EMLSAT00000010099, EMLSAT00000010099-705946 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010099
Unique NameEMLSAT00000010099-705946
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s666supercontigLSalAtl2s666:153539..161390 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010099 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010099EMLSAG00000010099-692865Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000044898EMLSAE00000044898-753826Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044899EMLSAE00000044899-753827Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044900EMLSAE00000044900-753828Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044901EMLSAE00000044901-753829Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044902EMLSAE00000044902-753830Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044903EMLSAE00000044903-753831Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044904EMLSAE00000044904-753832Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044905EMLSAE00000044905-753833Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044906EMLSAE00000044906-753834Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044907EMLSAE00000044907-753835Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044908EMLSAE00000044908-753836Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000044909EMLSAE00000044909-753837Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto773483auto773483Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010099EMLSAP00000010099Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010099

>EMLSAP00000010099 ID=EMLSAP00000010099|Name=EMLSAP00000010099|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=403bp
KYLSNVEIYHSKANNETGFRLPINVIPVNYFLNLSTQHTQNYAVDGFVKI
EVKCIKATYNITLHSSNLEIQNVSVLNGTXSTNHTSIISFGDETNDFLII
ALTEKLVINKTYYIEINYRMKEWPMEFGFFKTEYNNNKGEEKEMYATQFQ
AIHARSAFPCFDEPELKSTFDITLGHYSNLTTVSNMPNISITTSRSTAGY
AYDKFKTTPIMSTYLIAFAMVSDHSHIDVNASDVQLQLWAPKDSISQLNT
SFDCSPSLYNFFYDYYNYSQPLSIEKMLLVPNYPGGMENWGLFIFEKLLF
LDDGGMDLESLKNLNDLYLLIAHEFNHLWLGNLVTVKWWTEVWLNEGLTS
YMSYLAVHKTYANISSMDEQIFVVLTDVMDSDSSSLSPPIKQKIVNSNAK
ILD
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mRNA from alignment at LSalAtl2s666:153539..161390-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010099-705946 ID=EMLSAT00000010099-705946|Name=EMLSAT00000010099|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7852bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s666:153539..161390- (Lepeophtheirus salmonis)
