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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s68 | supercontig | LSalAtl2s68:1354764..1380961 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010392 >EMLSAP00000010392 ID=EMLSAP00000010392|Name=EMLSAP00000010392|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=533bp
MRPIYCFAFILIWAMGSSGNLFSYEANRSCLTSSLKGVCYNKLQCLARGG QISGYCSNALLSEVCCVFVQKGCYSNPSSQEKSLYFTNPKYPDYDSEANS CYLTVYFQPNVCWIKIEYNNFQLPSSKNGLCHYNYLTIINGGSGSGSMIC GFKSRMAXLIERPXKTKENAIKINILTQAEKYAWNIRVVQIECDQIQPLP RDPSCGFTGAPNSLVARSLNTLESPRNXLRHIYKPHGGDGALNLNRISPL LRRKLNTEMNYPGFNIRGSFCKSIFHDEFTEASEKIINGVEAPVFAFPWI VSFQYRGDHFCGGSIIDPQWVMTAAHCFDFPNLHEFLEGVEVSIGDHDIS LSNETRSTIRTIERIWIYPAWYRNPGSDGDLALIKLESPVVNIGSKAIHS VCMPDEHSVSKLESMKSGIAAGWGITESGDKSKVLRMVELNRIPLSVCKK NMEPLLIDIKKGMLCTLKGTNSRETVCSGDSGSPFMARYGSRFFVIGVVS FSTTDCNAPFPAVYTRVSQFVKWXGAVISSADS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s68:1354764..1380961+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010392-706239 ID=EMLSAT00000010392-706239|Name=EMLSAT00000010392|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=26198bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s68:1354764..1380961+ (Lepeophtheirus salmonis) GCAATGATTAAGAAGGACAAATTAAAAGGCACATTCAAAATTTCGATTCA
ATTCTTCAAAAAAGGTATGTAGTCAGTTGTTGATTTCATTTCCGTGTTTA
AATACATCACAACCTCAAACCATGATCAAGTGTTGCTAAAAAATTACACA
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TCTGGAAAGTAAGGAATGATTTCCATACGATCCACATAGAATATAAAATA
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TCCATGGATAAGTGTGGATTAACTGATTATAATCAGTTAGGTTAATAGTA
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TTTTATTTATATGCATGTCTGACTTTTCATGGGATCCTTGAAAATAATTG
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TATTCTGGTCCACGAAATGTGCGAATTTTTGTTTTTAAAATATTTTGGTC
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TAGAAAAGGATATTTCGGTTCAGGGTTTGAATTTCGATCTACTGTATTAA
TTTTAGACAATGGATATAATTTCAGCCTATAGTATGAGTTTCGGTCCATA
ATTTGAATTCCACTCCATGATTTGAACTTTGGACTATGATTTCAGTTCTA
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GGTTTGAATTCCAGTCCATGGTTTGAATTTTGGACTATGATTTGAATTCC
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GTTTAGTTTTTATAGCACTAGGCGGCAATTAGACAAATGAAAAATCTCCC
GCCAAAAATTTAAGTATGAACTATTTCAAAATTTCTCCAAACAAGTGGAG
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TCAGATAGCTTTTTTATTTCAAAATACATTCATATATATGTATATACATA
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TGCTGCCCTTTCCTCATTTCCCTTTCAGTTAGAATACATAAAATGTTGTA
GAGCAGTACAATTGATAACCCATTGAATGCGTTATAAATAGCTGAGCTAA
CATTTCATGAAATTAGCTGCAGTCTGCTGTGAGATAATAGAAATRAATAT
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CGATGGGCATATTTAACAAAAAAAGAAACCGCTAATTAACATGGTAACCT
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TCATTATATCAGCTGTGAAGAGGGAAGAGTGGGAAAAGGAAATAAACAAG
GGCATTGGCAGACTAAGTTCTCAATTCTACGCCTTCTAGTCATACAAAGA
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AGGACTTGCTTGGGAATTTTAAGTGTGAGACCTGGTGAGACTCCAATATA
ATCGAAAATCGACATTAAAGTCATTCCTGAATATGTATTTGTTTGATACA
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TTCCTTTTTTTTTTAGTTTTACATACCGGCAAGTCATATTTTTTGCAACT
