EMLSAT00000010867, EMLSAT00000010867-706714 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010867
Unique NameEMLSAT00000010867-706714
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s723supercontigLSalAtl2s723:287875..307374 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010867 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010867EMLSAG00000010867-693633Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000048505EMLSAE00000048505-757433Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048506EMLSAE00000048506-757434Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048507EMLSAE00000048507-757435Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048508EMLSAE00000048508-757436Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048509EMLSAE00000048509-757437Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048510EMLSAE00000048510-757438Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048511EMLSAE00000048511-757439Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048512EMLSAE00000048512-757440Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048513EMLSAE00000048513-757441Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775884auto775884Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010867EMLSAP00000010867Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010867

>EMLSAP00000010867 ID=EMLSAP00000010867|Name=EMLSAP00000010867|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=733bp
MSLRYCIYLLISSVCLLIPGSLSLTSPRSGTGEQSFIREPSDQIAIVGEH
VTLPCRVVNKKGELQWTRDGFGLGVERNLTGFSRYHMIGSDEEDDWTLDI
NPVDLEDDAEFQCQVGAAENTPPIRSRDAVLTVLVPPSKPIIHPSGDFLR
TVEGKGVEIVCESRGGXPAAEITWFDSQNEVVREGVQTFQELAEDGKRFN
TKSILKFVHYPPKVNLQQTDPMIKEGSSAKFSCNAHANPSQMSYNWYISG
KLVPEAKKRDYIINSVDRRLHNAIIRCDVTNSIGKTVQAAKLNVSYPPLF
LTRPESSSGSPGENVQLSCRVDSNPKALYQWYHKSFLVGHSENITIKVDE
RQTGEYVCKAFVPGYEDITASAMLYMKQSPIIRNGNRFESGAVGETGLIS
TQRXXTIQDKLSSNEVESTLIIKKIDEKDFGSYSCTVSNDLGEDTDIMHL
RKRSALPLLVIMAXXIGGXIXTIAVIMIVVLCRRSSTSSNKKLNNLLTIH
RTVIKGNHNNNSSTSADEISNNSSEMNKVEVRTSSSLSQEECWGERSEDS
YKNPPLSVSPPLQGVGGGDINSYNTQTQRIIXQKPTSIDVVDSMNYRDTY
GSGIAHLNGGYTSNNASSSPLMKSNDNIFSSSAHPSSYYANTKYTHPTSS
GNGVVGSSGSGYHHGGGQHGGFDYIIPPAQQSTPRSNSSSVVSNNINNLD
NYCVYVNSTALLQPGLTATTQNVGKVSSLATHV