AAATATTTATCTAATGTTGAAATTTATCACTCGAAGGCAAATAATGAAAC TGGATTCAGACTTCCTATTAATGTTATACCAGTGAACTACTTTTTGAATT TGAGCACTCAACACACACAAAACTATGCAGTAGATGGTTTTGTAAAGATT GAGGTGAAATGCATCAAAGCCACATATAATATAACGCTTCATTCAAGCAA TTTAGAAATACAAAATGTGAGTGTTCTTAATGGAACGRCATCCACAAACC ATACTTCAATCATTTCATTTGGTGATGAAACAAATGACTTTTTAATCATT GCATTGACAGAGAAATTGGTAATAAACAAAACTTATTATATTGAAATCAA TTATCGAATGAAGGAGTGGCCAATGGAATTTGGTTTCTTCAAAACGGAAT ATAATAATAACAAAGGTGAAGAAAAGTAAGTTTATAAAAATTTTTCATAT GATTTCAAACTAAATACAATTCTTTATTTATTAATTATGTTAATCAAACT TGAATTGTTTTAGAGAGATGTATGCCACTCAATTTCAGGCAATTCATGCT CGTTCAGCATTTCCTTGTTTTGATGAACCAGAACTTAAATCAACATTTGA TATTACTTTGGGGCACTATTCCAATCTAACCACCGTGTCAAACATGCCAA ATATATCGATTACAACCTCAAGGTATTTGAATTAAGTGAATATATACTCT AATAACACACTATTTGAGTTAATTCATTTAGCCTATAACGACATACCACG TATCATAAGGCTCTACCCATGTCAAATAACAAAGGTTGGGAGCCAAGTAT CTTTAATTTAAGGACATAAATTTTATACAGGGGGTTAAGATCAAATCCGT GTATTTTTCAAAAATCTTTTAATTGTCAACGAGGCCACATTTTTCGACGG ATTTACCTGAAAATTTGCTTAAACTGTTTTTATGAATGTGGAACAAAACT CATTTGATGTATCCGGCTCTAGCATCTATTATTGGTAGGATCCAATGCCA GAAGGAGGTAGTTCTTTGGCATGTGGGCCATTGCCTTCTTAATGGAGCAA TCAGAAAGTCTTTGATGGTATAAAATATTCGATTTCTTCTAGATTCAACM TAGCCATAGACAAAATTATCCATCAGATTAAGATTCAGACTTCTAGTGAT CATATTTCCTTACTAATGAAGTCATAGCAATGCTCACTCAGCCATTTTAG CAACGAATCTGGGGTCATTAGTCTCCAGAAGAGCCTTATGAATCTTTTGC ACCGTCTGGATTACTCTGTACTTATTTAATGAACTCTTTTTGTCTAATTT CAGCGCAAACTGCACTGTATACGCTTATATTTTTCCTATATAAGTGCAGT AACAAACTTATCATGTGTTTTACTTAAATTATCAATTTAATCTAAATCGG ATATTTACTTTATTTTTTATCTGGTCATTTTAATACTGTAAAATTTAAAT AGTACCAACCTAACCAATATATATTCAGTAACTTTTTTAATAGCAAGTTT GTATAATAACGAGAATTTAAGGCTTTAAGTATTAAATTATACTGCCATAT AATTTAATATCATGATAAAAAAAGCTACGATATTAGGGGAATATAATGCA CTAATCGAGGAGTCAGATAATCTAAAATACTGCGTTATGCAAAATCCATG GTGTTTGAAACTACGTTATGCGGTTATGTCTTATGTATATATTCAAAAAT TTTAATTTTTTAAGTATTTTTACTTGACGTACATATAAATTTTTTACTGA TTTTCAATTAATATAAATTTGTCATTGGTGAAACTGTCCTGGAATTTTGT TTCAACAATGAGGCTTAATTTAATAAAAGGAGGAAAAAAATGGGGTTGTT TTTTAGGTATGGATTTATAAAACTTTTTTTAAGCTTGATTATGTTTTTTC TCCCATTTTTGAGCTCTATGTGAGGATTTCTTGACAAAACATTAACTCAA AAAATTTGATTCAAATTAAAATCTTCAATTCCGAAAGATTCGATTTTTTT CCATATAAATGGAAAAAAGTTATAACTATTGAAATATTGACAACAAATTC ATTTAGCATTTTTAACTATTTTACAAAATTTGACACCATATATTAGATCA TATAAAATAACACATATTTCAACACTTAGATCAACAGCTGGTTATGCATA TGACAAGTTCAAAACAACACCAATTATGAGTACCTACCTTATTGCCTTTG CAATGGTTTCAGATCATTCTCATATAGATGTAAACGCATCGGATGTTCAA CTTCAACTTTGGGCTCCCAAGGATTCAATAAGTCAATTAAATACATCTTT CGACTGTAGTCCTAGTCTATATAACTTCTTTTATGATTATTATAATTACT CACAACCATTAAGTATTGAGGTAAGACATGTTATTAAATATAGTTACTTC ATACACATTTCTTAAGGAAGTATTCTTTTTATATAGAAAATGCTTCTGGT TCCAAATTATCCTGGTGGAATGGAAAACTGGGGTTTATTTATATTTGAGA AATTGTTATTTTTAGATGACGGTGGTATGGATCTAGAGTCTTTGAAAAAT TTAAATGATTTATATTTGCTCATTGCCCATGAATTTAACCATTTGTGGTT AGGTAATAAATGACTATTTAATTTTTGACAACCAAACTAAATTATTAATT TAATATAAATTTTATTTGTCTGGTATCATAAGTCAAGCTAAAATTCTGGT