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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s620 | supercontig | LSalAtl2s620:81291..92627 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000009659 >EMLSAP00000009659 ID=EMLSAP00000009659|Name=EMLSAP00000009659|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=408bp
MEESFPFVFTPLKSDKPLLKDFKGYKEVLYKSNPGGWVVRHDYGELYAKE
IYNMELRDDDVWFIPFKGTNNSLKDDFPGFQGDLEKCKDGDWVLFPRYGE
NYADEIYNMELRNDDIWITTYPKSGTTWMQSIVWLLLNDLQFDESKHMDD
FSPHVDLDQVLQKEKFVPMLESKLKTLTHGEEHLKKLIQDRIDFLERGQL
EIAKEIPMGSRRLLKSHLPFSLMPPGVLKKNKVIFVARDPRDVILSYFRH
QRLMKYYDFQGDFTTFLDYFVRDEIVGGPFWEFIHQGWEHKDKDNFLFVF
FSDMKTDLYGTIQKLIKFLDLTGKYTESDIHKLMDMVSLQSCKNNTVMDG
TAIKVQLGLYNDNRGGFVGEGKVGGWKDVFTLDMVAKMDEWTICRTQGRD
LPLHKLYC back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s620:81291..92627- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000009659-705506 ID=EMLSAT00000009659-705506|Name=EMLSAT00000009659|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11337bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s620:81291..92627- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGAAGAGTCATTTCCCTTTGTTTTTACACCCTTGAAGTCCGATAAGCC
TCTTTTAAAGGACTTTAAAGGCTACAAAGAGGTTCTTTATAAAAGTAACC
CTGGTGGTTGGGTTGTTCGTCATGACTATGGAGAGTTATACGCAAAAGAA
ATTTATAACATGGAACTGAGGGACGATGATGTTTGGGTAGTTACTTTTCC
AAAGTCTGGAACTACATGGATGCAATCCATTCTTTGGTTACTTTTAAATG
ATGGGAAGTTTCCAATAAATAAGCATATGGACGAAGTGAGTCCGCATTTA
GAGTAAGTTTAAAGTAATAAAATAATGAATTTACATATGTGTGTTTTATA
AATAGACTGGATCAAGGAACACCCAAGGATGAACAACGAAGAAAGTTAAT
GGAAAAGAAAGAGGAGCTCCCTAAAGAGGATCCATTAAGAGAATTAATTG
ATAAATTTATTGAAAAACAAAATTCTACTCCTGTTGATTTAGCAAATAGT
CTACCTCGAACTAAACGAAGACTGATTAAGTCTCATCTCCCATTCTGTTT
ATTACCTCCAGGAGTGCTGAAAAGAAATAAAGTATGTCAACTTGATTTAA
ATTAAAATCTAATCTCTGAAAAAAATATAATAAGCCTCAAATTTAAGGTC
GTTTTTGTGTATCGAGATCCACGGGATGTTGTAATAAGTTATTATCATCA
TATGCGCCTCATCTCAGACTCAAGTTTTTCAGGAAGTTTGGAAGATTTTT
TTGATTATTTCATTAAGGATGAGGGTAGGTATTAAGTCTGGAGGAAGGAC
AATACATTAAATTTATTTTTTTGTAATTTATTTATAGTAAACTGTGCTCC
CTTCTGGGATTATATCCATCAGGCGTTTACTGAAGGATCTAAATACAAGA
ATAACATTCATTTTGTGCATTTCAAAGATATGAAAAAGGTTAAACTATCA
TAACTAAATAATATTAATAATCAATTRAAMATGTTCTAATGAAATGTTCC
TTTAATATTAGGATTTACGTTCTGTGATAGAGGAATTGATTCCGTTTTTA
GACTTAAATCCTGAAAATTATGACTTAAATAAAATCATGGAGCAAGTTTC
AATTGAGAGTATGAAAAAAAATGCTACGGTTGAGCANNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCAGACACAATGGTT
