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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s606 | supercontig | LSalAtl2s606:23780..34423 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000009444 >EMLSAP00000009444 ID=EMLSAP00000009444|Name=EMLSAP00000009444|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=640bp
MEWLXRINDLSQSSPRQYPQVLDLENLSCTLINKHSKPGDGNEKPLVPLL
SVRPDQFICEYDVHCFALCLCCEFFACDCRMRCSEGCSCYHDQTWSDNII
NCGNRNHSKVPDMIPMDATSIYLDGNPQLTDISGDTFIGRKHLTSLYLNN
SGITEISNRTFSGLAELLILRLDGNELETLTGGEFTDLQSLKELYLHDNM
LTSVSGETFKPLTDLEILTLHGNKLNTLAVGNIIPADASAQAGIQQLSMT
GNPWTCSCDFVQDVQQVLKYGFRLTGPIDAHDKERKYDAYIHYAPSDDQF
TRQLLTRNLDEYRLCLRHRDIDEKSASALASAAKSSGRVVLLGTPAYLAD
KAAQSEMATVVDAVAPRKRPDQILVILKEDVLGAGMSGGGPRRQEELKRK
LQESSLLKDATFMTWGSESFWNRFRYNLPEHPLDADINKKNQQFSNISSH
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WTYLKGGGTTNVQGSGGSSLSTRSTTDGMAENTGVILTTNNSIFKICINF
SNNINNLMTISLMAHCPSFSLYPFKKSFFYIDKYLPDIYL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s606:23780..34423- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000009444-705291 ID=EMLSAT00000009444-705291|Name=EMLSAT00000009444|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10644bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s606:23780..34423- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGAGTGGCTTYAACGTATTAATGACTTAAGTCAATCCTCTCCCAGGTA
AGCTACTATAAACATACTTAATTTTACTCTCTAATAATTTTTGATAAAAT
GTGTGTTTAATTATATTTATACACACGTACTAGCTGTAGACCTAATTAAA
AATCTAGGTCAGAGTTTATTTCAATTCTCTCATTTCTAATATATATATAT
ACTATGTGCATATATATTATGAAAATAAATCAAAACGTCTTAATCCTAAA
GTTGTGGACCCCTGTGATGTGTTGGTCCACATTATACTGGGTGCTGAAAA
AGTCTTGCAATGTTAGTAAAATGAAAATGTAAGAGTTTTTGCAGTCATTT
ACTCTGGAAACATTTGCTTCGAACTTTTTGACTTCATAGTTTTGCCAAGT
GAGGTCAGCTGATTTTTAGTTCCGATTCAATACTCTGAAGGGAAAAATAT
AAGCCAAAAGAAAGGAGTTTGGCACTTTACTCTGCGCCGGTCACACCAAC
ATTATACCTTTAGTAAAAAAAGACTGTGATTTAATTTAAATTATTCTTAC
ATAATTAGAAATTTGTGAATTTTTATTTCAAAAAAGGAAATATTTACAAA
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TTTTTTGAATAAAAAGCAAAATTCCTTGAGTTTGGGGGGGGGGGGTTAAA
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TGTTCGCGAAGGGCACATCACTAATCTTCATGATATTGGTAAGCCTGGAT
CAGAATATAACAGGAACTTATTTTCTTTTGGGTTCCATTTTCTACTTTCA
AATATTTTATCTCAAAAATTAAATTAAATCTCCACTACACATTTGACCCA