AAATTTGAGTAAAATAATTAGTTTTACAATAAAGAACAAACTGTTTTGAT TTAATTAATATACCTAATAATAATTAATTATACATGCCCAAGGGAAAAAC TAAAATTTGAGATGTGAAAAAGGTTGGAATCCGAGGTAGGGTAATTTCTT TAAAAATCAGGTATATATAAGTAGCCTAAACAGTATCAATTTGTAATTTT GTTGTTAATTGTTCATTCCTATTTGCTCATGCGACGATTCTTTTGGTCAA AATTGAGCAGTTTCGGAACAAACATTGCTGACACTCGTCTCATGCCCAAA AAGTGCGAAAAAAGTTTATGGCACGAGCCAGCTGATATGTCAATGTCTTA TGCATTTTCTCTGATACTAACGTTCTTCAATACCGCAACGCTTTTGTTTG CTGTTGAGGGACTTGGGCGTGCAGAGGGAGTCTTGTCATTGATGGCTTCC TGTCCATCTTGAAAGAATTTTTACGACATGTAAATATTTTCAAGTGTTTT GGAGCACTTAATTTGATTTTTTATACAAAATTTGATGCAAATTCTTTGAT CCATATTTTTCAATAGCAAGGAATTGCCAAAAACGCAAAGCACTACTAAC CGGTATGACTCACACTAACAATCTATTCATATGATTTAGCTGAAGCAGTA AATATATGTTCGTAACGAGTGTACTACCATAAATAAAAAAATCGAGCATA CCAAATGTACGTTGCTTGTGAAATTTATAAAGTCACCTTATTTTTTGAAC ACATCTCATATTAACTAAGAAGGAGCAACATTGTGACATAAGTGAAAATA CTAGTATGTTGCCTCTTAAAGTTATCATATTTTTTGTAAAACTCACTCAT TTGTAGTTTTTACGAACACTGTTATTGACCTTTCTCACATCTTAATGCAT CATTTGATATTCTAATCATACATCCACTTTTTTACTAATTTATGTCTTTT TAATGGCGATCTTTGTATTCTTTTTCACACTCTATAAATTTAAGACAATT TTTGTAGATGAAAAATATATTTAAGATATTGAAAGTTTACATAATATGTA CTGTTTTCACCTTTGGGTTTATATTTCACATAATCAATTTTTAAGTCAAT ATGTTAACCATTTTATTTGGTACATTGACTTACATTATATANTTTTTTAC TAATTTATGTCTTTTTTAATGGCGATCTTTGTATTCTTTTTCACACTCTA TAAATTTAAGACAATTTTTGTAGATGAAAAATATATTTAAGATATTGAAA GTTTACATAATATGTACTGTTTTCACCTTTGGGTTTATATTTCACATAAT CAATTTTTAAGTCAATATGTTAACCATTTTATTTGGTACATTGACTTACA TTATATATAAATCCAATCATATTCACTGTTAAGAAGTAAGGAATATTTGA AGGTTTTGACCGTATAAGAAAATGGATTGTTTAGCTTGAAATAATTATAA ATTTTCATTTCTAGGAAATCTTGTGACGGTGAAATGGTGGACAGAAGTTT GGCTAAATGAAGGTTTAACATCTTATATGTCTTATCTAGCAGTCCACAAA ACATATGCAAATATTTCTTCAATGGATGAGCAAATTTTTGTTGTTCTAAC GGATGTAATGGATTCAGATTCAAGTTCACTATCTCCTCCAATCAAGCAAA AAATTGTCAACAGTAACGCAAAAATTTTGGATTGTCAGTTTAGTTATAAT ACTTACGAAAAGGGGGNCATTTTTAACTAAAATGATGAGTGATTTTATAG GAGAAGAAACTTTAAAGATTGCCTTGAGAATATATGTTGCAAAATTGTAA GTTTGATCCTTTTTTCTATTTTCAGGATTTCAACAAATATAGTTTTTCTA CTGTATTGTTATAGTGGACATAAAAAGAGCTTTAAGAAATATCTCTTAAT AAATGGAGAAAGTTATAATTTTAATACAGAAATAGGCATACCTTTTGCAA ATAATTACTTGCACTTTTTTTATTACTTACCTATTGTTGACATACAATAA GGCTGTTGTAACTAGAACTAAGTAATTTTAAAATTATATTTATTAATTTT AAATATTTCTAAGAATTAAAATAACGATTGGTAAAATGTTTAATTAATTC ACTAAGATTCTTTCTTATTCTTTTTGTACATTTCTGTCATTAGTGCATAC AAAAGTGTAGATGAAGATGATTTTCTACATGTAGTACTTGAAACAGCTCC AAATTCGAATATCAAAGATATTGTTAAATCTTGGACTAGACAAGGTGGTT TTCCTATGGTCAATGTTAGTATTGATTATGACAGTGGGAAAATAACAGTA ACTCAGGTAAACATGGATTTAATTTTTTCCCTTTGAATATATAATAAATC TATGTGTCTAAGCCCAAGTACATTATCATTTTACTATTTCTGTATCATTT TACTTTTAAGTTAATTTAATATATAGGAACGATTTCTTTTTGACTCTCAT ACGAATGTAACAAAAATTCAGAAATGGTGGATTCCCCTGAGATATAAGGC AATTGCAGAAAGCGAAACTGAAGTCAAAACAGTTTGGATGGATAATACTG AAAGGTCCAAAGTTTTCGAAATTGAAGTAATTAAGAATACTTCAACAACT