EMLSAT00000009401, EMLSAT00000009401-705248 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000009401
Unique NameEMLSAT00000009401-705248
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s5supercontigLSalAtl2s5:561017..570903 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000009401 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000009401EMLSAG00000009401-692167Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000041781EMLSAE00000041781-750709Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000041782EMLSAE00000041782-750710Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000041783EMLSAE00000041783-750711Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto778591auto778591Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000009401EMLSAP00000009401Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000009401

>EMLSAP00000009401 ID=EMLSAP00000009401|Name=EMLSAP00000009401|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=77bp
MACTKQTDHRSNGGKAPLKQQTTKGARYSALATGSINKPNLYRSGTVAMR
LISLKEILNKMYILCNKTNFQSRTTDK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s5:561017..570903+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000009401-705248 ID=EMLSAT00000009401-705248|Name=EMLSAT00000009401|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=9887bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s5:561017..570903+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGCTTGTACTAAGCAAACTGACCATAGATCTAATGGAGGAAAGGCTCC TCTGAAGCAACAAACAACTAAAGGGGCTCGGTATTCAGCACTTGCCACTG GAAGTATCAATAAACCTAATCTTTATCGTTCAGGAACTGTAGCCATGAGA TTAATGTAAAGACATCAAAAATCTTCTGAATTGTTGATTCGTAAACTTCC ATTTCAAAGACTTGTCTTAAAAATTGCTCAAAATTATAAAACAGACTTGA AATTTCAGTCTAGTGCGTTCATGGCTTTACAAGAAGCTTCCTAGGCTTAC GTTGAGAAATGATTGAACATACGAATTTGCGTGCGATTCATACTAAGGGG GTGACAATCATGCCGAAAGATGCCGGTAAAATTAGAGGCGAACGTGCATA ATTATTAATAAAGTTTTATTTTTTATAAATATGTACAACTTTATATTGAA AGACTATTTATATTGACGATACAAAAATAAATATATAATCCAGAGGATTC ATATCTTGTGATTGAAAAAGTCAAGAGTTTTTGTACCAGAAATGGATTGA AGCTTTAATAGACAAATTTATTAGATGAAAACTCTTGAAGACTTCTTCGA GATCCTCAACCTTARCCAGGCACTACTTGATACGGTAAACAGCTGCCATT