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TTTTAGAGTATATTATCTCATTAATTATAATTAAAAGAACTCTTTTTGTT
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GGTTGTTTAAGTCATATATATTAATAGTAATATTATGTATAACTTATTTA
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AAATTGGTATGAAAGGATGACTACAAGATATGTGGTTGTATTGGCTCCMA
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TGTTGGTTCTTCAATTTTCCCTATATATTTTGATAGCTAATTAAGCCAAA
TAAGACATGTCAGATATGATACATATCTTATAAAAAATATTTATATTTTG
AATACAAACATATTATATTCTTACCTAGTTATATAATTGACAGGGTTCCT
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ACGTCACCAGTATGTAATGTACCCCCCACTTGAAAATACCTTCTACCACT
GGTGGATCAAATACTTAATTTATCCACTGTATAACCAAAAAATTGACAAA
GGAAAAATACCTTCAATAACATCACGAAGAATCAATTTTACCTTTTCCAA
GGCCTGACAAGTTGGACTCTAGTTGATGAAACCAAAGAAGAATGATTTTC
AGTCCTTGATAAAAACTGACACTGTCATATTCCTGTGTTGTCTACATTTA
TCCGTGATATGTTATTCAAACCCTGCCAAAAAATGTTTAATTCCTTATAA
TAAAATTTATTTATTTGCAAAAACAATAAATAATTAATTTGACTTTAAGT
ATTATATTTATAATATTTTTAAATATATATACATTCATATAAATCCAAAT
TTTATATGGATCATAACTGCCAAAAGGTTTTTCTAGTATTAATGAACACA
AAAAGAAGAAAAAAAGTAAATTTAGTTTTATTTCTATAATTAAAATATTT
TGGCATCCTTTTAAAACGAAAATAAACCTTTCATTTTTGACATTGTTCAA
TTTATTGATGAAGAAAGTTATTTAATGTGATTTTTTTTGTCTCTTTTATC
CTTTTCTTCGAAAAAAAGACAAAAATCAAGGATAAATAAGTCTTGAAATA
ATTAGTTTACTCATTACACCTCGTTCTTCCCACATCTATTTTTTTTAATG
TAGGGATATCGATAAAAATCCTACAATTTGTACAGTAGTTTATCGAATTC
TCCTTAGAATTAGCGTGGAAAAGTTATAATATGGTAAGGCAATAAATAAC
CTATGCAAAATTGTATTGTTCAATAATGTCACCTCTGTAGTCTAGAAATA
GTTCAAAGTTTGAAAAGAGACACAATTTATTTAGATCCCCAATAAAGGTT
AAAAATACGGCATTAATCCTTATTATTCACATTTTTACAATAATAGACAC
TGTTCGAATCTATTAAAAATATGATTATAGTTTGATAGAGATGTGTAATG
ATCTCTTAGGACATTTTGCTTAGGTAATTTTCATACCTAAGGCAACCTTT
TCGCTCTCCCTGAGGTTGAAATTCGAAAAAAGTTAAAAATCTTGCTTATA
GAATATCATAATTTCATGGGTGTATGTAGATTTAAAGTTTTAATATAATA
CAGCCTGACTATACACGATTGCCAAGCAAAATCCCTTTGTTGTCTCTATT
TATTTATTTTTCAATGAGCTATACCTATGTTATGTACGCGCTCCCATATC
TATACAGGTTGCAACTTGTATCAGCAAATTGTACTAGTTGCAATTTATTT
GTTTAAAATGCATTATTTAATTTACTACAATTGTATTTTGATCTATTAAA
ATGACAGGGTTATTATGTATTTATGAGTAATATAAGTATGGGTATTTGAA
CTTTACCTTGAATTATAATTATATTTTGGTAGTATTTATTAAAATAATTA
AAAATTTCACCATCTTCACGATCCTTCATTGAGTAGTATTTAATTTTTGC
ATTATCCCGAATCGAAGTTGTGTAAATTCTTCATTTAAAACTAATTATTC
CATTTTTTTGTTCCAATTTGTACACAACACGAGTATAGAATGGACATATT
AAAAAAAATCAACTGAAAATCAACATTGTAACCCTGAGTATTTGAAGAAT
GTTTTATGAGCACACATGAATGTTCAATCAGATTTTGAATATTATTAAAT