CTAGCAAGATTGTATGTAAGCGAGTCCTTTAAATCAGGGTTGGTTAATTT
TTTTCAAGTTACTTCAGCTGGATATTTTGGATAATTAGGGAGGAGAGTGA
AGCTAGTTGACGCACTCCAATGCTCAAATCGATGAGGGATGCTAAGAAAT
ATATATTATTTGACAAATGACCAAGGGCTGCTCAAAAGGGATAACCAAGG
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AAGACCAGCTCATTACACAAATAAAATATTTATCTCCATGGAAAACATAA
TAAGTGTTGACCTCTCATTTTCAAAAATGAAGCAGCGGGGATTCTACAAA
TTAATTACGACAAATATTTAGCTAGAATGGATTCAATCTAATTATTACTT
TTAAAAATATACTTTTAGTTAAAAAAATGTCCATAAAATCAATTCTCTCA
ATTTCCCTTATTTTTTCTACTCATAAGCCCAAACAAAATTACCAAGAGAG
TTTTGTTAAGTATTCAACCATATTTTAAGAGATTTTAAGGAAAATAAATT
TAACTTAAAACAAAATCCGAACTAAAAAAAAGGAGAAACTGTCCTATGGT
CCTTATAAATATTACATAACGATATAAGTCGTAATGTAAAATACAGGAAA
ATTATTCTATCTTGTTAATTCATAAGACTCCTACACCCAGGGGCATTTAT
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TTGCAGTTTCCCTTTGCCATAAAAAGCTAGGTCCACAAGCTAAACCAAAA
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TTCGTTTTTAGAGTGGTCCTGTAAACACATTTGTGTAAGAACTATTCTCC
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TAATTCAATAACATTTGACACCCACCACTACCAAACTTTTACCTAATAAA
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TATTACATTCAAACATTTTCAAAGAAAAATAATTACATTCATTTAGTATT
TCCATTGCTTTCAAAATATTTGGTTTAAATAGTTTTGCAAATTTTATATT
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GCCTATCAACTCAAAAGCAAGCTAGAATGATTGCTCTCAAAATGGAGTCT
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TTATTCTAATGAACCCTTTTGGTGCATCGTAATTAGGACTTAAAGTAGCC
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TTAAAGTAATTTGCACTTCATTTTGAGAAAATTATCCTAGTTTGCTTTTG
TGTTGACGGGCTATATTTGTGTATAGCTATGAAAATTAGAGATGTACCAT
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TGATTCTAATGCTTTATAAGAAGTGTTACAATCATTTGATTTAAACCAAA
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AATGCCCTTCCCGTTGATCCCCTTGTCCCAATTAGCCAAAAACTCCGATA
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ATAGAAGAGCAGCTCATAGTAAATTATTCCATGCCAATCCCACCAAACAC
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GCTTTKTTGAATTTTGGCAACAATCTCTGTTGCTTGACATTAACATTAGT
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TTACTTTTAAGTAGTAAAAATCTATAATATGGAGAATTTCTTCCTTTTAG
ACTCGATGCATGATAATTAACAAATGAACTGGCCAAGTGCAATACTATCC
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CCAATAATGACAATGAAACACACAGTTTTAGAGAAAAAAACATAATAAAT
ACTTTCATTTTCAATTGATGGACCTCAGTAGGTCANATTATTATTGCACT
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AAAGGAGCCCCTAGTCTTATACCTAGGTTAGTCTGTAATATGACCCTCAC
TTCCTTCTATGGGTTGACATTTAAAATAAAATAATAAAATTAGATGTTTT
TTGTTTCTTTTTTTTGCCTAATAATTTATATGAATAAGTAAGCAGAGATA
TTGGAAGACTTTACATTATTGAGCAGATTCCTATACTTCAAAAAGGCAGA
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TGTTATTTTTATGCATAAAAAAAAATTAAATAATGTGAAATTATTTATTT
TTTTGTACTTGCTTAGGGTAAAACTAATATCCGGGTACATTTAATAACAA
GCTTTTTTTACTGTACATTTTTCGTTAAGTATTATAGCATAAATTGTTTA
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TCGTTAGGTTTGATAGTGGACTAAACTAATTTGTTTCTATAAAGAAGTTT
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CCTGGTAATCCAAACAATTTGAAAAATTGTGAACCTCTTTATTAAATCAG
CTGGAAGCAGCTGTGAGAATAAGGGAATAAACACGAATCCCACTACTTAT
ATAACAAGGCTATATAGACAGGAATTACTCTGATGTAAATCATCAACTCC
