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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s723 | supercontig | LSalAtl2s723:287875..307374 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000010867 >EMLSAP00000010867 ID=EMLSAP00000010867|Name=EMLSAP00000010867|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=733bp
MSLRYCIYLLISSVCLLIPGSLSLTSPRSGTGEQSFIREPSDQIAIVGEH VTLPCRVVNKKGELQWTRDGFGLGVERNLTGFSRYHMIGSDEEDDWTLDI NPVDLEDDAEFQCQVGAAENTPPIRSRDAVLTVLVPPSKPIIHPSGDFLR TVEGKGVEIVCESRGGXPAAEITWFDSQNEVVREGVQTFQELAEDGKRFN TKSILKFVHYPPKVNLQQTDPMIKEGSSAKFSCNAHANPSQMSYNWYISG KLVPEAKKRDYIINSVDRRLHNAIIRCDVTNSIGKTVQAAKLNVSYPPLF LTRPESSSGSPGENVQLSCRVDSNPKALYQWYHKSFLVGHSENITIKVDE RQTGEYVCKAFVPGYEDITASAMLYMKQSPIIRNGNRFESGAVGETGLIS TQRXXTIQDKLSSNEVESTLIIKKIDEKDFGSYSCTVSNDLGEDTDIMHL RKRSALPLLVIMAXXIGGXIXTIAVIMIVVLCRRSSTSSNKKLNNLLTIH RTVIKGNHNNNSSTSADEISNNSSEMNKVEVRTSSSLSQEECWGERSEDS YKNPPLSVSPPLQGVGGGDINSYNTQTQRIIXQKPTSIDVVDSMNYRDTY GSGIAHLNGGYTSNNASSSPLMKSNDNIFSSSAHPSSYYANTKYTHPTSS GNGVVGSSGSGYHHGGGQHGGFDYIIPPAQQSTPRSNSSSVVSNNINNLD NYCVYVNSTALLQPGLTATTQNVGKVSSLATHV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s723:287875..307374- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000010867-706714 ID=EMLSAT00000010867-706714|Name=EMLSAT00000010867|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19500bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s723:287875..307374- (Lepeophtheirus salmonis) ATGTCTCTTCGATATTGCATCTATTTGCTCATCTCATCAGTGTGTTTGCT
TATCCCTGGATCCCTGTCTCTCACGTCTCCACGCTCTGGCACGGGAGAAC
AGTCCTTTATACGTGAGCCTTCGGATCAAATCGCCATTGTGGGAGAGCAT
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TTTTTTTTTAATCGTGCCATCACTACTTTGTACGTAGACAAAGATTTATT
TTAGATACTACTACACACAATCCTTCACTATGAAATCTTAGGAGTTTTCC
ATTATTTACTTCTTATTTTCTTTTTGATAGGTTGTGAGGTTTATATAATA
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GTTGCTATCAGTCCTTGGTGGCTGTCCAGGGGTGTCCGCAGAAAAATATT
GTTTTAGGAAGCTTGGTATTCCATTTTTTTTTAATCCAAAAATTAAAATA
TTAGCTTCCTGAATTGGGGGGGGGGGCTAKATCACCTCCAGCCCKCCCCC
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TTTTTTAGGACCGATATGCAGGACGACTTAACTGGACCGGACCTAAACTG
AACTTGACGGGCTGCAGTCTTCAGTCCTGAAGAAGGACTGATACAACATT
ATACAAATATGTCAGGATTAATATTCTGTCGCTAATTAAAGAAGGTTATG
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TTATTATATAACTAAGTAACAATATAATTTGTTCGTATTATATTATAATG
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TCCAAGGGCCGACACTTAATGACCGATCCCCAGGACTGACAGTTCCTATG
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GACACAATACTAGTCATGACGGTTTCTTTATTGCGTCTCTCAAACCTTCA
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AGTAGCCCAACCACCTTCGGCCACCCCTTATGACGTTACCATTTTATAAT
