EMLSAT00000010954, EMLSAT00000010954-706801 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000010954
Unique NameEMLSAT00000010954-706801
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments
Table of all RNA interference experiments conducted using this feature, grouped by Phenotype CV: no visible phenotype
Gallery Image Title Gene or target symbol Sex/Stage Phenotype Datesort descending
S F163 UN46_10954 female
  1. Adult
Some abnormal
no visible phenotype
14.10.2014 - 11:18
14.11.2014 - 00:00
Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s734supercontigLSalAtl2s734:77352..98585 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000010954 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000010954EMLSAG00000010954-693720Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000048969EMLSAE00000048969-757897Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048970EMLSAE00000048970-757898Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048971EMLSAE00000048971-757899Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048972EMLSAE00000048972-757900Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048973EMLSAE00000048973-757901Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048974EMLSAE00000048974-757902Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048975EMLSAE00000048975-757903Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048976EMLSAE00000048976-757904Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048977EMLSAE00000048977-757905Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048978EMLSAE00000048978-757906Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048979EMLSAE00000048979-757907Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048980EMLSAE00000048980-757908Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048981EMLSAE00000048981-757909Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000048982EMLSAE00000048982-757910Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771513auto771513Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000010954EMLSAP00000010954Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000010954

>EMLSAP00000010954 ID=EMLSAP00000010954|Name=EMLSAP00000010954|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=651bp
MWPKLACLTLLFALANCNYNGYKVLQTEDIHSQAKTIELIKFIESADEGI
YDFWVSPRVGSYAKVMVAPGHVSEFEKFLKEQSIASTLLIEDVEITNQRA
STVQNVLRKLKTSSRSIDFENYYSSDDIFAYLHELEADNDFVEVETYGKS
YEGRDLKVIKILKAGPNAPNIFIEAGIHAREWIAPAMGTYIIHSLLEDPE
NAQYLDQFNFHIMPSVNPDGYEFSREHERLWRKTRSRNQGSDCRGADPNR
NWAFHWHESGVSDDPCTNIFPGLKPFSEPETDAIRQYVEKLQPTPLMSLS
