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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s76 | supercontig | LSalAtl2s76:97510..108277 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011251 >EMLSAP00000011251 ID=EMLSAP00000011251|Name=EMLSAP00000011251|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=464bp
MTADREAVKVIVRCRPMNSREKSIKSKSCVFMDSKINQCSLVQVSESGAP PKNFTFDGCGKSFTMQGITDPSTQRGIIPRAFEHIFDAIDASPNMKYLVH ASYLEIYNEEIRDLLGQDCKKKLDLKEHPDRGWNNRSVGATLMNKDSSRS HSIFTINIEMMSSGDTGEEHIRKGKLNLVDLAGSERQAKTQASGDRLKEA TKINLSLSALGNVISALVDGKSKHIPYRDSKLTRLLQDSLGGNTKTIMVA CLSPSDNNYDETLSTLRYANQPDEDLLEAERERARQEYNDDMEEMKNKME NERQSKNRMQDEFNKMKDAYEEKLQLLENKFSINDNDNNYSDSSTKQNLN EMQQHAMQKKLQEEMIDGGARATDKDLKERRLRNKKAAEKRLKALGEALS CVDDDDGVILKVKVLNVEIKDLHREFEADRTDYLDTIRKQDQQLILFQQI FDKIQSVIRKDCNY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s76:97510..108277+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011251-707098 ID=EMLSAT00000011251-707098|Name=EMLSAT00000011251|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10768bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s76:97510..108277+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGACTGCGGATCGAGAAGCAGTTAAAGTCATCGTTCGATGTCGACCTAT
GAACTCCAGGGAGAAATCCATCAAGAGCAAGGTATTTATGATTTTAAAAT
GAACGCTGTAAAATTATTCTCTATTCTCAAATATTTAGTCATGTGTTTTT
ATGGATTCAAAGATCAATCAATGTTCCTTAGTGCAAGTAAGTGAGTCGGG
TGCTCCTCCAAAGAACTTCACATTTGATGGTTGCTATCATACGGATTCTA
CCACAGAACAAATATACTCTGAAATAACATATCCGTTAGTAGAAGTAAGT
TATTTAATAATATTATGTACGTTATAGTCGACAGTTGTGTTGTGTCAGGC
CTTATTTATTTGGTCCAGTCGTGTCTTAGGATCTGTTCTTAGTACTGTCG
GTCCTTCGGRCTGTCAGAAAAACTATTCTACAGGGCTCTCTTGTCCCACG
CACTTCCAATCAACCTCACACTCTCACAACAAACATGACATTTCTCACCC
ATACGTTACTCTACCATCAATTAAAACGGTTCAAAATGACTGATTTAGAA
CAACAAACTCTTCTGTCAAATGGAATCCACACATTTCTGTCAAAAGGCCT
CAAAACCAGCAATAAGCGTCCTTTAATGCTTATTCTGATGTCAATAATAT
TTTTTTTCCCCATGTATTCTCCTTCATTTATCATACAAACTATGAGAAAA
TGGTTGATTGACGTCATTACACTCATGATGTCACGTAGTTAGGCTGATGA
TCTCACAAACTGATTTAAAAACTTGAGAGACCAAAGACTGTTTCACAAAG
TTCATCATTGTAATAAGTCATGAAAGGAAATCATTTTTTGTTTCATTATA
