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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s770 | supercontig | LSalAtl2s770:233833..248056 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011256 >EMLSAP00000011256 ID=EMLSAP00000011256|Name=EMLSAP00000011256|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=526bp
MFSNLLSIMGTGISKRQGHLYLLHDRKVIKVMYDRYSSLRDMNDQIATCV GLTRFTNIVLKSKDGTLIAMSPSMLNNTQSNPYKVHISGYNSNSSDIIAV TVKEVGKQFHKVFMVEDMKKEVIQKMNALERRVDKEGRRLVEMEKYKLDL VELRDSIYNRSRNTLDYNRLRPCVTMPEYYYSPTSEKETISSHSQSLPQY NKYKLSEETKEALKTPGFNMWQWEPNEMLILLEEMYYELGIVDELEINPI ILKKFLIRVQEGYRNNPFHNFRHSFSVTQMMYVLIHACKLNEHLSIKDLS VLITACICHDLDHPGFNNTYQINARTDLXIRYNDMSPLENHHCAMCFKIL SIAECNIFANCGTEVSKEIRGDMIILILATDMARHAEILDAFKQKIDDGF DFKSEEHLNSLKMILIKACDVSNECRMTNVADPWVDCLLEEYFHQSDIEK KESLPIAPFMDRDRVTKATAQIGFIRFVLLPLFESINRLFPEMEELALVN LRNSLVYHEKLKEAMDSQEADANKQT back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s770:233833..248056+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011256-707103 ID=EMLSAT00000011256-707103|Name=EMLSAT00000011256|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14224bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s770:233833..248056+ (Lepeophtheirus salmonis) AAAAAATCGAATTAGAGCCTAATCGGATTTCTATGGTAACATTTCTCTTA
ATCATTGCTTCATAGCATTTCTCATTTTGTGAAAGGGATCAGAGGAGGAG
AGGGAATACTTTTTTGAGGACATACTCAGAGGATACAAAGGATCAGAGGA
AGAAAGAAAAAGGACTTTGAAGAGGATGCTTGGAGCCTAGTTGGGAAATG
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GGTATGGATTCATCCTCAGGCCAGTTTTTATGGCCCTGGAGACTGTTGTC
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TGCACTCATTCTAATAAAAGAAGGGCCTTTCTTCTTTTTTTTTTATGAAA
ATTTGCATTAGATTTTTTTTTCCTCATTATTTCTCTCTCAAATAAATTTT
TTTTAGAAAATAAACGTCAAACTTCTTTTTTAAATCAAAACAAGGGCCTA
CTGCAGTCACATAGGTCGCAAAGGCCTAAGTTTAACGTCATTGTTGTGAT
CATTTTAATAAAATGAACGGAAATCATTGAATTTTTCAAACATCAAAGGA
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CTGTCCAGTATATCAACTCAGTACATTAGCAACGCCACTGGTTGGTAGTG
CTGTATTAGCCCTTGTTTACGACCACAAACCAGTCCAGTCCACCTTGTCG
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TGCAAGATATGTGCAATGTTCTTAATAGAAATCTTATAAGGACCAACAGT
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TGTTACACCATTGTATGCCAGGGGTAGTCCGTAGGATTATATTTGTACTT
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ATTTTTGAAACAAAATTTTCTAATATTCAACAAACAACAGCTATTCACAA
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AACATAGTTTTGTCCATTACTAGACCATCTAATGTACATAGATACAAGCA
GAACAAAAACTTTCTCTTCTTGAGAAAAATCCCCAAAGGCCACGCTATCA
TCATTATCCTCCATAATAACTTTGAAAACCCCACTTTTTTTACTCTTTGA
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TGTAGTAGAATTAATTTACCCCAAACTAGTTGAGGGGCTTCCACAGGATT