TTTTCCCTCCCCACTTGAAAATACATTCTGGGGCCTGTGTTCAGAACATT
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TTTTTGGACATATTGATATATAAATTTTGAAAATGGAACGTATGATGGAG
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TCTGACATCAATACATCGTGTCCCACTATAGACCTGAAGCTGTACTTTAT
TTTCAAAGTAAACTTAGGATAAACGTACACTTGACATGCAATGGAGCAAT
AAATTTATAAAATGGAGAGTTGATCAAGTAGACATTTTTATAAGTCCCGA
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GGTCCAACTCGAGGATTTCCACTATTTTATAGACATGTTGGATGATTGAC
CTACTAGATCAGTCCTCATTTTCGACGTCCATAATACCAGAACGGAATCA
TTGGAACCTTGGAGTTGCTGTTGCATTCCATACTATATTGGGTCCATAAA
CAGCAGACTTTTTTTGGCAGCCGCCTTTTCACCTTGGTTGTAGTGATACT
GAAGAATAGATCAATTTTTCTATTAGTTCCATTTTGGAACGCTGTAACTG
AATAATTCACCAAACACAAAACTATAAATGAACTTTTTTAAAGTGTATGC
TTAACCTTAAAGCATATTTGTAACTGTTTGTTTAATGCAATGTATCAATC
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TATTGTTTACATATCCCTAATTAACAACCTCTTCTATGAGTGTCCTTTCT
CTTAGCCCCTTTAATTTTATATGATATAGTATCTATTATATATACATATA
TAGTCCTACATATAATTCAATTTAAAAAACTGTTTTGTTATGACTTGTCA
TTCGTTATTATTATTTTAAGACGACGAGAACAACAATTTCATACCAAGAG
TAAAATAATGATATTTATACATATATTTCTTTAATTATTTATTTTGAATT
TTTTTGTTCTTAACCAAAGGGTCACTTTCCTTGGAACAAATCTATTTATA
TTGTTGTTTTTCTGTTTATTACACATAGTTTCTGTGTCATGCAATGTATT
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ATACAAACATTGGAAAATATTTGACGTCATCTTGTATTTTCTGAGAATTT
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TTTATTAAGGATTTGTTTTCCTAAAAAAAATAGTCATTCCATCACCGTAT
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ATCTTATTAGTTTGATTGGAAAACTTTGGCCATACTTTACTTTCTGGTAT
AGCTAAACTTTTAATAAAATATTAATATGAAATATCATCATACTGTATCG
AATAAAGTACTATGTAGGATTGTAATATTATGAAATATGTTTATGTAATT
CATTTTAAAATTGTGGATAGATAGTATGCCAATGATAGTGTGGACTACTT
AAAAGGTTAATAGCCGTTGGATAGCTAATGGATTGCGGGYCATTTGAATA
AAGGMTGCGTGATACAATAAACATAACGAAGTGATATATACATATATATG
GTAAAAACTAGAACCTTTTTTCAACTTTGATCAAGATATGCTATCTATTC
ATAGGCTTGTAAATCCTAAGCATTTTTAACGTGCAAGTTTTCTTGTTGTT
GCCAACCTGAACAATATATTTTTTCTTTTCATTAATCTTCTCAAACTTTA
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ACGGTTGAGAGCTCATTAAAAAATAGAGAGTAACACTAAGGTTTTGGTTT
TTTTTGGGTTTTATAAATGTACATAGTTGAAGATCAAAAACGAAGTAATT
CTTACCCTGTTCCTTCCTCGATACGCTATTGGACTTGCGTTTATGCAGGG
GTGTCCACAGGGGTGTCCTGGAAAGGGATTTTTTCTAATAAATTTAATAT
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TAGTTTTTGACTCATCCAAGAAGGGATTATTTTGAATGGGTTGATATCCC
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AAAAATTATAATTATTTGGGAAAATTTGAAAAATTAAATTTTTTGGAAAA
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AATAAGGGTTAAATTCTGCTCTTGTATGTTTGATAAAATCCTCATTCCTT
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ACATCCCTTCTCTCTTTTCTTCTAACTTCATTCCTTGTTTCTATTACAAT
