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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s682 | supercontig | LSalAtl2s682:692373..711459 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010305 >EMLSAP00000010305 ID=EMLSAP00000010305|Name=EMLSAP00000010305|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=487bp
MKQDKSKNAARNRRERENGEFFELGKLLPLPXAITSQLDKXSIIRLTTSY LRMRQVFPDGLGDGWGLKPSINKQPEILKELGSHLLQTLDGFIFVLSADG KIILELEMEKSFVLRMKCVLAKRNAGLTSGGYKVIHCRGYLKIKRINGSD SSSNTSSSSSPSLISESSKFANIGFVAVAHSLPPSSITEVKMFSNVFMFR ASLDLKLIFLDQKVLNLTGYEPQDLIEKTLYQYVHGSDMLALRMSHITRN IIPITLPLLYKREKQEHNLILNQDQLTDLVPSYNSWIPSRLDQSQCTIQQ GQQKESSRDIVNSCEGVNSIYLQEIDATTSEFQTDFGSHNVPESSSSSPA WQYDQCYNNTCXSWSNYYSNRNPPQIQPHLSPTQDQAQMQHKDFFGSLPW KDLLVNEPRSLSRSSQNSSSSAELDKTMMHHQQMSASSNIVNPSIPSSGI LTNSDSFDMKPKSVESDYSDIRSTLYLKKMSPTFNGA back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s682:692373..711459+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010305-706152 ID=EMLSAT00000010305-706152|Name=EMLSAT00000010305|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19087bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s682:692373..711459+ (Lepeophtheirus salmonis) GTAAATGGAGAGAAGAAGAAGCAAACACAACTACTCCACATCATCCTCAG
TAGAAAAGGGTGGGAGGAGCCTTTTCATTATCTTTTGGTTCTTCTTGGCT
CCTCCTTTGGTTTATTATTAAAGACTCAAAAAGAGGATTTGTCGTCCCTT
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TCAGCTGGATAAGSCATCCATTATTCGTCTCACAACAAGTTATCTACGAA
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GAATCCAACACTCATCCATATTTTGAATGGTCAATAAATTTGACTTGTAA
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GTTTTTAAAGTACCTAACGTGCTAATTACAAATCTGTAAACAATTTTGGT
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ATTTGAAGATAATTACTTAATATCTAATAATAAAAAGAGCAAATGCTTTT
AGAAAGAGTAGTTCATTCTGATTTGATTTCAAATTTATTGTGTCGGAAAT
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AATTGCCATCAATTGAATGTCATGATTTTAAATAAGCACGTTCTATTAAT
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GTTTATCGAAAGAAAAAAAATATTGATCCCATCATCTTAGTAAATTATAG
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CGTTTTTCTGTAATTATTGCGTAATATAAGTAGTGATGTTAATCGTGTGT
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AATTAGATAATAGTTACAACAGCTTAAGAAAAGAAAATTCACTCTACACT
TTTCCCCAAACTTATTAGATATATTTAAAAAAATAATCCTATTTATATAA
GTATGTATATATTACGATGGTGATATTTGTTTAGGTTTATCCCCCTCTAA
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ATCTACACCAGTGTGTAGTAACGGTTTTATTATTATGGGGCCGGAATTTT
TGTAGTTGGGGGGGGGGGGGAGGATTAGAGTGACTATGGATTACTTTAAA
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TTGTCGTCATTACGACTCTGTAAAGAATGTATACATCCTTATTAAAATAA
TAGTCCCCCTGAAAAAAATTAACCCTGATTAGTCAGAGGGACTATTGCAT
ATAAATTATATAAATTGTTTTACGTTCTGTTTTTTTATGCCATAGACCAT
CTTAATTTGCCATTTAACTGTAATTTAATTATTATCTTGTTGACATAAAT
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ATATAAACATATTCTATCGAGCATTATTCTATAAGAACATATCCCCATAT
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GTTATTTATAAACCTTGTAGACAAGAAGACACATTAGCAAGGTTGTGCCC
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TAGGTATCAATTAAGCTTTATCGATCTCAGTGCCGGTCTTCGGTCTTGGT
TCTTTTTTATACAGGCTCAGTTAGGTCACAGGCACTTGAAACAAGGGCCT
