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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s777 | supercontig | LSalAtl2s777:63125..74248 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011298 >EMLSAP00000011298 ID=EMLSAP00000011298|Name=EMLSAP00000011298|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=256bp
MRQHLRTHIGGKDFRCNHCPKAFRQKSHLLQHMRMHTGDKKYIKFTQLSH
LQQHIRTHTGDKPYKCQYNGCLKAFSQLSNLQSHSRCHQSDKPYKCNACY
KCFSDEAALLEHIPKHKDSKHLKKHICYFCGKSYTQEVYLQKHMQKHADR
EEKETVNSSYFSSEYGYGIGSSTYNQLNSQIRIQSTSTTINHHINFHIQP
QQYNYNISHEERKSINSSSLVPLQGGNILNATSARGCTFYDPLSFPKQIT
QETIDK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s777:63125..74248+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011298-707145 ID=EMLSAT00000011298-707145|Name=EMLSAT00000011298|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11124bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s777:63125..74248+ (Lepeophtheirus salmonis)
GAAACGGTTTGAAGGAAGATGAAACATTTCTCAAGTTTCTGGAGTCCAAG
ATCAATAAAGATCCAACAGCATCAATGCGTCGTTTGGCTGTCGAGTTCAA
CATCATCGATATCACCATCCACGATATCACCATCAGGAGCACAATTCAGG
ATGACCTCAGTCTTAAGAGCTTTCTCAGGATCCCAAGGCATCATCTCCCC
AACAGAATGAAGGCCTTAATGCTTGAGAGATGCAAAAAAGTAATTAATTA
CTTTAAGGGGCATCTGTCGAATATGAAGATTTTTTTAGAAAAGAAGATTT
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ATCACCTGAAGAAGTCCAGGGCACCTTCAGGATAAAATATCCGGTCAAAA
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CTTCAAGCCCAATGAGAAAATTGGGGCTGAGGCCTCTATAAGGTCCTGAA
GTGAAACATATTTTCCAGGCTGAAGGGTAACTATCCTGAAAACAACAATG
TGTGGACCCAAGACGGTATTTTTTGAAAAAATTGTCATTAGAAACAATAA
AGAATGAATGATAAAAGGAATGCCTTTCACTTTTTTTTCCATTCATCATT
CATTTTTCCCCCGTTCATCATTCAAAAGTTAACGGAAACCTTTCTCTTCT
ATCTATATTGGAGCTATGCTGTTATCCTGCTTAGCATTCTTCAAATGTTC
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TTTGTTTTTTTGTTTTAAAGTATATTAAATAATTCAATTCACAAATATAA
TGTATTCAATTTTTGTATTTATTGATCATTGGTTATATTGATTGTTGGAA
GATTTTTGTCTAATTCTAAAACTGTTTGATATCAAGGAACCCTTTAAAAT
AAGAAATGCAATACGCCAAGGTAAAAATCCAGCTTGAATATAATTTCTTG
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TTTTATGTCATGTTTAAATTTATTTTAAGATATTATTTTTCGTTTATATT
GTGAGCTTTATATTTTGAAATGAGCCATAATTTAATCTAAATTGAATTAT
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AAATTTAAGTCGAGTTGAAGCAACCTGACATTAATGTACCAAATATATAA
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GGTAATATATCTTTTTAATATTAATATTAATTAAACTAAATATATATTTT
