EMLSAT00000009706, EMLSAT00000009706-705553 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000009706
Unique NameEMLSAT00000009706-705553
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s626supercontigLSalAtl2s626:223487..231342 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000009706 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000009706EMLSAG00000009706-692472Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000043035EMLSAE00000043035-751963Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000043036EMLSAE00000043036-751964Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto774811auto774811Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000009706EMLSAP00000009706Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000009706

>EMLSAP00000009706 ID=EMLSAP00000009706|Name=EMLSAP00000009706|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=237bp
MAICKEKKRYLVHHGEKMNQEEFKQEIESTNTYCSDDFIEIRVNRIILRQ
TTSFDVNLKSRSKRKSFVPKKIVAAHTILNKNNFLLRNRKKHSYSPIISW
NDSASKDVSSETVMEEPHALVVFKPLNKITKQGKYLKNMTPQRRVEANTR
ERQRVHTITNAFDRLQSAIPSPNHSKQSKLSKLSVIKIATAYIMVLSRII
GYDYSIDGSTPSVDDCILNCKRLMESESRLKTKQLVL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s626:223487..231342+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000009706-705553 ID=EMLSAT00000009706-705553|Name=EMLSAT00000009706|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7856bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s626:223487..231342+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGCAATTTGCAAAGAAAAAAAAAGATATTTGGTTCATCACGGAGGTAA TTTATTTATGCTTGGTATCACATACGAACAGGGCTAGTATATTCTGTTGT GTAATGCGCCTGCTCCTGTTTCACATGTTAGAAATATAGCAGCACCATTA ATAAGAGGGAGATTGTTGTTATCTGAACTGGAAAACAGCAATTGCTCAAG AGAAAGCATTTTAGATTTAACTCTGAGATAAGAGAAATAAAGATGAGTTA ACTGATGTGCTTACACACTTATTTAGCAAGCATGATTTCTCTCTGACTAT TATTATTTTGTCTGTTTTTACAATTTATTTTTTTATGATTACTTTTGTGT TTTTATTTCTTGAATTTTTAGATTTCTTAATCATGAAAGTGAAATGAATG AGATTTGCTCTAGACTGAGAGAAAAGTGACAAAACAAATTTTTTTTTAAA GTACTAACTATTGAGGAATTAGATAATCTTCAGAATTCAGAATACATGTG ACGACTCTCCATTCTTCCAACTTTAATAGAATGATTCAATATTTATATTA TTTGAATTCGTCATTTGAAGTTATTATTTCAATAGATTTGAATCTGCACC TGACTTATTAAGGATCAATACTCAGAATTGCCAATAAGAAGATATGAATG CACATTTACCAGAAGAAGTGAGAATTGCCCCTCTTTTTGTTCTTATTAAG TATTCACTATTTTATCTTTTATCTTTGCCCCTTCATTTTACTTCGTAAAA ATTGAAAGATTGCGTTATATATACAAAAATAGGCGAGGAAGAAATCGTAT ACAACAAAAACAAAGAAATGCAAACTTCTTTGGACCCATCAGTGAACCGA