CGTCTTGGACTCTACAAWGAAGATTCTGGRACTTTTATTAGAACAGGAAA
GAGTGGAGGRTGGAAAGAGAGTTTTACACCCTCAATGATGAAGCGTATGG
ATTTATGGACTGCTGAAAAGACGAACGGATTTCGTAATTCGGCAATGACT
AAATTATATCCTAATTATAATTTGGATTGATATATTATTTTACCTTAAAT
TATGAAGTTTTTATAAAAGTAATTACGTTACTTTGATAAGTTGTCTTAAA
TATTCATTTTTTTACGATCATATGAGTCATTAACATTTGTCTCTACTAAA
AGGTTATGTTTGATGAAAAATGGTATTGAAAGACAACGAGATATATTCTA
TTACTTAATAAGCATTTATAAATTACAAATGTGTTGCATTAACTCAAAAG
CAAAACCTTGAACATAAATCATGAAAGTATGAAACAACCAAATTTTCAGA
GACATAATTCGGTCAATTATGAGCTTTATATTCCTAAATATGGGATCAGT
GGAGATATCCAAGAATACCACTGTAGTGTTAAGCCTTCATTTTGATTGAT
AAGACTATATTTGGCTTCAATATTATGGCTTTCAAATAGAATCCATGAAC
ATTTTAGAAAGAAACAAATTTCGACTTCAATTTGAAACACCTCCAAAAGA
TCAATCATGATAATTGTTGACAGAAATGGACGATAACTCTTGAATAATAC
TACTGTAATCCAGACTCAATTTTGTGAAAAATCATTCTATCTTGATTTTG
TGTTGATGGACCACATCATTTGCAACCATGCAGCATGTGAAATTTAGTTC
TTAATAATTGTGAGTCAAAATCTTCTTGGTTGATATAAAATTATTATTAT
TGTAAAATAAGGTTACAATAATTTAAATTTGAACTTGATAAAACATAAAT
TATTTAAAAAATCTGCATCTTCCAAAAATCTTTTTTGAATTAATTTATAT
ATTGTTATTCAATCTTGACCTATTTGAAAAAATAATAATTTGAAGGCAGT
TATTCATGCATATGAACAATATTTTGCATTAAAGTCATCCTTGATCTCAG
ATTTATATTATATTACATCTATATAAATTTGCATTGTACGCATTGATTCA
TATTAAAGCCTCGTATAATTTGCAAAACTTATGCAGGGAGTACTTTAATA
CTGGATTGTACTTTATTATATTTTACACGTTCATATATTTAAGAAGTTAT
TTACACTTTTCATTTACACAATGAGTATTTGTTATAAATTATACTGACAA
TTAAATGTTTGTAAATAACTTTTTGGCTTGAAAAGTTCAATGAAAATATG
ACTTGCAACGATCATCATCAGTCTCCCTTTGACCTATAAATTGTAAGATA
CATTAGTTTCCTAATATTAAGCAGCTAATTCAAGGTTTACCTAAGATAGA
TACATTAATTTTCGGCTTTTTAGTCATCACATCATGAGACAGAGTAACAT
CAGGCCCCACCTTAGTCTTAAGCTCTCAGACTCGGAGGCCAGTGGATGTA
ATTAATGGAATATACTACTATAGAATTTATATAATATGGTCGTGCATAGA
GAATTCAAAATCCATAATTGGTCACAATTTTTTTTCAAAAATCCATATCT
ATACTCAAAAAATTAATTTTTTTTTTAAACAAATCTCAAAAATTTAATCT
TAAATATCCACTGCTATTCACAAAAAAATAAACTTTTTTGAATTAAATTT
CAAAAATCCATAGTTATTCTCAAGAATTTGAATTTTTTTGGAGAAAATAA
TTCAAAAATCTACAGCTATTCAAAAATAAAAATTAACAACTAGTAAAAAG
CAAAATATCCTTATTTGGGGGGGAGGGGGAGCTACAGTCCCTCCAGTCCA
CCCTCTGCATACGCTCCTGTAAGTTTTAGAACTCCAGGGGTTTTTGGAGT
GTAAGTGTGATTCAATTATCAACTCCTGAATATTTCTGTAGTGTTCTACG
AACACCACCTACAGACAGAAGTAACGGACCGGAGTAAAGCCAGTAAGATC
TTTTGATTGGTACAATCATACAATAAATATATATTCTATGAGGGATGTAC
ATAGACATAACTATTAAAATATATCAACTCGTAAAACAAAAAGTACATTA
CTATCTATTTAAAACAAATCCCTACGTCATGAGCTAAAAGTATATAAAAG
ACAATACATAACAATTTCCATGATCAACAAAACATTTATCATTTCTTTCA