CTTAAAATAGGAATTCATATATCATATCTCAATATATTCATATATCAAGT
GATTATTTAAATTCAATATTGAGTTAAAATTTAGACAAAAGAGTCGTTAT
TTTATATTATAACATTATTAGACAAGTATTTTTGCAACAAAATGTCTATA
AAATTCAGCTGTCAGTATGTTATATTCAGAAATATGATTCTGGTTAAGTC
ATCTAATAAAAATATCAATTATTCAGTTAGAATATAAGATTTAATTGGAT
TTTGAATTTTAACAATCAGTCAAAAATGAAATAAATATGAAGATTTTTGA
GAAGTGCCATAAATGAATTACTTTTATAAAGAGGGATAACCTTCCAATTT
AAAATAGCATTAGTGCGGCGAAAATATTTTAATTATATTGAAATACATAC
ATACTTAGTTTATTATACTTTTTTAAACCCATTTANACCATAGTTAGGGG
ATAATTCTTCTTTTAGAGGAAGATGTTCAAAGCACGATGATCTATTAAAG
AATGAACAAGAAATAAATAAAAGCACACCGTTATTTTTTCTTTCCTAATC
ACTAAACTCTGGGGGGTTCTCTACAAAAATCACACCCCTACTAATGACAA
CATATATGTAAAATAAACTGTTTTTGTCTAACAAAAAAAAATACTTTAAT
ATTTTTTGCTTCAAATCAAAGAATTTTAAGAATAAATAAATTAAAATGCA
CTCTTAAGATAGTCAACCGGCAAGGAAAAAATGCTAGTCACGTCCATGGA
TTCTTCCTAAGTTTGTAGTGCATGTCATTGGATATATAGGATATTAAAGG
CGTGCTTTTGTATTTCAATCCAGATGACCCACGTAATTTTACCATAGACA
TAAAATGTTTTAATAAATTGCTCTAGGGAAATACAACCTATCAAAATGTG
TTAAAGTGAAAGTTGCTAGTTTTAGTATAATGAACTAGGAAATGGCATCT
TCTTATGACATTGGTGCAATGATGCACTCTAGAAATGAACATAATATATT
TATAGATATTTTTTGTAATCCATATTTATTTAAATTCAGGGAGTTTTGGA
GGGCTACAATGGAACAGTGTTTGCATATGGACAAACAGGATGTGGCAAAT
CATTTACAATGCAGGGTATAACAGACCCTTCCACTCAAAGAGGAATTATT
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GAAATATTTAGTGCATGCATCTTACCTTGAAATATATAACGAAGAGATTA
GAGATCTATTAGGTCAAGACTGTAAAAAGAAATTAGATTTGAAAGAACAT
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TCTATATATATGGAGTAAATAGTCAATACTCAATTATCGTTATCTATCAC
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TTATTACGACGTCAGATCTGTTTGGACTAAATTTTGATGTATTCTAGAAG
TATTATCGTTTAGTTGACGGAATTATGAGCAGTGATGGAAATCAGTAGCA
TTTTTTAGCTCTCCCAACTTTTGGAGTTGACAAACTTAAGATGGTATTTT
CTTTTCCTAAGCTGTTATTATTATTATTTAATCCTTGAGAAGTACACTTC
CTTTTCTACTAAATGCAATTGTACACAAACCCAGATTGAACGTTTGCGTG
TGCTCATTACGGCCAAGCTTAAAAAGAAATACAAGGTTAGACCATCATGT
AATCGGTCTTTCTATACTTTTCATTTTGATGTACGTTACCGACTGCTCGG
CAAGACAGACAGATTTTGAGGTCATAGAGTATAACATCCGTACCTTAATA
GTAACAGTCAAAGAAGGCGATATATAGCTACTCTTGGTAACAGTTATCTC
TATGACGTCACGATTAAAATCGTGGTGGAAGTCAAACATCAGTTGGAAAA
