EMLSAT00000010392, EMLSAT00000010392-706239 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010392
Unique NameEMLSAT00000010392-706239
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s68supercontigLSalAtl2s68:1354764..1380961 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010392 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010392EMLSAG00000010392-693158Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000046220EMLSAE00000046220-755148Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046221EMLSAE00000046221-755149Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046222EMLSAE00000046222-755150Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046223EMLSAE00000046223-755151Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046224EMLSAE00000046224-755152Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000046225EMLSAE00000046225-755153Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780675auto780675Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010392EMLSAP00000010392Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010392

>EMLSAP00000010392 ID=EMLSAP00000010392|Name=EMLSAP00000010392|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=533bp
MRPIYCFAFILIWAMGSSGNLFSYEANRSCLTSSLKGVCYNKLQCLARGG
QISGYCSNALLSEVCCVFVQKGCYSNPSSQEKSLYFTNPKYPDYDSEANS
CYLTVYFQPNVCWIKIEYNNFQLPSSKNGLCHYNYLTIINGGSGSGSMIC
GFKSRMAXLIERPXKTKENAIKINILTQAEKYAWNIRVVQIECDQIQPLP
RDPSCGFTGAPNSLVARSLNTLESPRNXLRHIYKPHGGDGALNLNRISPL
LRRKLNTEMNYPGFNIRGSFCKSIFHDEFTEASEKIINGVEAPVFAFPWI
VSFQYRGDHFCGGSIIDPQWVMTAAHCFDFPNLHEFLEGVEVSIGDHDIS
LSNETRSTIRTIERIWIYPAWYRNPGSDGDLALIKLESPVVNIGSKAIHS
VCMPDEHSVSKLESMKSGIAAGWGITESGDKSKVLRMVELNRIPLSVCKK
NMEPLLIDIKKGMLCTLKGTNSRETVCSGDSGSPFMARYGSRFFVIGVVS
FSTTDCNAPFPAVYTRVSQFVKWXGAVISSADS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s68:1354764..1380961+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010392-706239 ID=EMLSAT00000010392-706239|Name=EMLSAT00000010392|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=26198bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s68:1354764..1380961+ (Lepeophtheirus salmonis)