GATCATATTTGGGTTTTGAATCTAACAATTCAAAAAGAAAAAAGACTCCA GGACAATGTTATTAGAACAAGGTGAGGCAACAACAAAATTTTAGGCAAAC CGAGTATATTTATAAAGTAACTCTCTCTTTTTCTCTTTATCGTGCCGTCA TTGGGCGCATTTATATGGATAAATGTAATTGATAAAAAGTAAAAAAAGTA GTAATTTAATTATATCTTTCCATTGATTCCTATTTTATTAACATTTCATT TGGGGTTTTCAATGATTATCTATAGTTGTATTCCTGTATGTGGTCCCAAT GACGTCATCTGTTATGCTAGTTAATTTTCAGGGAGAACTGAAATTTATTG ATGCCTCAATTTTTTATAATAGTATTGCTCATCCTCTCTGTAGAAGGGAA AAGGAATCAAATTGTTCCAGTTAACACTGACTTATTAAGTTTTAAAAACT GTCTCAAAGCTTTTGCACGACCTGATTTTTATAAACCAATAATGTCATCA TTAATAAATCTTCACTCATATCCATAGTAATAATAAATACTTTAATTAAG CCTAAATTAAGATTAGTGGCTAAATATTATCATGCATGAACTATACTTAC AGTTTTACTAAACTAATTTTGGTGAAAATTATGGCTTTTAGTTACAAATT TAAATTTCGGGAATCTTTTTGAGGACTTATAACAAGGAATGAATGTGCAA ATGGATTGTTTTAAGTTCCATATTAAGGAATTATAATTGTACAACAACAA ACATATTGAAGTGGACATAAACGAATTCATTACATGGTTTGTCGCTTCCA CCGAAGGTTTTATGTAAAAATGAAATCATTCAGCACCTAGAAGTAAGCGT AATATCCCAAGTGTAACACACTTCCCAGAACAGTCGCGTTGCATATTTAT TCTACACTTGTACATAAGTATCAAAAGTTATCAATCAGAGCAAAAACTAA TCAAACACTTCCTCGGGATTGTAGAAAAGAAGATAAGACCCATAATTTGT TTTGTTTTAAAAATCCATTTCAAAACCCTGAAAAGATACGGATAACTCGA TTATGTACTACACTTGAAACGTTGGAGAATTCGTTTCAATATGGAAATGA TTAGTTTGAAGGATATGTGATCGGTTCTAATTTAAACCCCTACTTCATTA TTACCAATATCAATTAATAACCCATAAAACTTATATTCTTGATTGGTCTA GTTGCTCTAGATACATATTCCTCATCCCGAGCTTCGTGACCAAATCATAG TCTTCCATTATATTTTACAAATCTCTGTTTTTTACAGAAACATTTCCCAT TAAAAAAATGAGGCATGGTGATAGATTAATCAAACTGATAAGAACACCAA ATATGAGTAAAGCCAGATGACTAAACCATAAGTAAATAATCTTATGGATC GATCGAACAATACTATATATAGCATGACGTAATGAAAGAGGAGTAGCCCT TTCGTGAAGGTATTTTTTGATTGAATCGTGTACATACCTAATTATAGGTA TATTAATACATATCTACAGATTTTTTTTTTTTGTTATTTAAGTTCTTTAA AGGAGATTTTAAATAAGGTACTTATTGTATCTATTAATTAAATATCCATA TGAGAGTGTTTTCTCATATCACACTAAACGATCCTTGGAATAACCTTATT ATCTCTGGTAATTAAGCTGAACGAAGCTATGTTTTTGTTTCTATTTGATA GTCGCAAGGAAAACTCCAAAAGTTACAGATTGATTTTGGTCAAACTTAGT AGGAAGGTAACAGTAAGAGGCCATTCACTTTTGAGAAGTGAATATCAAGG TAACACAAATCGTAAAAAAAAAAAATGCATAATCGACCATACCTTTGTAA TAAATTTCGATACATATCTCAATTTGATTTAAGGCAAAGGGGTTGTTGCA CTCTATCAAGTGCTTATTATAGTTAGAAGATATTTGGCTATGGTTTTTTT ATTGTAAAGCTTCCGTCAAAATTAGCACTATTAATATTTCCTATATTGAG TAACTTTGGACGATGTACGTTACGAACATTCCGGCACATGGAGTTTTTAA