GCGTTGTAGTATATTCTTTATTTCTATAAATCTTACTTACGACTAGCTTT
TTGATCCACTCTCAACTTCGACTTTCAAAAAGGAAAGGAAAATGTTGAAA
AAATATATGGTAGCTAGTCTTCTGCATTTTTCTTGTTGCCCGCTGTTAAT
TATTATTTAGAGAATAGTTCTTAGTTATTATATACAATGAATAAATAATC
TTATCAATGCCACAGTATGAAATGACACGGCTTTTTAACAAAGGAGCTTG
ATTGATAAGAATACATTTTAAAATCAGAAAATATGAACACTTGCTAATTC
AATAATTGATAAAGGTTAATTGATTGAAATTAATTCATATTTTGATATAT
TAAAGTATAAGCAATTAGCTACAGAACAAAACCAATTTGAGCTCTCCAGC
TTACGTAAAAGTCGAGAAAATGCACTTGTACGTGCTTCATACATTTTCTT
TAGCACACTCAAAACAGTTTGGTGTCTCCAGGACTAACGTCTACGCCGTG
AGCAATTCTGAAACGTTGGAGAGGAAAAATGTCTTTGTCTTTAAGGCCAA
ACCGGGCCAGAAGGAGTTAAAGAAAAAAACCTAGGCAAATCCTCTCAAGA
TATATCGGGCTATAACCCCAGACTATCCAAAGAGCTATCAAAAAAGTGGG
GTGAAAGAGACCACTTTTGACACCAGCAAGGCAAGGCTCATTTGAATGAG
CCTTTTGCGCTCTTTTTAACACTATTGGCCAATCTACACCCTGATAGCAA
CCCCTTGACTAAACCTTTTGGGTGCTTGTCGAGGGAAGGCCTGCAGTGGC
TGKCATACAAATACGAGATCCTCAAAGCCACTGTCAGCCAGAACTGATGA
CTACATATGCAGCGGGTGGCACACCTTCCGCCGCCGACTGMAAGCCATAA
TTGCTGCTAAGGGCGGATACATTAAGAGAGCTCAGACTATTTTTTTGCCT
TGAAATTCTATTGTTAATTAATAAATTATATCTTGTTGAATTTTAAAATT
CAAGAGTTCAGATTTGAATGAACCATTCGGTAATTTGCTGTTGAATCCAA
ATACAATCCCGACTCAATTTTAAGAGCTGCTTTTGTGTTGGCAGACCACA
TACTATGTCAAAGTTCTATAGATTAACACTCCTTATTTTTTGAAGATATA
TCCTTACACCCAGTTCACAATACGGCTTCTTGTGAGGCCTTAATGAATCA
AGGCTGGAACAACAGATCCGTGGGTGCAACTCTAATGAATAAAGATTCAT
CCAGATCACATTCAATTTTCACAATCAATATCGAAATGATGAGTAGTGGT
GATACGGGAGAAGAGCATATAAGGAAAGGAAAGCTCAATTTGGTGGATTT
AGCTGGCTCTGAAAGACAAGCAAAGACACAGGCCTCTGGTGATAGACTCA
AAGAGGCAACCAAAATCAATCTTTCCCTCTCCGCCCTAGGAAATGTTATT
TCAGCATTAGTTGATGGAAAAAGCAAACATATACCCTACAGAGACTCAAA
ATTGACTCGACTTCTTCAGGTAAATATTACTAATGAGTTAATTTTAGACG
TAAAGTTAATTAAGATATAATCAGATGTAGTTATTATTCNCACCGTCTTG
TGGCAAAGTAACATAACTCCCTGAACGATATTTCATATTTATTTAAAAAA
TAAATGATATAACGTATAGTCCGTAGGATTATATTATATATAAACATTTT
AGTTTATTTTTTAGTTTTTGGTGGGGGGGGGGGGGGGGCTTGGTTTTTKG
AAATTWTTTTNAAAAAAATCWAARAAATAAAACATCTTAGAAAAGAAATT
TGAAAAATTGATTTTTTTATTTTTTATTTTGTAAATTTAAAAATGAATAA
AACATTTCAGGCCAAATCTGAAAACTTGATCTCAGGGAACAAAAGAAGAA
TTTTTTGTTTCCAGTTATGGCGGKGKAATTTKACAGGGGKGSATATATCT
CATTCAAAAGTGGAGGSCAGTTTAATAAAAATGACTTCATTTATCACGCA
