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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s59 | supercontig | LSalAtl2s59:489485..501247 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000009377 >EMLSAP00000009377 ID=EMLSAP00000009377|Name=EMLSAP00000009377|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=365bp
KXXXSIIKNWNELSDRFGLDEKEKTECIEGFDIIHPRSNNRYKKHILGIY
LGKDIDRHGLASYEIWRRICFKRRMSRFSKEEEELILKRVEELGKSSQAF
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YFLTIMSRNIIKKVGRKDLSFQEILENAVRLNYSARSPLISTVIRNDILV
DIYENIKKSKQIKKC back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s59:489485..501247- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000009377-705224 ID=EMLSAT00000009377-705224|Name=EMLSAT00000009377|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11763bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s59:489485..501247- (Lepeophtheirus salmonis)
AAGAANNNNNNNTCCATTATCAAAAATTGGAATGAACTCTCTGATAGGTT
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CGTGACTCTAGTATTCTTGAAAAACATTGGTAAGTGCATAATAATTATTA
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TCCTATATGAATACCATGGATTACTTCCTTTAGGAAAAGTTGGAAAGGAA
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TTCAATGATTTTTTTTCTTTTGTATTATTATAACTTGTAAATGAAATTTC
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TGTAGTAAAATGAAAATCGTTTTAGACCTCCATTCTCGACGTACGATAAT
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TAGTTCCTTAAATCAGGGGTGTAACTAAAATGGATATTACAGACGAGGCA
CTCAAATATACCCTATTTTTTTAAATTTCCTTTGATCAGGGCCGTGACTA
AAAGTTCATTGCCGAATTTGTGTGATTTTCTGAAGAATTTTAATTTTTGT
CGAAAGATTTAATTTAATAAGTCGTAATTGTGTTCCTATGCCCTTCTAAA
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AATAAAATATATATTATTTTTTCCCTGCCTCAATGCTATTTTCTCTTCTT
TATAGCAGTAATTCATTTTCTCATCATAAAAGTTATATAACAGGCAGTTG
ATATTAACAATGGTCGTAATTCAGTAATAATAAATGTCTCGCTTCCGCCT
TTTCCTCCCCCTCTTACAAAGATTCATTCTCACATCATAATTTATGTTCC
TTTTAGTTAAAATTTAAATAAATAAAAAATACTAATTTGTTAAATTGATT
TTGTTTGTTTTTGTTAGTGAGGGCTCCTTGAGATTTACAGTACTCTTTAG
TTATCCTTTTCTTCTTCTTCTTTTCCAAATCGTTTTAATACTCTTTCATT
CTTGAGGATAGAGTAGGTCATATGAATTGATGTAAGTATTGAGTAGTTAC
GTGTGCTCATGACAAATGTTGAGTAATTATTTCTTGGGGATTTATCTTCT
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TTATGAAATAATTAAATTTGAGACTCGATTACGAGAACAAGCTATCCCGA
GGGAATCTTTGGAAGGAACCAGGTACTAGACAGTTTAACTAGTCTTTCGC
TCCTATACCTGCCCAGCTCCGACGATCGATTTGCATATCAGAATCGCTGC
GGTAATATTTAGCCTTATGAAGATCCTACCTCACACTTTGAGCTGCTCAG
AATGTTCTATATTTACTCTACCCTTATATGTACATCCCCGATAAACGAGA
TCCCAGGAGAGAATCTCTTACTGTGCCACTGTTTGAAATTTTCAGGAACT
AAGAGTCCTTCGTTCGTTGAAACAAGAAAAGAAACAAAAAACAAAAATGC
TTTCCGACATATTGAGTATAAATACAAAGTTTTAATTTTAATTGCATATA
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GCATCTTGGATGTAATTATTCAATTATATTTCAATTTATTAGTGTAAATC
