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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s788 | supercontig | LSalAtl2s788:261718..270151 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000011399 >EMLSAP00000011399 ID=EMLSAP00000011399|Name=EMLSAP00000011399|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=223bp
MNLSFIIFILILNQCELRHGYSPQCDEEWNCGYTGGQEEEDKPSSQESSS
FRFFFPPGGDSAYYGRPNLPSYNTYPGISQAXPYTPLNNNNYYTPFYGRY
GPSGGGGQDGLDGYAEEFLHLLLILQEYATIASGRLNWYASYLQVEMVSR
ARIDSTDDGKMSRLIIYKVLPEDKGTYACETWSFLNEDWSSENPYNYFQG
NNVQKELLTIDFYPQFPTFSTNC back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s788:261718..270151+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000011399-707246 ID=EMLSAT00000011399-707246|Name=EMLSAT00000011399|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8434bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s788:261718..270151+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATCTCTCCTTCATCATATTTATACTCATTTTAAATCAATGTGAACT
CCGTCACGGATATTCTCCACAATGCGATGAAGAATGGAACTGCGGCTACA
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ATTTGGATATTCACCCAATAATTTTGAGCAACAAAATTTTAGAACTGTAA
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AGATATCAGTCACTGACGTCATCTTCAACCATTCTTATAATAATAATAAA
TTAGACTTAAGTAAAAAATAATGTAGAACTATTCCCATACTTGAGAGATC
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TACTTTACTAAAACACTATTATTGTGCTTGAAAGTTTATTTCTTTAAAAC
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TTAATTTTCTTTTAACAGCGCTGGTTTTTGAAATTTTTTTGCAAAAAAGA
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TTTATGTTCATATTTCAAAGCACAAACTTTTGTCCCCCCAAGCTGCAAAT
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GTGATCACTTTGTTGCGCCTGTACACACATCCAAAAAGACTCAGAAAAGG
TTAGAGGACAACTTGCCTTTTTGGGCAAAGAAAATGGGGTTCCTACTCGC
CCTATGCCAACTCATTGGGATCCACTTTTTGAGTGCATGTCCAAGGCCTG
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GTGGACACCTAGAACCCATCATTGCTGCCAAGGGGAGCTACATCGATGAT
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TGTACAGAGTTTTTTGCCGCGCCAAGTATGTATTGAGGGAGCACTAGAGT
ATACAACACTTGTCAATTTTACTGCAGACCCTGGAGGAGGAGTGAATAAC
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GGAGCCTTGAACTTGTTTCTTTACAACAAGATGGTCCCATAACAAAAACA
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AAATAATTTAAGTACGAAAAATTAGATCATTGTTTCAAAATAATCCATTA
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GCATTGATCCACAACTTCCCTATATTTACGTCTTTTGGAAATGTAAACAT
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ACGTTTTGATAGCTAATTACTTCCATATTAACAAAAGAAGGAGTAATCAC
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ATTAATATTATTTGCAAGAGGAGTTCCTCCATCTTCTCCTTATCCTTCAA
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TCCCAGAGGAAGATATCATGACATTTTGGATTATTATGGGTAATTTAATA
GTTTAAATATCTTTAAAACGGCTGAAAATGAGTTTCCGCATCTATCGTAC
GTGTACACCTAATCAACGTAATTACATCTGCCAACGATGTTGAACAGAGG
TTATATTTTTGCTTCTATTTTTTTTTTAATCTGCTGGTCCCCGGAATTTC
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GACTCCGACCCCACCCCCTAGTATACTCCATAAGGGAGTAACTCAAAAAG
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ACATACCCAGATTATATATGGATAAAGTCCATTAAATTTTGAGACAGCGA
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GTAAATAGCTATAGATTTTTGATTTTTTTTTCCACGAAATTTAATTTTTT
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GTCTTAAAATAGGAATGAAGTCCCTAATGTCAGAGTTCCGATAAGTCTAT
GCACTTACAAACATGAATTGTGTGGGAACTCACCTCAAGACATAAATGGA
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ATAAAGTTCGATCCTTGATGACGCAAACAACTTTATTTATTATTTTTTTA
ATCAGTTCTAGTACTGACTGCCCGAAGGACCCATAGTTGTAAGGACTGGT
CCCAAGGACTGAATTAATAAGGACTGACAAAACACTAGTAACAAATAAAA
ATTTCCCCTAGTTCGTTTTGAGGTACACTTAATCAGTTGGCATGCTCATT
TTTTTCTTCCATCTGCAGAATTCACCTTTGGTGAATTAGGCTCTTGGTCT
TAGCCTCGAACATTATCCCCAGCGTTAATTTTGCCCCTGGTAATTTAGTT
CCGAAGACATTTTGCCACATGATATATTTACCGTCTTTTTAGTTTTTTAT
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ATTTATTCTTCTAGCTATATAATTAGTTTGATCAAGAAACAACAGTAAAG
TTAAAGTTGCCGGTGGCAACAATGTTCGTGACTAAATTAGTGGATTCAGG
TGAATTCATGTTGATTATGCAATTTTAGATACGAAGTAATTCATGATAGA
TAAAAAGGTATTCATTCTTGTAGCAAAGTAAACTTGAACTAAAATTGATA
CCATGTTCGTCGTTTCGTCATATAGTTTGGCTCTGGGTGTTTTGTTTTTA
ATTTTGGAGAACATTAAAAAAAGAACAAAGAATTGAACAGGTAGACGATT
GACCCTCAGGTGTTCAAAAATCGACGGAAAGCATGATTTAATTCTAATTC
TGGATTAATCCCTTAACAAAATGAGAGAATATATCAAATATCATTAAAAT
TAATCATTAGGTCCTTCCTGAAGATAAAGGAACGTATGCTTGCGAAACAT
GGAGCTTCCTGAATGAGGATTGGAGTTCTGAGAATCCTTACAATTACTTC
CAGGGCAACAATGTTCAAAAGGAACTACTCACTATAGATTTTTACCCACA
GTTTCCAACATTCAGTACCAACTGCTAGCTCAATGATCATACTACTTCCA
GACCAATTCATTATTGGGGCTCACCAGGGACAAG back to top
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