EMLSAT00000010203, EMLSAT00000010203-706050 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010203
Unique NameEMLSAT00000010203-706050
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s678supercontigLSalAtl2s678:269421..282044 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010203 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010203EMLSAG00000010203-692969Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000045353EMLSAE00000045353-754281Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000045354EMLSAE00000045354-754282Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000045355EMLSAE00000045355-754283Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000045356EMLSAE00000045356-754284Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000045357EMLSAE00000045357-754285Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000045358EMLSAE00000045358-754286Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775621auto775621Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010203EMLSAP00000010203Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010203

>EMLSAP00000010203 ID=EMLSAP00000010203|Name=EMLSAP00000010203|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=390bp
MPHTGQAGVNQLGGVFVNGRPLPDYVRRRIVELAMMGVRPCDISRQLLVS
HGCVSKILTRFYETGSVKPGSIGGTRPKQVTTPSIVKRILRIKLENPGLF
AWEIRDQLISQRLCDPNNIPSISSINRILRNAGHLDDTPRIGQXSASSTS
SQISNISLNATPLTGKQAPHESNEATKITLDSNVKIIESSKEKIPTDIPQ
TSNIAAXVLSSFPHIWNRGALMSMYPYIWPGYPLDSSSLLSERYYNHVEQ
PNGIVAAAAAAAAAAVCAANVSNSGNRSLNHSRIQESKSNTTNPSFTSTI
FQNVTSTTSFGGNAQDMSEMNEPSSTTQEPSSSGSKKGSPSFHSIDEILN
KNFDKGSKKLKSSVIHVEEDEDTDNIIDPVCITSLKTSPI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s678:269421..282044+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010203-706050 ID=EMLSAT00000010203-706050|Name=EMLSAT00000010203|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12624bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s678:269421..282044+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTAGTCCTTAGTGGTTGATCCTTTGCGATAACTTATTTGGAATCATTTTG TAGATATTTCTTGTTGTGAAAGTTTGTTCAGGAAGAAGGTTTTGTTTCTT TGGACTGGTTTGAAGAGTAAGTAGATTTTACTTCAGTAGTTAGTTCTAGG GTTCATATTGTAGATTGCCCACCATATTTGAGTATCACTTTAAAAAATTA ACCCATTTTTTAAAGAAATATTTCACATAATGATGATACAATCAGTGGAG TAGATTTGATGGGATATTTGACTCTCCTGAAGTGATTAATTATCCACTTA AAATGGAGAAGTAATACATATGTAATGTTGATTATCATAAAATTCAATTA ATGATGGATTTGTCATTAGTTTTATCTGCGTTTTATCCAATGTAAGACTT CAACTGTATTTTTATGAGGACACACATTTGTACAAAGCCATTTTTAATCT CTTTTATTTAATTTTTTCAAGATGGAGTTCAACCAAATTCAACTCTATAC