LHSAANLWLVPYGYAYNAYPDNYDELVKLAEKAVDALNEVHNAGFEVINA
ADFYPAAGASDDWYAGVLGSTYVYTVELRQGGYYGFDLPPSQIKDSGEEL
WEAMKVIFDRLHQVYKVFQTEDIHSQSKAIELIKFIESADEGVYDFWVSP
RVGSYAKVMVAPGHVSEFEKFLKEKSIASTLLIEDVEILLEDPENARYLD
QFNFHIMPSVNPDGYEYSREYERLWRKTRSRNQETSCRGVDPNRNWGYHW
NETSVSNNPCSDIFPGLKPFSELETDAIRQYVEKLQSTPLMSLSLHSAAN
LWLVPYGXAYNVYPENYDELMGLAEKAVDALNATRRKSWLRFASKRDQRK
W
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mRNA from alignment at LSalAtl2s734:77352..98585+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000010954-706801 ID=EMLSAT00000010954-706801|Name=EMLSAT00000010954|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=21234bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s734:77352..98585+ (Lepeophtheirus salmonis)
GGAATTCAGTTAGAGCATTAGTTTCCATTATGTGGCCCAAACTGGCTTGT TTAACACTTTTATTTGCGCTTGCAAACTGCAACTACAATGGGTAAGAAAC AAAATTATTTCCTTTACTCTGGCTATAACTAATCATTATCTTGGAATAGA TACAAAGTATTACAAACCGAAGATATTCATTCCCAAGCAAAAACCATTGA ATTGATCAAATTCATCGAATCCGCAGATGAAGGAATCTATGACTTCTGGG TCTCTCCACGAGTTGGCTCTTATGCTAAAGTGATGGTTGCTCCAGGACAC GTTTCTGAATTCGAAAAATTCTTGAAAGAGCAATCCATTGCCTCTACTCT TTTGATTGAGGATGTGGAAATGTAAGTTCATAGATTTTAACATATTTATG CAGAGATAGAAACCTCGGAAGGATAGAAATAAGCAATCTCAGATTACATA TCCTCCTCACGGGAAGTTACCCCATCCCAATTATGCTATGGGATTTCTTT GACTGTATTTATGACTATCATTACTCGTTCCATGACTAATTGTAAAATTA TTCCAATAGTACCAATCAAAGAGCTTCCACCGTTCAAAATGTTTTAAGAA AACTCAAGACTTCATCCAGGTCCATTGATTTTGAAAACTACTACAGTTCA GATGACGTAAGAGACACAAATACGTTTGATTTTCACCCCTAACTCACTTT TTCTTGCTCCAGATCTTTGCTTATTTGCATGAGCTTGAAGCTGATAACGA CTTTGTCGAAGTAGAAACCTATGGNAAATCCTACGAAGGTAGAGACTTAA AGGTCATCAAGATTCTGAAGGCTGGACCTAATGCTCCCAATATCTTCATT GAGGCTGGYATTCATGCACGTGAATGGATTGCACCTGCTATGGGCACATA TATTATTCATAGTCTTCTAGAAGACCCTGAAAATGCTCAGTATCTCGACC AATTCAATTTCCACATCATGCCTTCCGTTAACCCCGATGGCTACGAATTT AGTAGAGAACATGTGAGATATAATGTTTCCTCTTATGACTGATCTATAAT ATTACTTTATATATATTTTTTTTAAATAGGAACGTTTGTGGCGAAAAACA AGAAGCAGGAATCAAGGATCTGATTGCAGAGGTGCTGATCCTAACAGAAA TTGGGCCTTCCATTGGCATGGTAGTTATATTCTGTAGTTTGTTTTTTAAT ATTTATAGCATGTTTCGTATAATATGTAGAGTCTGGTGTGAGTGATGATC CATGTACTAATATCTTCCCTGGATTAAAACCATTCTCTGAACCTGAAACC GATGCTATTCGTCAATATGTGGAAAAGTTACAGCCCACTCCATTAATGAG CTTGTCTCTTCATAGTGCTGCAAATTTATGGTTGGTACCCTACGGATACG CCTACAACGCATATCCTGATAATTACGATGAGCTTGTAGGATTCATTTTC ATTTGGAAAAATAGCAATTTATTAACAATATTAGTTAATACATTTTATTT ATTTTTAGGTAAAACTCGCAGAGAAGGCTGTGGATGCATTAAACGAAGTC CATAATGCAGGATTCGAAGTGATCAATGCAGCTGATTTTTGTAAGTTATT ATACAAAGATTTTTATTACTACCTTTCCTCTTATTTGGTGTCATTTATCA TTGCTGGTATTTATTACTAAGGCTGAATAGACGATGGAGAATAATATTTT ACTGAGAAAATTTCACAATTCGTCCAAAGAAATTATGAATTCATAGTTTT AGGTCGAGCTTCGACAGTATAAGGCTTCGAACCGTTCACACTTTTACTGA