EMLSAT00000011463, EMLSAT00000011463-707310 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000011463
Unique NameEMLSAT00000011463-707310
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s790supercontigLSalAtl2s790:313171..331500 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000011463 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000011463EMLSAG00000011463-694229Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000051271EMLSAE00000051271-760199Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000051272EMLSAE00000051272-760200Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000051273EMLSAE00000051273-760201Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000051274EMLSAE00000051274-760202Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000051275EMLSAE00000051275-760203Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776238auto776238Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000011463EMLSAP00000011463Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000011463

>EMLSAP00000011463 ID=EMLSAP00000011463|Name=EMLSAP00000011463|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=235bp
MSPVGLYTEDHPENKGHSGINQLGGVFVSGRPLPDSTRQKIVELAHSGAR
PCEISRILQVSNGCVSKILGRYYETGSIRPKAIGGSKPRVATLQVVNKVK
SYKSACPSIFAWEIRDNLIKDKICSSDSVPSISSINRVIRNIVEISGEFE
NGNGNFQFMNHPQYCWPFKDEVETFHSTTFNYNSLQVSSEFERTHYPDIQ
TRERLAQIITIPEARIQVWFSNRRAKWRRESNKKL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s790:313171..331500-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000011463-707310 ID=EMLSAT00000011463-707310|Name=EMLSAT00000011463|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18330bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s790:313171..331500- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAGCCCAGTAGGGCTATACACAGAAGATCATCCAGAGAATAAGGGACA CTCAGGAATCAATCAATTAGGTGGAGTTTTTGTTTCAGGAAGGCCTTTAC CAGACTCTACAAGGCAAAAAATAGTGGAGTTGGCTCATTCTGGAGCTCGG CCCTGTGAGATTTCACGTATTCTTCAAGTATCGAATGGATGCGTATCAAA AATATTAGGAAGGTAGGGTAGGTTATGAACCATCATTTATCATATACTGT GGGCTAATTATTTTATAGATACTATGAAACAGGCTCCATTAGACCTAAAG CAATAGGAGGATCCAAACCTCGTGTTGCAACTCTTCAGGTTGTCAACAAA GTCAAGTCTTATAAGTCAGCTTGTCCATCAATTTTTGCATGGGAAATCCG