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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s57 | supercontig | LSalAtl2s57:696472..732745 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000009176 >EMLSAP00000009176 ID=EMLSAP00000009176|Name=EMLSAP00000009176|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=970bp
MMTPETRVRLLSIVSVTLTVVCVGLIIALSVVTPSNGLDETKSSHSPSKA TLSPNDEGVTLSPITDYHQNNKGRVGIQIGSKESMNHFLLHLKYLDVKMV KMYTGHINFQPPFQDENTDLINQEVSLLSTFEYKKHEFFVFKTVDIMEAN NYTLYLEFNGSLTRGFVGFYKSTYQNGNGRMVPIATSKFQPTSAREAFPC FDEPSFKSTFTVSLIRPSDNYIALSNMPVEESVKDYPSHGSTLVKFRKSV PMVTYLACFIVCDFEYKEKYTALHGTKFRVYAPPNQKHRIKYALDIGANV SDYYVDYFQISYPLPKQDMIAIPDFVSGAMEHWGLITYRETALLYDNLES SSKNQQRVAAVISHELAHQWFGNLVTLAWWDDLWLNEGFASFIEYKGIHH YHPDWHIHEQFLTSDLHSVMELDSQITSHPIIQDVAHPDQISEIFDKISY NKGSSILRMLENFMGDEEFRIGVSRFLDKYKFDNAVTEDLWTELEKISSQ NLPIARIMRTWTKQMGFPLITVSRIKDNMYRCSQSRFLSNPESESLSTSS PYNYKWEIPLTWINENKEVQRLWLTPEEEFVEISIPSSLRWLKFNEGQYG YYRVNYPTNEWEEFAKLLETKSDVLGVTDRSNLINDAFALANAGLLNYSI TLSLLKYLPKEFDYVPWATAYESLISVGNLLRETRAYPGYRKFVLSLTRE HYVRLGWLDEGSHIEKLHRIKILSLACRFGDKDCLKEAQKQFERWVLEKN IYIPPNLRSLVYKYGMYSDGSFESWNILFERYKNEINAQEKSKLLYGLAW PRDPWILNNFLQLAKNESVIREQDYFTTLTYINSNPIGKPLVWNFIRDHW SQIIDRFSISARSLXXXYPNLQLNLIWKKLIAFFSSIPREGLEQGVESRV LKKSTITSTGSKSIKKTLNLGYHQTATPKKFLLFFFYITELLNYYPYKIA YLYKIIMINYVIIIITSINT back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s57:696472..732745+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000009176-705023 ID=EMLSAT00000009176-705023|Name=EMLSAT00000009176|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=36274bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s57:696472..732745+ (Lepeophtheirus salmonis) ATCGTAGAGTAGAATCCATCCATCCACACGCATGCATATCCTCTACTGAA
CGTGTACGCTTTTTTAAGAAAAACGTTTTTTTTTCTTTTTTGAGAATGCC
CAAGATTACTACTTCTTCATAGAAGTATTACTACTACCTGGTTATTATTG
TGAAACCTTTGCTTGAGTGGGCAAATAAAGATTGAATCTATAGCATTCGT
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TTCCAACAACTTTAATTTTCTGGGAAAAGCTATGGATTTTAGAGATTTTT
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TTACAGGTTTTAATTGAAGAGGATTTACACTTCGGTGTTTCTTCTACTCA
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GTTTTTTTCCATGATATACTTTATTTTTGTTTTTTACCCATAAAATATTT
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AGACTTTCAAAAAACATCATTTTTTTCGTCCTATTTTTGTACTCACAAAG
GATTTTTTCCCATTCAGATCAAAATACAGAAATAATTAAAATATTTTTTG
AATCTGGATACATGAGCATACAAATTATATTTCATATTTTCTGCTTTTAT
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GTATGTTGAATGTATTTTTCATGTTTTTCGTCTTAACTTTCCGTGCTTTA
CATACTCATATTTATGAAAGAGCTTCTTATTCCTAATAATTTACATTTTA
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AATTTATTTTGATAAAACCTTATTTCAGAGTTTTAAAAGTTAGAGTCGGT
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GGGTACAAAAATGTATATAAATTATGTATACACAACTTGTTTATAATCTA
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AGGTTTTACTACTATTAACTTATGAAACTTGAAATTTAACTTATTTATAA
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AGCCATACTAATTCATTACTTAGTCTTCTGAATAGTCAATATCATCAGAG
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AATTAAATACATGTTTCTTTTTTTACCCAGTTCACTAACTACGTTATAAA
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AAAAGTTAGACATGATATTAAACAATAAATTTATTCAACATGTCTTCCCT
CAYCAGCCACCATCTTCTCCATCCTGCCCCTAAAGGATTTGCATGCCCTG
ATGACTTCCGCGGAATCGACAGCATTCCACTCCCTCGTAATGGAGCCCGG
GAACTTTGTGGTGAAGMCCGCAGGGMCCTCTTCTCTCTCTTGCAAGCCAC
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GGAGAAGAAGATGATTCTTCCTTCATGGCTCTTCAGGTCATCGAGGAGAC
GTTTACACTTTGGTGAGCCTGGTGACCTTCATGGATGCCGTGAGGATGTN