CTATTCAGTTCTGCAACCCTGGCACCTTTTGCTAGTGTATACATAAAGTA
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CCATTTACCTATTGGGTCATATCCATTGATAAAAATAGTGTTCTACATCT
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GGGAATATTTAAAGGCTATAAATATAGAGTGATGTACATATACATATGTT
ATGATCTTATTTTTGTTTTTTTTAAAAGTTCAAAAGGATTTTTGAGTTGG
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TTCCATGTTATCAAAGATTTTTTATTTTGTTTATTTTCTTCATGTCTAAC
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ATACATCATATTCTCTATATGTTTCGTGATGTTCAAATTGAAATCATAGC
TTGTACTCTTTGATGCCTTCTTGTGTTATTAGTAGCAACCTTCTTGGAGT
CGCTAGTGACTAGTGTTGTGTCGGKCTTTAATTAGGACCATGGTCCAGTC
CCACTGTTCAGTACTAAAAGAACTTAAAATTGGTCCCTCGTGACGCCATT
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ATATACCTATGTAACAATATTATATGTTTTTATTATAATGAAAATAGCAA
TATTTTTTGCAATATATGTGCAATGGTCCTAATAAATATATCTTATTTGG
CTTAATAGTCCATCACCATTTTTGTGAAAAATTTCATGGACCGATAGGAC
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TATGCAATTGTATCCATGAAGCTTTTAAGGGAAAAAAATGGTCAAACTGC
TCAAATCGAGACTTCCAAAACAATTATATCAAATATGATAGGCGTTATAG
GATTAAGAGTTTGAGTGAAAGAAGAAAAAGACTTGATACCAATGCAGATA
TTTCACAGTTTCTTTCTTTTTTTTACTTAAGCACTCATATATTTATTTTA
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ATTAATGTATATATATATATGTACACAGCCTTAACCTTAAGATTTGTATA
TATACTCGTATATATCATACAAATGTTGCAGTCAGGCAGTTATGATTAAA
TAACGAAGTTAGTGCCTTTCTGCATTTCTTACAAGTTTTGACTTAATATT
GTTGCCCAACTGCCTAGTTCCTCTTACTCACTAACTTATTATTCCTTATA
ATTATCTAGATGACTGGACCCTTGACATCAATCCAGTGGATCTAGAGGAC
GATGCAGAGTTTCAATGTCAAGTGGGAGCAGCTGAGAACACGCCTCCAAT
TCGATCCCGGGACGCCGTTTTAACTGTCCTTGTCCCACCTTCCAAACCCA
TTATTCATCCCAGTGGGGACTTTCTAAGGACTGTGGAAGGGAAAGGTGTG
GAGATTGTCTGTGAGTCTCGGGGTGGAAAKCCAGCTGCTGAGGTAAGAAA
CTGATCTAAAGATAATGTTATCTTATTTATTTTTATTTATTTTTTAGATT
ACTTGGTTTGATAGTCAAAATGAAGTCGTTCGTGAAGGAGTTCAAACCTT
TCAAGAACTTGCAGAGGATGGAAAACGTTTCAATACGAAGTCCATTCTCA
AATTTGTAGCAAAGGCAGAGTCTCATCATGAAAAGAACTTTACGTGTCAA
GCTCAAAACTCTGCGGATCGGCAGSCGCMTTCTGTTTCAATCAAGTAAGA
GACATACATAGTAATAAATCTTAAGCATTTTTACCCTGCAAGTTTTTGTA
GTTGACCGAATGAATATTTTTTTTTTAATTTTATCCAAAGCTGTTATTAT
TATTCTTTCATTACTCAAGTAGGTACATCTAATTTTGAAGTGCGTGTGCT
CATGAAAGATGATTTATTAGGGAGGTATAAGTGTAAATCTTTGGCGGAGT
ATAATTGAGGATTATATCAATYCCTGCCGATGTCCTTCCTAATTTAATTT
ATCCTCCTTCCCATTGAACCAGGTGGTCCATTAAAATCTGAACACTTACT
AATTCAATAATTAATTAAGATTGTGTGATTGAAATTAATTTATATTCCGA
TACATTAAAGCATAATAATTAGTTACAAAACAAAACAAACCTGAGCTCTT
TAGCTTACGTACAACCCGAGAAAATGACACTTGAACGTGATCAACGAATT
TCCATTCGGGCACTCCTTGACTGTCGACCCCGTGAGGAACAGTCAGAATG
ATACGTTCCTAAGCTTTGGAGACATTGATGAATCAATAAAGATAATTAGT
ACCACAAAATATCCTACCTCTGCTATGTTCTTGGGTTTTGTGGCCTCGGA
CGGTAAAGTAGTTCCTCTGTTGTTGTTTGCGATCAGATACAGGCTCACGA