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mRNA from alignment at LSalAtl2s723:287875..307374-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010867-706714 ID=EMLSAT00000010867-706714|Name=EMLSAT00000010867|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19500bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s723:287875..307374- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTCTCTTCGATATTGCATCTATTTGCTCATCTCATCAGTGTGTTTGCT TATCCCTGGATCCCTGTCTCTCACGTCTCCACGCTCTGGCACGGGAGAAC AGTCCTTTATACGTGAGCCTTCGGATCAAATCGCCATTGTGGGAGAGCAT GTGACACTTCCGTGTCGTGTAGTGAATAAAAAAGGGGAGTTACAATGGAC GCGTGATGGGTTTGGACTTGGAGTTGAGCGAAATTTGACGGGGTTTAGTC GTTATCACATGATTGGGAGTGATGAAGAAGGTATTGACTCCTCTTTATCT TATAATATATTGTATACTACCTTTTAGGGACTGTTGTTGTCTGTGTGGTC GGATTTTTAAAAAAAAAAGTTGTTGTTTTTTTAATTATTATTATCGTCAT TACAATATTATATTTTTTCATACTTTCTTACAAGTATTTGTCTCTTAGAA CTAAAAAAACTGGTTTCTTTTTCTCTATATACTAACATTTTTATATATTA GTTGTGGCAGAGMACTACCACAACATTAGGGGMAGATGTTATTTATTATA AGCTATTAAAGCAAGTGTGTCGTGCATTTAATTTATTAAAGGTAGTAATA AAAAACTCGACAAAATGTCATATCACTTTTGATATTATTTTTTATAATGG TAGTAGATACCACTACGATTCATGACGACTTCTATTCTTCATAATAATAA TGAACTATGTTTAAAACTTTTTTAATTTATGTATTTTCATTCCTTTAGTG CATGGCTGTACGTTCTACTATCCCCTTACAAGTTCATATATTGCTATCTC CCTGCAGAAAGACCTTTTCTCTGCTGGGGACAATACAAAACTGTTACAAG TTTGAGACCTCTCATGCCATTTACATGTCATTTTAAGGCCACTTGTAATA TGATGCTATGAGTCAAGTGTTCTACTTTTGATAACTTTTAGTATTTGATT TATCAGTAAAAAACGTTTTTCACGGAGCCTTCACATGTACATTGTACAAC CCCTGTCCATAATAACTTTTCTTATAACTGCAGCTCAATCCTAAATAAAG AGACCCATATTTTTCAATGTTACTGTTATACTTAATTCACTGATTGATGG ATATCAATAGTAAATAACATTATAGATATAAATTGCAAATATTTTATGTA CTTGAAAATTTTTCTCACAAACATTTTAATGCTCGACACTAACGTCATAA CTAACTGACATCACCATATTATTTTTAGTAGTAGTATATATTGGTCTATT ATTGGCAATTCATTCAAAGTAACTCCAACCAGGCCCCCAAATAACAAAAC TGTGATATCGTGATATGTGCTGGTGTTAAATCGCGGAGCCGAAAACTTCT AACTATAATATAAAATTATTTGTCGAACATATTAAAAAAAAGAGTCAACT ATTGGGTAAATTACGGTGGCATATAGTTGTAAAAATGCTGTGCATGCCGG CTAGCTCATAACAGAGATTGAATTGCTTTCTAATTGTAGACGGCCTGCTA TGTTATATGTCAAGGAAATCTTTGCTAGCTACCTACTCTTGAGATTTAGA ACTTCATTTTAAAGCATTTTATTGTTGTTAAATACAGTTGATTATTATTG TTCTCTATTCATTGTCACAGAGTATATTACTGCTAGCCTTTTTGTGTATC CTTTATTATCCATACAACTACTCTAATATCAAAATATGAATATTCATTTA TTAGTAGGGGAAAAGTTTATTCAACTTTGATATTTTGATCTTATTCTCCT TCTTAAGGCTAGTGTTGAAATTTTATATAAGACAATTACCTACTGTAGTT AGTAAATATATATATATATATATTTACTATCTTTTGAAATAATTGTAAAG TAAAGCGTTTCTAAATCCTTTTTTAGCGTAATTCATACTAATTATGCGTA TAAATAAATCTTTTCTCCCCACTGATAATAATTCATGAGAGCTACTACAC ACATATTATAAGAAATATTGTTTTTAAAATGTATATAATATATTATAAAG AGAAGTTGTGTGAAGGAGGAGAAAAAGTAATTTAGAGCATCTAAGCCGAT CGTAAATTTACCGATATATTTGTCCTAATTAAGAATAAAGGACTGCTACT CCGCTCCTGATTGTCGTAATGGCTCCRCCKTATTGTGATAGGMTGCTTTR GGYGCAAACTATGTCGATCCTATCAAGCGTCCCTCCCACAAAGGGGGTAG AAGAACTGACAAATTACTACAATGACATTAGATAAGTTCAAAAGGCAATT