ATAAAATTGATTTAATTATAGATTCTTATAGTAGTGTTGCTGGGTCTCAA
AAACTAAAAAGACTCCAGTCCGGTACTAATAAAGTTTGTCAGTCCTTGGA
CCGGTTCTTCATCATAATTCATAACCTCTTTCAAATAAAATATGAAAAGA
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GGTGTGGATTTTTGAAATTTTTTTCTAAAAATTAATATTTAATTTTTTTT
TCAGAAAGTTCAATATTGGGAATTATTTTCAAAACCTTTAGTATTTGAAT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNGTAGATTTTTTGAAATATTTTTCCAAATTAAAATTTTTTGC
AAAAAATTAAATATTCGAAATTATTTTCAAAAACTTTATTATTTGAATTA
TTTTTCCACAAAATTTAATAATTGAATTTTTTTTCAAGAAAACTGCCTGT
GAATAGCTATGAGTTTTTGAATTAAAAAAAATGTATATATTAATTGAAAT
TTTGGTGTACAGCTGTAGATTTTTTGAAATTTTTTTGCAAAAAATTAAAT
ATTCTAAATTATTTTCAAAAACTTTAATATTTAATTTTTTTTCCACAAAA
TTTAATAATTGAATTTTTTTTTCAAAAAATTAATTGTCTGTCAATATCTA
TGAGTTTTTGAATTTAAAAAAAAATTAATTAATATAATTTTTTTTGTACA
GTTMTTGATTTTCGAAACTTTTTTTGTGTTCAATTATGGATATTTGAAAT
TTTTTGAGAATAACTGTGAATTTTTTTTGAGCTTGACTATGAATTTTTGA
AAAAAAATCATTTTTTTTTCTTTGGATATTCAAAGAACTGTGTAAATGTA
ATACGAAAAATAATTGGACATTGATTAAGTTTTTTGAGTAGATGTATATT
TATAAAAGGGCTATAGGCGTAAAGGTGTAGGGGTTTCTTTTTGTTTTTGT
GTGTGGATTTTGCCCAAATATTTGTGACAAGCATTTTTTTGGTAAAAAAA
ACAAAACACTTACTTGACGTTTCTTGATGACCATTACTAGACTTTTATAC
AAAAGTATATTATTCTATTTGTCAGTGTCGGATTTTTCTGACCTCTTTTG
AAAAAATTGTCGCTCTGGGGGAAAAAATAATAAGAAAATCCTCTGAATTT
TTTTTTTATAGCATTTCTTTTCTAATAAAAATAGTCATTCGATCAAATTA
TGCAAAGGAGCAATTTAATTTCTTTAAACAAAAAAAAACAAAAAACCAAG
CCCTTTTGGATCCCCAAAATACAAGATTTTTGCGCACGCCTCCTGCAAGT
TTTTCCTCTCCTTAAATCGACATTTTGTTTACATACCTACAAATTTAAAA
GGATCATTATTTTGTTAACTATACAACTATACACTGAGCTGTATTTAAGA
CATTTACAAATTAGGATGTTTAAAATCATTAGTCTGGCAAAATTTCTTAA
TATTTTTGGTTATCATTACCCAAAACGCTGATTTAAAATGATTAGAATAA
CATATTTTTTTGATTTAGTCGGCTGTAAAACGCCTAGAAGGCTACTTTTT
GTTCTAGCCGATTTTCATGACTAATGAAAATCCTATCCCTACGTCTCCTG
ATGAAAATATACGACAATACGAATTTTTAGAACCAATACGAATTTTTTAG
GTATTTATTACACATTGCAGAGTCATCTGTTTGAGTGCTGTTGCCTTTAT
ACATACATGGTTGTACATTTGTACTTGATTCATGGATAGAGMAGATAATA
TAAACCTTGCATTGCCTTGCCTATCCTTATTTGATTTATTTTTTAATTAT
AATATACTCCCTATTTATTTCATTTATGGATCTCGTAAAAAATGCAATTT
ATGTTTAATAACAAAACACTCAAATTAGTCAATAATCAGTGTGCCGAGAG
GCCTATTAGCATTGTTAATCCAAATTAAATGTAATTGTAATACTCTCAAT
GGATATAAAGTGTAGTTTTTTCTCCCGTCTTTTTGCTCAAGGCATACCAG
AACTTATCTTGGCTACACAATTTATTCCTTTCGATTTTTCAACAGTAAAA
TTTAAAGAAGAGGTTTTGTGAGGACATTCATTTAACAAAATCCTCTGAAT
TTAGTACTCGCCACAACTTTTATTCAATATTTGAGCTCTAATAATTGCCT
CAATACGAGCCCAAAATCCCTTGCAGGCATTGATTATGTGGTCAGACTAG
AGGTTGGCCACTCTTCTGAGAATGGCCCACCCATTATCTTCTAGAGTGGC
CTAGATAGAGTAGTCCAAAGGGTTCACGTCTTTAGTGGAGGMCGGTCAAA
TGTTGAGGTCCCAAATAGTCCGGAAAGTTGTCTCTAGGAAAGACCTTGGT
CTTAGTAGTGGGATGACACGGAGCTCCGACTTCAGTGAAAACAAAGTTGT
CCCCGAACTTTTCTCTGGCCCAAGGTGTCACTTTTTCATTCAGAAGTTCG
ATGTAAGCATCTGTATTGAGCCGTCCCTTCCTCTCCACAAAAATAAGGGC
ATACTTCGCCTGGGCTGGCCACGGTGGTTTCATCAGAAAAGAGAACAACT