GATCCGATTATGTGACTGCCTTGGAGTAGAACCTTTTACTGTGGGTGCAT
GCAAACTATCCTGATGGAAATATAGTTTTACAGCAGGATGGTGTACATGC
ACACACCTTAAAAATGGCACAGGAATAGTTGGTCAACAACATTACCTCCT
GGACCCTCTACACCCCTAATATCAACCCACTCTACGACACCTTTTCGTTG
CATGTTGAGGGGATGGCTTGCAATGTCCTTCATCAAAATACCGAGGCTCT
GAACGCTATTGTTAGCCATGTCAGGGACGCCATGACAGAGGACTACATTT
GTAGCAGGTCCCAGGCATTCCACCACTGCCTGGAAGCTATCATTGCCGCT
AAGGACGGCTACATTAATGATTAAGAGAGCTCAGACACACATCCATTTAT
AATATTAATTTTGTGGACATTCTATTGTTTATAGGTATCTTGTTGAAGTT
CAAAATTCAAATTTTTCAGATTTTAATGGATCACACGTTGGATTCTAGTT
ATTGTTCACTTGAAATGTCATTACAACTAAGCTGACGTGACTCCGAAACA
TTTTATTTTACTTTTTTTACATACAAAAATAGCTAAGGATTTATAAATCA
AAGCTCATCCGCCTATGATCATTTTGCGAAAAAAAGAATCTCTTTTTGTC
CTGAATAATTGATTTTTACCTTCCTACCTATTCGTTTGAACTATACACAA
TCCGTTGCCCTTCGATTTCCAATAAAAATACTCCTAAATATGATTATTAT
TTTTGTTTTCGATAAATCGATATTTTTGCAACAAATATATCTAACAGAAT
AAATCATTATTTCTCTCGATATTTTTATATTTTCACTACATATTTGTAGT
GAAAATGAATTGTGTAATCATTCTTTGTTGTCAAATCAAGTTCCTAGAGA
GTTTTTATGTGACGTCAGCATGGTTGATGTCGGTCGTCTTGGAGGAAACA
TAAACAATCAAGTTTTATAAGAATAAAATTCTTTTTTTTCCTTAAGATTA
AGGAAAATGGTGGTGAACTACTGCCGTATATTTAGATACATCGAGGTACT
TACAAATAAAAGGACTTAATCCTTTACTCTCCATCAAAAATCTATCTTTC
TAACTTATAGCTTAATTATATGTCAGACCCTAATATGTATTGAAAATGTT
AGAATCTCCTAATAAATTCATATTTATATACTGTATGGTCCATTGAAATC
TGAGCACTTACTATTCAATAATTAATGAAGGTTAAATGATTGAAATTAAT
TCATATTTGAGATATTAAAGCATAAACAATTAATTACAAAAGAAAACAAA
CCTGAGCTCTGTAGCTTATGTACAAGTCGACAAAAYGACACTTGAGCGTG
ATCGACGAATTTCCACTCGCCTACTCTAAGCAGTTGGGCGTCTTTAGGAC
CACTGTCTACTCTATCAGCAAATCCAAAACGTTCTAGAGAAAGAGGCTCT
GTCAAATGGGCCAATCTGGACCCAGTGGAATTAAAGAAAACAGTCCAGGT
CAATTCCATCAAGTCCATGCATGAAATCTCCAGGTTTTGCAGCAAGCGTT
CCAGAGAGCTATAAAAAAGTGAGTGAAAAGAGGCTTKTCAGGGAGGAGAG
GCCAGTTTTGACACCAGCAATGAAAGAAACCCATCCCCTCCATTGGAAGA
CTCTTCACAATTCTTTTTTGATACTTTTGGCCCCCTTAGACTTCAACTTT
TGGGTGTATGTCGAGGAGAAGGTCTGCAGTGTCCGTCATCCAAACACAAA
CACCTTTAAACCCACTGTCAGTCATTACTGGGACGCCATGTTAGAGTACT
ACATCTGCAGTGGGTGCCAGGGCTTCTGTAAACGCTTGGAATCCATCATT
ACTGCTAAGGGGGTTACATTAATAATAAAGAGAGAGCTCAGACACATATC
TATTTATAGTATTAATTTTCTTGAAATTATGTTCTCAATTAATGAATTAT
ATCTTGTTTAAGTTTAGAATTCAAAGTGCTCAGATTTTAATCGACTACTT
GGTAGATAGTGTAAACAGTAAATCAACTAATATATTTTCTCCAATTACCC
TAATTTGTTAGTCCTTAATCCATCCAAAACAAAATTAATTGTTAAAAAGT
ACTCATTTGAATTAAATCATATTAATAAGTACTAGAAATTCTAGAAGTAC
TAGATATGTGCTATACGTACTAACTCCACCAAAAAGTATTAATTTAATTC
TTTTTTTTATATAGCCTTCAGGTCCATTATCCACCCAAAGTGAATCTTCA
ACAAACAGATCCAATGATTAAGGAGGGTAGCAGTGCCAAGTTCTCCTGCA
ATGCTCATGCCAATCCTTCTCAAATGAGCTACAATTGGTATATATCTGGC
AAGTTAGTTCCAGAGGCGAAGAAAAGGGACTATATCATAAATAGTGTGGA
TCGTAGACTTCACAACGCCATTATTCGATGTGATGTGACCAATAGTATTG
GGAAAACGGTTCAAGCAGCAAAGCTCAACGTTTCTTGTAAGTCAATTAGT
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