TATACAGCTATTTTAATAAAGCAAAGTTTGTCTGTCTATTTATTTATCTG GGAAGGACTCATTTTTAACAAAGAGTGTACGTTTAGTTGAAGCTCAGTTC GTAAAATAAAAAAAAAGAAAACAGAGAAGGACATATAAAAAATAATCAAT GTGACTATAGATGTGGTTTAGGAATGAGAATGTGAAACTAAAATCTGAGG TTCTCAAATTATAAATAAAAGAAAGGAGAGTAAATTTGTTTTGGCCTGAT TATGCTCATGAAAAACAAAGAGTAACAACGAAGATTTATTTGGGAGTTAT CTTCAATAAATAAAAGGAAGTCTAGATATTATGATTATAGCAACGTGTGT CTGTTTTTTTTAGTTTTTTTTTACTGTTTGTCGACCGCTAAAAACTCTAA GCAAGCGCCCTTGCTATAGTATATCATACGGTCCACATCTAATTCTAGTT GTACTTGATGCGTTAATCATGAAGTTATAATTAGTTTTTTCGTATTACAT CTTGTTTTTGAGAATGTTTGATTTGATTTTTTTTGTGCTATTTTTATTTT TAATCGTTTTATAGGTTAAGGGGCCAACATTTTTGAGGACAAATAAACAA TCAATAGTTTATTTAAAAAGTTACTTACTAATAAATATTGTTGCTAGACT AGACCTTCTAGAATTAAATTAAATACCATTTACCCCGCTGTAAATAAACT ATTTTTTTTCCTTTCATTATTTGAAGTTCACAACACTTAAAATACAAACN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCTTTTATAAGC ATACACGAACGTTCAAACAGGTTTGGAATATAATTGAATTTATTTAGGAA AGGATGTTGACTACTGAGGAATTAAATAATAATGACAACTCCTAAAGAAA AGAAAACTCCTTCTTTATATTACCAATTACAAACTAACCGGATTTACATC TTTATATAAGTAGTATAATAAATAGTCAATTTCCCGCTCCATTGTTTTAG AAAGAATCCAAGAAAATTATTATTAGATTTATCAGGATCTTCATCGGAAA CAACAAAAGATTCGTATTATAATTATTAGTATATGTGATATATAGAAGTA TTTTCTGAATAATTTTTGAATTTTCTAAATTAATTGGAACATTACCAAAG TGATTCTCCTCTTCCTGTTTGCCCCGAGCAATACCGGGTAGGCCTTTGCT AGTTGCTGCATAATTGTAAAAAGTTCATCTGAGTTTACCAACGTAAATAT CCGATCACAAGAGGGTCGTAATTGGAGCTTGTGCTCCTCCAGAGAGTATC GGAACTAATGTACTATTCCGTATTAGTATTATTTTGAATACTTCTCCCTT TCCTAGCTATATTATTAATCTGATCGAGATACAACAGTTAAGTTGGAACC GATAAGAAAAAAAGGCAGCGAATATGTCATGCAGTAAAATGTCATTGAGG CGAAATTGTGAGAAAATTAGTGGTCACGTAGTAGTACTATATGTCTAACT AACGTCTTCTCCTAAAGCTCTTTTTTTCTTTAAAAAAATGTCAACTCTGA GCATGATATATAACAACTACTAACAGCAAAGTTTTATATTATTCAAATAT CCATATTACTAATGCTAAGGATGTTAAGGGAAACAACAGAAGTTCAAGAA TAAATAAGTTTGATAACTTTTATTCTTTAGTTAGAAATAATTACTTTAAG AATGTTTTGTCTTGATTTGTAGTCATTACAAAAAATTAAATTTAAAAAAT GAGTAATTTTAATATGAGCTTCATAGTAACTTTTTCAAGAGTAATTACCT ACAATTAAAAAGTACTTTTTGACTAATTGCGCCTATGAGGAACATTTTAT TGAACGCTATAAGAAAGAATACTTAGCTTCTATAGTCTTTATACTGCGCT TTAAGTTTATCTAAGTAAATGAGTTTTGATACATCTTTTATTTTAAGATT TAAAGAAAAATATATTATATGACTTATTGAAAGAGAATTATCAATCCGAT CCTTATCCATCGCATTGTAATTCCAAATACTATTGCAGGGGCGTGGACTG