TGATAGATCCACTAATATTTGAAAAAAATATATATTATATCAGCAAAATA TTGAAGACATGACTTTACGTCGATGAAATCAACCTTAGTAAACTATTTTA TTTTTGGATCATTTGCGAAAACAAAGGGGAAAAAAACCAAAAAATAAGTT CTTAAATGATGATTATATTAACGAGAATAGTTCTTCAATTGCAACTCTCA ATTCCTGTAAAAAGTTAAGAAATACTTTTATTAGAAAAAGCCACTTATAG GATATAGATTCCTAGACAAAAAAAAACTCTCATTTTACTATTTGATCACA TTATGATTGATTCATTTCCTTAAATTAGGATAAAGGGATCCCTATTTATT TTACTATTTAAACATTTTCATTTACTATTTCAGGTTTATAACTTAATGCC ACATACAGGTAAGTGTTCTAACTTAGATTTTGACTCCTTTGTGTGATATT CAGCATATTATTAGTAATTCCTCAATTTGCCGTATTCTTGATTAGAATAC TCAAAAAAATTCTTATTTTATCTACTCGCATATATAATTTGCCAATCCAC TCAACAATTATTCAAACTTTGTAAATGTATAACAAATTTGAATATTAATC ATATATTGTCAAATAAGGCGATCCTTGTTGAAATACTGTTTGATTAAAAT TTAATTAAATTGAATAAGAATGATATCCTTAAAGTTTTCTAATATGTCTT TGATGTGATATTTTTTCAAAGTCTAGTATATTTTAGTGTTAGCAATATTT TTACACGGCTTTCAATACTGAAATAGTTCTTAGTATTTCGATATTTTTTG ACCAAATATGTTAAAAAGAATGTTAGGTAATTTCGCTCTTCAGTTATATA TTTTCCCTTAAAAAATTAGACAGAAATGGATCTTATGGAATTTATTAATC TATGAAATTAATCATTTAAATTTAAAATAACAGGGGAAATCAAAAGTTCT GAGCATTTTTTCACTTTATTTTGACAATAAAATTGACACAGTAAGGATTA TTTAATTTAGAAGGTTCCAAACGTTTTTTTTGGATAAATTTCAGTTCCTG GACAAAGCAATAAGTGCTCAAATACCATTCCAACTCGACGATTACCATTA TTTTATCGAGATTTTCGACGTCCATATTACCATAATTGAATAATTAGAAC CACTGTTTTGCTGTTGCATTCTTTACTGTATTGGTTTACAATAAACAGCA GGGTTTCTTTTGGCCGTCTGCTCTGCCTTTTCACATTGGTCGTAGTGATA CTGAAGAATGTATCGAATTTTCTCTTTTTTTACTTCCATTTTGGAACGCT CTAACACGCAAATGGCTTTACAAAACACAAAAATGTTAATATACTTTTTT AATTTTACACTTTAAGCATACTTTAAGCTTTTTTTTTGATGCAATGTGAT AATTGTGAGATATAGCTCATTTAAAAATCTCTAGTAAAAAATGGTCATCA TTTTGTATTTAACCTAATATATAAAATATTTTCTTAGTCCTATTGAAATA ATATTTTGCAGAAATGCTTTTTTGTTCATCATTTTTTAAACAATGATCTG TATTAAACTGTAATATAAGAGGAAGGATAACCATACATCATTTTTTAATT GTTCATATCTACAAAGACAATGTCAATGAACTAAAAAATTAACACAATTT ATTTTTCATACCGCTTGAATTTTACGTGACATATAAAAGATTACGGGAAA TTCACTTACAGGGGCGCCCGTGGATTGGTTTGTTTCGTTTGCCAACAGAT TAATATCCCAAGGATACAATATCTAAACAAAATCAAAACTATATCATTAT TAACAGCTGACTATAAGTTAATTCGAATAAAAATATTTGAGCTATAAAAG TACGGCTTCATCAATTTGATCCCAGTTTAGTAATGTTAGTCAAATTTTTA TTGAAGGCAAATTTGGTATATAATCCAAACTCTTATCTTGAATTTTTTAC CTAATTTAATGACCAGGGGGGCAAACCCTTTTTAAGAAGTACATAAGTAG ACTTAGAATTTTTGAGCTATTTATTTGGCCAAAATGTTCAAAAAATGAAA TTTAAGTTTTTGAACAATAAGCACCCGAATATCAAAATAGATCAATTTGT ATTGAAAGAAAATACAGTTTTATAAGAATTTGCTTTGTATTTATCATTAA TTTGTTTATAAATTATATCGACAAATCAAGATTTTATAAAGATTTTCTTT CGTTAATGTTTGTCTTCAATCCGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 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TTTTCTAAAAACGATTTTTTTAAAATAAAAAACCGTAAGATTCTAAGAAT TATTCTCACTGTATGTTAGTATTGATCTTTGCACACTTTAAAAAAAAGGA GATTATAAGGTTTAGAGGCGAAAAAATATTCCAGCGTCAACTGTTGAATT