GACCTTCAATGGACAACGATGGATTCTGATTATAGCAAATTCCGAGATTT
GTACTCTGATAAAATTTTGAAAATACAGTTGATTAAAGTGCAATTTTAAC
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TTTTGTTGAGGGGGATGATCCCCCACCCCCTAGAACTCGAGCACTGCTTA
TAACTTCAGAGCAAACCTTTATTATTACCCAATATTTTTCATGAGCAACT
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AATTAAGGAGTATTCATCAACCACCTGGCCACATAGGGAGGGGGATCCGC
CTTATAACCGTGTATATCCTCGTTGGGAGAGGGGGAGGGTTTTAGCTTAA
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AGAGTATGGGACAAAAAATGTATATGGAACAACTTTTTTAAAAATAAATA
AAAACAAAAGGATTAGCCTTATCTAAAAAAAAAATCCGTTTGAAAATAGA
ATGTAGCATTATTCTCTTAAAAAACATGATTAAATGAGAAAAAGTAATAT
TTCTAGAGGAAAGGCGAGGCAGTACAAAAACTCGTACTAAGAATAGGGCT
GACGAGTAGGAGTCGGAGACTCCAGATGTTGTTTTGTTTTTACGTGGAGT
ATATAGTATAAAAATATGAATTAGCGGCGAATATGTCATGTGGTAAAATC
TACAGAAGGCGAAAATCTACGGCAAAATTATCAGCCACGAGTTTAAATTA
TGTATATGTGGTAGTCTTGCTCTCCAATGAATGATTGAATAATGTTCTGG
TATACCTTTTTCACTCGGTTTCCCTCCTTTTGAGTCTTTGTGTAACATTT
CTGTTTCTTTAAATGGGGATATGCTTGATGATACACTTTGATCAATTTTT
GATACTGTACTTCATTATTCATTTTAATACTTTTTGGAAATGCAATCTGG
TTAGGAAGAGAAAGGGTACAATTGCTTACAATGTGAAAAAATAACCTGAG
AATCCTTTATTCTTCGGTTTTCAAAGATTTCATCCACTAGGGATCCCCAC
TTTGAAAAGGTTTTGTTAATCAGTAAAACAGTGACCAGTTTTCAATGCCC
CCCTCTSTCCCCAAAGTCAATAAATCGGTACCCCCCCCCCCTCGTCAACT
GAACGTCTTAAATGTATGACCCCAATAAACATATGTTTATTGGGTCAGTA
TCAAACGTCCGTTTGTACTTATATATTTCATCGAATAAATTGCATGGAAA
AATATAATGGGTTCAAATAATAATGCTTTTATTTTTATAGATGATTGCAT
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AACAGTCATGTATATTTCCAAAAAAAAAAGATCTCTTTTGTTTTTATGAC
TTGGGATAATGAATTGCTACATAGTAGGGGAGACGAGTAAGACTTTTGTG
TCACTGCCTCATTTACTCCAAGCTGGTGGGACTGAAGGTGGGTTACTACT
AGTGATGTGTTGTTCCTTGGGACTGGTTSATAACTGTCAGCGATAGAATT
TCCCCTGAAAATGGCAGMAGTTTATCAAGTCATGGGGATGAAGGAGGGTA
TTTATTGCAAATATCTAGCAAAAAATGATTTGGGCTGATTTTTGGGTCCA
GACTGTGGTCTCAGACCGTGGACAGATTTCTTTCTGTCATTTATTATGAG
AGACCAATTTTTTTTTTCATGATCAACTGTCATTCATTTTTTTCAAAATC
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GGAAGGGCGGGATCAAAATTAATCCGAGCTATCTCGCTTTAAACTTGGTA
TAACGTCAATGTACTTGAAAAAACATATTATGTCACTTTATAAACAATTT
ATCTGTAAAATCGGTCTACACAGATATTTTTTTTGACCGAACTAGAGTGA
ATTTTTATATGAGACCGGTCAGATCGAGCTTTTTTGTTGGACCAAACTAA
TTTGGTCCAACAAAAAATATAACAGTCTCGGGCCGGTCTAGGATTTCCAG
AACCGAAACCCAACGCTCAATGATGTCACAAGGGATTGATTTTACCTTCT
TTAAGAGACTTTTAGGACCTTCTTTAACCTTTATGACCCAATGTGCCAAA
TTTGGCACATTTTGAAAATTACTTCAAAATCAAATAACTGTAAATACATC
TGTTAGAAACTTATCCTTTGACCATTTTGCGGTATAAATCGTATGAGCTA
TGTTCTCATGTAATCATTATTTTAAGTATTATCGACTAATCAATACATAT
TGTGATATTTTGCATTTGAATGCCAAATGTGACATATTTGACCTTATAAA
ATGTATGTGTCCCTGATGTACCAAATTTGGGACATATCAATTAAATACAC
GTTTATATTTTATTTTTATGCCTAATATGGATTAGTTATACAGAATAACA
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ATATGATTTTGCTCAGGTGAAACTAATTCCGTCCTTTAAATAAGTTCGGT
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TGCACAATAACTGACAAACTAACCAACAGATTGCCATGAAATTTTGACAG
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CATCCATGTATGAAGCAGAGACTTTTCACCCTATGTGTTATGTTACTAAT
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CCACCACGGACTGTAATGCKCCTTTTCCAGCAGTGTACACCCGAGTTTCT
CAATTCGTTAAATGGAMGGGAGCCGTCATATCCTCAGCGGATTCCTGA back to top
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