CTTTTAGTGACTCCTTTCTTAGAGTAATTTATGTAATAAAATTAAATTAT AAATTTTATGACTCCACATGGACAAGTTTGCTTTTTCTTAATATTCCGTT TATTTAGTCATTATTTGCTCCTTTTGATCACACATGTTTGCTAACTATTC AGCGTTCATATTTTTTGTAATTCATACTGAATCTTTCATGTCCACTCTTT CCTAGAGTCATTTAGTTGGAACTACATTTATTCGCATTGTGCTGTACAGA ACTCTCTTTCTGTATTTCAGAAATGGATAATAGTAAACGTTTGCTTATAC AGTCTTATGTTAATTTAACAAAGTAAAACCATAGAGAAAGGGGAGGGGGT GCTTTAAGAAATATTATTAATTAGTGTTCCCTCAATATATATATTTCTGT AATTTTTTAACTAAAACATATTTTGATATGATATCCAATATGAGAAAAAA AATATACGAAAATAATAATTGTACTAAAGATTGATTACAACTAGCTTGAC AATTTCGATTTCTATGGTAATCGATTAATTTGTTCATTCTTACAACTGAT CTAATAATTAGTGTTGTGTCAGTCTTTATTTGGGACTGAAGACTGCAGTC CTGTCCAGTTCACTCTTGGTGGTATGGTCCAGTTCAGTCCTAAAAACGTC TAAATTTTGGTCTTTGACTTCTTCATTCACCTTTTTATTTTATTTTTTAA TCAGTTCTAGTACTGACAGTTTGATAGACTATAGTCTTAAGGACTTTTCC CAAGTACTGATGGACCAGTCCTAATACTGGCATGTACCCTTAATAAATAA GGACTACCACAACATTAAAAAAAGGATTAATCAGATATTGGCAATGATAT GAAGCCACAGTCAATTATTATCAATAATAAGGATATTGGTGTCCAGTTCT ATGCAAGATTTAAAAAATGATGTAAATTGATCCAATAGTGACTCCAAAAA ATTCAAAAAATTAGTAATCTCAGAGCAGTGAAATTTTATAATTCAACACT ATGTGACAATATTGCAATTAAATAAAGAGATTGTCCTTGGAAAGATTTAA CAATATCAAAGCCTTGGTTGAGTAATAAATATCCTTGTTAGCGTTCTTCT TTTTTGCGTTCCGTTCATTTTTTTTAACTCGTTCATCGTTCAGTATTCAG CCATTTTTTCTATTCCTTTTCCACTTTCCAATCATAAGGTTGTTCGATAT AAACAGTAAGACATAAAATCTTAACTTCCAGGCACTTTCAGGGAGGGCTC ATTTGAGAACTATGTTTCAAAATTTTTTAACACAATAATTCGGTGAATAT TAGTGTTCAAATGAGCTACAATTTACTAAAATCGGATGATAAAATCGATT GCTGTATGACCCATGGCATCAGACGGGAAGAGTTTACCTTCGTATTGGTT TCCAAAAGGCCTGAAAGTTGGCACCCAGGAGTACAAGGGAGTCTTCAAGG TTTTGGTATTACCCAGGGGGAAGTCCCACTACACAGTGAGAAACATTGTT TTCCAGTAGGACTCCGCCCCTGGGTCCAAGGCCAGGACTATGCAACAATG GCTTGAAGATAATTTTTTTAATTTCTAAAATACGATTTGTGGCATCCCTC CTCGCCTGACATGAATCCTCTAGACTACAATATCAGGGCCTATGTCGAAA GTATCCCAGCTTTGACACTCTTAAGACCTCCACTGAGAGGCAGTGTGCGG CCATGTCCAAGGGCCTTGTCGTAAAGTTTTGTACAGCCGTCAGGCTTGAG GCCATGGTGGCAGCAGTTGGCGTCCATTCCGAGAAACTACTTTGAAATTA CAGAACGGGAGATTGAAAATCTAGACTGACATGAATTTAAGCGGTGTCTT AGTTCTWTTGCATCCGATCCGATTCAAACGGGTCAAGAATTGGTATCGCT AAAACTACTATAGGTACATCCTTGCTCCTAATAGATCATGAAATGAGATG GCCAATTCTACTTTGAAAGAACTACAACTCACTTTTATAATACAGAAAAA ATTTTATTTCTCAATTACTACAGTGATTCATACCTCTTCGATAAAAATAA CTTCCAGCGACATTGCTATTATAAACACTAATTAGTGGGAAACTATACTG CAGCCCTCACAACAAACGAAAGCATAATGTATTATTTTTAGTGCCCCTTT TACTGAAACTCACGGCAATGGATGAACATCGGCCCCATGAGTAAGTGTTA GTCTTTGCTTTATCCGCCCTTTAGACCAAGGTTAATAGAAACATAAGTTT TTACAATAACGCGTGTTAGACTTCCACCACGGTTTTTAATATTGAGTCAT AGTCGTTGCGTGTTTTTTCAAAATCTATCTTTCTTGCCAAGCAGTCCCTA