EMLSAT00000010807, EMLSAT00000010807-706654 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010807
Unique NameEMLSAT00000010807-706654
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s716supercontigLSalAtl2s716:164342..182438 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010807 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010807 V-ATPaseEMLSAG00000010807-693573Lepeophtheirus salmonisgene


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAP00000010807 V-ATPaseEMLSAP00000010807-1Lepeophtheirus salmonispolypeptide
polypeptide-auto773648auto773648Lepeophtheirus salmonispolypeptide


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000048190EMLSAE00000048190-757118Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048191EMLSAE00000048191-757119Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048192EMLSAE00000048192-757120Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048193EMLSAE00000048193-757121Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048194EMLSAE00000048194-757122Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048195EMLSAE00000048195-757123Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048196EMLSAE00000048196-757124Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048197EMLSAE00000048197-757125Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048198EMLSAE00000048198-757126Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048199EMLSAE00000048199-757127Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048200EMLSAE00000048200-757128Lepeophtheirus salmonisexon


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010807 V-ATPase

>EMLSAP00000010807-1 ID=EMLSAP00000010807-1|Name=EMLSAP00000010807 V-ATPase|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=887bp
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HDSPEAPQPREMIDMEATFEKLEHELQEVNQNAEALKKNYLELTELKHIL
RKTQQFFDEQDQLELGGGGGVDGQHQQLISEETGTSGLQLGFVAGVILRE
RLPAFERMLWRACRGNVFLRQAEIEDTLEDPAVGSQGVLKSVFVIFFQGD
QLKSRVKKICEGFRATLYPCPDQSADRREMAVGVMQRLEDLSAVLGQTND
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ADIDSIQLALRRGTEKSGSTIAPVFNVMITKESPPTFFRTNKFTLGFQEM
INSYGIATYQEANPAFWTVTTFPFLFAVMFGDAGHATIGLCVGLWMCLKE
KQLAARKIENEMWKIFFSGRYIITLMAMFSIYTGLIYNDFFSKSVNIFGS
SWKPTTPKEEMMSIDSEMIDPSKGGYANVPYPFGVDPVWQVSDNKIIFLN
AFKMKVSIILGVIQMTFGVVISNWNNKFFGKTMNIFAEFIPQIIFLMVLF
GYLALLIFHKWVTYFANDLEDSFTYSERCAPSILLLFINMVLNKDTAYEE
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LRLHWVEFMSKFYSGSGHLFLPFSFEEILQKAESSCD
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mRNA from alignment at LSalAtl2s716:164342..182438-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010807-706654 ID=EMLSAT00000010807-706654|Name=EMLSAT00000010807|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18097bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s716:164342..182438- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGACCCTGGGGAAGATCGGAAATTCTTCCTTACTCTTCGGAGCATTGAT CATTGCTTTGAGTGTGACCCTTTCAAGTGCCGGTGTGAATGAAACAGATG