ATCTAGTGGAGTTGGTGAAGAAATAGTTTTTAACTTGTACATATTATGGA
ATTACAAATTATCGTAGTTTCAACTTGAATGTATTTAAAATATAAATAAA
TAACTGTCAGCCCATATTTTGTGTATTATAGCCTGAATCGTTAGCCAAAA
AGTTGATTATGATGAAGTTTGGACTTCATATTTCATTACTCTACCTGTTT
TTGTATACCTTTGATATTTCAATCAGTTGTATCCATGTATATGTTGTAAG
ACCTTGTATAAATTATAACTTATAGGTGTATTTCCTCGTTGGACTAGAAG
TAGAATTGAGGATTAACATCAGAGTCATCCATGCGATATTTAAATATTTT
AGTTGTTACTCATAACTGATCAGCGATAAGTATTAATAGCTAACAGGATT
CAATTAATGACATAACTATGCCTCCGACAACAGCTGACTCAGGCATAATC
TATTACTGCAGGGCCATCAATTAAAACTTCGCCACTATATATTCAGCTGC
TCTCCTCTCTAACAGTATTCAAATTGTTAGGGTTACCACGTTCATTTTAC
AACTCCAATCACGGTGTGACCTCACTAAAAAGAAAACTTTGTAACTGTWT
TTCGTTCCTCTGCCCCCCCCCCCCCCCATTCCTAATCAGTGGTCTGAACT
TTGATTGGTTGCTTAAGAAGGATTCCTTATTAAGCTCCGAACAAGCCTGG
AAAATCATTGAGTAATTGTTGGGATAAATACAAGCAAGTTATATTGGGCC
ATTTTTCTGTTTCTTTTCCATTCAAAAAGTTGTCAGATAAAATATCAAAA
AACAACCTCCTGTTCTTATATAAGAAAAAAATCCCCTCACAACATTAATC
ATGTCTCTGCGAAAAAAGTTTATTCCATTCAAGGGAACAAATAATAGTTT
AAAAGATGATTTCCCTGGATTTCAAGGTGATTTGGAAAAATGTAAGGATG
GGGATTGGGTTCTTTTCCCAAGATATGGAGAGAATTATGCAGACGAAATA
TATAATATGGAGTTACGGAATGACGATATATGGATAACTACGTATCCAAA
GTCAGGTATGAGGAACAACTGTCAATTTTTGTATTTACTCATGCTAAACT
CGAACCTAAGTTGTAATTGTTGTCATTATAGGTGGTCCATTAGTTTTGCT
CTATTTTCTATATGTAGTTCTAAAATTGTAACTTTCAAGTTTTGCTACGA
TTGATGTGAAAAAAAAAAATATTTAAACTCTCCTCTAATTAAAAATATAC
CTATATTTACAATTTAGATTAATTAAAATAAAATGAATTATATGTTTAAT
ATGGATTAAATATTATATTTTCTTCTTAATAGCTGAAAAAGATTTATTAA
AAAAATAATATTGAAATAATGCAACGGAAGTTTTTAATAAAGTCTGACAA
ACCTCTCTTTACGAATTTTAGTATTTCATGTGCATCTTCAATCTTTGTGT
TATAAATTGTGAATAGTAATATTATTAACCATTAATAGGTACAACCTGGA
TGCAATCCATTGTATGGCTTCTCTTAAATGATCTTCAATTTGACGAATCA
AAACACATGGATGATTTTAGTCCACATGTTGAGTAAGTAATTAATTAAGG
CTTAAAGCATTATTTAAATATTTTTATGTATGAGGGATTCATTTATGGAA
TAATTCAATTTTTAGTTGAAGTTCATGTTTCTCTTGAATTTTTTAATCAA
AATGTGTAATTTTTAGTMSTATAAAAAACATTAAAGGTTTTTTTTGTGTT
ACAGTAATGATGGAAATATACTCACGTCGTTACCTTTATTTTATCACACA
GCCTTTAATCCAAAATGAAACTTTAAAATATTAGAATTGTACATAGTATT
TTATTCGATACTGTATAATAATAATATTGTGTTTTTTTTTTAATATTTCA
TTAAANCGTATATTTCTCAATTCAAAATTTCTATATACATAAACATAATA
AAACTGTCAACATATATATTGATATAAAGTGGTGTACGCAGAGGGTAGGC
TGYAGGGGSTGMATSCCCCCCCCCCCCCCATTAAAAAAAAYAAGAATTTT
TCCTTTTTTCCCCCCAAAAATTCATTTCTTTTCCTTAAAGAATTAATTTT
TTCTTAATAACTAAGAATTTTTGAAATTTTTCTTCGAAAATTTTTCTCCT
AAAAATCGTATATTCAGGAACCTAAGTGTATGTCTACCCATAAGCCAAAT
TAAGACTTTCGAGTGTGGTGAATTACCCCAAACTCCTGCATTGATAGGTT
TTGGAGGAAATAAAGTGAAAACCTTTGGAAAAATAAATCAGACAATTCAC
