAGTCCATTAAACG TGTAGATTGAGGCCTTCAATTCTTGAGGCGATGCCCCACATTGACAAGGA GTTCCTTATCATGGCCTTTTGGATACTGTAGTTGAAGCTGGAGGTGTTGA ATTTAGTGATTGACTCCAATATGGACACTGTCATGTAAGAAAGAAAAATT ATAAATTGTAGTGATAATTTTTGAAATTGTATTTTTCAAAACACATCATC 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