TGTTATATTTTATGAGGGGAAAAAGTATTTATGAGATTTAAATAGTCAAA TATATACACCTATATAAAAAAATCTGGCTTGTGAAATTCATAAATCACAG TTTTTATGAAATTATTTAATTCTAATATCAAGCCCATCAGAGGTCTTTTT TTTTAGGTATAGGTGTACATTCGACTGTTTAAATCTAATGATAGGGTGTT TTTCTCATAAAATGTGACAAATGACCTTATGACACTTATGTTATGTCGTA GTTGTAATTTCTTAGTTATTCATTTGTAGTGGGTGTGCTTGAGCCTTTGA TTCCAGGTTTTTAGTATTATATGGGTATGCATAATGACGGTTGTTAACAT TAGCTGCCTGTTAAATGACTTTGGTACTCATTTTAGAACTAATAAAAATA AAAATAGAATCCCAGCGTTTATATTTAATTCAAATCTTAAAATATACTGA AAATGAACATGAATTTTTGATATATATCTAACAGAATAATAATAAAAACA CGCACAGACCTCGTATATTTCATTAATACGACTACATTATAATTTATTTT ATAAATAAAAAGTATTTTTATTTAACCAAATATAAATTATAAGTATTCAA TGATAATGCTTTGAAATTCTCAGAGGTTAATTCCGAATGGCTAATAAAAA AACTTAAATTTGTGAGCGATTGCTCAAAAAATACATCATTTTGCCCTTTT TTATGTGAAAATTGCTCATTTTTCTAAATTGGTACGAATGAAATAGATAG AATTTGGATTCTAGTTAGATTACACAACATTTTTTGATGATATTTGTCGA GGGAAAGTCCACATGCAAAAACCCTCTTTATTAGGCTCTGTTTTTGGAGG TCAAACTTTATATATATCTATGGTATATTTACAATCATGGTTATGATTAC ATAATCGGATATGTGAGGGAACCAGATTCCGACGACAACAGGCAATTAGA GGAAGGGGAAATTTGCTGGAAAATTGAATGTTTCACAATCCCCCCTTAAA TCTTGCAACAAAGGAAAAATATTGCCAATTCCCGATATTCTATTTATACA AAATATAAAAAATATATAAAACAACCCTAATATTTTTCAATTATTTTTAT ACCAGTGTATTTTTATTTTAATACAAATTGCTTAATTTTGATATTTTGTG TGTTCATTTTGCCCAAAAAAATCGTAAGTCTACTTATAAAATAAACAATA ATTATCCTGAATTATAATGGATCCTCCCCTAGATATGATTTCCCTACACA TGATTCTCAGTGTTTGGAGGAATATTATTTTGGGTTAGAAAAATGGGCAT GAGAATCTTGGGGCCATCTTCCTTTTGACTCTGACAATCATCCCTTGTCA ACTCACCTTCTTGTTAGTTTTTTCCCTCCCCCCTCTTTCCAGCTGCAATT ACAATTAAAAATTAATCAAGAAAAATAATAGCAATATGTCAGCACAGCAG GTTGTTTGTGTGAAGCAAGAGAGGGGGGGGGGAGACTTCAATCATTTCTG CCATTTTTATTTGTTATTAATATTTCTATTATGTACTTCAATACACAAAA AACATGAGAGGGGAAAATTTGGTATGTTTCAAAGATTTATTTTAGATACT ACACACAATCTTTTACTATGATATCCTATGAGTTTTCCATTGGGTCCTCC TATTTTCTTTTTAATATTAGAAATATTACTAAATTTTTCAAATTTTTGTA CAAAAAAAATTATCGTTCTCTGAATCAGTATTTTTTAATTTTTTCTCAAA AAAAAAAATATAAATTAGAAATTCAATTATTCAAATTTTTCAATTTTTTT TTTGAGAATAGCAATGGGTTTTTGAATTTTTTTTAATAGTTGTAGATTTA AAAAAAAAAAAAATAATCATATCGTATATTTGAAATTTTTTATTTTACAT AAAATTTCAATTTTAATCTAGTTTTTTCAAAAAAACAAAACAAACACAAA GACCCCCCTCCCTCCTAAAATATAAGTCTGTGGACGCCTTTGATAGCAAA ATTGGCATCCGTAAATTTTACTAAAATTCCATCGGAATCCCCCTCGGGAT TTTTTTTTTAATCGTGCCATCACTACTTTGTACGTAGACAAAGATTTATT TTAGATACTACTACACACAATCCTTCACTATGAAATCTTAGGAGTTTTCC ATTATTTACTTCTTATTTTCTTTTTGATAGGTTGTGAGGTTTATATAATA ATAAAGATAAAAAAACTACTATTTTATTCTGTCAAAAAATGAAATACCTT CATAGTTTAAAAATATAAACTAGAGGCAGGCAGCATCTACTTGAATATGC ATTWGTTTTTWTTWTTAGTAGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTCGTAAATGT