EMLSAT00000010822, EMLSAT00000010822-706669 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010822
Unique NameEMLSAT00000010822-706669
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s719supercontigLSalAtl2s719:17799..41461 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010822 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010822EMLSAG00000010822-693588Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000048286EMLSAE00000048286-757214Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048287EMLSAE00000048287-757215Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048288EMLSAE00000048288-757216Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048289EMLSAE00000048289-757217Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto769389auto769389Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010822EMLSAP00000010822Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010822

>EMLSAP00000010822 ID=EMLSAP00000010822|Name=EMLSAP00000010822|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=658bp
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VIALIRNTEEIFDKQWFRNLIPFMVKLVEWTVVFCLGVWGFGYGSLLFLF
TVYAIKVQGDILSTKDTLFGEMTNEEFMSKVPPESLPLWISSSNSCEKVD
WINDILEQVWSHIGQYATPFIKTFIEPGIKDILNDMQLKDLSGFDLKRVV
LGSIPLKMGGMKVFPKRHKNHKVESVVLETELIYAGDARVLFQLQKVSAE
IKNIKFRGLARIHLKPLLNTFPIIGGFEITFIKQPVINYSLGGLGTFAEI
PGINSLVKSIVESQIKSRFVWPNKFRLTLPIKDDPKISPATKKNTSCLLP
LGLLNVHIIEAEDLVAKDLKLRGKSXSDPYAVVAVNGEEISFQSQYVDKS
LNPLWNYECKFILDGDLVPEDHCLEIRVYDYDHGTQDDFMGKVCINLEEV
ISDREVDLWYDLCDTKKGRIHVKLSFKECSLNLIPSEDYILSVYINSCKN
LLNSKDQTPSSPVKCVVNGRRNFIQKCKASEQKVHVIEEGALMLTKSGSY
FTIDVIDGKNSSEIYGRVKIAVDKILSSTNWEINNQEIHMNYTTSASIHL
SAKLYSIT
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mRNA from alignment at LSalAtl2s719:17799..41461-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010822-706669 ID=EMLSAT00000010822-706669|Name=EMLSAT00000010822|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=23663bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s719:17799..41461- (Lepeophtheirus salmonis)
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ATCTTGCAATACCTATTATTCGAAAACCCTATAGATACAATTTGCTAGAC AGAGTTATACATTGGTTATTGTAACTTAAAGGATTGAAACAATCGTGAAA CAGGTAAACTCCGGTATTTCTTATGCTGAAATGTATTAATATATATCCAT AAACATATATTAACACAATTATTTTTGCTGGGCATCCTTCTTTTGATATT TTTTGATAATAGGGGCTGMTATCTGCTGTGTTGCTCCTGGGCAACGTTAT GAGAGAAAGGGGTAAGGACATTTAGCACGGCGTTACCTCCTTAACATAGA AATGTACATTATCTGTAGTGTTGTTCCTGGGTAGCGTTATGAGAGAAAGG GTTAAGGACATTTATCACGGCGTTAGCTCCTTGACATAAAAATGTACAAT GTATTTATTTGTCAGCTGTTGATTTCCTGCCTCTTTTTCGCCTTATTAAT GTTCTCAATGGTGAACACGTCATTACCTACATTGTATGACACAAACTTTC AACTAAAAAGAGACAAAAAAAAAGGATTGAAATCAAATTATAGTAGGCCA AATAAGTCAAGCATACCAACTACTGGTACATTGTATTAGTTTGCCCTCAC GTCATACATTTCTCTTTCAATTTCAACGTGGAAGACKCCACAGGGGCATC CACAGGGTTATATATTTGGGGGGGGAGGGGCATGGTTTTTGGATTTTTTT TTTTTTAATTTAAAGGATTTAATTTTTGCTGAAAACATTTCAAAAATCCA CAGTTATTAACAAAAAAAAAAAATTTTTGGAAAAAATTTAGGAAATTAAA TGACCAAAAAATGTTCTAGTAAAAACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTATATATTAAA AAGTCAAGAGAGCCGACTATACTTTTGAGGATCATGAAAATAAATGGAAG GTTTCATTATGGGAAAGAAGTTAGGAGTCGATCCCTGAACTCATTAAGTA AAGGACAACAACTTTTTCTTGTATTCTCCATGATCCATTACAGTATAATT ACAGAAGTAACGCAAAAAATAGATGATCGAGAGAACTTCTATGTCATCAA ATTGCCCATTAACTCCTGAAATGGAAAATTAGTATAAACATACGTAAATA GATATATTCATTACACACTCCAATGTGATCAATTCAGCCGAAACCCCGCT CCGCAAGGTTATTTCCTTATCAAAAAAAGGTTGCGATGATAATTGAATTT CAACTATCCGTTGTTGGTGTCTCCAATTTTGAGGTAGAAAGAGAAATTAT GGTCTGCGAGCAAACTTATACAATCTACCACCAACTACTATTTATATCTA AAGTACGCCCAGACTATTAATTTGCAACAATTTAATAAAATGAATTACAT TCACTCATCTCTATTAAGCAAATTTTGAGAGGTTAAAAGTCTTTATTTAC AATTTTCCTATAAGCAATGTTGTAGAACACATAATTAGCTTTCGATTGCT AAGAAAACACTGTCCTAGTCGTTACCATGAGCACATATTACGAGAAGGAG ATTGTGATAGCAGGGCTCCTCCACGCGAAATTGTCCTAAAACGCCATCGG GGAGTAGACAATGTTTTCCGTGCATGGATATTGTATTTTACGAGTAATAT AACGCTGGGTATTTGAACGTTATACTCTGTCACAAAGTACTTATATTTTA GTAATTTGTATTAAAATACACAAAATTTAGAGCATTAATATATCGATCAT CCATGGAATATTGAATAATTGCATATTCGGCATGCAAAGTACTGTATATC CTTCAATTAAAAATAATCATCTCATTTAATATTTGCACCTTGTACAAAAT 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