ATGTACATATTTTTTTTTTCTTAGGTGTAACCATTGTCCTAAGGCATTTC
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CTTTTATTAACTGAATTATTTATGACCGTAAATAATGTAAATAACTAACA
ATTCTGGAAATTCCTTTTTCGTTCTTCTTTTTTTATGTGTAAAAAACTTC
TTTAGAAAAAGAGTTTCAACAAAAAAAAAAAAAAAATCATAAAATTTAGT
GAAATAGTTGTTGGATTGAGTTAAATATGAAATTTGTTTAAACCAAAGAT
ATGAAAGGAAAATTTAAAATATTGTTATTATCAATGGTACATTTTTGGAG
TATATTTTTAGTATTAAATAATTGAAGTAATTAAAAATTTGTTATTATTT
TGCTACTTAATATCAGAGTAGTATTTCTTTAACCCATTACAGGAAAACGA
ATTTTCCCTTAATATGTGTATTTAGTAAAAATATTTTCCTTGCAATGGAC
ATAGCTTAGACATTATTTTAACTAATTTGAAGTGTCAAAAAATATATATT
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TCACGTTTCGTTACTTTATTTTAATGCTTTACCTCTATCATGCTCTAAAC
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GGACTGACTGTGGCTGCTAAAAACAAAACACTTAAGCTTGATTTACTATG
ATTAATTATTAAAAAATACGCCTATAACCATTATTGGAAAATCCTAGTCC
TCCATGCAAAATTTTAGAACTTTATAAGCTACCAACTTGGGGTTTGATTA
AAGAAAAATATGTGTAACTGACCGACAGAAGGACAAACTAATATTCTGTT
TTACATGTACATATAGGGATCAAATAAAATTATTTGTAAATAAATCTTAC
AATCGTAAGCCATTCGGAGAGGATTTTTAAAGGTAAATATATACCGAAAA
AAATATCTAATTACTAATATTTTAAGCTTTTCAACAGAAAAATCGCAAAA
ATAAAATTATTGGTTTCGATAAACGATTCTCCAAATACAAATGAATATAG
TTTAGGAAATGTGTATAAGTTTGTGATAATAGGCAACTTTGGTTGCAATA
ATATCTATACGTAATATCTATAGTAACCTGACTGAATTGTTGAAATTATT
TATTTTGTCCCTTATATTTTGGATATTCGTAACAATGTGACCACTTCTAA
TAATACTCCATTAAATAAAGCTAGAGATGTAAATCTTTAACTTTAACATT
TATTTGAATTACTTTTCAATAGAAACAGCGTTGTTATTTTCCATAGTTGT
TATAATTATTATTTAACTCTTGATGAAAGTAAACACGAGTTATAAGTGTA
AGTTCTTGTTTGCTTATGAGGGTAAATATATATGCTGGATATGGAGTGGG
ATTTNATATTTCCTTTTCTCCCTCCCAAAATAACGTCAATAGAAAAAGAG
AATAGATAATCTAATAAAATGCTATAACGTCTAAGCTACTCTGCTGACAA
TTATTCTTGATATGGTTATAGTTACCATATCATTTTTCAGTTTTACACAC
TGACAAGCATATAATTTACAACTCTAATTATAGTTATGAAATTACTGTGC
AATTAAATAAAAAAAATTATTCTATAGATGTGAAATTTGTCAAAGAAAGT
TTACTCAACTTTCTCATTTGCAACAGCATATCCGTACTCATACAGGAGAT
AAGCCATATAAATGTCAATACAACGGATGTCTAAAAGCCTTCTCTCAGCT
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AATGTAATGCATGTTATAAATGTTTTTCCGATGAAGCGGCACTTTTAGAA
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TTTTTGTGGAAAAAGCTATACTCAAGAGGTTTATTTACAAAAGCATATGC
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TTATCAAGGTGAATATGGCTATGGTATTGGTTCTAGTACATATAACCAGT
TAAACTCACAAATTAGAATTCAATCTACATCTACAACTATCAACCACCAT
ATAAATTTTCATATTCAACCGCAACAATATAATTATAATATATCACATGA