ATAAATAAATAATTTGAAGAAAACCTAGAATGCTTTTTTGATTCATTTCA ATTACATTTAACATANGATATATARRTTATAAATATATATATATATATAT TTCTATTAGTGTTGCAATTCGATTTGGAATTTCTGGACCGGTGCTAAGAG CATTCATTCTAACATGTCTTGGACTGATCTAATAGAATCAATCAATTTTG ATCCGTCATATTTCTAACACGAATACCTGGGTATATATGAATATGTAGAT TTAGTGCTGTGTCAGGACTTATTTATTTGGTCCACTCAACTCTTAGGACC GTTGCTATCAGTCCTTGGTGGCTGTCCAGGGGTGTCCGCAGAAAAATATT GTTTTAGGAAGCTTGGTATTCCATTTTTTTTTAATCCAAAAATTAAAATA TTAGCTTCCTGAATTGGGGGGGGGGGCTAKATCACCTCCAGCCCKCCCCC TTCGGKCKCCACTGCTGTCCTTAAGACTGCCAATCCTTCGAACCGCCTTT AATAGAACTGATTAACAAAAAAGAAATGAAGTTTGAGTGACGTAATCAAG TTTTTTAGGACCGATATGCAGGACGACTTAACTGGACCGGACCTAAACTG AACTTGACGGGCTGCAGTCTTCAGTCCTGAAGAAGGACTGATACAACATT ATACAAATATGTCAGGATTAATATTCTGTCGCTAATTAAAGAAGGTTATG TCGATCCCTCGTGACGTCCTTTTTTTAATTATTCCGTTATATAATAGAAA TTATTATATAACTAAGTAACAATATAATTTGTTCGTATTATATTATAATG GAATAAAATCATATTTATTGCAAGCAATGTCCAATAATATTAATACATAT TTCATATATTTTATTTGGATTGATAAACCATCGATATTTTTGGTAAAAAT TCCAAGGGCCGACACTTAATGACCGATCCCCAGGACTGACAGTTCCTATG GACAAATAGGACCGGTCCTAATKCCGGACTGGACCGAAKAAATGAGAKCC GACACAATACTAGTCATGACGGTTTCTTTATTGCGTCTCTCAAACCTTCA TTCCTTTCCGAAAATTGAAATTAAAAATCCCTATCACATTTAGTAGAAAT AGTAGCCCAACCACCTTCGGCCACCCCTTATGACGTTACCATTTTATAAT TTTTCCCTCCCCACTTGAAAATACATTCTGGGGCCTGTGTTCAGAACATT ACTAACATCGCTTTGACCATTATTGGACAAATTTATTTTTATTTTAGAAA AAGAATGACATTAAAAAAGAGTTGTGTGTTATGTTTTCATCAATATATGA CACCATTCTTATGAAATTGACCCTCCCTATACCATTTTAAAATGTTATGT TTTTTGGACATATTGATATATAAATTTTGAAAATGGAACGTATGATGGAG AAAATAAATCACATTTCAAAGTTTTGAAGCGAGGAGACTTTCTGACCCAC TCTGACATCAATACATCGTGTCCCACTATAGACCTGAAGCTGTACTTTAT TTTCAAAGTAAACTTAGGATAAACGTACACTTGACATGCAATGGAGCAAT AAATTTATAAAATGGAGAGTTGATCAAGTAGACATTTTTATAAGTCCCGA AATAGCTATTTAGTAGTTAAAGGTGAACTAAAAATTTCGGAGGGTTTTTC ACTTTATTTTGACAATAAAATGAAAATAAACTAATAAAAACTAAAATGCC GGTCCAACTCGAGGATTTCCACTATTTTATAGACATGTTGGATGATTGAC CTACTAGATCAGTCCTCATTTTCGACGTCCATAATACCAGAACGGAATCA TTGGAACCTTGGAGTTGCTGTTGCATTCCATACTATATTGGGTCCATAAA CAGCAGACTTTTTTTGGCAGCCGCCTTTTCACCTTGGTTGTAGTGATACT GAAGAATAGATCAATTTTTCTATTAGTTCCATTTTGGAACGCTGTAACTG AATAATTCACCAAACACAAAACTATAAATGAACTTTTTTAAAGTGTATGC TTAACCTTAAAGCATATTTGTAACTGTTTGTTTAATGCAATGTATCAATC GTGAGATATAATGGCTCACTAAAGACATCTAGCGAAAAACGCTTAGAACT TTTTACTTGACCTAATATAATAATTAATTCAATAAGATGGTTTTCTTAAA TAGTGAACAGATTTATTTGGTCCTTTGAGATTCAGCTTAAGTGCGGGTTT TATTGTTTACATATCCCTAATTAACAACCTCTTCTATGAGTGTCCTTTCT CTTAGCCCCTTTAATTTTATATGATATAGTATCTATTATATATACATATA TAGTCCTACATATAATTCAATTTAAAAAACTGTTTTGTTATGACTTGTCA TTCGTTATTATTATTTTAAGACGACGAGAACAACAATTTCATACCAAGAG