GCAATGATTAAGAAGGACAAATTAAAAGGCACATTCAAAATTTCGATTCA ATTCTTCAAAAAAGGTATGTAGTCAGTTGTTGATTTCATTTCCGTGTTTA AATACATCACAACCTCAAACCATGATCAAGTGTTGCTAAAAAATTACACA TGAGGCCTATATACTGTTTTGCATTTATATTAATTTGGGCCATGGGCTCT TCTGGAAAGTAAGGAATGATTTCCATACGATCCACATAGAATATAAAATA TTGTTTTTTTGTTTTTATTTGCAAGTTTGTTTTCCTATGAGGCAAATCGT TCCTGTTTGACATCAAGTCTCAAAGGTGTTTGCTATAATAAGCTCCAATG TTTAGCACGAGGAGGTCAAATATCAGGATATTGTTCCAATGCCTTACTTT CGGAGGTTTGTTGCGTCTTTGTTCAGAAGGGTTGTTATTCAAATCCATCG TCACAAGAGAAATCCCTGTACTTTACAAATCCGAAATATCCAGACTATGA TAGTGAGGCCAATAGCTGCTATTTAACCGTTTATTTTCAACCGAATGTCT GTTGGGTAAGTAAGCAAATACAAATTAAACAAATGAAAAGATAATAGAAG ATTTTTAGGTCAAGGTTCATTATTTTATATTTATATGTAGATGTATTTAA TCTAGATAGATTTAGAAGGAATGGAGATAAAACAGTTAATAATCTTTGCT AAATCTTTATTTATATTAATATAAGCCGTTCTTTGGGCAACTGCCAAACG GGTGAACCAATGTCTCTCTAATTTATCAAATAAGTCCTTTGAATAGCAAT GTTAACTCCTTTATTAAAATTTTCATTAAATTAGGAAAGAAAAAACGAGA AATAATGAACCTCTTTCATAAATATTTTATGTACTTATTTTAAGCAACTT TTGTTTCGGACAAGGACTGGTTCGGATTTAAGTTATAATATTTCATCAAA ATGAGCCAAAAAGTTTTTATCTAAAGGATTTATTTTGTTGTCAGCTTCAA ATAAACATGTTTGGATATGTCTATTGATGCTAGATAATTACATTCCCTGT CTTGTCCTTCCTGATAATTACCTTTCTAGTAAATTCATTCCCTACAAAAT TCATTTCCGAACATTTCATTTCCATTTTGAAAAAATGGATATTTGGTGAC GTCATACGAACTGTAAATTTATATTTGAGTATCGCTGTACAGAAAAATGC CGAAAGAATGTGTTTATTGCTACCATAGAGGTTATGATTGATAAGTTGAA TTAAATTTACTTCTATCTCCTAAGCTACGTATAAAATCCTCGGATTTCTT TCATTCTCACTATGGAAGATGTATGATGAATATGTAAACACTATAAATCA TATCCGTTTCCCATGCCAAGGCATTTACAGTACCTGCTGCCGACTCAGCC CTCCTTGAACAACATTACACAAAAACTTATAACTAGCTCAGCAACATTAA TCGTAGGACGTCACAAAATTTCCCACTTCAAAATGGTAAAAATCCCTGGG GATGAATTTGAAGGACATAAATCAACTGGGAATGAATTCACTAGAAATTT AATTACGGGTCTCTGCTAGTTAAGTATGAAGTTCATAATAGACTTTGTAA ATCATAATTGAGTTATTATATCTATGGGAAAAGAGTATACAAATAAAGGT CATTAAACATATAAACTAATACAATCTCTATTCCAGATAAAAATCGAATA TAATAACTTTCAACTTCCGTCCAGTAAAAATGGGCTATGCCATTATAACT ATTTAACGATTATAAACGGTGGATCCGGGAGTGGAAGTATGATTTGTGGC TTTAAATCTCGTATGGCTTYACTAATTGAACGACCCYMTAAAACAAAAGA GAATGCAATTAAAATCAATATTCTTACACAGGCAGAAAAATATGCATGGA 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AATGTTTGAATAGCTAAATCCCTAAAAATTGGTGTTGATCCGGTCTTTGG TTATTATTTTAATATAAAAAGTAATTTGAGGGAAAAATAGGAAATTTTGG TCCAGACTATGAATTTCAGACTAGAATAAAAATTACGTTCCACAGTATAT ATTTCGAACTATGATTTTAGAAAATTGTCCTCCAAAAAAATATTTTTGAA ATTTAATTCAACTTTTCAAGTTTCCATCCAAAAAAATTCTGTAAAAACCT ATTGTATTTTTAAATTATTCTCGAAAAAATTCAAAATTTGAATTTTTATT AAAAAAATTATGTATTTGAAATTGTTTTCAAAAAAAAAAAAAGTTTATAG GACAATTGTGAGTTTTTAAAAATTTTGAGAAAATTCATTAATTTTGCAAT TTTATTCCTAAAATTTGATACTAGAAATTATTTTTCAAAGAATTTTATAT TTGAAATTTTAAAACAATGATATTTTGTGAATAGTTGTTGATTTTTGAAA TTTCTTTCCAAAAAATTAAATATTTGCAGTTAAATTTTTGAACTTTTTTT TACAAAAAAAAATATTTTTTTGAGAATACCCATAAAATTTTGAATTTTGT ACAAAAAATGTAATATTTGATTTTGATTTTTTTTAAATTTAATTTATTTT