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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s678 | supercontig | LSalAtl2s678:269421..282044 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010203 >EMLSAP00000010203 ID=EMLSAP00000010203|Name=EMLSAP00000010203|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=390bp
MPHTGQAGVNQLGGVFVNGRPLPDYVRRRIVELAMMGVRPCDISRQLLVS HGCVSKILTRFYETGSVKPGSIGGTRPKQVTTPSIVKRILRIKLENPGLF AWEIRDQLISQRLCDPNNIPSISSINRILRNAGHLDDTPRIGQXSASSTS SQISNISLNATPLTGKQAPHESNEATKITLDSNVKIIESSKEKIPTDIPQ TSNIAAXVLSSFPHIWNRGALMSMYPYIWPGYPLDSSSLLSERYYNHVEQ PNGIVAAAAAAAAAAVCAANVSNSGNRSLNHSRIQESKSNTTNPSFTSTI FQNVTSTTSFGGNAQDMSEMNEPSSTTQEPSSSGSKKGSPSFHSIDEILN KNFDKGSKKLKSSVIHVEEDEDTDNIIDPVCITSLKTSPI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s678:269421..282044+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010203-706050 ID=EMLSAT00000010203-706050|Name=EMLSAT00000010203|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12624bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s678:269421..282044+ (Lepeophtheirus salmonis) TTAGTCCTTAGTGGTTGATCCTTTGCGATAACTTATTTGGAATCATTTTG
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TGGACTGGTTTGAAGAGTAAGTAGATTTTACTTCAGTAGTTAGTTCTAGG
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GTAAGGTAGATTTTTCCTTAGAAAAATATGATAAAATAATCACCTGTTGT
GTAATCTAACAAAAACCCAAACTTTCTATATTCATTTCATACCAGTTTAG
AAAATGAGCCCTTTTCAAGACAAGAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAGGTAAA
ATGAGCATTTTTTCCAAAGGCTTAGTTTAAGTACGTTCTGTATTAAGCAT
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TTTTTCTGATTGAATCATAGAATCATATATCAGAGCAAATATCAAAATTT
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AACGCTCTTTCGACAGATGTTTGGTATCCCCCACGCTTTTTAAAAATGAT
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TAATATATTTTATTATAAACATAAAGTATGATTCTCAGTAGAGACTCTTT
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ATAGTTTTAAGATTAGAAAAAGAAAAAAGTTGGTGCAGACTATCTTTTTA
GTTAATACTTTAATAGATCATTGAAATGCTACCGTCTCTCTCTCTCTCTG
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CGAGTTTTGTCAAATTCATACGTCATTTTTACTCAGTATTGTTTTACAAT
TCTTCATGGAAATATATACGCCACAACAACGTGTACAAATTGTTCAATTG
TTCTATGGAAATCAACGTTCTGTGAAAGAAGTTTTTCGCAAATTACGCCC
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TAAAGGGGATTTTTTTCTAGATATAATTGTAAAGGATTGTTTTTTCGGTT
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ATCCAAAAACCGCTCGTTTTGAACTACCCTTTACTATTGATCAAAGTTTA
TTTTTAGATTTCAGATGCCTATTATGTTTTGATTTGGGAGGATAGAATGT
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GTTGATCCCAAAATATTCGATATAGTCAAAAAAGAGAAGTTTTTAATGAC
TGATACTATACATACTATTTGTCATAGTCGGAGAAGACGGGATGCAGGAT
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ATCTGACATATTTTCAATTGCAGAAGGTTTGGCTTTTCAAGCTTTTTACT
AAAAATCACGTTTTTGGAGTATCATTTCGATTCGAAAGCATATTTAGAAT
TGAAATAACTTAAATAAGTTATCTTGAATAATTTTCTATAAAATTAATCC
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AACCTTAAATTAATACTTAAAAGGGATTGCGGTAAAAAAAAATAGTTTGA