AGAAAGGAAGAGTATTAATTCATCAAGTTTAGTTCCACTACAAGGAGGAA
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TCATTTCCAAAACAAGTAATTAACAATATTAAAAAATCAATATTTCCATA
CTATTTCATATGTAACTTCAGATAACACAAGAAACAATCGATAAATAAAT
GAGGCAATGAAAAGAGGTAATAGAAACAATTATATATATATTCTAAATAT
TACCAGAAAAACATGGTGAAACATACTGTATTTTACAAAATAAATAAAAG
ATATTCCCTAAAGTTATAACATAAAACATAAAATGCATTTTTATTTACTA
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ATAAAAATTTAAATCCTATACTATTTTAATAGTAATTATTGTTTTGAAGT
AAATTATTACAAGCTTCTTTATTAGAACTTCACACTCACATTATTTTAAA
TTATCATTTTGGAAGTAAAAGTGAAGTAGAAAATTCATCATTCTNTTATC
CGCCAAACTTAACACTGTTATTTATTATATAAATTTAATTACAATATTGG
TTGTTCTAATTAAAATATCTAATTCTAATTTCGATATTAGAATTAATTGG
TTATCATTGTAAATTTTTAAGCGTAATAAAATTAGAATACACAGTAATAA
CTTGATATACGAGTTTATTGAGTTTATTTCGTAATTGGTAGGCCAGAACA
ATTGCTCTCATAAGAAATAACTAAATTTTTTAACTTGAAACGTTTCTCGT
GTCCAGTTGCCAACTATTATTATCTCAATAAAAATTATAATACATGCTTT
CAAGGTGGTCAAAAGTCCTTTGACCAGAATCTCTTCAGGCAAATCTGCAG
GATTATAATTTATTGGGGGGCTTCGTTTTTGGGGGAAAAAAATCAAAAAT
GATATTTTATATATTCAATTTTAAGGAAAAAAATCAAAAATGATATTTTA
AATATTCAATTTTAAGGAAAAAAAATCAAAAATGATATTTTAAATATTCA
ATTTTAAGGAAAAAAATTAAAATTCATAGCTATTTACAGAAAATTATTTT
TATTTTGGAAATATAATTTCAAAATTAAATTTCTTTTTAAAATTTTAAAA
ATTGGCCATCTTACTTATTCTCTTCATCGGGCTCCTGTCTATCTTCTCCT
TCACTGAGTTGAAATAAGGATGGATACCCAATTTTTTTGAGATTACCACT
TCCAGGAGTCCGTTTGAGGCTCATCCCATCCTTGTTCAGCTTCTTCACCT
TGAAAGCGCATTCTCCAACCTGCTGACTATCCGGACAATTTCTGCCCCTT
GACTTGGGTATCGAGCAAATCGGATATCCTTTTTCTTTGAACCCCAATCG
TCGCACTCTATCATTATACAAATGCAATTTTTAAAAAATGTAGTTATTGG
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AATTTAATTTCTTTCTTTCACGTTTGATTAGAAAACTATTTTTAAACATC
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TAATACATCTTATGTTAAATTACTTGAAATTATTAAAAGATACTTTCATT
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TAAAAACAACGGAAATGGCCGCCATGTCTATGCAAAGAAAATTTCGTTCT
GAAGAGATGCAGGTCATTAAGAATTAAATTAATTAAATTTTAAAGAATGG
TGACGATTGGTTGGAGATTATTGACTTTTATGTAAGGATGCCCGTAAATC
AAAAATTTAGGGAAAGTATCAGTAAGTCATTTTTATAGCAAGTTGGATTT
CATTTAGGCAAATCATCAAATTCCCTTCTTAGCATAGCCAAAGAGAAAAG
TGCTACATCGACTCAATGTGGATTATATCAATATGTGAGCATGTCATTTG
GTCTAAATATGTCACAAGATCGTTTCAAATGATGATTGACAGAATGTTGG
GAAGTATTTGTATAGGCTTTGTTTATGTTGATGACATTCTTTTGTTTTCC
TAGACGGAAAAGTAGCATCATAAACTTGTAGGTGAGGTTTTAATGCTCTA
ACGAAGTAATGGATTGAATTTGAAAATTGAAAAAAGTCAATATTGCAAAA