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TGGAGGCTAGGGAGGCGTGCAGGAAGATGGATAATTGTGGATTGCTTTCA
GTCTACACATAAATACATAGGTAGTACAAATGTTTCGTATAAGGGGGCTC
AACTAAAAATTTATTAGTGTATGGGTGGCCTGGCATAGTAAAGTTTAGGA
AACCTGAGATTAAGAAATATTTAAAACTCAGATAAAACTGTATTACCCTG
GCGGTGTATAGAAAACGCTACAATTACACACAAAAAAAATCAGAGAATTG
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TTGAAGGTCTCGGTTCGACTTTGAGAACCGAACCCGTTTCAACCACTAAA
CCGATAAGGGCACAATGTTGTATATTAAGTATTTAGAAATTATTTGCAAA
TAAATTAATACCTACTGCCTTCAGAAGGTTTTTATGAAATACGTAATGAA
TCAGAGAGTTTTCACTGACGTCATATATTGCATCATAATTAAAGAAAACG
CCATTTTGAGGGCTTAAAAATTGATCTTTATATTACATAAAGTTGACAAA
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CATATTTGAATTTAATCAAAGTAATATTATCTCTGAAAATCCCTGTGCAA
TGTCCAAAGTTATGCAATGTTTTTTGATCGATTAGGAACGAGAAAAGTTT
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TGTTTACAATATTGAAATAAGATTGTATAAGGATGTAATAACAATGAATA
ATTAAAAAAAAATAATATTATAAAAATACCCTTAGAGAAATAGATTTTTG
ATAGAGAGCAAGGTTTAAATCTTATTATTTGTTGGTCCCATTTTGAAATC
CAATAGTTTACTGTATTTCTTAATATCAATACGAAAATAAATTACTAAAG
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AAAGTAAAATGAAAATGCTCTATTGTCGTGTTAAATATTAACTATGAATA
AATATTACAACATTATTTATTAAAATTTAATATTTAAAAAACGGAACTTT
TCATTTAGTACTCTCTTAACCTTTGAAAAATTACAAAGATCCGTATTTTT
GCACTGTTTTGGTGTTTCTAAATTGATTAGTACTCAGGGGCGTCTTTGAA
ATTTTTTTTTCTCCGAAACATTTAGTTTTTCAAATGATTTTTCAGTAAAA
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TCAGGCAGACTTTTTTTAGAAAATACATAATTAATAAAGAGATTTTTTAC
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ATGGGAAAGGAAAAATTCTTCCTAAAATTATATATATATATAAATATTAT
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GAGTATAATATCTAAAAGAAAAAACAGAGAAATACATTCATAATTATTCA
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TCTACTTTTCATGAGCATGCTCACACGTAACTACTCAATACTTGTATCTA
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TCTTGGTTTAAAGAAAATCGTGAGAAATAGAGTCCTAGGGGATTTTGTAT
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GATGTTGGAATCCATCGGTCATCTCTTAGGGAGAAGGTATCTGCCCTTTA
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GCTCCCAAGAGTTGTACTTAGAAAATCTAAGCATCTCTTGGATTTTTCTA
AAGGAAAACTGAACTCCTTGGTTCAGTTTATCACTGGGCATTGTCTCTTA
CGCCGACACTATCACCTTATGCACCATGGAGTTATCCCACTATGTCGTGG
GGGTGCTCTAAGAGATGAAGAACTACTTCATCTAGCTTATGAATGTCCTA
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CAAGAACATTCCGTCTCCAGTCTCCCCAGTTTTTTTATGAATTCTGATAT
TATTGGCTGGKTGAACAATACACCATCCCTACCACACTTTCAGGACGTAC
TGCAGTAAGATACCTAATCCGGCAAACCATTGAGAGGGCACCAAAAATAA
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TTAGAGCGCTTACTAGTATAAACAAACAAAATTAATTCTAACATGGATCA
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TATATTATACATAAACGACCAATAACAAAAACAAACTTAAACAGGGGGAG
TACTATATACAGTGGATCCTGTATACACGCTAGATTTTATATGCGCACAG
GTCTGCAATTATTTAATTAATGCCACTACATTATCATTTCTTAGATTAAA
ATATGTTTATGATATACATCATGGAGCACTATATACAGTGCACCACGTGA
CTCGTTTCCATATATTCATACCGACAGACAAAATTTACTCTATTAATATA
GACATTATCATTGCATTTTGATCAATTAAAATTACTCAGTATATATTTAT
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AAAGGGGTGTTGGGCTTTTTGACAAATAAAATTTTAGTATTGACGCGGGA
AAAAAAAGCTTTTATTTATCTTTTTTTTTTTGTTTATAAATTAAGAAAAG
ACAAATTTTTAAAACAGAATTGTTTAAATTTCAAAACTGTGACAAAAAAT