AATTACATTATTATTCATAATTTTCTTTATAATTGTAGGTGATCCAATAA
TCGTTTGTCCTCTCTGTTTCTGTGCCTATATTCTGCAGATATTAATTTAT
TCTCTTTGTGAAAATTTTACTATCTTAGACTTTTAAAACCCCATTTTCTA
GCCATACAATGAATAACAATACAAGAAGTGATATTGATATTTTTCTGACT
TGGTTGTTAAGATGTGAAATATTACTTTTAAAAACACTCTAAATCCTTGT
TAATTTGAGATAAGGTCATGAAAATATAAGAAAATCAGTTATAATTAATA
CTTTTATTCATTTAATTCGATTAGGACTCCTTGGGAGGAAATACAAAAAC
AATAATGGTCGCATGTCTATCCCCTTCTGATAACAACTATGACGAAACCC
TGAGTACTCTTCGATATGCAAATCGTGCCAAAAATATCAAAAATAAACCA
ATAATCAATGAAGACCCAAAAGACGCAATGCTTCGAGAATATCAGGAAGA
AATCAATAAATTAAAAACACTTCTTGAGAAGAAGCCAATGGATATGACAT
CATCAAGCGGAGAAATTATGATTCGTAAGAAAGTGTGGGGTAGGATCAAA
AGGGTTTATATTTGGGTTTGGAGCCTTATCATAAGAAATCTGGAAACAAT
TTCATTGGTTTATGTTTGCTTGTGATAATGGCCGGKCTAGGCTATCAATT
TTCACTTAGACAGCATTAACATGTATAGAAATATAACTGAAAATTTTAAT
TGAAGAAAAAAAATAGATACATCCATTTGACCCCACTTCCATTTATAATT
TTTTATAACAGATCTGCATCATGAGACTTTAAATTTCATTTTGATACTCA
AGTGAACTATGCGTAAGCTTACTCTTTTGTGTAGAAGTATATTTAAACAA
AATAATTTTGACCATTTTTTTTAAAATGGAAAAAAATATTTTCATTTAAT
TAATATTAACCCTGTTTAACACCACGTTATATAAGTGATTCTTTGGGTAA
CTTAATTTAAATAGGGAAAAATCCTTATAGCTTTTGAAACAATATTATTT
ATGGTATTGAAGGAACTTAAAGAAAGTAATCAATTATGACATTTTAAATG
AGATTCTAGGATTAAAATTTAGTTGTTGTTTTTTTTTCTAATATTTTAAC
ATAATCAAAAAGTATACACTCACTTTAATAGATTAGATGACACTTGTGCC
ATTTAATAGCTCATAACAGGGTCGTTGCTTGCCCATAATAATTAAGGGAG
GGCCCTAAAAGTGATCAAAACCTTTATATAATTTTTTATTTAAACAGGTA
TATTTACATATATGCTAGCAGAGGAGGGCTGCATTGCAGAAGTGAATGGA
GCGAAACAGAAACAAAGAATGAAGGTAGGAGAAAATAAACAGAGAGAGGG
ATGTAGAAAGAGACAAAGTGAGAAGAGGAGAGGGGAGAGACAAAGATAAA
GAGAGAGATATAGAAATAAAAAAGGGAAAAGAGGTTTTATTTCAGTCAAG
AACAACCTCTTTCCTAGGAAATTCAAAAATAAGTAATTTTTGTGAGCGAT
TGAGTGATTGGTGATTGCTCACAAATCCTTAGTCTAATAATAACCATGTA
ATTTGAATACATCAAAATGAAATGACAGTATCAATGTTTATCATAGGAAA
ATGTTCGGTCATTTTATACGTCTACTTGCTGAATTTCAGAGTGATCTGCT
TTACCAGTTTGGATTCTATATGTAATAACACCGAAAACCAACTTATAAAT
ATATATATAAGATATTATAAAAATTTAGTGGGGAGGATTCAAAAACTTTT
GGGAAGCTCATTCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAGGACTAGCGACGCCACTG
TCTCATAGTATGGAGTACATGAAGGCATTTTTGGGTGCGTGGACAAAAAA
TCTACTGTCAAAATGTCAACCGACAAAACGTCGAATATACTAAACGTCGA