GAGGGGTTATTTTTGAATCTTACTAGTACATTTAATATTTGTAATTTATT TTAATTCTTCAATTTTTTTCTAAAAAATTTAATTGTCTGTGAGTAGCTAT GGATTTTTGAAATTTTTCTCTGGAAAGTTTAATATTTGAAATCTTTCCTT AAAACTTCATATTTTGTAAGCAGCTCAGGATTTTTCAATTTTTTTCCAAA AAAATTGATTGTATGTCAGTAGCTATGGATTTTTGTAATTTTTCTCTGCA AAATTTAATATTTGAAATTCTCCCCGAAAAATTTAATTTTTTGTGAACAA CACAGGATTTTCAAATTTTTATGTCAACAGCTACAGATTTTTTGTTATTT TTCTCCAAAAAATGTACTATTTGAATTTTTTTCCCAAAAAATTCATACTT TTTTAGCAGTTCAGGATTTTTCAAATTTTTTTCCAAATATTTAATTGTAT TTGAGTAGCTATGGATTTTTGAAATTTTTCTAAAAAAATTCTATTTCTTG AGGAAAGCTATGAATTTTTTGCGATTTTCAACCAAAAATTTAATTTTTGT GAATAGATGTGTATTTAAAAAAAAAATCCAAAAAGTTTAATTTTTCAGAA ATATAAATTTAAAAAAATGCCAAAATCCTCCATTCAAAAATAAATATAAA TTTAAAAAAATGCCAAAATCCTCCATTCAAAAATAAATATATATTTAATT TTGCAGACGCTCCTCTATAGGCATAATTTGATAATAATGGGTGCATCAAA 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ACTTGCGATACCGGCAATAGGTTATAGGTTCTATTATATTACTGGTTCGG CCCACATTAAATCAAAATTGTCCAGAGCTGCCTCTAGTTCCTAACTGAGT TTTATAAACTTGCCCTAAGAATTGAATTATGTATAAACCAGTGCTCGAGT CCGGATTAGTGTCTTTTTTAATTGAGACAGGACATATACTGATGACTCGA ACTTGAGTTATAACTTCTTCTATAAACAATATTATTCAACATAGATACAA AAAAGAAATATTTAGATAAAAAGTTACTTAATGGTGTGAGAGTAAACCGC TCAACCTAAATCCTACCGTTCCTGACTTTTTAAACGACCCATGATACAGT TCAAATGTATGGGGCACTAAAAATGTGAATATTTATACACTTTACATTCA AGTAAATTTCCTGTACAAAATTGCTAATTAGTATAATCTCTATATCTATA TACTTTCCCGCATTTTTTTCTTCTTTTTTTGAATTTGTCTGAATGATGTC ATCTAATCCGGCTATTTGATTAATTTGTAACCGTATTTTGTCTCATAAAA TGAGCTCAAATAAGTCATACTATCCATATAAACAATTATGTAGGAGTATC GGTGGAACTGATACTATATTGAGACGATTATGATATTTCAAAAAAGACCG ATTCTGACCGATAGACCTCCAGATTATTCCATTTGTAATAAAGGGCTCTG CAGTTCGTTTTTGAATCGGAAGATCCCAAGAACTATTTGTGTTGGATTAG CCCTAGAACTGTCTTCTAATCTTTTCTTTCATCCCACTTTTCAGTCTTTC TTCAAATTGTTCTGAACTTTTCCACCCATTCAACAGTCCGATAAGTCGCC CTTACGCTCCTAGAACTGAAGAAAATAAAACTAATGAAATAATGAATGAT AAGTATATCGTATAATACTAGTCTTCGTTTCGCTAAAGCGTCAAAATCAT CCATTTCAACGTTAAGCTTACAAAAAATACTTGAAATTTCTGGTCTTCTT CCAAATAGACCTCAACATTGTAGAAAGTAAAAAAAAAAAAATCCTTTTGT ATCATCATATGTCATTTAATTTTGTTGAAAACGAATTTTGTACAAATATT ATCGTATGTTTTTTTTTTTGACCCGGTTCGTAAAAATAATATTTTATATT ATTCAAAGAAAACATATAGATCCAAATTTTGTATATCTTGGTTTGAGTCC AAAAACGACTATACTTGTCAAAAAATAATGTTTATTGTATTTAAAAATAA