TAAAATAATGATATTTATACATATATTTCTTTAATTATTTATTTTGAATT TTTTTGTTCTTAACCAAAGGGTCACTTTCCTTGGAACAAATCTATTTATA TTGTTGTTTTTCTGTTTATTACACATAGTTTCTGTGTCATGCAATGTATT AAATTATTATTATTTGTATTAAAAGAAAACAAGGACTATATACATAATAT ATATTAGGGTGGTTTGTGGGACAACTTTAATGTTTAAGTGCGGTGCACTA CTTATTATCACTTCAAGTTGTATTTTTTAGCAAAATTGCTTCCATAATAC ATACAAACATTGGAAAATATTTGACGTCATCTTGTATTTTCTGAGAATTT AACATCAGGGCGTCCATAGGGGAGGGAGTTGTAGCCCTACCCTTTTTCAT AAAGAAATTTTTGAAAAATTATCAATCTGAAAAGAAAAAAAAAGGAATTT TTTATTAAGGATTTGTTTTCCTAAAAAAAATAGTCATTCCATCACCGTAT GCAATGGAGTAAAAAAAATTTTTTTTTTAAATAAATTCAAAAATCTTATT ATCTTATTAGTTTGATTGGAAAACTTTGGCCATACTTTACTTTCTGGTAT AGCTAAACTTTTAATAAAATATTAATATGAAATATCATCATACTGTATCG AATAAAGTACTATGTAGGATTGTAATATTATGAAATATGTTTATGTAATT CATTTTAAAATTGTGGATAGATAGTATGCCAATGATAGTGTGGACTACTT AAAAGGTTAATAGCCGTTGGATAGCTAATGGATTGCGGGYCATTTGAATA AAGGMTGCGTGATACAATAAACATAACGAAGTGATATATACATATATATG GTAAAAACTAGAACCTTTTTTCAACTTTGATCAAGATATGCTATCTATTC ATAGGCTTGTAAATCCTAAGCATTTTTAACGTGCAAGTTTTCTTGTTGTT GCCAACCTGAACAATATATTTTTTCTTTTCATTAATCTTCTCAAACTTTA CTAATTATTATTCCTTTTTTGAGGAGATAACATCCAAGTATTGAGTAAAT ACGGTTGAGAGCTCATTAAAAAATAGAGAGTAACACTAAGGTTTTGGTTT TTTTTGGGTTTTATAAATGTACATAGTTGAAGATCAAAAACGAAGTAATT CTTACCCTGTTCCTTCCTCGATACGCTATTGGACTTGCGTTTATGCAGGG GTGTCCACAGGGGTGTCCTGGAAAGGGATTTTTTCTAATAAATTTAATAT TTGAACTCTAATTTTCTGTGAAAATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 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AGGAGGGGATTGTGGCCCCTTCAAGTTCCTCAAGCCCTCCCAAAAAAGAA TCATCATATATTTATGTGGCTGKTGTTGGTGTTGTCACATATAGAATCCA AAATAGTAGAACAGATTAGTCTGGAATTTAGCTAGTAGACCTAAAAAATA ATCAAGTATGTTATTAGAACATTTTTTTGGAGCTCCGAGGTCATTAAAAC TATGTTTTGACAGAAATAAAATATCATTTCCCTTCTCTATATCTCTTTCT ACATCCCTTCTCTCTTTTCTTCTAACTTCATTCCTTGTTTCTATTACAAT CTATTCAGTTCTGCAACCCTGGCACCTTTTGCTAGTGTATACATAAAGTA AACCTATTTATAAGAGTAGGTAATTATATAACGGTGTTGATAAATTTTTG GGGCTAACTCTCCAAGTATGAAACCTAACAACGACCCTGGTCTCTACATT CCATTTACCTATTGGGTCATATCCATTGATAAAAATAGTGTTCTACATCT TATACAATTTATTATTGTTACATATAAACTCTAAATATGAAAAGTATTGT GGGAATATTTAAAGGCTATAAATATAGAGTGATGTACATATACATATGTT ATGATCTTATTTTTGTTTTTTTTAAAAGTTCAAAAGGATTTTTGAGTTGG ACTTGCTTCACTCTCTTTTGAAGAGTTGTATCTCATTTATGTTTTTTCAT TTCCATGTTATCAAAGATTTTTTATTTTGTTTATTTTCTTCATGTCTAAC ACCACTTCGAGTGTATGTACTCGTATAACAATTTAGCCCCCCCCCCCCTT ATACATCATATTCTCTATATGTTTCGTGATGTTCAAATTGAAATCATAGC TTGTACTCTTTGATGCCTTCTTGTGTTATTAGTAGCAACCTTCTTGGAGT CGCTAGTGACTAGTGTTGTGTCGGKCTTTAATTAGGACCATGGTCCAGTC 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