CCAGACAAAGCGTAAACCATAGAATACTCCAAATGGTGTTGCAATATATA
TATCACATTCAGACATTTCTCCCTTAAATATACCCCCGCCACAACCCCTT
CTATATAAACTACCAGTAAGGACCCCTCCTAACCTCTTATACAACTCGAA
TGTTGAGGCTGTTTTCGAGTACCACCGTGTCCCAAAATGGGATAAAACCC
ACTGCCACTATTAAAAAAACCAATATGAACCTCTCACATATTCCTATTTA
CCCCCCCCAAAAGCKGGGACTGTTCTCAGGTACGACATGGCCCCGAAATG
GCATGAAMCCCACCGTCACTATTTAATCAACCACTAAGAACCCCTCATAT
CACCCCCAATGTTGGGACTKTTTTRGGGTMCTGTCGTTCTCCAAAAWGGG
AWGAAACCCACCGCCACTACTACCATTTACATCCTGAAGGTCCCTGAAAT
TTGAAACTGTTTCAGGTTTANTCTCGTTTTGGGAACCTGCGGTTCTCGAA
AGTTGTCCAAGCTTCCTGGATATAAATCGAGGTGTTGGAAGGGCATTAAA
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TTCGCGAAATAGCCCCAAATTTCGATGTATAAATGTGGGTCTGTGAGGTT
TCCTTACTGTTAGTTTATGTAGGGGTGGTTGGGTAAATATCTTGGGCGTT
AAATATCTAAAGTGAAAGGTCGTAGAAACTGTTGTTCATATTTATGAAAA
CCAGTATATATTTAGGCACATGTAAAAGTGAAAATTTATAATTTCTAAAG
AGTTATAGGAACCGAAAACTGAAATATACCCATTTTGATCCAACTAAGTC
AATGGAACTTCAATGAACTAATTACATATTTATTCACTCATACTTAGAAC
CAGATGAAGATTTATTGGAGGCTGAAAGGGAGCGTGCCAGACAAGAGTAC
AATGATGACATGGAAGAAATGAAAAATAAAATGGAGAACGAAAGACAATC
CAAGAATCGAATGCAAGACGAATTCAATAAAATGAAAGACGCTTATGAAG
AGAAACTTCAACTTCTTGAGAATAAATTTAGTATCAATGATAATGATAAT
AATTACTCGGACTCATCGACAAAACAAAATCTGAATGAAATGCAACAGCA
TGCAATGCAAAAGTATATTCTTAAAGTGACTTTTCCACATCTATCGACCG
TCTAACGTTACGATGTGTATAATTTAGGAGCTGATCAATTATGAAGAGTA
TTTTAATTCTCAAATTTTAACAATTATCCTTTAAAAAATTAAGAGTTTAT
CTGTGGCCTTGAACCCGTTTACCCTTTATCTGTGCGCCCACTCATAAACT
TATTTTCGTTTATAAGCAAAATACCACATGTTTGTTTAGTTGGGTATGAA
CAGACTTTTCTCCCCTCAGGATGCTGCTTTTGGGATAGCAAGAATAAGGT
TATTTCATCATTTTTAATTGAGGTATGGAAATTTTTTTTTCTTTCACATT
GAAAATTCAATTAAAAGACCGAATTTGTAAAGTTTGTGCAGTTAATTATA
TTGCCATTCATAGCACCATTAGTGCCCTCTATCAAAATCAAAAATATGAT
CGTAGGCTGCTTAATTTTGACAAAAATTGATTAATTTCTAACTGTTTTGC
CACTTGGTTTTAACCTTAATTTAGGAGCGAAAAGATGAAATGTTAAATGA
ACGCCATTGTATGATATTTTCAAGTAAGTGGTTCATTTTTTTCCCCACTC
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ATTTCTTAGCCTAGTGCTGATATTTCATGTAATTTAATTGTATGTAGAGG
AGAAACACCACAAATAAATTAAATTTTGTAAGAACGATAGTTACAAACGT
GTTTTCAAATATGCAGAGTTCAGATTACAAATCCGGAACAAGTTTATACC