CTATTTAGGAAGGGAAGTTCACTACACAGGAATTAAATAATAAATTGATC
CATATAATCCATTTTTTGTTCTAAATTTTGTCAATTGTTTGAATAAAGGA
ATGAAAACACCCTCCCATCTACTCAAAAGATAAAACTACTATCCATTGTT
TCACTTCAATCTATTTGCATAAAACTAATATTGCAAATATAAATATATAT
ATATATTTTAATTCAAGCAAAAAAAAAATATTGAATCCTTTTGTTCCATT
CAAGAACATTGTTTAAAAATTCAATAGTCAATAAGTCTCATTGTTTCATT
AATTAATATAGTCAACGATTCGCCAATTATCTGTCTGCGTAAGATTGACT
GGGGTTTTATGGAATGGAATATAACGGGTACGTAGTTGAAATCAGTAGAC
TTATAAAAGAGGGGAATAAGAAAAACACATAATAGGAGTTGAAAAGTTAA
CATACTGTGTGTTGTTAGACCCGATCAAAAAAATAAAAATAAATAAATAA
CAGAATGAATCGAAAAATGGCCATAGAATGAGACATTAATATAGCTTACT
GCTCTATTTAGTGCAATACATAGAACAACAGAGATCTGGAACATGACTTA
GTCAAGCAGGCAGACTATTTACAGTTTATAGAAGGCCATTATTGACAGTA
TTGAAATCGATACTATCTTTAACAAGACGGTGTGCACAGTCCTTTATGGA
GACCAACATTCCATTCTGGCCCAATACAATGTAGCCACCATTCTACCAAG
ATACAAACCCGCTCCACTTTTCCTTCTGGAATGTTCGTCTCCAAAAAGAC
TTTTCTGTGTACCGTTGCACCATATTTTCTATGCCCCTTCTCAAAGCCAA
TACTGTCATAATTAGCCTTGTTGACGTTGTCTGCTGGACAAGAGTCCCGA
ATCTCAAAGGATTATAAATAGGTTCAACACATGTACTAACCATTACGAAA
TTAAACTTGGTAAAATTCTATATTTAAAATGTCTAGCTAACAATTACACA
CCCGGTAATTACATGTTGTCATTGGAGGGGGAAATAGATTGAGGATAATA
TTTTATTTCCCTGCACTACATACATAATCCCTCTTCTGATTATACCATAA
CTAATTCATGACTTCGACTGGCTCGCAATTWTCCCAACTTTGGTSTTTTT
TTTGGGGGGGGGGGGGGAAGTGTCATAAATCAAAAAGAATGTGTGGTTTT
TTTTTCAAGTCCCATTATTTTGCTAGAACATACATATGCAAATAATATTT
ATTATTTAAAGGTATGACAAAGAAGCTTGCATATTTATTAGGCCATTTGA
AACCGTTTACGTCCATTAGTATAATTGATTTTCTTTCCTCTTTACCTTTT
TCAAGACACTAAATTGTCATATAAAGAAATATCTTTATAAACACCTATAA
ATATATATATATATGAATACTCTTCTTCAAAAGTATGCATAATTTTCTCA
TAACTTGAAGAAGTAGATTATAGATTGCTTAGGCAATAAAAAGGAGGACT
CCCCTTTTTTCTGTGCTCTCTATATAATCAATAATTTTGATGATATACCA
CTTAAATATAATCTAATGTAAACTATTCTCCGGATTTCTTTATTTAGGCA
ATACCCGCAAGTTCTTGATCTTGAGAACTTAAGTTGTACTTTGATCAACA
AGCATAGTAAACCGGGAGATGGAAATGAGAAACCCCTTGTACCTTTACTC
AGCGTCAGACCGGATCAATTCATCTGTGAATATGACGTGCATTGCTTTGC
GTTATGTCTGTGCTGTGAATTCTTTGCCTGTGATTGTCGGATGCGTTGCT
CTGAGGGATGTTCGTGCTATCATGATCAAACTTGGAGTGACAATATAATC
AACTGTGGAAATAGAAATCATTCCAAAGTACCGGATATGATTCCGATGGA
CGCTACTTCTATTTATCTGGATGGAAATCCTCAATTAACAGACATTTCAG
GGGATACTTTCATCGGTAAGAGGATTCTTTCGCATTAATGATGTCGTATA
ATCTATTTTAATTTTCTCTCAATAGGTCGGAAGCATCTGACTTCTCTCTA
TCTGAACAATTCTGGGATTACGGAAATAAGTAATCGGACTTTCAGTGGAC
TAGCTGAGCTCCTTATCCTTCGTTTGGATGGGAATGAATTAGAAACTCTC
ACTGGAGGTGAATTTACGGACTTGCAGTCCTTAAAGGAACTTTATTTGCA