TAATCCAATGACGCATTAATTCGTTCATTTCTTTCTGTTCATTGTTTTAA AAACAAAACGACGACAACGTGATCATTTTTAGTCCAAGTTTAGTTAGCTA CGAAAAAACTGTATTCCTTGCGAGACGTATACTTTGACGTATGCATATCA CAAATCAAAGTATAAGAGTCGTGAATTTTTCTATAACGCTAGACCAACTT GACGTAAGGAAGATATATGTATTCCGTCTCCTATATTTGTAAGATTGGAC ATGTTTTTCAATCTTTTTTCATCAAAACAATATCTATTTAATAGTTTATA GGGATATGTCGTCTCTCAAAGGAGTGGTTTTTACACTCACTGCAATTTAG ACAATATTTTCATGCCTACTGATATACCTTGTCTCTTAATATCTTGCCAC AGATGACATCACTCAAAGATTTTACGCATGCAATGTTTTCCTTTCTTTAC AGAATTCTACTTGTTAACTCAATTAAAAGGGTTCTGAATTCGTTTGTGTA GTTAATTATAGAGTAATTCATAGTGATTTAAAGGGTGTGTATTTTTTAGC AGGTACGTTTTTTATAATTGCTAATCTGAAGAAAAAAAAATTCCTTAGCC ATTCTCATTATTATTTTATTCCCGAGTATTGAACTTATTTTCTTAAATAG ATTCAATTATATTCTAAACCTGATTGTACGTTCGTGTGTGATCATAAAAG ACAGAGCGTGACCGTGAGGAATTGGGGGTCGACATCGAAGTAATTTGTAC CAATGTCATTTTTTATTTCCTTTTCCCTCCACCTTTGCTGATTGTAGCTG CTCTCCTCCAAAACATTCCTCAAATTATCAGGGTTACCATGTAGATGTTC TTTTTTTTTCTTTTTACCATTCCCAAAATACACACAATTTTAATCACTAC CAGTTCATTAGACTCTCAGCATCCCTGATGAACAAGCAAGTATCAACATA GATAATTAAATTTAAACTAAAAATAATCATAAGGTATTCATTTCGTCATT TAGTTTTTGCTTTGTTCCCCGAATAAAAGATCTATTTGGAGAACAATTAT AAAAGAAATGAATGGAAATCCAAAAAAAAATTATGTATTCAGATCCTTAG GCGTTTAAAAATGAACTGAATTTCCAAGCCTAGAAAACATGAATTTCGCT AAGTCCCTATTACATTATATATTTTAGATCCTGCTGCTGGAGCATCAGAT GATTGGTATGCCGGTGTTTTGGGATCAACCTATGTATACACAGTTGAGTT GAGACAAGGAGGATATTATGGCTTTGATTTACCTCCAAGTCAAATTAAGG ATAGTGGGGAAGAATTATGGGAAGCAATGAAAGTTATTTTCGATAGATTA CATCAAGTGTCAATCCAATAGACTATTTTTTAGTTTTTTCTAATTTTTGG CTATTTTTATAATATACTTTTTTATACAATATTTACTTTTAAATAAATAT CTGTATGTGGTCACCTTGATAATTTGAAGAATGATTGGGAGAATTGCAGA TTAGTTGTCATGGCGTTTGATAGGATTAGATGTGAACAGCTATGAAACAT GAATCCCACTCCTAATATAGCAAGGGTATATATGCTGGAATTACTCAAAT ATCGATCCTCAATTCATAGTCCAAAATTGATCAAAGTTATAACCACTGAT GCGTCAAACATGCTCAGCTGTTAAGTAAAAATATAAGAAACCAAAAATGA ACGTTATAATCCTAACAATTGTGGAATGTTTGGGAGGAAAACAGATAGGC TAAGATGAAGTTTGTGAACAGAAGATAAATTTGAACGCKCGTTCCATGAA KAATGAACAAAACGGTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTAACGCTGAAC ACTATAAATGAGATGTTAGCGTTCCGTTCCAATAGATCATATTAATTTCA GAAGGGGTCTAGTTGTCCACGGTATAAGCATCCTAGAAACATGACTATGC AAATTCAGGGGCAATTTTTGAATTTGGGGAGGGACCTATAGCCTCCTCCC 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GACTCAGAACCAGAAAGACCCGAAACATGAGGACTCACACTTTACCTGAA CACTGAAAAGATAGACTCAAATACAGCTCTGAATATTGGATTTAATAGAA CTTTACTCTTTTCCTTAATTATATTTACATTTACTATTTAGAAAGAGTAA TTCATAATTATMTATGAAATATGAGGAGGATATATAATAAAGGTACATAA TAACTTCTGAGAATTATGAATATAGGTAGATAGTGTAGTATTATATCTTA ATATTTGATTTATTATATTGATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGTAGT CGCATCATTCATCAGTACACATTTAAGATGTGCGTATAAATTTTTTCAGT ACAGAGGCTTAATGCCATGAATGGATAACGTTATTGTTGTTGATTTATTG ATTGGATCGCTGTTTTCATCCATACCATTGAGACTGAATTGAAGTGTTCG