CGACATATGAAATTGAAAATTCCATCAAGCCCGATAACAAGATGGTATAA TCTTATATTTCTATTAACCTTGCTTTAGATCATATTTAAAAAAGTAAAAA AATATGTAAACTTTGGATTCTTAAATTATTGGACGTACTTTTGGAATGGA ACGTTAAAATCTGATTTTTAGTGTTCAGTGTTTTAAAAAAAATCCTTCCG TTCATTGAATGCACGTTCCATGGAACGGTGTGTGCTCATGAAGGACAGAC TAATACGGATTATTTGTTGGAGAGTTATAAGTGTAAGTTATTGTTAGAAT CAGTGTATTTTGAGGATTTTCTTCGGAGTAATTTGTCTCTTTGTATTTAT TACATAAAGAGTTAGATTTATGTTAATTTTTTTCCTGTCTTTCCTATAGT TGCTTTTTTGCTAATCTAATAAAACGTCATGATAGCTGATCTACTCACTT TATAAATCAAGGATGAGGATTGAAGTATCCATTTGACAAATTATCACTTT AGTTTATATCTCTCAAACTTCACCTTATGAATGGAATTGATATCAATGTG ATGGAAATTAATTATTTGTCTGCTATGTGCATCAAGGAAACTGAATGACG CTTATCATTCAAATAGTTTTATTAGAGTAGAAGATAAATTAGAGTTGACT TAAGGAGAAAAATATCCAGAATTTCAATGAAGGAGTGGATAYATAATTAT TTCTCTTTTCCTCKTTGGGTCTTTCAGTCGATTATTCTGTCTTTTTATAG AAGTAATCAGTTTTTATAGAAGTATACAATGATTCTGTAGAAGATCTTGA GGAATTTATGTACTCTTGAAAATGAATTATTCGTGAGGTCAAAAGTCATT ATCACAGACCTTGATGGGAAGGGGCATTTGCACAAAAAAATGTCCTTCCA TTAAAGGAGATCAGGTCAAACCAAGTGAGGCACAAAGATGAGAGATTTGA TAATAATATTAAATCTATTTTATACTGCACTATGCTAAGCAGTAAACTAA CTATAGTTAGTCTTTAATAAAGAGAGATGTTATCACAGCAATGATTTTAC AAATAATGAATAAAAAAGAAGAAAGATATTACTCCTTATTAAGGGCATCA AAAAAGATTTCCTCCTGTCATTTATGCTTGTATAACAACTTACTATTATC ATGAAGGATAAACACAATCGCTAATTATAATGCTATACCCAATGTAACTA CCCCTGATGTTTGACCATTTAAGTTGTTGTTTCTTGGAGCTTATGAACCA TAGTTAATCCTTCAGTGATAAAAAAGTAATATTTATTGACTATGTAATTT TGGAAAACTTAATGATCATACACAAGTCTTTAAGTGAAGAAACTAATGTC AGACAAACTAGTTGCGAGCCATCCAAAGCTACTACCCCCGTTGTTATGAC CATTTAATCAGTTGCTTTTGCAATTTAATGAGTTGTGTATCCTAATTCTT GATATGTTTAGCTATAATAGAATCATATTTTATGATTAGATTTTAAAAAA AACTGAATACTTACTGTTAGATGGTACAAAATTCAGAGTTCCATTTCGTA ATTTGGTGTGAATTACTCAAAACATGCTGGAAATGATCTCAATTTCACAA TTACCAATGGGGATATTTCTATAAATTATATAATTACCAACATACTCCAT TAATTAATGATGGTTCCATGAGAAGGGAAGAATTAACCCGTGTATTTCTC CATAAATTTTTTGAACGTATGGTTAACGTTATATTATATTCAATAAGCAT CTTTGTGAGATCAAAGTTAAAGTCTTACTTGATGTATTCATCGTTAACTT GATTTTATTGATGAATATCAATTCTCTTGGTATGAGATGATGATAATGAG TGGCATGTAATTCTAAACAGGGTACTGAAAGCACATTTACATCAACGAAT CCGATAAGCCAACTGTTTCTTATCCGGTAAGTATTTTCCAAAAATCCTGG GCCTCCATTTTCAGAAATCCAGAGAGAAGGCGACTTTATTTTATGCATTT TATTCAGTTCTCTATCGACTATAAGCATCTAATATTATATTAATATTGAA TAATAAAAGCGGGAATGATAACGTTCTTGATAGAAGAAAACGTATATTAT TTAATCAATGATGCCATAAGTATTTCTTCCCTTCTCCTCGCACGCTTTTG TATTCTTACCAATTTATCAACCTTAAATATATGTTACTACGGAATTAAGA CCCATGTTATAATGATCTACTTTTTACATGATTTTAGAGGAATAAAAAAC GTATTATTCCTATAGAGAAGAGAACTTTCAACATTTAAATAGTATTAGTA CAGGCAAAATTGTGTAAAATAATATTAAAACATGTATATTATGATTGAAT