CGATAACATGCTCACATCCGTCTCTGGAGAAACGTTTAAACCCCTTACAG
ACCTTGAAATCTTAACTCTGCATGGCAACAAATTGAATACTCTTGCAGTT
GGTAACATTATTCCAGCTGATGCATCTGCTCAAGCAGGTATACAGCAGTT
AAGTATGACTGGGAATCCCTGGACCTGCTCTTGTGACTTTGTTCAAGATG
TTCAACAAGTGCTTAAGGTATGTGACTACTTTCATTCATACAGGCTCCCC
TCTCTAATATAATACACTTAATAAATACAATTAAGGGATGCCATATTCAC
ATTGTGACGGGTTCTAGCCTGCTGTGGAACTTAGCACAACAGTTCTTTTC
AAGGCATTGCTCTATGTTGGTTGAAGTAGTGTTGATGGCGGCCTTCGGTT
TGACCTTGGTTCTGTATTGTACTCCCCTAAAGCTTCCCATTGAGGTGCCC
CAAATACCCGAAACAAGGGGGCTGTCAGGGCTAAGGGGAGGCCAAGAATA
TTGCTGTTCAAGCTAGTTGAAGAGGATTTGTTACCAAGTAGACACGCTGC
ACTTTATCCAAAGGCTTCTCTTGTAGGTGTTAAGATTTAAGTCTTGCTTC
ACAAAGTATTGCATGGTGGTCTAGTTCCTCTCAAATTTACGAGATTGCCA
CTGACGGCAACCTAGCCTCTTCTACATTCAATTGTGCCATTAACTCCAAT
AACTCAACCAATACTTTTAGCCTCTTTGGGTTTCWTTTGCACCTAGTGGA
AGSTTTTGGTGTGCTTCCTGCCGTCACCCAGTACAGAATTGTACGGTTAC
TGCTTATAACTTTAGATATCTCTGATAATGATTTCTTACGCCTGAATAGA
TGTAGATTTGCTGCTTTACGTTGCTCCATGTTTTTGGGCATGAAGCTTTT
ATTCACAGTTTCTTAAGACAATTATTTAAAATGAGTAATTAGTGTTAAAC
ATCCAAGTATAACAAATAGGAGTAAGGCACGCCAATTAAATATGTGTAGC
ATTTAGACAGAGGGGCCAGTATTGTGAAAAAATTGACTTATCATTTTTTT
TTTTTATATATAGGAACATCGTGATAGGATTGTGGATGTGGATAAGCTGG
AGTGTGAAACTGAAGGGGAGATCGTGAATATTGGAAAGTACAATGTTACT
TGTGCAGATGTGATGGCTGTTCGCTCTGTTGATGGACTAGTCATTGGTCT
CATTCCACTCATCATAATCGCATTTCTCTTTATGCTTGCTCTCCTTACAC
TTTGCTGTTTAGCTCTTTGCTGTCGTAATCAGCTCTATGCCTGGTAAGAA
AAATTTACTCTTTTTAAGCCTTTTTCACTGAGTTAAAAACTCCCACATCC
TTCTTCTTACTTTGATGACGACGTATCTTATTTTCAAACTTTAAATAAGC
CTTCTTCATTTTATAGTCTATGAGATATATAATTCTCTTTTATCTTTTTG
ATCACTACCAATAAAAGTGCAAAATCTTCAAAAGAATATAGAGAAGGCGA
AAAAAAACATCGATAAATCTTTCTGAAAAATAAATAAAATATAGAGTTGA
TGACTTTAATCAAGGCTAGAGATGAAAAGATCATATTGATAATCTTGTTC
CAATCTCTTTCCGTATTTGCTTTTTATTTTATCTTTCTATTATCGACTTT
TGAAATCCTCAAATTGTGTGTTTATTCATATAAATGACTCTCATGAAACT
TTGATTACACTCCCTTATCAGAATAAGGAAAATGAAATACAATAATGAAG
TTTCTTAATATTTCATTTCCACCTTACTTCCTATTTTTCTCCTTGTATTT
CTTAAATGGAACTAATTCATTTTTTACTTTTACATATGTACAGGGTGGTT
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CATATAATTATATGAAACTATATAGGTACATGCTCCCCCAGATATATAAA
TTGCATGGCTTCAGGTCAAAGCTGTTTGTAGACCAAAAAATCGGATTCCA
AATGGGAAAACATTTTTTGGTTAAGACATCCTTCACTTTTTAGACTTGTG
GGCTAGTGCTCTGTCTCATTGAAAGGTGTTATTTCTTCCTTGGGCTATTC
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TGTGGCTAAGGTTAAATAGAATTCAGAATCTCATTATGAATATCTGAATG