GTAGTTTGCTCAACTGTCATGTTATGGTCAAAAGTCCTTTTTTTCTTCTC TTAAACGTGCGCAAAGATACAATACTAGTGATGTAAATCGTATGATTTAT TTAGCTGGCAGTTTTCATCAAGGTTAATAGAAATACAAGGTTGTACCCTA ACGCGTGCACGACTGATGTTTGACTTCCAGCACGCTTTTTAATATTAACG TCACATTAGATGAGTGGTTTCGTGTTTTTTTTTAAATCTGTTTTTCTTTC TCAGCAGGCGGTACGATATATTAAATTGTAAATTCTAGCAAGAGTGATGT CATAGACTATGAGTGGTTGCTTGTTTTGTCAAAATCTACCTGTCTTGCAG GAGTCGGTACAATACATCCAATTGAAAATTGTAACAAGCACGATTACATG ATGATCTAACCTTGTATTTATAAAGCCTTGATTGTCATTATATAATTCCG GAGACTTTCCTTTCTTAAATAGATTCCGTTATATTCAAACCCTGATTGAA CATTTGGGTATGCTCCTAAAAGACGGAGCTTAACCCTGAGGATTTGTTGC GGAGTTGTAATTGTAAATCCTTGTTCGACTCAAAGTAGAATTGGGGATCG ACATTGGAGTAACTCTTGCCAATGTCCTTGCTTCCTCCTCCACCTCCTTC CTCGTCAAAGCGGATTGTAGCTAATCTCCAGCAAAACATTCTTTAAATTG TCAGGGTTACCATGTTGATTTTTTTTAACTATGCCCATTATTCACACGAT TTTCATCACTAGTCATCACAACATGCAGCGAGAATAATTCTTAAAATTTT ACAGCTTTTATTGATATGAAGTGGAAGAGTTAAGAATTAATTTTAATTTC TTAATGCCCCGGTCAACGGGGGGGGGGGGCGAAACCTACTGTAATAATTT TATAAAGTAAACTTATGATATATATATATATATTTTTGTTTTAGGACAAG CTGGAGTTAATCAACTTGGGGGCGTTTTTGTAAACGGAAGACCACTTCCA GACTATGTTCGAAGACGGATAGGTAATTTATTACTCCTTTTGATTCACTA CTAGGATTGGAAATCTATATACGTTTCCAAAAATATGAACAACACATTTA TAACCACTGTTAATGACTTGATTTTACTTCAAGGGTACTAATGAGGTGTT AGTCAATGTACAGGGTCGTTCAAGTAAATCAGGACCAACTTTAACTGCAC CCTTATCAATAAGTGAAGCAAGTAGAGGTTTGAAATTTTATTTACAAGTT CTAATAATACAGAAAAAAAATCCATTCAATGTGCCCACTATCTTCACCAA TCATTTGGCGAATCCTGTCGGCCCCATCTTCTCTTTTGGCTCAAAGAAGA GGGAGCCATGATACTACAATTGCTCCAGTGGACCCAAAGGTCATGATACT GGCCTAATCTGTCTATCATAATGCTGTGGGATCTGTTGGTAATCCATTGT TTCTTATCTGATAAAAGATGATTCGGTTACCATGGGACTTCAAATCGTTC AGCAATTTTCTTATGTGGGCAGCCCGTGCTGCCTTCATTTTGTCTATAAG GATATGTATTTAGTAGAGGCAGTATTACTTCATCCTTAGGTCAGTGTTAA TGGCCCTGGAGACTCTTMCCTTCTTACAAGGCACTTGTTGTCAAGAACGT TAATCGGAGTACACTGGGATCGTGCGCGGAAAACTGCCCTGGGCAAAATT GCCTGTTCAAGATTGCCATGGAGAAAACTGCCATGTAGGAAAATTGCCCG TATTTTGATCAAACTTCATGATAAACAATAGCACATTATAAATTCACTAA ATTATTTATGACAAATATCTAAATTTTTGTTTGTTCCATCCGCCAGGGGA GTACCTTCAAGTGTGAGTAATATTATTGCAATACAAGCGCATTGCATTTT TTGCAATTCAATTCAATTTTCTAATAAATGGACCGAGATGATTGGTAAGG GTGGATAAATAGCTTATGGCCTCTTAAAATAGGGTTGAATACTCTCCGCC CTTGGATTGGCCAATGTGTCGGAGGMAGTGTGGGATTGTTAAAAACCAAC GCCAATTCATCCAAGAAACCCGTCTAACACCACAAACTAGTTCAAAGCTC TCGGGTTGACTAGAGTCCTGGGGGTAGTGTGGGATAGTTAAAAACCACCT CCAATCCTCTAATATCAAAAAATAGTACTAATTCATCGGGTTGTACGGGG TACTTGACGGTACGCCTGGATATATATAGTATGAGTAACATTACTCACAC TTGAATGTACTCCCTTGGGGGATGGAACAAACTAATATATTTAGATATTT GTCATAAATAATATTAAACGGATTTATAATGTGTTATTATTCATCATAAA GTTTTATCAAAATACGGGCAATTTTCTCCTTGGCAATTTTCCTAGTATCC ACTGGGATGTATACCACGCAAGTAAATTCGATAATGGTATTCTTTTGGGT