CCTATTATATTAAACTGGAATTTTACGGGTATTAAACCACTATAAAATTC ATCCATAGTACTTCAAAACATTGATAATTTTTCAGGAATTTATAAAGTTA ATTATGATTCTGAGAGTTGGAAAAGAATAATTAATCAACTTATTAAGAAT AATAGTGTCATTACAATGTATAGTCGAGCACAACTAATAAAGGATGTCTT TACATTAGCTAAGGCTGGCAAACAGAATTATACTCTACCACTTGAACTGA TTCGATACATACCATATGAGAACGAATCTTTACCACGGGTTATTTTTTAT GAGGAGATGGAAAAGATAATGACAAGCCTTTTTAGTGTTGAGTTAGATTG GAAGTTCAGGGTTATTTGAGTTTATATCTATTAATCTTTAATAGCAAATA ATAACAAAATATATATTTCATAGAATTATATGAGGAAAATATTTGACAAG AAACAAATCGGTATTAATCCACCAACTGAACGGAATTACTACAAAAAGTA TAATTGGGCTCTGGATCTTGGTTTTTCTTGTCAGTTTGACATAAAAAAAG TGTACACAAAAATTTGTGAATAAATTTAAAAAATGGATGAGAGTGAAAAA CAATCAAAAGATTGGGTAAAATAACTTTTTTTCTAGAGATTTTTTGACAA GTTATTACTTTTGAAATTTTAATAGATAGCTCTAGTCAATACAGTAAGGA TTTAATTGTGAATTATATTGATACAGATTTTTGTTCAAGGTTGCATGGAT CTATCATTAGTAAATAAGTAATTTCAATGGATAATAATGAAATGATAGCA TCAATTTGTCCAAAATAAATTTATTGGGTCTTTAAATTTTTTTTTTTTTT TGAATAATTCGATTTTATTAGAAAATAAAATATGGAGCCTTTTTTTTATT TAATAAAAAATTTGTCATTTAAATCACTTTTAGAGTTGATTCCGATACTT TGGAAATTATGGTATGCACTGCAATAAGGAATGGAACTCAGAGAGAATGG CGTTTTCTTTTATATCAACTTTTAAAAACAACATACAGCGCTAAAGAGAA GCAACAATTCCTATCGGGTCTTACATGCTCTACAAATGTCACAACTCTAT ACAAGTAAGTTATAAATATATATATATAGAGTCAAACCATGTCTAATGGT CACCTGATTTAAGCGTGTTACAGCTAAGCTAAGCTGCGATATTCAGCACC CACGCAGGAAAATTTCATAATATAAAAACTATATTAAGCGTTTCGCTGCA ATTAAATAAACTATTACATACTTTCATAAATGAGCTTGCTTTTAAGTGTA AGTTTTTTAACACTTACATAGACTGTTGATTACAAAACAAAGAAGAAGTT AACAACTATAGATACGCTCTTGACAAGTTAAAAAATAAAATATGAATGTA TGCTCATAAATGAATGGTTTATCTTATATTTATGAATTTTCCTCCAACTG TAGAATAAATGTTATCCTATTTGCTTATACTTCCAATACAGCCCCGATAT AAATTTGTATCCTTTATTGTATTTATTAAACCACTATAAATTATAAAGTA ATTCCATGTGTGTGAGCTTGTAAAAGACGTAAAATAATTCTAAGGATTTG TTGTGGAGTTATAATTGTAAGTCATGTTGGATTCAGAATGGAATTTATGA TTATCATTAGAGTAATTCCTGTAATGCCATTTCGAAACAAGTTGATACAT TGGTGTTTATTTCCCAATCTGATAGATCTTTTAATTTAAACTTATAACAG CTAAGCCTACTCTCCTACCAAAAATGATTTAATTTGACAGGTTAAACATG TCAATTATCTTAATAAATTAGCAGGGCATATGATTAAAATCTGTATATTT TTCTCTCAATATGAATTAGAATATCAAAACAATTACTTAATTCATTCGGA ATATAAAAGTTTATTATCAAATTTACGAAACTGAATTATACCATCCAAAT AAATCTGCAATATATATATTTTTTTTCAAATGGTCTCATCGTTGAAAATG AGGAGTTTATATTATGATGTTAAAGTTTTTAAAGAGATTTTCTTTTAGTC TTGTGTCAGTAACTGATACATCATTTGAGCCCTTATGGTCTGATGGCGAG GATATTTTATTGGGTATGATGAAAACATCCTATGGAAGAAGTGCTTTGTT CAAATATATACAAAACAATACAGCAGCGTTTAATACGACGTATTTATGCA TATACTTTTCTTTGATAGTACCATTCTATAATATAGTTTTATATTTTGTC GTAGATTTGGACCACAGATTTTGGAAAAAAAAATATTTGAAATTTTAACA TTAGCTAGGGAAGAACAGGGAATCTACAGGGTGAATATCATTTAAAAATT ATTTAATTTTATTTTTACTATCAATTTTAATTTTATGTCCTCATTTTAGA TTGCTACTTTTATCGGGAATTGTACATTGGTTCCAGGAACGAAGGAGGAA AAACAAAAAAAAATTGAAAAAATAAAAATGAAGATTTCTACTAACAAGAA TATACGAGAAAACGTTAATAAATGGTTGTCCAACAGAAAAAAGCGTAGAT AA
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