TCATTAAATGTAGCTTTTTTAATCAAAAAATATCGTTATATCCCATCTGG
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CTACTGGAAGATTTTGCAAAAACAAGTATACTTTATTGCTTCATACCCTT
TTATTTTTATTTTTCAGGATGAATTCCAAGTATGGGTTCCGACTAACTGG
GCCAATTGATGCTCATGATAAAGAACGGAAATATGATGCATATATTCACT
ATGCTCCAAGTGATGATCAATTTACACGTCAACTCCTAACTCGCAACCTG
GATGAATATCGTCTCTGCTTACGTCATCGTGATATTGATGAAAAGTCCGC
TTCTGCCCTTGCCTCAGCTGCTAAATCCTCTGGACGTGTTGTTCTCCTTG
GAACGCCTGCTTATCTAGCTGATAAGGCTGCTCAATCAGAGATGGCAACT
GTCGTGGATGCTGTTGCTCCTAGAAAACGTCCTGATCAAATTTTGGTTAT
TTTGAAGGAAGATGTTCTTGGTGCAGGAATGTCAGGAGGAGGTCCACGCC
GGCAAGAAGAACTAAAAAGGAAACTTCAAGAGTCTTCACTTCTCAAGGAT
GCCACCTTCATGACATGGGGTTCGGAATCCTTCTGGAATAGATTCCGATA
TAACTTACCTGAGCATCCACTTGATGCAGACATCAACAAGAAAAATCAAC
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MCCCTCTCMCCTGCTTCGAATCCCTTTTTGGATGAGGAAGATTCAAAAAC
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TCAAGGAACATTGAAAATATATCTTCCTCTCATCATCAGTCCTCGCACGT
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ACAAATGTGCAAGGAAGTGGAGGTTCCTCGCTAAGCACACGATCTACCAC
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AATCGCTTTGTTAACTTGTCCTCCMGTTCTGCTGGATTMCCTCCCAGCCA
TGCCGCTGCCACTGCTTCCTCTTCTGCCATTAATAATAATAATACGCTTA
GTAGTAACGCTGGAGCCATGATACTTAGAGATGGTGGACAATATGGTACG
ATTGGGAGTGGTGGKGGCCTTGAAGGKGGKGGKCATACAMCCACCACTAC
TACCMCGACCACTGTTATTAAACGCCATATTGTTGAAAACCCTTTCGATA
ATTTCCTTGACCTCCCTCCAAACTCTTCCTCAACGAAGCACCTACTTCCA
CATTCTCATTTATCAGATTCGGACTACATGTCTGTAAGTGAGCCCATTTA
CCACACACTCGACGCCAGGGGGCGACTCATTGAAGAGGGATGCTCAAAAG
TTAAAAAACAATCCACAGTCTACATGGACAACGATTTGAAAGTGGTATAC
CCATCAAAAGTAGGCGGTGGAAACGGAGGAGGATCAGGGATCATCAGTAG
TAGTGGACTTAGTTCCTCAGGACTAATTGGAAGCATTACGAATGCAGCGG
GAGAGGGGAATGATGACGAAGAGGAACGTCTTTTAGGAGGTGATCGACGC
GAATATTTTAGTAGTAGTAGTAGTAATTATGTGCCTTCCCCTGCTCCAGG
AAGCTTATCAAGGAGTAGTAATAATCATCATCAACGATCAACGACGACCC
GATTTGGTGGAACATCTGATTATGATAAATTCAGAACCACAGATCGCCAT
GATTCTTCTGCTACAAATGAAAGAGGCTTTGGAAATGGAGGAACATCTAC
CACGTCCACAACTTATCGGACTCGTAATGACTCCTATTACATATAAGGAA
TAATATATAACCATATAATTATTATTTTTTGATCCTTTCATACTTGTTAT
TCGCCATAATATTTTTTGACAATTTTAATATATATATATAAAAGTCTATA
TTTAAAATTTGTATTAATTTTAGTAACAATATTAATAATTTGATGACTAT
TTCCTTAATGGCCCATTGTCCCTCTTTCTCTCTCTATCCGTTTAAAAAAA
GCTTTTTTTATATTGATAAATATCTCCCTGATATATATTTATAA back to top
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