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GKCCTCCTTTGTATATAAATCCCAGNATGAGCAGCTAAGGATTTATGAAA
TGTTCTTCCAAAAAAGTCATTTTTTGTGAATAGCTCAGGATTTTTGAAAT
TTTTTTCGAACAAAATAGAGAACGCGTATGGATTTTTGAAATTTTTTGAG
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GTCAACAGCTGTTAATTTTTAAATAAAATTTAATTTTTGGATTTTTTTAT
ATATTAATATTATATCTCGCAACCTTTATTCTAAAAAGAAACAGAATAAA
TTGAACAAATCCAAGTTAGTAATTAGTCCATTCTAGGCCTATTCTTCCCA
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ACACTTCGATAGCTGATAACAAAATACAGAGCAACAGTGACGTAAGGGCG
TGTTAAAGAAAACCATTTGGACAATGTACTTTTTCACATCCTCATGACGA
AATATTGTTGTAATTGATCTAAATAANAAGTGCGTCGCAGGGGATCGGCT
GGAGGGACTGTAGCTCCCCCATCCCTCGTCCAATTTGAAGAATTATTGCT
TTTTAATAGAAAATTTAACATTTGAAATTTTCTTTCAAAAATATCATTTT
TCAAATTTTTTAACAAAAAATTTATTTTTTGTGAAGAGCTGTAGATTTTT
GAAGTTTTTTATCATAAAAATTTAATTTTTTTGTAAATTGTTGTGGATTT
TTGAAAAAAAAAAGATTCAAAAATTTAATTTTTATGAGCAGCTGTGGATT
TTTGAAAAAAAATTAAAAAAATAATATTTATTGTAGAAAAGCTATGGTTT
TTGGAAATTAAATTCTACCAAATTTAATTTTTTATGCATACATGTGGGTT
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TATGGAGAAAAGCTATGGTTTTTTGTTTCCAAAAAATTTAATTATCTGGA
AATGGGGAAGAGGAAAAGAGCAAGTTTTTATCCATTTTCTACTACCTTTA
ATTTTTTGCAGACCAAAAGAGGCATTCCTACTTTTGTTCTAGGTTTTTCT
CCTTTATTTATTCTGCTTGATTAGTACTTCTAAAGAAGAGAATATCATTA
TGATACAACAATGATTGTTATATGTATTATATGACGTAGAATTTGTATAC
ATATACCTAAAGAGACTAAAAAGGAAAGAGAGACAAGATGGTTGAAATAA
ATAGTAAATAAAAACTATGAAGATGAATCATGTTCGGGATTCACCTAACC
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TATAATTTTGTTTTAAAATAACTTTTATAATATTTTCGAGCACAATTATG
ATTCAGATACTATGAACTATGGTTTTAACTATAGTTTATGCTTCTGGTTG
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AAAATGCGCATATATAGAATTTTAAAGGAATCATAATTAGAGATAAAAAA
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AAATACAAGCCATCTTAAATTTTCTCAAAATAGAGGCATTCTCACAAATG
TGCCGCCCCCTTCAACATTAAAGTAAGCTGGAATTATTTTTCTCAAAATG
GAGTCTGGATATTATATTCTTTGATGAATTAATTATCGTACGAATAATTA
TTCAACAAAATATTCCTGATTAATCCTTTGATGGCGTTCCAAACAACATT
AAAAGTATCAAAAATTCAGCATCAGAATTGAAAAATAAAAAAAACATCGA
TTTTACTTCATAATAGAAGTACAGAAAAAAAAGGAATTTTTGTTTTTAAC
TAGAAAATGTAATTTTTCATTTTTTTTAAACTTAATATTTGAAATTTAGC
TCAATTTCTTTCGAAAAAATTTAATTTTCTGCAAATAGCTATAGCTATTT
TAAAATTTTTTGTGTAAAAATTTAATTTTTTGTGAATAGGTATGGATTTT
TAAATTTTTTCTTTTGGTTAATAATATAATATTTGAATTTTCTGTTTAAA
AAAAATAATATTTCAAGATTTTTTGTTAACGGCGGMGYATTTAGAAAAAA
AGTTGCATAAAAWTTATTTTTTMTGTGAACAGCTATAGATTTTMGAAATT
TTTTGAGAATAGCTATGGATTTTGGAAATTTGTTTGAAAAAAAATGCATT
TTAAAATCTTTTTACAAAAATTTTTATTTTTGGAATTTTCTTTAAAATAA
ATACCTAAAACAAAAAAAAATATATATATAATCCTACTGACGCCCTTGTG
AAGGTTATACCTATATTTATACAATACAAAGCCTATAATGAACCCAAAAT
ATATCAATGAAATATTGAGCATTTTATTTGAAATGCTATACGGGTTAAAT
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GTAGGTCTCAGCTCATCCCATAAATTTGGCAACAAATTGCTAGAATTTTG