ATATCTAGTAACAATCCAACAGTTTGGTCATTTTATGTAGTGGATACACA
AAAAGCAATTCTTGGCACATTTTGTGTATATTCCATCAACATGAGGAAGA
AAACACAAATGGTCAACCACCTTCATGTTTTGGGAAATTACATAAATCAC
GCTTTATATTTTCAAATGAAATTGTCAAGGGTTTTCATCGAAAAAAAATG
ACTTTAAGCCATTGGGTGAGGCAATGCATAAAGTCTTACACTCCATTGTT
ACCACACAAGTGCCATGCTTTGCATGGACAAGACGAGTTAATGGCGAAAA
GTTATTATTTCTAAAGGATGAAGTAAAACTTCAAAGTCTCGGAATAATTC
GGCCCTTAAATTCAACATTTTCCTCACTCATTTACAAATCCAATGGAGGG
TTTGGACTCTGTAGAGACTATCSTGCTCTAAACAACATGTCAGATCTAGA
TTGTCATCCTCTATCGAAAAGATTTTCCCTACAATTTGTCTGTTGCCAAA
ATTTGCTCTAAGCTAGACCTTTCTAGAGTATATCACCAACCAAATCCCTA
TGGAGAACGATTCCATTTACAAAACTACAATAATACGAGTTGGCCTGTGC
GAATAAGTAAGAATGCCCTTCGGTCTTAAAAACTCGGCCCAGACATTTCA
TTGACAGTGTCTTAGGCAGAGTATTTTTCTATTTATTGTGCTGTTTATGG
ACCCAATACAGTCTCTATTCATTAAAAATTATATTAAAAAAAAAAAAAAA
TACGACAATTATCATTTTTTTTTTAAATTAAAAAAACTACAGATATTCAT
TTTTTTTCTTCAAAATCCATAGCTATTCACAAATGGTTTTCTTTTTTTGG
GAAAAAATTCAAATATAAATTTTTTTGGAAGAAATTGAACATTAAATTTG
TAGGGAACAAAATCAAAAATCTATAGCTATTAAAAGAAAATGCAATGTTT
GAGGACAAATTTAAAAAAATTAATAAAATTTTTCGGAAAAATATTTGAAT
TTTTTTTTTAATATGACATTTTCTTGTAAAAATTCCTTAATTTGGGAAGG
CACAACCCATGCAGTCCTCCCCCTGTTGATGCACCTGTAAATTAAGAACT
TACAGAGAAGGCGGAACAAAAAAATAAGCACATGATATTATCAGTCTCCG
TACCGGAGACTGATTGTTAATTTCTTTTCTTTTTAAGTAAATGATTTTTA
CCGCAATAGCTTTGTTATAAACAGCTAAAAAGTCAGTTCCCTTTCTACAA
TTATAGTCTGGATCAAGTCCTTCAAAAAGAAAAGTTCGTACCAATGCTAG
AATCCAAATTAAAAACCCTTACTCATGGAGAGGAACATCTCAAAAAACTA
ATCCAGGATCGCATTGACTTTTTGGAGAGGGGCCAATTAGAAATAGCAAA
AGAAATCCCAATGGGAAGTCGTCGACTCTTAAAATCACATCTTCCATTTT
CACTTATGCCTCCTGGCGTATTAAAAAAGAACAAGGTTTGTGGGGAGCAA
ATCCAAAATATTAATTATTAATTTTGAGTTCTTCTTATTAGGTTATATTT
GTTGCTCGAGATCCACGTGACGTAATCCTAAGTTATTTCCGTCATCAGAG
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ACTTTGTACGGGATGAAAGTGAGGACTTTATTTCTCATAATCTTATGCAC
ATTACCTGATTCGTTTTTTATTTCACATAGTAGTGGGTGGACCCTTTTGG
GAATTTATTCATCAAGGCTGGGAGCATAAAGATAAGGACAATTTTTTATT
CGTTTTCTTCTCTGATATGAAAACGGATTTATATGGTACGATTCAAAAAC
TCATCAAATTTTTGGACCTTACAGGAAAGTATACGGAGTCAGATATCCAC
AAACTAATGGACATGGTATCCCTTCAGAGCTGTAAGAACAATACTGTCAT
GGATGGAACTGCTATCAAAGTTCAACTTGGTCTATACAATGATAATAGAG
GAGGATTTGTGGGTGAAGGTGAATCTTTTTTTCATAACGTTAGTTGCATT
TTCATTGAGTGGATCTTTAAAACTGTAATTGAAAATTAGATACTTGAATC
TTCAATTTGAACATGTTTAATTCCAGAAACTAGAGAGCAACATTAANTTT
GTGGGTGAAGGTGAATCTTTTTTTCATAACGTTAGTTGCATTTTCATTGA
GTGGATCTTTAAAACTGTAATTGAAAATTAGATACTTGAATCTTCAATTT