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CAAAACTGGGTAAGAAAAATACAAAATCCTTGAGATGTCCTCCAAATGCA
AACATCATGCTTTTATTTTCGTTTGACTCCTGGCCGGACAGACGCCCAAG
TAGGTTATTAAGTTTAAGAAGCTGTAATTAAACTTTTAATGATGTTGCGA
AGGATTTCAAGGAGTCGTCTGGGTCGGGAATATCTGCAAGGCAGAGTTAT
TATTGTTTTAGGCTTATAACTGATAATAAACTAATGGAATACACGATTAA
AATGAATGGACATATGGCTTCCTATCTCCCGGATCTGAATTCCTTGAACT
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ACTGTTGACTCCTTGCCAACTTACATTCTCAAGGACTTGTCCAACGTGGA
CAAGGAGTTCCCCATGAAGGCATGTGCCAGGTTCAGAACCAGGTTGAAGG
CGGTTGGTTTGAGTAATAAACTTCACTATGAACCATTGTATGAAAGAGAA
AAAGATTTGTGAATTGCCGAATTAATTTTAGGGGACAAATTGCAATATAC
ATTATCCTTAAATTTTTCGGATTTAGAAGTCCCACCCTATATTATTTTTC
GGGAAGTGATATTATATTAATAAAACCGTTGTAAACTACAGAACCTTTTC
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AAATTGCCCATTCTCAAACACGTGCGTTAGATGTGGAAACTCACCATAGG
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GCTCAAAGCATTGGGAGAAGCCTTAAGTTGTGTTGACGACGATGATGGAG
TTATTTTAAAAGTATATGACGACATCCAAGAGGAACTTCGCGCTAAAACT
GAGTCTCTTAAAAGGAGTAAACAAAAGGTATCTACGTAATTCATTTATCT
TTCTAGAAAAGATATAAAAAAAGTGATAAAACCCAGTTGTTACCTTTATA
AGATTTTATTAATGTCAACGTGAACATCCTTTCTTTCTGCAAAATGTCGC
TTTTTATTAACATATTTTAGGTGCGTTATTAACCAGCATARATTATTAAG
AAGTTTTGCTTGAGGACCCTGTTATCACATCATTTAATATAAGCTGTTGC
TCGGAGAATTGATTATATATTTTTTGTGGGATCCTTTTCCTTCACTTGGC
TCAAATATTTTTATTTCAGAAGTCGKCTCATGGAGCACCGAGTCTATTCT
TAGCCAGCGTCAATACATGCTCAGGGTTGTTCGCAGGGGGTGGGCTGGAG
GACCTGTAGTCCTCCCCCAAATTAAGGAATATTTGCTGGTTACTATAAAA
TTTGATTTCTTTTTAAAAATAAATTATTGACATTAAATTTAGTTTTTCAA
ATTTTTTTTGACAAAATTTAGTTTTTTCTGAATAACTATAAATTTTTGAA
ATATTTTTTAAGGACATGGGATAAAAACCAAACTTTTTTTTTTTTTCTTT
TTGAAACTGTCGTTTGGTGACGTAATTAAGACTGGTTATGGAAAATAACT
GGGATAAAATAATAAATTAATGCTACTGCAAGTTTTGTGTCCTCAACTCT
GTAAATTTACCACATGTTGACGTTTCGTCACTTAATTTATATAGCTTTCG
GTATTCCATGCACTACCCCTCCGCCTAAATAACCACTTAATCAACTTCAT
TTTTTATAGGTTAAAGTCTTAAATGTAGAAATAAAGGATTTACATCGCGA
ATTTGAAGCTGATCGTACAGATTATTTGGATACCATCAGAAAGCAGGATC
AACAACTTATTTTATTTCAACAAATTTTTGACAAAATACAGTCAGTTATT
CGAAAAGATTGCAACTAC back to top
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