TAATTTTGTAAATGTGTATCTATTTTAACAACGATGAATCGTTTATATAA ATATTGTTATTTTTATGTTATTAGAATATATGTACTGCATATGTTGTTGA AATTAAAGAAACTTTACATCCACTTATCACCAAAAAGTTACGGATAATAA TTTTTTCTTGGATAATTTTTTTATATTAATGTAAATGGATGTCTTCAGGG TTGGTTTTACTACGAATGGATTTAAAATAAGATAAAACACAGGACCCCTG TATAAACTTAAAAACTCAAGACCTAGGGCCATTGTCCCCTTTTAAATAAT CAGTGGTTGTATCTTTTTTTGTTGAAAAAATACTCAAGTGCTGCTTGTCA ATACAAATACGGGTATTGATATGCGATCGAAATTATTCGTCTTTAGATTA ATTGAAACTTCAATCCTTTATCGGTGTTTATTACGCCTGTTAAACAAATA ATTAATATATGATGTGTAATAACCCATAAAAATATAATTAATCTTTTTGT TTCTAATATTTTTTGAGGCCCCAATTTTAACAAAATAAAAAAATATGAAA ATTTCAATGGAGTGTCGACTGCTAAAAGAATATTTTTCATTGCAAATTTT TTTGCATACTCTTACAACAGCACTACTCTTTTAACTTAGGATTGCTCAAA CTTTGAGTTGTTCTCAGTTTATTACACTTCTATCTCAAGAGTGCCTATCA ACTTTTTATCACTAACCGTTTATGAATTCCCAAAAAAGTGGTTTTACCAC CCCAAAATAGCCCGTCCTATTGGAGAGTCGAATACGTCACCTATTTGAAA GGATTATCAAAACTTTAAATGTGTACTATCATTATAAAACAAAAAAATTA ATTTTTTTTGTAGAAAAACTTCAAAAATCCAAAGCTATTAACAGAAAAAT AAATGTGTAAAATTAAATTTTTTGAAAAAAAAAAATCAAAAATTCACAGC TGTTTACAAAAAATTATTTTTTTGTAAAATAATTTCAAATATTAAATGTT TTTGAAAAAAATTTTAAAAGTTCAATTTTAAATATTAATATTTTTTGAGG AAAATTTCCAAAACCCATGGCTTTTAACAGAAAATAAAATTTCAAATATT AAATTTTCTAGTAGAAAACAAAAAATCTTTAATTTGGGGGTGGAACTACA GCCCCTCTGGCCCAACCCCTGGGAACACCCCTGGATCTATTCGATCATTT TGGATCGTATGTGTGATAACACCAAAACAGTGTTATAAATACATATATAG AAGACACCATAAATATTTTACGGGAGATCAAATTCCACCCAAAGAGGGGC TAGCGGCAACATTGTTGATATGTCAAGCTTCTAACATAATTCCTAGATTG TGTGATTATCTTTAGTTTTACTACTTTTTTTTCAGATTTCTCACAACATT CAAGATATTTATCAAATAATGATAAAACATAGTTATATTATTATTTAAAC AAGAAAGTAATAATAAATTTTGTTCTACCAAATTAAAATAGCAAAATAAT GAATGGAACAATATAATTTATGGCCGAAAAGGAAAGAAATATCAAATTTA CGATATTTTTTTTAACATTTTTATTATTGGATTCTCAGTCATTTTGATCA TAAGTAAAAAATATAATTAAAAAATGCAAAATTACACAATCAACTTCTTT TTTATCTTTAAAAAAAAAGCTAAATTAAAAGAATGATTCTAATAATTATT AGTTATTCACACGAATAGCTTCAATTATGTCTTATGTTTATGTACTTAAA GTCCCTGTATACCATAATTAGTTCATATCAACATTATTGAAATTGAGGCT CAAATGCAAAAAGAGACTATAGATGTGGTCTTATAATTAATCTTTGATTA ATCTTTGTTCCTTTAGTAGGAACAATGTACATTAGAATAATTTTTGGAAA ATTAATTTATCTTTTAAAATAATCTTCTTTCAGATGTATATACTTTGCAA CAAGACCAATTTTCAGTCCCGTACTACGGATAAATAA
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