AGATAATCTCATCAAGGATAAAATATGCAGTTCAGACAGTGTTCCTAGTG TGAGTATTCAATATTAAATTGGATAACTAGACCATCTTCTATTATACATT ACTAGATATCTTCAATCAATCGTGTTATTAGGAACATTGTAGAAATCAGT GGGGAGTTTGAAAATGGAAATGGGAATTTCCAATTTATGAAGTGAGTAAA AAAATCATGTTACTTGGAACTTAATGTAACTTCTTCGAATCTTATTAGTC ACCCACAGTACTGTTGGCCATTTAAGGATGAAGTAGAGACGTTTCACTCA ACTACTTTCAATTATAATTCACTGCAAGTTAGTTCTGGTAAGTTAAAGTT AATTTTTATTTCTTTAAAATGATTTATTATGCCTTTTTCTGATCCGAGTT TCAATGGTTATTTTATATTTGATTTCATTTCGAATGACTTATAAAATATT TTTTTTTTGTTTTTGTGGTCTAAGTTGCATATTAACTATTCAGACAGATT ATTCAACGTGAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAAACAATTATAAAAACCATAC 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GTTATATGAGTTATGGTCGAAGTTATGTCATTTTTAACGTTTTTGCTACC TTGATTTTGACCTTATTTGGTTAAAAACTTATTGATGTTTACCATAGTAC GTACATACATACATTATAAAATAGTACAAATATGCATACATTATAAAGCT ATACATACATAAGGCACAGAACATGACAACACATATATATGTGCTATTTT AGCAGAAATTGATCTTAAGTCCTACTTAATTTTATAGTTATTATCAATGG TTAGTTTCATTTTTGTACATTTCATAAATTTAAGAATACGGAGATCTTCA TTCTCTTCTTGCATGACTTGGTATCTCTCATATGAGAGAGATGTATATCT GTTAATAAGGTTGTCTACGCTTGATGGTTCTTTTATGCAGGTATTCCACT TGTATTTTTCCATTTGCCCAGATCGGCCAAAAATGGCCTATGACCTGTGT AGTCTGCAGGCTTGAACAAGTAAGTTCATGTTTCGACACAAAAGTTTGGC AATATTTTGTTTTAGTTTCTTCAGCATGCCCCGGAGAAAAGTCCTTGTTC TCCATCTAGACTTCGTTGCTTGCGCTTGTATGTAGAGGTCGAGGGGAGTG ATACCCAACACTTGATTTTGACCGTAACATATCAAAATTTATTTGCTTCT TACCGTGACCATATATAATCTTTGTACCTAGTTAGATTAAAATCGAACTT AACTTTTGCTGTAATCCTTCTAATCAATAGACGAACAAAAAATCATAGAT AAAAAAATGACTTTAACTTCGTTCAGAGAAAATTAATAATTTTAAAGCAT CTCAATATTAAAAGATATCCCAGAGCCTTTTATTCTCTTATTGCAGGAGC ATTCTAACCCTACAAAATCTCGACGCTCTCAATCATATGAAATATTTTTT TTCAAAACTAAATATTTAATAATTTTAAAAGTAAGGTGTTTTTGAAGGCC TTCTTTTATAAAAGCGAAAGGTAAATAAGGTTTTTTTCATTAATTTAAAA CCAAGATCTAATCATCATCGCCTAAAGTTTGGAAGATATAAGAAAAAATC AAGAATAAAAGAAAATAGACATGAATATAAATGTGATCCAAAGGATTATT ATAAAGTGGAAAATTATAAATCAAATAAAATATATTCACCGGAACCCAAT AGTACCCACATATAAACGATAGACCCTGATTATTACCATATCTACCGAAT GTAAAAAGCACACACATGGTATGGGGTGTTGTCAGCAGATACAATAAGGC ACTCCTTTTCTTCTTTATCCTGTGGGGTCAAATAAATAGTATTAAGTACA TGGACACCTTTCTGGAGAAAGGTATCCTGTCATAAACACAATTCCAACTT CATGGAACTGTATAGTAGCTTAGATGGTGCTACCTCTCACACGTACAATA TGGCAAAGTGGTGTCATCTCCCTGGCTTTTGGAGCCACAGCTTCTGACCT ATATCCAGTCAGTATTTGAGTCTGATAGATTTTGGAATATATCCAAATAT AGAAAGCCCCATCCAAATTTAGATACACTTAAAGTCTCTCCAATTATATA