AATGCCTTTAGGAAAAATTACAACAAAAGTAGTCTGTAATTTATCATTCA GCGACAGATGTTAACATTACGACTATCTATTAAAGAATTAATAGAAAGGG GGAACACACTATAATACCAACAGTTTTCTAATCTTATAACTGTTCTTATT ATCTACGTTTTGTATTATATCACCTAACTATTGAGAAATATACAGCAGTT AAGTGAAGGAAAAGTATTTTTTAGGTAGCTGTCATAGGTTGAATGTCTTA TATTATTATATATATATATTTTTTTATAAAATTATATTCTTTCCTATTAC GACGAATTAAAATTTTAGAGAATATAAAAAGAAAAAAAACTGAAAGAGGC TGAATATATTACATATATCCTACTAGCATCTGCTTTTTTAGATATAAATA GCAACAGTGCCCTTAATCAGTCTTTTCCTAAAAAAATGTGATTTATGATT TTCACAGGTCTCTCTTTTTTTATTTCGCTATATATTCATAACATAAGTTC AAAACGTCATTTGTTATATTTTTCTGAAAAACATATTATATAAAAAATAG AATTAAAAAGAGAACTTTGGTACACTTTTGGTTTATCGGTTTGGCCTTTA AAGTCTTTTTAAAAAATTGAGTTTGTAGGGAATAACTATGATTCAGTGCC ATATTTCGACATGAAAGAACTATGTAGATGAAAATAAATGTAAGTATAAA TTGATACAAACATTTTAGCAATTGAAAAATGAATTATTCATTACTTTTCT TAATTACAATCAATAAAAAATGTATACAAACACCAAAAAATCGCGTAAAA TGAAGGACTGATCTTAGAAGATAATATCTTATTTACCTTATTTTTACTGT GGCCTTATCTTTCAAACTTAAAAAAAATCGTGTCTAAAAAAGGTCAATTT TGATTTCTTTCTTGGGAATCCAATGACTTCATTTTACTCAATTGTTTGGT AATTATTTACATTTTTTATTAATTGTAATCAAGATAAAGTAATGAATACT TTCATTTTTTGCATTTTTGAAATGCTTATTTAGACCCATTAGAATATTTT TTCTTAATATATATTATTGTCATAATTTTAATAATTGTATGTACCTTGCC CAAATCTAAAATAATTTGACTTATTAAATTATTAGTAAATACATAATAAA TTGATAAATCATACTATATTTCCATAAAATTTTTAAAAAAAATTAGAAAC AATTTTGGATATGACCCAAATTTGATGGCATCTAATATTAACAAAATTTG AAAATAATTTTTTTATCTGTAAATCAATCCAAATTTGAATTCAATAATAC TAAAATGAAGAGTTCTGATCTTCTTTCCTTTATTATATCTCGAAACAACA GCCCTTAAATATGTATGTATTCATTCATAATTTAATATGTCATTCGCTAA ATTTTACAAATTTAATTTTTAGAGAAAATGAACCAAGAGGAATTCAAACA AGAAATAGAATCAACTAATACATATTGCTCTGACGATTTTATAGAAATTA GAGTAAACAGGATTATTCTTCGTCAAACTACTTCATTTGATGTTAATCTA AAATCAAGATCAAAAAGGAAATCATTTGTACCAAAAAAAATAGTTGCAGC TCATACAATTTTAAACAAAAATAATTTTTTATTGAGGAATCGAAAGAAAC ATTCATATTCACCTATTATATCGTGGAATGACAGTGCTTCAAAAGATGTT TCTAGTGAAACAGTTATGGAGGAACCACATGCTTTAGTTGTATTTAAGCC TCTCAATAAAATAACTAAACAAGGAAAATATTTAAAAAATATGACGCCTC AGCGACGAGTTGAAGCAAATACTCGTGAAAGGCAAAGAGTCCATACCATT ACTAATGCATTTGATCGTCTTCAATCAGCAATACCTTCTCCTAATCATTC TAAACAATCTAAATTATCGAAGTTGTCAGTGATTAAAATTGCAACCGCTT ATATAATGGTTCTTTCTCGAATAATTGGATATGATTATTCTATTGATGGG TCTACCCCTTCTGTGGATGATTGTATTCTTAATTGTAAGAGACTGATGGA ATCAGAATCTAGATTAAAGACTAAACAGTTGGTTCTTTGATTTAAAACAT CATATGCTATACTTTCTATCAGATTGTTTTATTAATTAGAACCTGACCGT ACAATTAATATTTATGTTCTGAGAAATTTAAAATGTATATGTATAGATAG ATACAAGACGGTAAAACCAATACCACAGAGTTTTATTACAATTTTATAAA GTACAATATAATATTGTTGTTTTTTTTCATATACAAACTATTAAATAGAA TAAACG
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