GAACATGTTTAATTCCAGAAACTAGAGGAGCAACATTAATTTAACTTTGG
TGAGATTTTAGCACATGTGTTGCCATTTCTAATCTTTAATGTAGTCTCCA
ACGACTTTGATAATGGCCTTGATGCGCCGCTGGAAGCTCTGCAAGGGGGT
AAAAAGGTAGTTGTGGTGCATATGCAGGGTGTTCACGATAAATTGGAACT
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ACTAATATAAAAGATTGCGTGAACAATACACTATAACTTCCACCACAAAC
AATAGTCATCATGGAACAAGCAAGGAGAGACGCCATCTTAGAAATTGGCT
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CAGGTTGGCCAAGAACCGTGGAGTGAGCAAGCAGCTGGAGGTCATACCGA
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CTTCTTCTCCGACGAGAAGAACTGGACTGTCGACAGAAGCTACAACGTCC
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GGTGGCTGCTGAGGGAGGACATGATGAATAAATTTATTGTTTAATATCAT
GTCTAACTTTTTCATATTAACAAATACATTCCAAATTCCATTTTTATCAA
GCAGGTTGAATTTTAAGATAGTTCCAATTTATCGTGAACACCCTGCATAT
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ACATATACCCATATATAAATGAATTCATAAATAACAGTTTTTATGATATT
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CGAAGGGGGGCGTCAATACACACAGCTTGTCAGCTGACGGGAAAAATTAT
CGATTCATCTCATGTGTTTTTATTATTCATCTCTTTTATAAGTGTCCAAA
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AAAAAAACTGAATAGATATTTGATGTCCTTATCAAGTTTCGGTAGTAATG
AATCTTGACATAAGTAAAGAAGACTGCAAACAGTTCGAACACTTTTTACT
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TTCGTTTATTTTTTTCGTACTGAGATATATATATTTGACACAAAATAACA
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ATTTGTGCACAAAAAAACAAAAAAACAAAAAAATAACTGCTCGATTTTGA
CTCGCCACACTGTATTATATCATGACCAAAATTGTCTTAATACTTTTTTT
CTGGTCATGTAAACATTTCACTTATACCTAAAACTCCGCCATGGAGTTAA
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GACCTCAAAGATCACAGGGATAGACAGTAGTACAATTATGGAATTAAGGA
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ATACTTTTAGATCATGACGTAGGGATTTGTTTTAAATAGATAGTAATGTA
CCTTTTGTTTTACGAGTTGATATATTTTAATAGTTATGTCTATGTACATC
CTTTTAAGTGTAATCCCTTATAGAATATATATTTAGTGTTGTTAATTTAA
AGTAGATTGATCGAAAGTGCGGGATTTCTTTGTTCTACTCTGTACACATT
TTTGTTGGCCAAAGTGCTTGAGTTTATAGGAAGAATCGAGTAGGAAGGTT
TATAAATATGTAACACGTTTAGCTATATATATTAAAAAATAACTAGTCAA
ATTGTCTTTAGTCACCTTGCACGACTAATGACGTGATACATGTACATAGT
TCCATAGAACGGAAGTAAATTATCTCTTGATAATATGTACAATACATGTT
GCAGTAACCGTTTTTTATCTCATTTGTTAGAATCTGTGTATGTGTATATT
TTATGAATAAAATATTTATAGGCAAAGTTGGTGGTTGGAAGGATGTATTT
ACGCTTGATATGGTGGCTAAAATGGACGAATGGACAATCTGCAGAACACA
AGGAAGGGATTTACCTTTACACAAATTATATTGTTAG back to top
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