CAAAAAAATGATTAGAAACAATCATTATTGTATATAGATATAAATGTAGG GGTTCGGTTTTGAACCCCAAAACCGGTCTGAGACCGTCGTAATTTTAGGT AATTCTGTCCAATTTTGGTCTGGGCAGGTCTCGTAGTAAAATTTGTTATA TAAAAAAATTGGTCTTGATCCGGTCTTTGGTTATTATTTTAATATAAAAA AGTAATTTGAGGGAAAGATAGGAAATTTTAGTCCACGCTATGAATTTCAG ACTATGATAAGAATTACGTTCCACAGTATATATTTGGAACCATGATTTTT TATTCTGGTCCACGAAATGTGCGAATTTTTGTTTTTAAAATATTTTGGTC TATATTTTTTAATTTTTGACTATGATTTGCATTCAGTCAATGGTATGATT TTAGGACTATGATTTGAATTCTGTTCTACGAACTGTGGAACCTTTTGCTT TAGAAAAGGATATTTCGGTTCAGGGTTTGAATTTCGATCTACTGTATTAA TTTTAGACAATGGATATAATTTCAGCCTATAGTATGAGTTTCGGTCCATA ATTTGAATTCCACTCCATGATTTGAACTTTGGACTATGATTTCAGTTCTA GTTCACGCAATGTTCAAACTTTTATTTTAGAAAAGAAAATTATGGCCCAC GGTTTGAATTCCAGTCCATGGTTTGAATTTTGGACTATGATTTGAATTCC AGTCCACGGTATGAGTTATGGACATTAGGCCTAAGTTGGCCCCATAGGCA GTAGTCTTGAGACCCTTCATCTACAAAAGCATATTATGAAAACTAAAAAT GTTTAGTTTTTATAGCACTAGGCGGCAATTAGACAAATGAAAAATCTCCC GCCAAAAATTTAAGTATGAACTATTTCAAAATTTCTCCAAACAAGTGGAG ATGATATAAATTTATGTTTCGATTGTAGGCACAATTAAAATCGAGTTGTA TTTGAGTTCGAATAATTTTCAAGATATTTATCCACTCCAGTAGTCAAGTC GAGTTTTTCCACACCATAATATCGAGTAATGGCTCSAATCCAACACYAAT AAAWARATAGAAAGAWATATGAATGTGTTTTTGTTTCTCTAAATGAAGGA AGAATCAAGATAAATTCTTTTGAATGGAAGGAGTGCGTATTTGATCAATG TCAGATAGCTTTTTTATTTCAAAATACATTCATATATATGTATATACATA ATATATTTGAGTCAGAAATGAAATGTTCAGACATTGATACATATATACAT 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TTACTTTTAAGTAGTAAAAATCTATAATATGGAGAATTTCTTCCTTTTAG ACTCGATGCATGATAATTAACAAATGAACTGGCCAAGTGCAATACTATCC AAAAAGCACTTTTAGTATACACTCACACCTTATAGTATGATTCAATGTGA CCAATAATGACAATGAAACACACAGTTTTAGAGAAAAAAACATAATAAAT ACTTTCATTTTCAATTGATGGACCTCAGTAGGTCANATTATTATTGCACT TTTTATAGATTAAAATAAAGAAAAAGTATTTTTATCCCTGGCCCCTGCAG AAAGGAGCCCCTAGTCTTATACCTAGGTTAGTCTGTAATATGACCCTCAC TTCCTTCTATGGGTTGACATTTAAAATAAAATAATAAAATTAGATGTTTT TTGTTTCTTTTTTTTGCCTAATAATTTATATGAATAAGTAAGCAGAGATA TTGGAAGACTTTACATTATTGAGCAGATTCCTATACTTCAAAAAGGCAGA CTCTTGCCAAATCTGATACATCGCTACACTCCTTATGAAAATTGGATTGT TGTTATTTTTATGCATAAAAAAAAATTAAATAATGTGAAATTATTTATTT TTTTGTACTTGCTTAGGGTAAAACTAATATCCGGGTACATTTAATAACAA GCTTTTTTTACTGTACATTTTTCGTTAAGTATTATAGCATAAATTGTTTA AAACTTTTGGACTTTAGGTTGTTTAGACTTTTCTTTAAAATGGTGTTTAT TATTTTAGCAATGAATAGAATAACTAATAGTGTTGAGGCTCAGTTTGAGA TCGTTAGGTTTGATAGTGGACTAAACTAATTTGTTTCTATAAAGAAGTTT GTTCGAAATTATCCCAAAAAAATCAATCAGGATCGTTCTTACAAAAAAAT TGTTATTGGATTAACGTAATTTAACTGTCAATCGATCTGTATATTTAAAA 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