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AAAGAGAGTAAAATTGTCGGAAACCCCCAATTATTAAAATGACTTTTTTT
TGTTGTTGTTGACGCTCATGTCTCTTCCGCCTGTCGTCATGAAGATCCAA
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AGTGACTTACATACAACAACGTTTTGTCCAAACTTGGGAATCTTCTAGAA
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AAAATCTATTCGTCGTGAAGGAAAATGATTAAATAGCGTCATTATTTATA
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CCTTTACAAAAAGGAACAATCTAGTCATTTGTACTGGTATGATAAAAAAC
GATATCTTACGATGAAGAAAATATTGAATGAACAATAGGAATCTACTTAA
GCTAATAGACACATTTTGCCACTTGGTTTATAGCCTTTCATTGAGAGAAA
TCATTGTAGTTCTATATCTATAAAGAGAAGTAAAGTTACACACATGTCAG
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ATATTTGTCAAAGAATAGAGATGTTTAAAAATATGTGATACTACATACAA
GGGCCAAATAAAAATAACTATACTTCATATGTTTTGAGCAAGTTACAATA
AAAAAAATATGATAAACCATTTAAAGTGAGAAATCTAGAGATCTTGTGAT
AAGCATAATTCAATTATGGCTTTCCTATAGGATAATTGCCATAGCACTTA
TGTTATTTATGACTTTTTTTCTTTTGAAAAGTAATCATTCATAAATATTA
TCGTGCACAGAATTCTAAAATTTATATAAATGGATCATGATGACAAAGTT
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TTTGTTATATGTGTGTCAAGTATATTTAGCTATAGTTTTTCTTCTCTATG
ACATTTTTCCCAATCAATCACAGCCTCTACACGCCGAGAGACAGTTTTTC
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AAAATGTATTACTATCTAAAGAATATTCTTAAAATAATATCAATAGAGGG
AAAATATTGTCAAATTATATTTAAACATGTAAAAGATTTTATCAAACGAC
ACGAAAAGAAGTAAGAAATTTGTCGACAATATATTTAAGAAGAACAAAAA
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TGGCACACATTTTGAATATATTTTGTATGTATTTGAAGATATCAATCTAC
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AGATGCATTCGATTCCACTTACTACTACAAACGAAAATGTTTGCGTAGGC
AGAGCGAGTTTATTAACATATCCCGTTTTCCCTTTTCAAATCTAAGAAAT
ATTATTTTTCTTTACATTTTCCCATCTCCATTTAAGTGATAGTATCAGGT
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ACACGCCCTCTTACCTCTTTGTGGTTTGCCGGGGTTATCAGAGATACTAG
GCATGTTCAAAGAAAGGGTTAAGGAAGGCTACAGGGTAACAATGAAAGAA
ATGGACTCCTTTTTTATTTTATATATGTATCCAGAAGCTGACGAAGACGG
ATTGATGAGGAAATGCGTGCACCCGCAAATCTACGTTAACTTCTCGCAAA
TGTTTTCAATTTTTTTTTTAATACTTCTTGTGTATTCTTTTTTTTTCTTT
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AGGGGAAACGCGGAGGAGGAAGAAAATCAAGGAAATAACCATTTTAATAA
CTTAATTTATTCTTAATTTTTATACCCGTTTTGAAGCTTCCCAGTGAAAA
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TATGTGTATTTTATTATTTATATGGGCTTATTTACATAGCCATTGATAAT
AATTATGTTCGCCTATTTTGGTTGAGAATAAATAGAAGGAAAAAAAAAAT
AATAATAATAAAAATGATTGGTGTTATACCTAATTAGAAAAATATGATAA
ATTGGAAGACAAATTGCAACTTATATCGAGCCCCAACTTGTACAAAAATA
ATATAATAATTATATAATTCAGAATCCATGAACCTATAGGCTCCATTTTT
ATTGTTATTTCAACTTGAACGCATAATTTGATGTTATTCTAAAACAAAAT
AATAAATCTTTCATATCAACTGCGAAACAAATGTTTTAATACGTCAATGT
CTCTTTGAACATACATATGTATTTGGAATTCATGAATAATAGWWTTTTTT
TTTTTTCCACTGTTATGAAAGTTTTTCTTTTTTTGTGTATGTACAAGGTA
CCTATATGTTTTCAAATATTTTAACTGTAAATTCTATAACTTTTGACGTT
TTTTWTGCCGGCACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TGAATTTTGCATTACCTAGATAATACATTTTGAATTCAAACAGTTTGCAG
GATTTCTTATGGATTTTATTAGTTTTAATTATTTAGTGGCATTAAACTAT
CGGGAAAGCAGGATGTTACCTTACTAACACAAAATACCAATTTTATTACT
TTGTCAGCTGTGGAATCCCCTGTCTTACTTGAAACATTATGGTTAATGTA
TAATTCGTTCCTTTACGACCCTTGTCGGAAGGGGACATGTGGGTCCTCTT
GTATGAAAACAACCCTAAGTATTAACGGAAAAGTCATAGGGGTGGTAATT
CATCGATTTGGTGCGGTTCTACTTTATCTCCTTCTCCAAGCTGGACAGGA
ATTCCGTATCCCTACTTCACAATGTCCATATCATCACACCTTAGCATCAG
GATCTAGAAAATCTGAGATGCACTACCTTTTACCTTCTTGCTCGCTCACG
ATGACGAGATAACAAAATATGTATTGTATATCGTTTGTTTATGGACAATG
AATGAATGAACCATAATATCAAAAAATAATCATTTTACATTTTTAAAATA
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TATTGACTTATTTGTCTAACTATCAGATGATTTCCGTCCTTTTTTCTGTT
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