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TTTCAAATTTTTTTTTTTTTTTTGCAAAAAATTTTATTTTCTGTGAATAG
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TAAATATTTGTAAAAAATTTAAACAGCTGTGGACTTATGAATTTTCCTCC
AAAAAAAAATCAAATCTTTTGAGAATAGCTTTAAAAAAATAAATTCCACA
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TTAAATTTTTGAAATTTTCCACAAAAAAAAATCATTTTTCAAATTTTTTT
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GAATATACAACATACGGTTGTATACCTTTGTTATGGAAATTGAGAGTCTA
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AGGTATCTCTAAACGTCAGGGTCATTTATACTTGCTCCATGATCGCAAAG
TCATTAAGGCAAGTTCTGAGCCATCATTAGCTAATATATGCCCAAATTAA
TCCAATTATATTTATATATAATACAACTGATGTCAACAGGTTATGTACGA
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ATTGCCATGAGTCCTAGCATGCTCAACAATACTCAAAGGTTGCCTCTCTC
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GAAAACGTCCTTATTCGTATAATTACATATGTAGTTGTTTTTTGAGACAC
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GTATCCATGGAAAGTTTCATCCTCCTAGGTCCAACGGCTTGGSCATCCAT
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GCTTTCGGAAAATTACATTTTCTGTCAATAGCTTTGGATTTTTGAAATTT
TTCGACAAAAATTAATATTTAAAAAAAAAAAAAATTATGCATGAAATTTA
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TTTTGGAAAATTTGAGTCAGCAGCTATAGATTTTTGAATTTGTTTCCAAA
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AAAAATTGTGGTTTTTGGATTTTTTTTCAAAATAATTCACCCCCCCCCCC
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CACTCGCTTTTGAGTTGGAACTTGTACAATTTGCGTATACCAGGCACACG
TGACAACTTGTACATGCATCATATGTTATATAATAAAATAACAGAATAAA
GGGAGTTACGTTTAACAAGTTACAGGAATGCCAATGGTTGGAGGTAGGAG
GGTGATTAACGATTTTTATTTATTTTTACTCCATAGCTAGTGATATCATT
GCCGTTACGGTGAAAGAAGTTGGTAAACAATTTCATAAAGTATTTATGGT
TGAGGACATGAAAAAGGAAGTTATCCAGAAAATGAATGCATTAGAAAGAC
GTGTTGATAGTGAGTAGTAACTAGTCTCATATCTAATAGTTCTCTCTTTC
TCTACCCCCTCTACATACATACTGTCATGTCTGTCTCAAACTCTCTGTTT
CAGTCATAACGTCTCTCCTTGTTATACAAAGACCATTTCGTACTTTTTAT
TCCATTGTAATATTATGTTGAATGATTCCTATTATTTATATGTAAGTAAC
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GAACAAAGACACATAAATATAGTCCTAATAGAAATGAAACTTGCTCTGAC
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TCTACTCGCCTGTTCATCTTTTTTTATGAAAAAAAAGTTCAAACCGACTA
ACTTACATACTTAGTCATTATCAAATCATAATACGTAAATATAGTTCTAG
AGTACTGTCTGTATTTTCTTTACACAGTCATATTATTTCCTTACTACAAG
CTACTTACTACCTGGCGATGGCCCAAGAAGTAAAGTAGTCTTGAATACAA
TCAAATTAAAACAACTTTCATTGACATTGAGAAGTCTTTCGGGATCCCGC
TTTCCCTGGATTTATTCGTGTTTTACACCCCTTAAACATTTATTTTATGC
TAAAAGTTTCATTTAATTACATATAATCTACAAAAAATGACTCTTTACTC
ATTTAATATTTTTTGTTGCTGGTTGGATCAGATTACGGAATTCAAAAAAG
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AATGATAAAAATAAAGAACATGAGAATATATTATGAAAGTAGAACTAACT