TTGCCAGAATTTTTGTTGTACTTGTGGAAGTTGAGAATCTTCTTTGCTCT
TTCCAACCGTCTCAGCTTGCTCTGTTCAAAGATAAGATGTCCTGTTGTCC
TCCTCCGTGATTTTGCACCAATGCCATTCCGGATTGAAAATAATAAAATG
TGACCACAAGTTAATATCAACCCTGTACTTATGTATATAAGACTGTGCCA
TAGGGGTAACACGTGAACAACAAAAAAAGAGCTATGATGGGCTTAGGTAT
AAAAAGGGATTTTAATACAAAGATTTCTATTTACCAGGTATGTGCCTATG
AAATGAGAATTTTTTTTTTTTTGAACGTTTATTGTGAAAAAATGCTTACA
AATTTAATTTTCCATGTATGCGCCTTCACTACCCACACATTTTTCCTCAT
TTTACAGACAATTTATGGATGCCTTTCTAAAAAGAATTGTTCGTCTTTGG
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CGTAAATTATTGAGTGCGTGTCCCATCTATGCAAACGAGCGATAATCAGA
CCGCGCTAGGTCTGGTGAGTAAGCAGCATGAGTAGAAGGTTCCCAGTTGT
ACGATTCAACAAGCTGGCGGATGGCTATAGAGCGATACGGTGGTGCGTTG
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TTTTTGGCGTTTGGCATGGTTCAAATCGGCCAATTGTTCTTGATAGCGAT
CACCATTAACGGTTTGACCGGGTTGTAGAAGGTAATACCAATGACACCAC
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AATCACGTCTTTGGAATTTTTCAAACCCCCTGAAGCACTGTGCTCTGCTT
AGAGCATGCCCACCGTAAGCTTCTACAACCATTTGATGAGCTTGAGAAGT
GTTTTTCTTCAATTGGTAACAGAAAATCAGTTATGRCCGCACATCGTAGT
CTGTGGGCACAAAATTAGATATTTTGASGAGCCAAAAAAGTGCGTTGTTG
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AAGCATTTATATTTTTGGACCGGTTGATAATTTCTAACTGCCGACACCTA
GGGACCAATAGCCATAAGTCTCTTTTCATAGGCGCATACCAAGTACATTT
GGCAACTTTTGAGATGCGTAAACTCGTGATAGCTCATTTTTTGGTTTTTT
GATACGCCTTTTTGGGTGATTTTAGCAAGCAGAAAAAGGTCTTTGTCCGG
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CATGGACACAACTTCTATTTCTATAGTTTGTAAGTGCTATGTATTATCAC
TAAGTCAGTTTACCAGCTTTTGATACTCGAACTCTTACGTATCATAAAAA
AGATCCGAGGTATTTCACAGATCTTCAAAAGCTTATATCATTGCTTAAAA
CTGAATCCTATTCATAAAAATAAGATATTATCTCAATTGAGTGTACACTC
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GCCTATACCCCTTGTCGCCTTTGCCAACTGCGCCAATGACATACATTATT
ATGTAGGTATTTTTATACCTACATGTGTAATGTGTATATACATGGTACCT
ACACAATATATTTATGTTAGAGTTCCGTTAAATGTGTAAGGAAGACACAA
GATGAAACTTTTAGTCACGATTCTTCTCTTAATTCTCCTTCACTGGCTCT
TCGCTTCTTCCTTCTTTTAAATACTTTTCAAAAAATAGCGCACAAGTTTG
ATTTGGTTAATAGTTAAATAAAATGTAGATATATTTATGTCAAGGGCTCT
AGAAAAAATCATCTTCAAATCACTTCCTGTGTAACTTGTGGATTTAACAA
ACAGAGAAGAAATTGAATTACTTCTTTCCTTGAAACGAATACCATTTTTA
ATTTATAGTTAAAGAGTTAAACTATTCAATATTAAATTGAAAGACTGACC
TCTGATGCACTTACTTATTTGGTACATTCAAAGCTACATTTATTATCTAA
TTTCACTGAAAAGCAACATGGGTGTTTCTATGCTTAGGGGGGTATAGAAA
ATCTTGGAGTATATGTAAATGTGTCTATTCATAGATTTGGATATCTTCTC
TAATAATTCGTATTTTATTATCTTCCTCCAGGCTCAAAGTAATTCTTCCA
GCACTTCTATCACATGAACTCGGACTATCCAACCAAAATTGGCAAATTCC
GCTCATTCAAATTCTTTTGACGTGGACTAAAGAGTCCAAAATCAGAATGG
CTCSTGATTTGGACTACATGGAACTCCTCGAACTTTTCCCTGGTCAGACC
AAACAAAGTATTCAATATTTCCTTACCATTATGTCTAGAAATATTATCAA
GAAAGTTGGTAGAAAGGATCTAAGTTTCCAAGAGATTCTGGAAAATGCTG
TTAGGCTGAATTATTCGGCGAGAAGTCCACTAATATCAACCGTCATTCGA
AATGATATTCTTGTGGACATTTACGAAAACATTAAAAAGTCTAAGCAAAT
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