TTTTATATATGTAATACTTTTTATATATCCTATCCTTATGCAAACTCCCC
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CGAAAAATTTAATTTTTGGAAAAAAAATTTCCAAAAATGTACTATTTGAA
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GTAGTTTGCTCAACTGTCATGTTATGGTCAAAAGTCCTTTTTTTCTTCTC
TTAAACGTGCGCAAAGATACAATACTAGTGATGTAAATCGTATGATTTAT
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ATGATCTAACCTTGTATTTATAAAGCCTTGATTGTCATTATATAATTCCG
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ACAGCTTTTATTGATATGAAGTGGAAGAGTTAAGAATTAATTTTAATTTC
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TCATTTGGCGAATCCTGTCGGCCCCATCTTCTCTTTTGGCTCAAAGAAGA
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CTTCTCCATCGTAAATACTTGTTTTGGATTAAAAGTTGTGCAACTAACTT
AAGGCTAACGCTTAACCTTTATGTTTAAAATTAGAATAACTGTGTTAAAT
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ATTTGCAATTTCCTTGTTTTATCAAAAGTAGTCAAATATCACTTCGACTA
GGGTTAAATGTTACTATGTTCTGTTTGCATAATTTATAATAAAAATTTTA
ACCTATGGAGTCCTCAAATTGATTGAAAATAATTATTATTGCATACAAAC
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CTTGTTGAAATTCAAAGTGATCAATAATTTGATTTGTGTTATTTCAAAAC
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TTTACACTTAAAAACAAATAATTTAATTTATTACATTTTCTTTTTTTAAG
GAGATTAAAAACGGTGATTAATTATTAATTCCTTGAAAAAAATTACACAA
CAAAGTTAATAAGCTAATTAGTTAATCTTAAAATAGAGGAATAGGTTTAA
TTGAAAAGGGTGGCATAGATTGTTACAATAATCTATGTACGGATATCATT
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AATATTGTAAAAATAAAAGATTCATGTAGTAGTAGGTTTATATTACATAC
ATAATATTTTCAGTTGAATTAGCCATGATGGGAGTACGTCCTTGTGACAT
CTCTAGGCAACTTTTAGTATCCCATGGGTGTGTATCTAAAATATTAACAA
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CCAAAGGTATGATTGATTTAATAAACAATTAAGAATGCCCAACTCATATA
CAAATTTATAGCAAGTGACGACTCCTTCGATTGTCAAAAGAATTCTTAGG
ATCAAATTGGAAAATCCTGGACTTTTTGCATGGGAAATACGAGATCAACT
TATTTCTCAACGCTTATGCGATCCCAATAATATTCCTTCAATTTCCTCGA
TTAATCGCATACTCCGGAATGCAGGGCATTTAGATGATACTCCAAGAATT
GGGCAGKCTTCCGCCTCTTCAACCTCTAGTCAAATCAGCAATATTTCACT
CAATGCAACTCCATTAACTGGGAAGCAAGCACCCCATGAGAGTAATGAGG
CAACAAAAATCACTTTGGATTCTAATGTAAAGATAATCGAATCTTCAAAA
GGTATTTTATATAAATATACATATTTATAACATTTTAATAATTTGCAAAT
GCATATACCTAGAAAAAATCCCTACGGATATTCCTCAGACATCCAATATA
GCGGCAGYTGTTCTATCCTCCTTCCCTCATATCTGGAATCGGGGAGCTCT
TATGTCAATGTACCCATACATTTGGCCCGGATATCCTCTGGATTCTTCAT
CCCTTTTGTCAGAAAGATACTATAATCATGTAGAACAGCCAAATGGAATT
GTAGCAGCKGCAGCCGCCGCTGCAGCTGCTGCAGTTTGCGCTGCAAATGT
GTCAAATTCGGGAAATAGGTCTTTAAATCATTCAAGGATTCAAGAATCAA
AATCTAACACAACGAATCCCTCTTTTACATCCACCATTTTTCAAAATGTT
ACATCAACAACCTCCTTTGGAGGGAATGCACAGGATATGTCTGAGATGAA
TGAACCTTCTTCAACAACACAAGAGCCATCTTCCAGTGGGAGTAAAAAGG
GTAGTCCTTCCTTTCACTCCATCGATGAAATCCTCAACAAGAATTTTGAC
AAAGGCTCCAAGAAATTAAAGAGCTCAGTAATACACGTGGAAGAGGATGA
AGATACTGATAATATCATTGATCCCGTTTGCATAACAAGCTTAAAAACAT
CACCAATTTAACTCCCGTACAATTCTTGCGTGTGTATGTATATGTGCAAT
ATTCCTTATTCATTAACCAAATTAGTTTATTACTATTGATTCTTGCAATG
CACTTAGTCAATTTTGCAGATTTTATTACTAATTCACTTTGTGTGTATGT
AAATTCCCAACTTTACCATTTTTG back to top
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