CAGAGGTTGGTTGTAATCTTTCTTCTTCAAAAGGTGTTTATATCAATAAT
TGGAAAATTTTCTGAGTTGAAACAGATGACAAGACTACAAATAGTGAAAC
ATTTCAAGTAATGGATTGGTATGGTTAATTATTATAATTATATATAATTA
TTTGTTCCTTGTCTAGGCGATCTATAAAGTTTAATTTATAAAGCTATCAA
CAATCAGAAGAAGAATGCTACGATTTCATGGTTACTAGAATTAGATCGAG
CTTTTAAAATGTTGAAACTATGTAAGGATAAGATTATAATGCTTTCTAAT
TATTTTCCTTGGGCGAATTGAGGATAAGGGTTGAGGCTTCGGATAATGGA
ATTGGAACAGTTCTTGAGGAAGAATAAGACTGTAAATTTCATCCTTTGGC
CTTCTTTATTCCAGGATATAAATTCAAAATAATCTGCATTTTCTCGTAAG
TTTTTAGCAGCTAGGGAAGCAATACTACATTTTGGTCATATTATTGAAGG
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GACGTGAGAGCCAAATATCCTAGGCCTATCGTATCTAGGGAACAGATCAA
TAAATTGACAAAAAACAAAAAAAATTCTTAATAGGTAATTAAAATATATA
GCACGACGATGCTCAAACGTTACTAATGGAATATATTAAAGTATCAAAGC
TCAAACACTTCAATAAATATGAAGATGCTACACGTAGAGAAATCAATTTC
ATGTTTGAAGGAATAGTGTTTAACAACCTGAACCTAAGAAATAACGAAAA
TAAACTGGTAGAATATTTACTTATTCCGGTTTACTCAAACCATTCCAAGT
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CAGATTATTGTGATTTAAACAAGATCACTAAATCTGATTTCCAAGTGGTT
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GAAAAGCCAAGTATATTATTGAGTTAAGCATGGCGGGMGTTTACATTGCA
GTTCCAGTAAAAGATGAAAATCAAGACTAGTTGACATTATTATCTCCGTT
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GGAATTGAGATGAAGAAAAAAAAAAGTTTTCCTAMCCTTCAAATAGAAGT
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GACTACAGGATGTGAAAATTGAGGATTGTGAGAATTGAATGGTAATCTTT
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TTATGTGGAGTATTAACACCAAGTCTATTGCCAATCCGATATGCAAAGAA
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CGAGGGAGTAGCCTAATTATATATAGACTTCCTGTATCTTCATTTCTTTT
AAAAAGGTCCCTGTAAATAAATATATTTTTGTAGTGTCTTTAGTTCATGA
TACCAGTTAAATTAAGGAAGGTAGAAGGAGGATTAAAACTATGGAATGAT
TCCCCTGCATAATATTAAACATTTTTTAAATCTATTTAAATTCATGAAAG
TGATTTCGGTCATAAAAAATGATGAGGCCTGGATATCATACAATGCTATG
GATATAACAAATATGGCTGSCAATACATTTAAAGGMACAAGATACTACCT
ATTAGCCATATCTGGATTAGCAATCAAAGACATCTATCTTAGTATTTTTT
TATTTTTGCTGGAGAGCTAAACACGTATTAAAATTAAAACTCACGAAGAC
CCAATACTCCTTAAGAAAATGGATTACCAGGATGGTACACACCCTCAAAA
AAAACGAAAAAAAACTGAAAGGACGCAATTTCACAAAGGGTGAGCATCAA
TAGTATCATCACACCCATAAGTACACCAACACATCAAAAACCATGTATTA
GTCATCAACTATATTCTCTTTTATTATATAAGATGAATAAAAACAATGAA
TACAAACAGGATATTTGAAACTATCTGAGCTTCTAAATTTAATAATTTTT
CAAGCATTAGTAATTTATAACTTGTGTTACTTAGTAAGAATAAACTTTTG
TCATATCATTATACAGAGTACTTC back to top
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