EMLSAT00000010305, EMLSAT00000010305-706152 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010305
Unique NameEMLSAT00000010305-706152
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s682supercontigLSalAtl2s682:692373..711459 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010305 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010305EMLSAG00000010305-693071Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000045837EMLSAE00000045837-754765Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000045838EMLSAE00000045838-754766Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000045839EMLSAE00000045839-754767Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000045840EMLSAE00000045840-754768Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779364auto779364Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010305EMLSAP00000010305Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010305

>EMLSAP00000010305 ID=EMLSAP00000010305|Name=EMLSAP00000010305|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=487bp
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LRMRQVFPDGLGDGWGLKPSINKQPEILKELGSHLLQTLDGFIFVLSADG
KIILELEMEKSFVLRMKCVLAKRNAGLTSGGYKVIHCRGYLKIKRINGSD
SSSNTSSSSSPSLISESSKFANIGFVAVAHSLPPSSITEVKMFSNVFMFR
ASLDLKLIFLDQKVLNLTGYEPQDLIEKTLYQYVHGSDMLALRMSHITRN
IIPITLPLLYKREKQEHNLILNQDQLTDLVPSYNSWIPSRLDQSQCTIQQ
GQQKESSRDIVNSCEGVNSIYLQEIDATTSEFQTDFGSHNVPESSSSSPA
WQYDQCYNNTCXSWSNYYSNRNPPQIQPHLSPTQDQAQMQHKDFFGSLPW
KDLLVNEPRSLSRSSQNSSSSAELDKTMMHHQQMSASSNIVNPSIPSSGI
LTNSDSFDMKPKSVESDYSDIRSTLYLKKMSPTFNGA
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mRNA from alignment at LSalAtl2s682:692373..711459+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010305-706152 ID=EMLSAT00000010305-706152|Name=EMLSAT00000010305|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19087bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s682:692373..711459+ (Lepeophtheirus salmonis)
GTAAATGGAGAGAAGAAGAAGCAAACACAACTACTCCACATCATCCTCAG TAGAAAAGGGTGGGAGGAGCCTTTTCATTATCTTTTGGTTCTTCTTGGCT CCTCCTTTGGTTTATTATTAAAGACTCAAAAAGAGGATTTGTCGTCCCTT CTGAGGAGTTGTTAATTGTTATGAAGGATCCAAGAAGTGAAACATGAAAC AGGATAAAAGTAAGAATGCAGCTCGAAATCGAAGAGAACGAGAAAATGGA GAGTTTTTCGAATTGGGTAAACTCCTTCCTCTTCCAYCAGCCATTACGAG TCAGCTGGATAAGSCATCCATTATTCGTCTCACAACAAGTTATCTACGAA TGCGTCAAGTCTTTCCCGATGGTAAGGCAAGTCCAGAGTTGTACAAATTA TAGACAAAAGTCTTATACTTTTTATTAAGGGCTTTTAAGAATAAATATTC ATTTATAAATGGAAAAATTGATTTTGCTAGAAATGGATTTGCAAATTTAA CTTTTAACATCGGATAGTACCCAATAATTACCCAGTTATTTTAATAACCA ATAGTTATTTATTGTTAAATAAATACACCGTGTCCTTTTCGGGTTAATAT TTTGTCCCCAAAACACAAATATATGTATTTCCTCCTGAAGACAATTAAAA AATGGATTTAGCAAAGTTTGGGGTAACAATTTTATAAGTAACAATTTTTC CTACCTCTGATTATGAAATAATCAGAAGTAGGAAAAAGTCCTTATACTAC AAGTCCGAGTGAAATCTCAAGTCTTTCTTTACAAGTCCCGATCCTAGAAA AGTACAGTTTCGAGTCTATGAATATTGTTAGCATGTCCATTTCGAATCCT TAAGTTTACTTTGAGTTAATTCCATTATACATTATTGAGTACAAAGTATT AAGGCTATTCTGGAGTGAACTAACTAACGAGTCCACGCCGAGTTGTGAGT TATAACTATTGAATCCAAGTTGCAAGTTGTTGAGGTAAGGTCAAATTGAT TCACAAGTTTTTAAAATATGGACTTAATCCACCTCTAACAATTATATATA TACGTGTTACGATTTAAAAAAATAGTAAACTATTGATTTGAAATAGAAAA TATGGCTAAAAAAGTATGTGACTATTTTTAGCTATGAGTTCATTATAAAA TTAAATAATTAAAAAAAAGGAAGCAAATTTCCAAGGCTTGTAAAGAAATC TATTAGATATTTTTGCAACTGAAATGACCAAGTTTTACATCAGCATTTTG CCAAAGAAATGGGGGAAAAATCATATATATGTACATAGAGTTAATCAAAT ATTGAAATATCAATATTTGTAAAATTTATAGGTCATAAAATAAGGGGCAA AAGGTTAAGATATCGACTACATATTTATTATTGAAGTTTATTCATGCATT AAAAGAATGTAGTCGGAGAATAATAAGTATGTGTTTAAATCTTCCTTCTG GCCCGAACTCTTAACTTGAGTAGTTAATTTGATAAATTGTACCTTCAATT TGCAAAAATCTAACACATGGGATGAAAAATCAGGCGATTAACATAGAAAA CACGTTTCTTTTCCTTTAAAATTTGTCTTTTTGTGTTTTAAATTATTATT ATTATTTATTTGCTTTATGGGTCGGGTCCTCATAACATTTTTCAAGTGAT ACTACGAAAAATGCCTTGGGGAAAATTGCCCAAGGGAGTACCTTCAAGTG TGAGTAATATTATTGCAATACAACATAATTTAAACTCAATCCAATCTTCT AAGAAATGGATCAAAAGGATTGCTAAGGAGGGAGGGGGAGATAAATAGCT TAGGGCCTCTTAAAATATTGTTGAATATCCTCCACCAACGGATTGTCCCG GGGGTAGTAAGAGAGGATGTCTTTGATACTTTTGGTGGTCCTTTTAAGGA 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