TAAAAGGTATCATTTCTTCTGAAAATATAAAAAGAAATACTGAAATTCCA
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AATTGTTTCTGGGGGATCCCACTCAAATACAATTTCCTGGAAAATGGTGG
GGGMGGGCTGTCGCCCTCCCCAAATTAAGGATTTTCTGCTTTTATCTAGA
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TTTGTGGATAGCTATTGATTATTGAAATTTTTTCCAAAAAATTTAATATT
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TGAGATACCCGGGTCAGAATTTATAGGTTATAGTATGCCCGTACTTAATA
AATCATTCAGCGATCCACCAAAACTGGTGGATTAAGGAACAATCACTTGG
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TACTTTCTCTCTCAGTCTCTATTCTTGAGCTTCGCAAGAAGGTATGATTG
CTTGCTTTGTTGCTAGGCTAGGTTAGATTTCATTTCATAGATTTTAATAT
TCACAAAAACATTTTCCCCTCTTCCTTTACATTGTATGTACAATATAAAA
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GTTAATTGCTATATGGACGTCACTCTTTAAATTTCATTTTTGTTTAATAT
ATATATATATATTATTCACAGAGGAAGGACGAAGATTAGTTGAGATGGAA
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CAGAAACACCTTGGACTACAATAGGCTCAGGTAAACACATCATGAATGAG
TGTAAATAATAATAAAAATCCTTCTCCCTTTGTTGCTATTAAAGACCTTG
TGTTACGATGCCTGAATATTACTATTCTCCAACATCTGAGAAAGAGACCA
TATCATCTCATAGTCAGTCATTGCCACAATACAACAAATATAAACTATCA
GAAGAAACGAAGGAAGCTCTTAAAACACCAGGATTCAATATGTGGCAATG
GGAGCCGAACGAGGTGAAGTCTTATATACAAATTCTTTTTTGGCTCAAAA
AACAAAAACAAAAAAATATCATATTATGTATCACTTATTTTCAGATGTTA
ATTCTTTTAGAAGAAATGTATTATGAGTTAGGGATAGTGGACGAATTGGA
AATCAATCCAATCATACTCAAAAAATTTCTCATTCGAGTTCAAGAGGGAT
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ATGATGTATGTCCTCATTCACGCTTGCAAGTTGAATGAACACTTGTCCAT
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ATCCAGGATTCAATAACACTTATCAAATAAATGCTCGAACAGATCTATRT
ATCCGCTACAATGACATGTCCCCTCTGGAGAATCACCACTGTGCCATGTG
TTTTAAAATACTTTCAATAGCTGAGTGCAACATTTTCGCGAATTGTGGAA
CTGAAGTGTCCAAGGAGATCAGAGGAGTAATTATTTTTTTAATCGAGGAG
CCGTTATATTTTCATATATGTACATTTTATCTTTAATTAAGGACATGATC
ATACTAATTTTGGCAACGGACATGGCACGCCATGCTGAGATCTTGGATGC
TTTTAAACAAAAAATTGATGATGGATTCGATTTTAAATCCGAAGAACATT
TGAATTCTTTAAAAATGATTTTAATCAAAGCTTGTGACGTCTCAAATGAG
TGTCGAATGACAAATGTGGCGGATCCTTGGGTAGATTGTCTTCTGGAAGA
ATACTTCCATCAGGTAATCTACAAAAATAACCCCACTCACACTTCATAAG
ATTCTAGAGTCATTATTATATAGTCGGACATTGAAAAAAAAGAAAGCTTA
CCTATAGCTCCTTTTATGGATCGGGATCGTGTTACCAAAGCAACAGCACA
AATTGGTTTCATCAGATTTGTTCTTCTTCCGCTTTTTGAATCTATTAATA
GGGTATGAGGACTCTTTAACATTCATTCTTAGAATAACAGGGCCTAAACA
CTCCCCCACACACTAATAATTTTTTTTCTCTCTTTTCATAAACAATACAA
TATATAAATCTATACACAAACAAACACTTAAGTTATTCCCCGAGATGGAA
GAACTGGCCTTGGTGAATCTCAGAAACTCTTTGGTCTATCATGAAAAGTT
AAAAGAAGCTATGGACTCCCAAGAAGCTGATGCTAATAAACAGACTTGAG
AAATATATCAAATACGATTATTTTATGCATRATATATATWAWAAAATCCG
CACAATTAATTGTAAAATTTTTCAATATAAGCATTTTTCTTCACATTTGA
ATAATGATGAAGAAATACATTTAGTTTGTAGAGACGATAGAAAATCAAAC
AGTTTAAGAAAGGCAGCAGGCAGG back to top
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