ACGTAGTAATCAATCGTTTTCGTTCATCAGAATTAAGAAACTAAATTTGT ACTCCAGAGATATCGTAGTTTCGTTTAAGATAAGAATATAATTGTTCCTA CAAGTTCTTTCTTAATCTTTGACAAGAGTAATTTACTTTGGGATCCCATT GACTTGGGAGTAGCGATGATATAGCGAGAAGCAAGGGCTTTACCAGTATA AAGTTCTATAAATTTTACAAGATTTGGATGACTATCAATATGGACTGAGA AATTTCAKGAGWCATGCATCATGCTCATATCTGACATAAATTAAAAGCAT CAGGACTTGGTTCAACTATATTCTTTGAATTAAGTTTCAAATTATTATCT TGAATACAACTTTTACTATGATGTTGAAATTCAAATTTTCTAAAAGCTAG GCTCACAAAATCACAAAGACCACATGATAAAATTCTAAAAGCCCCGTCAT AAATCTGGACTTTTTCTCTTTCATTATCGGCAAAAAAGAATTAAAATTAA TATATATACAGTATATAATAAAATTGAATGTTATTTAATGTCAGAAGATT AAATATAATTGTTATTTTTATTTGTTCTTGTTAGATGCATAATATTTTGT TTAAAACGTGTTAGAATTCATCATAAGAAAATTAATATTGGAATTCTAGG CACACAAGCTTTAAAATGAATACGTTATATTTTATAAAAATAGAAACATT TTTGTATTATTCTATCTTACATAAAGGAAAACTATAGAGTAATAAAAATA ATTTTATTTTTTAATTCCACATCATTTCTATTTAATTTTTAGTCAAACAC GGAAATTTTCATCACAATTATACATTTTAACAGTTTTAACAGAAAAGATT CTCTAGACAATTGAATCAAAGCTTGAACAGTTTATAACAGTTCTAAGTAC CCTCAAAAATAAAGAAGATGATTTTGAAAGAAGAATAACTTTTATACTTC AACAATATATCAAAACCTAAAACAGAGGAGATGGTACTCATTAAAGTTTT TAGTAACATGTATGCGATGGTAAAACTGTTGTCCTTATCAATATAGAAGA ATTGTTCATGATGGTTATTTTTGCATGCCAAGCTTGTGATACTTGAGAAA ATTGTCTCGAGTTGTAATTCAAATACAGAGATTTCATCTTCTACAAGCAC ATATCTCAATTCCTTTTCAAAGTTGGCTTGCTTCACAACAATGAAAAGTA AACAAAAAAAATTGATAGTGCATGCTCTCCTAGACGCGTCGACATTATTG GTAGAAATAAATTTAAATTTAGTCAATGAAGTCAACAGCATCACACATAT GGCAAGAGAAAGATAATTATCCCTTGGTCCACTTGTTAAATTTGATTCAT AATCTTAAATTTGTTATCGATTCTATTTCAATATTAACGAAGTATTAGTT TTAAGATGCTTTAGTTTTATTAAATCATTACATAACAATTACATACTAAG 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GGAAGCCCATAGCTCAAGAGTAGTCAACAAATGCAATACAATGGATGGCA TTGTATTTTCAAATACGGTTAGTTGCATAAATACGCGGACTATTTGTGGC AAGTAGTTAAATAAAATTCGTATGACGTATTTTTTTTGAGAATTATAGAA TAGAAAATTTATTCTGGTATAAAATTTAATATAATTACTGAATATAACCC CCATCAGCTGCTATGACACCCTCCAAGCGCCCACGGAAGGCCTTGCACAC ATTGATGATATAATGGTCTTCCATGGCTGCCCATTGCTCATTGACGCTGG CCTTCAATGAGTCCAAATTCGGGTGGCGGGKAGCACAGGCCTTCTTCTCA ATTTGCCACCACACACTTTAGTCAAGGGGATTCAAATCAGGTGATTGAGT TGGGCAATTTTTTTTTGTTTCCAAAATGGCATGTTGGCAGMGAGCCAATC ATGAGTCATTCCAGAAGTATGGGCAGGTCTTTCAGATCTTTTCCCTCCTT GACAAGCTTCTGGACCTTGAACACAGTAGTCCTGGATAGTCTAGTGTCCT TGATTATCTCMTTGACAGACCTACCGGCGCGGAGGAGAGTGGCAACCATA TGACATTTGGCCTCGTCATTCATCGTAAACGACTTTGTTTGATGCGAGTA AGAAAAACAAAAATAAAGCCAAAAGATTTACCGAGTTACTTGTACTGGAA TTCTTTATTTCCGGTCACAGAACTTCGAGATATATGCGTTTAAAAATTAG TCCGCGTATTTATGCAACTACCGGTACATAGTCTGTATTTGAATTTATTT ATGTCTCCTTCAATTAAAAAGCTCAGTATATGTATGTTATGAGTGGAATT AAACTGGAAAAATGTTTACAATTAGTTATTTATGATCCCCATATGTACTT TATATCAATCAGAGTTTAGGATCGACTTCAAAGTAATTACAGCTAATGGT 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