ATGGGACATAATGCTCGTGGGGGTGGTCTGTGCCTGCTGAAATGTCTTAC TTAACAGATTCCATTATATAATTCCTGGAAAAGGACACCATTTTGAATGG CTAATTATAGAAACAGAAAAAGATTTGCAATTATTCATTTTACTGTATTT AGGGTCCTTTTTGTATATTTATCAAATATGCAAATCAGCCTTAAAAAAGT AAACTAACCTGTATAAATACAAATAAAGTACATTAAAYAAATAATAATTC CCCTCCCCCCCCCCCTCCTTCATTCCTAGTATATTAAAGTAAATGAAAAT ATGTCATAATTGAATTATACTTTGTATGAATCCATTTTGCAATTCACGTG TTGCTGGGAGGATATGCCTGTTCTTGCCACTCAGTTTTTTTTGTTTTTTT AACTTTCAAGTAAACTTCAAAATGTACACAATTTTGATCAATTGGAGTTA TAGAAGTACATAGGTAATGTCAGGGTGATTATCAAAGAATAAATCTATCT ACTAATAAGTCCTGTGAGAATATCATATAATTCATGTCCAAATAAAGAGA TTTTATTTGTTTAGGCGTCCATATTTTGATTGTAAAATAACCCAGGAGTA CTGGATGCATTAATTTTGTTGGCTTGTATTGTAAACTTTAAATGATTTGT TGACTGTTCCATAACTACACAAATGCGCCGTATTTTGAATCTATATTTTT TTGAAGTAATATTGGATGAGACATTTCAGATGTTTCATAATTTTATAAAT TATGAGTTTCATGTATTCTAAAAATGCTTGAGTTGACTTTAAAAGCTAGG ATAGTACGATAAACGAAACACTTCATGGTACGTGCTCCGGCATGGAATAA TAGTAAAATGTTTTTTTTAATAGAATTAATGTAGTTTTTTAAGTTTTTTT CGATATTTTCTTCTTTAATAATTAATTCTCTGTACAAATTTATTATTCAT AAATATACTCAACTTCTCTAAAAAAAAATGGTTGAAGAAAAATATACGCG GGTTATATAATACTATTAATGCTAAATTGATAATTTTTTTTGTAAAAAGA TGAAGATTGTCCGATTAGCAGTCACAATATCGCCAGCGATCGAAAAAAAT TTTTTGTTACAAATGTCCCAATAGTTTCGAGGTATTGTGAAGCTAACTTA AAAAAATTTGGAAATTCATCTAAATTATTCCTCTGCCATACCTCTGGGGG TTCGTCAGCTTAGATATATTTTATCATTTTGTATGACAAAATACAGAAAT TATTTCTTATATATAAGGATGCATATGGATTATAATCTTATCTCACTATC TAAATTTATTAATTTAAAAAATAAATAAACAAAATTTTAAAATATAAAAA TACTTAATATGTATATACGAGTACGTACCGCACCATGGTTAAAAACGTAC AAAACCAAACTCTGGCACAACCCCATACCGTACCAGCCCTTGTATATATT TTACCAATGTTATAAGTGTAGTAAATCTGGGAAGGGATGCACGAAATTGG GTGCAAAATAAATCATAAGGGACTAAATTTTATAATTTTCCCATTAAATT TTTTATGAATTTAATTCTTGGTTTTGGTTAAATGAATTAAAATACTTATT TCAATATTATTCATCTAAAATTTATTATTCACAAAGAATTTATTACCATA TTAAGCTTATGCAATTAATCTAATGATACGTGGGCTGGCTTTTTTTTCTT TTTTTTTCCTTTGAGTCCATCATCCACATGCCTTGAACTTTTTTGTCTGA CCCGACTTTACTCACATCATTTTATAAGATTTTTTTATTATTTTTTTCAG AAAATTATATTTAATTATTTCATGGCCTACAGCCTACATACTTATCGAAT TAATATTAATTAAATGTATTTAATTGAAATTTAGAAGGTTGTTTTTACAA AATTGCACATAAAACTTTTCACTCCTAATGAAATTACTTTGTAAATTCTT ATTTTACTGTGACATAACCTTCTTTACTCCATAGAGATATAAAAAAACAT AGAGTGAATATGTGAAAAAGAAGTTGACGCCGTCGTAGTTGACCAAAACA TTCAAATTGTACAAGATAAAAATAGGTATGTTAACAACATCAACGTTCGT TCAAGTTTGTTTATGTTCCTAACTGTATTTTACATTTGATTATATTTTTC