AAAACTCGGGACTTCCTGCTGGTGTTAACTGTAATGATGGCCTTGTTGTT CCTATTTGGAGGCCCTATACGAATTTAAGTGGTGGAGATCGATTTGGAAG AGGTTTGCTCTATATCCTGTTGATGATCTACCTTTTCATCGGTGTTTCCA TTGTCTCTGATCGTTTCATGGAGTCTATTGAAATGATCACGGCCCAAGAA AAGGAAGTCGCTGTTAAGGACCCCAAGACCGGAAAAAAGACCATTATTAT TGTKAAGGTTTGGAATGAAACCGTTGCTAACTTGACCCTTATGGCTTTAG GTTCTTCCGCTCCTGAAATTTTGCTCTCTGTCATTGAAATCTGGGCTAAG AACTTCCATGCTGGTGATTTGGGACCTGGTACTATAGTAGGTTCTGCAGC TTTTAATTTGTTCATGATCATTGGTTTCTGTATGTACGTCATTCCCGATG ATGAAGTACGTAAAATCAAACATTTGCGGGTATTCCTTATCACTGCCACA TGGTCTGTTTTTGCTTATATTTGGCTTTATCTTATTTTGGGAACGATTTC CTATGGTGTTGTCGAACCCTGGGAGGGTATTTTAACCTTCWTGTTCTRCC CCGCCACTGTATGGACTGCATATGTTGCAGATCGTCGTCTTTTCTGCTAC AAATACATGAGCAAATCCTACCGTATGAACAAACGTGGTATGATCGTTCA AACTGAGAAGGCTGATACCGACATTGAAGCACGTGCTCAAGAGAAATTCA AGGATTTCGATGAAGAAAACATGGATCCTGCTCTTGCTGAATTTGAGCGT CACAGAAGAGAATACATCAATGCTATGAAGAGAATCCGTTTAGAAAACCC 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TTTTCCAATTAGAAGAGACGGAAAAAAAACGTCAAAGAATTGAAAATTTG AACAAAGATTTTTCATTTAAAAAATGTCCTCCGAATTTTGGATATGACAA CGATACAAAGATTTTATCGTAAATTTCAAAAATTGATATCTTTCATAGTT TGAAAGAAGGGTTGAAATATTGATTATTGGCCCATTTGGACAGAAAAAAT TTAAATCATGGATTGGGAAACAAAATGTACACTTTTTAATTTCTCTAAAA AGTCGTCAACTTTCTTTTTTAAAAAACGGAAAATGTTACTTTCCTTTTCT ACAAAATCTAATTCTCTTCTTTTTGAAGAAACGATCAAAACCCAATTATT CTACCGTTTCAAATGGAGCTTGAACAGCAAAATATTTTATGTCCTGCAAA AATTATAACGGATTTGGACGACAAGTTTTGGATTTTCAGACTTAATCCCA ACACTAATTTGTATATATATATATATATTATCTATTCTAAATTGTTTACT GTTAATTGTCTACCTTTTTTTGTCCCTTACATTTTATTAAAAAAAATCTA GGTATTAAAGTGAAAGTAGAAAAAAAAACAAAAGGTGTAATTTTTTTACG TACGTACAAAATTGAGTGAATACAAAATACTTTGATGTATATCAAAATTT AGAAAGAAACACCTTAATAGAATCACTATAGCATTAAACGAATTAAACAC CAATATGTTAGTATTGTACTACTCTTATCAAAAAGAAACCGTTATATTCT TATTCAGAATTAAATTCACATTTTAATTTCAAATTAGTTTTGTATTACAT TGGTACGCATAATCATAGCAAATTTTTTATAATATACGCCAGATGGCGGT TTAATTTTGTTTTTAAAAGATAAAAAGAAACGGCATTTTTTGTTGGACTC TGGGATTTTCTACTATGACAAAATGTAATGATAAAATATGTTTAGGGGGA 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AAATTGTTTTTAACAGCATATGTATTCAATTCACCTATTGGTTGATTACA TTTGATTTATTATTGTAAGAAATAAAACTTTTTACCAAATACTAGTGTTG GCTTCGAGTATTACTCAAACTACCCCGAAATATTATTTAAAACTCCACTT AACTCCAATTTTATGCAAAACATTTCAAATAATGATTAATCAATCTAGTA TCAAGATGGATTACCACATCGATCATACATGACCACGCAATTTATTTATT AAAAAAAATGCATTTTATAATCCTCAAACTTCCCTTACAAATTAAAAAGG TTTTGTGAAACTTCAAGATCTGCCTTGTTTGTGGGAGAGAAATGGTACGT TAGTAATATTTCGGATTCCAAAGTTTAATTTTTTCACTGCGACAATCAAC ACATATTTTTAATCACAGAACCTCCTTATCTTGAAAAGAAGAGTTTCTGA GCCTTGAGGATTATAATAAGCCAAATTCTTATAAATAAATGGTATTTTTC AAAATTATATATGAAGCTGATCTGAAAAGTTTCGAACATCAACGTGAAGA TGTCAGCACTTGTAAATGAAGGTTAGTCACATCTATCTACCATCGGTTGA CAGTTATTCGCCAATGATTCAGTCATTTTGTACGCACAGTTGTTATGTTA CAGAGACGATGTGAGTGTTTTTGTGCAAAAAATTATGGATTTTTACTTTT ATTTTTGAACATAGTCTCTTTGTAAGTCTACACACTTCTCCATCGAAGTT AAAAAGGAAACGGGCTACAGATATGGTTGAATCGCTGGGAGAAGTATAGA GTGAAATTGGAAATGATGTTGAAAATAAAATTAAAATAAATCAGAGTATT TTTGTACAGTAACACTCACGTCAACACACTCAAACGGATGTTACATAACA CCCCCGCATACAAAATGACTGAGAGTTTGATGAGTAACTGTCAGGAGATG 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