CTTCTCCATCGTAAATACTTGTTTTGGATTAAAAGTTGTGCAACTAACTT AAGGCTAACGCTTAACCTTTATGTTTAAAATTAGAATAACTGTGTTAAAT TTTTTCCTCATTATTCAGGATGTAGTTAAAGATAGTCTGGATTTACTTGA ACGACCTTGTGTATAGAATATTGACTTTGGCATGGTTTGATACCCCACAA CCAATTTTTGCCTTAGTACGTGCCATTTAAATGGAATAAATAGGATTTTT GACAAAATTGCCATTTTTAGGCATCTTGTACCGTTCCAAATATGGTAGAA TAACAAGTTATAGAATGTACCGTTTATATTAATAGTATTTGGTATATGAG TAAAAAAATGTTGTGCATCTTTTCTTAAATAATGTAGGATATGCTCAATG ATTTGCAATTTCCTTGTTTTATCAAAAGTAGTCAAATATCACTTCGACTA GGGTTAAATGTTACTATGTTCTGTTTGCATAATTTATAATAAAAATTTTA ACCTATGGAGTCCTCAAATTGATTGAAAATAATTATTATTGCATACAAAC TTTAACTCCAATTATTTTTTATTATTATATTCATAAGAGTTTAGGACTCA TGAAATATAAATTGCATATTTAAGAACATAAGTGTTTCTATGGCATTGAC CTTGTTGAAATTCAAAGTGATCAATAATTTGATTTGTGTTATTTCAAAAC TTATATCATTAGATAGCAACGATGCACTCAACTCTACGTAGATTTAATTA TTTACACTTAAAAACAAATAATTTAATTTATTACATTTTCTTTTTTTAAG GAGATTAAAAACGGTGATTAATTATTAATTCCTTGAAAAAAATTACACAA CAAAGTTAATAAGCTAATTAGTTAATCTTAAAATAGAGGAATAGGTTTAA TTGAAAAGGGTGGCATAGATTGTTACAATAATCTATGTACGGATATCATT TCATTCAATCTGAATTTAGAATGAATTCAAATTCTACGATTAATTTTAAT AATATTGTAAAAATAAAAGATTCATGTAGTAGTAGGTTTATATTACATAC ATAATATTTTCAGTTGAATTAGCCATGATGGGAGTACGTCCTTGTGACAT CTCTAGGCAACTTTTAGTATCCCATGGGTGTGTATCTAAAATATTAACAA GATTTTATGAAACTGGGTCTGTCAAACCTGGATCCATAGGAGGTACCAGA CCAAAGGTATGATTGATTTAATAAACAATTAAGAATGCCCAACTCATATA CAAATTTATAGCAAGTGACGACTCCTTCGATTGTCAAAAGAATTCTTAGG ATCAAATTGGAAAATCCTGGACTTTTTGCATGGGAAATACGAGATCAACT TATTTCTCAACGCTTATGCGATCCCAATAATATTCCTTCAATTTCCTCGA TTAATCGCATACTCCGGAATGCAGGGCATTTAGATGATACTCCAAGAATT GGGCAGKCTTCCGCCTCTTCAACCTCTAGTCAAATCAGCAATATTTCACT CAATGCAACTCCATTAACTGGGAAGCAAGCACCCCATGAGAGTAATGAGG CAACAAAAATCACTTTGGATTCTAATGTAAAGATAATCGAATCTTCAAAA GGTATTTTATATAAATATACATATTTATAACATTTTAATAATTTGCAAAT GCATATACCTAGAAAAAATCCCTACGGATATTCCTCAGACATCCAATATA GCGGCAGYTGTTCTATCCTCCTTCCCTCATATCTGGAATCGGGGAGCTCT TATGTCAATGTACCCATACATTTGGCCCGGATATCCTCTGGATTCTTCAT CCCTTTTGTCAGAAAGATACTATAATCATGTAGAACAGCCAAATGGAATT GTAGCAGCKGCAGCCGCCGCTGCAGCTGCTGCAGTTTGCGCTGCAAATGT GTCAAATTCGGGAAATAGGTCTTTAAATCATTCAAGGATTCAAGAATCAA AATCTAACACAACGAATCCCTCTTTTACATCCACCATTTTTCAAAATGTT ACATCAACAACCTCCTTTGGAGGGAATGCACAGGATATGTCTGAGATGAA TGAACCTTCTTCAACAACACAAGAGCCATCTTCCAGTGGGAGTAAAAAGG GTAGTCCTTCCTTTCACTCCATCGATGAAATCCTCAACAAGAATTTTGAC AAAGGCTCCAAGAAATTAAAGAGCTCAGTAATACACGTGGAAGAGGATGA AGATACTGATAATATCATTGATCCCGTTTGCATAACAAGCTTAAAAACAT CACCAATTTAACTCCCGTACAATTCTTGCGTGTGTATGTATATGTGCAAT ATTCCTTATTCATTAACCAAATTAGTTTATTACTATTGATTCTTGCAATG CACTTAGTCAATTTTGCAGATTTTATTACTAATTCACTTTGTGTGTATGT AAATTCCCAACTTTACCATTTTTG
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