ATGATTGTCTAAAAAAGGTTTTTTTCTCTATAAATTGAACTATAAACTTT
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AAAAAGTCCAGGAATATTCAATTTTTGCATTATCCTCATCACAAGTAGGA
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TGAATAACATATCCATTCATTATCATCTAGTACTATTTATATATAATAAA
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GAAGATATTCAGACTATTGAGTTATAACTTAAATGACATTTTGACCCCGA
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AAGATGGCAGCATTCGTAAATAAAAGCTAGTCACATAGGTGCCAAGGAAG
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CCTGATTTTGTTGAAACTTTGATTTGGAAATACAATACCGGACCTGCAGT
TCCTGTGGACGAAAAGTCAACCAAGGAAATATTGGTAAAAATACAATCGT
CATTAGTTAACGGTTGGTTTAGGGATCGATATGTTAGAATACAAATTGGA
AAAGCCTACCTTTCAAGTTGTTTACTTGGCACTACGCTGGTTTTAACAGA
GTATAATGCACACTTGTCCCAGGCTGTGTTCTTGACTAGAGGCGTCGTAC
TCGACAAAAATTATAAATAATGAAAATAAAAAGAATTTATTTTTCCTAAA
AGAAACCGTCATACGATGAAATAAGTTTTTCCTTTATTTAAAAATGCCCT
TCAAAATTGTTCATTAGAAATATAAGGAAGGGTCTGGAATATTTTTTTCT
TAAAAAGTTAAATCAATCAATTACCTTCCTAAAAAAATGATGTTATATCG
GAAAACTGTCTAAAATTTTGATTCTTCCAGTGAGTTAACTAATGTAATAT
AACAGAGACGAAGTATGGGCAAGAATATTTTGGAAGTAATAGTTTAATTT
TGTTTATAAATAAATAAACAATTTCCTTCAGGAATCGTGTGTAAGAATAC
GAAATAATTAAGTATGGATTGCTAGCGGATGCTGCTATCGCATATTTTCA
TGTCAGCTGTTGCCGAGTGTGATGTATGTTATATCTGCAAATATAAACTC
CTAATGGGACTACCTGTAGTGCTCGGAGTTGTTAGACATAAATGAGCTTT
GCTTTATTTATATATATATATATGAAGAAGGTATCACATAAACAGAGTGG
TTCATTAAAATCTGAAAACTTTTAATTTTAAACTTCACGAAGATATAATT
TATTAATTAATAAAATAATTTCAACAAAATTAATAATATAGATGGATGTG
TCTCTGAGCTCTCTTACTCATTAATGTAGCCACCCTTAGTGCCAATGATG
GCTTCCAGGTGGTGGTGGAAGGGTTGGKACTCGCAGCGGRTTAAGKCCTT
TATCATAGCGTCCCAGTACTGCCTGAAAGTGGAATTTAGGGCCTCTTTGC
TTGGATGACGTACATTGTAGGTCTTCCCCTCAACATAGACTCAAAAGGTG
TAGTTGAGGGAGTTGGCATCCGGGCTGTAGGAATGGGGGAGGGGGAAGTG
TAAAAAAAAAGTTCGAAAGTGTTTTGCAACGGAGTAGATGGATTTTTTTC
ATTGCTGGTATCAAAAGTGACCTCTCCACCCTCACAAGGCTCTTCCCACC
TTGTTTTGAGGTAACGCTCTGGGTAGTTTGGTGTGGAATTCCGAGATCTC
TTGCATTGGCACTCATGTACTTGAGGGGATTCACCAAGGTTGTTTTCTGC
ACTCACAGGCCAATATAGCCCTCAGGTCAGCGGTTGCCGACCTCTTGTAT
AAGTCCTTATTGCCCTGCACCCTAAACCCCAATCATTCGAATAATATCAT
TTTCAAAAGCGTAATGCAAGCAACTAATTTCCAACGTGTTTCTTTATATT
TATAGCCCATGAGTTATTTGAAATGATGCTGACAGTTTGTTTTATAGAAT
GTAATTGATTTGAGATTCTTACACAGGTCTTGGAGATGGTTGGGGACTCA
AGCCTAGTATAAATAAACAGCCAGAGATATTAAAGGAACTGGGATCACAT
CTACTACAAACATTAGATGGGTTTATATTTGTTTTATCAGCTGATGGTAA
AATCATGTATATATCTGAGACCGCTTCTGTACATTTGGGACTATCGCAAG
TCGAACTGACCGGGAATTCTGTATACGAATACATTCATCCCATGGATCAA
GTAATTATTCATTTTTAAATACATCATGTGGTGAGTTAACACACAAAACA
ATATCTTGAATAAAAATCAAGAAATTTATGTTTCACATTATAAATGCATA
CAACCTAATATTTTATAGGCATATTTCGGTCAATTATAGGCTCTTTATTC
AAATTTATGGTATGAGTTGAGATAATCTAGAATATTAACTATAGTTTAGA
ACCTTCATTTGATTTATATGGCTTAATTTGGCCCGATATGGTCATATAAA
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TAAGTGCGATTTGCAGGATTAATCATAATTATTTGTTTATTCACACTGAC
GATAATTATTATTCTTGAAAAATATAAATGTAATCATTACTCAATTTCGA
TAAAAAATATTCTAGCTTGMTTGTATGTTAAAGGGCCACATTTGTAGTTT
TATAGGGTTCTAGGTAACTTTACTGCCAATATGTTTGACTCTGGTCATTT
GGTCTCATGGAGATTTGGTCGCAAGACATATTCGCCGTCTTTTTATGTTT
TTATTTTACGGGTTTGAACTTTACTCTTGTCTGTACTGAAAAACTTAAGT
TATTTTCTATCGGTGGAACTTTTAACATTTCTTCAAGCCTCAACAAAGAT
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