TTTACAGTTTTTCATATAAGTAAAAATTCAATACAAGGTTTCGAGTGATT GATGCATAAATAATTATATTTACCATTGTTCTGGTCAACTAACTTTAGGC 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TGGGTATTTTGATTCTTGAATGGTTAGTGAATCAATAGCACTACAAAAAG GCATATTAGTGGAAACTTATTCAGATTTAGCTACTTTTGAAAAACCTTCA TTTTGGTTTTTATACTTCATTTCAATTAATAAGCTTCGAATATTTTGGAA CAACATTCAATGGCAACAGCAAGCCAGCTAAAGTCAATCGGCTGCCCTGT TAATTTGTCAAAAATCTTCAATAAAAGGCTCTTATTAAAGGGGAACATGA ATCTATATTTATTTTCGCTATGTAAAAATATAAGAAACCGAAAATGAGCG TGGTAACTGCTACCTTTAAAAATGCTTAAGATTTACACCCCTAACTATTT CAAAATATTTTTAAATAAAGTAAATGACTATGAAAAATAGAAAAGTAAAA TTATCAACAACAAACTTCTCCCTAACAATTATGAATTTAATCAATTTTAA AACAAAATATGAAAGAACGTATTTATAGCTTAGTGTCTGTGTTGATCTTT CTAATTCTGTGGTACATTATTTTAGGTGGGTACATATTATAAAAATAATA ACATGTACTCCATTTGTAGCCAGAATGTCTTCGTAAATCATCTAACAATG ATGTATTTTTATTTTCTTATTCTTTACAATGTTTTTCTTATCTATTTTTT CCCCTGCTCACACAACTTTTTAAAAAAGGGGTAGAGGCAATATCATTATT TTGTAAGAGTAACTAATGGGTTTATAAAGCTCATTCATGTAAAAGACTGA TATGAACAACCATCAACAAATATGGAGACTCACACAGAAAATGAAAGGAA AGAAATCAAGTTAAAAGTACATACACACGTGTCCTATTCGTTATCGTTTA GTTGTTAATGATATGTATGTACAACGTACAGAAATATGTTATGGGGGAAG AAGTGTCATTGATAAGTGAATTGTGGGTTTTAAATATGTATATATAAGAT 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ATATGCCCAAATAATTATTAATATATATAAATTTTTTTATAAAAATATAT TTTTGTCATCAAAATAATAATAAATAATATTTTTTTAGTATGTGTTAGAG ATTCCTTCCCCAATCTAAGCCATCTGTGTGAATAGAATGACATAATAAAT CTCTTAACCATTGACCTTAGATCAAAGTAGACACTTTTTGAATTACAATA ACAATGAAAAAAGTTATATGACTAAGATGTCATTAATTAAGGACGTCAAT TCAATAAAACTGATCCCCTTCCCATGATGTTATCTTTGTTGTATCCTACG ACCTAGTCTTAAAAAAAGTAATATACATAAAATATACAAAACCAGTTGGA AGTTAATCAATTGTTGAACAATTCATCATTTATATCAGTGAATTGTTCAC AGCTTTACATGAACTCATTCGAGTTCAACCAATAACTGATAAGGAGTAAT AGACAATTAGATGGCAGACAAAAATACAAGCTTCGTGTTAATACCGAGTC TCACTTTTGAGTTGGTTCCGGTGGCCAATACATTGTAATTTATCTAAAAA TAATGTAAAAATCAGGGTTCTGTTATTTGGGGTATCCATATTATGAACAT TTTTTATAATAATGTATTGCATCAATTTTAAAATATATATTAATTGGCAC AATACACGTTGAATAAAGTATTGAAGGATTTTATTTAAATCAAAGTTATA AAAAAGAACTTTAAGAACTGCTAATTACTATATGAGTTATTTTTTTAAAT TTAGTTTTTACTGTAATGCCTACTGGTAAACCACATTTGCTTTAGTTTGT GTTCTTCAATGGGATCAGAAGAAGGAAATTCTTAAGATTTGTACATTTTG TTTGAAAAATATAAAGTTATTTTCTGAATATCATGAAATTTAGCATATTT TATTATTGTTCCAGGACCTTGAATACATTTAAAGATGTGAAAAATATATG 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