EMLSAT00000011642, EMLSAT00000011642-707489 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000011642
Unique NameEMLSAT00000011642-707489
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s80supercontigLSalAtl2s80:264857..278656 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000011642 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000011642EMLSAG00000011642-694408Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000052077EMLSAE00000052077-761005Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000052078EMLSAE00000052078-761006Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000052079EMLSAE00000052079-761007Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000052080EMLSAE00000052080-761008Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000052081EMLSAE00000052081-761009Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000052082EMLSAE00000052082-761010Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000052083EMLSAE00000052083-761011Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto775555auto775555Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000011642EMLSAP00000011642Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000011642

>EMLSAP00000011642 ID=EMLSAP00000011642|Name=EMLSAP00000011642|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1845bp
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TATTITLIWNEDPCAKGYQVSHSRIVIKHQEQKSGFDDEEEYFGEGSGIE
SSGFEADTYHDSDALSGSGWXNGEYQSTPGFDFKVGRMVFENTITIRTLE
PCNKYFINVKGYYAESKLGNKDSDYGPSSIIEHEVLCPSSMKDYVSTTIK
NVEELLAGNFLEQKTNPTPHDTSSDFFLEDEENVSSTIMPLISSNGLLEE
STTNPEIASTTDIEIASTTLSYDMSTPFVETSTSYLDTTTTGEDTTSTTN
EDITSQSMDSTTEIYDISTTESNTMNYFTDSTHGFMSTTQSLSTTMDDLM
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TTDELMSTTQSLSTTTDELMSTADDFMSTTESSTVTTDFFTSTTDTPSTT
HMPTMSTDFTSTTIDXSTTTTLDYQTTTTYVPTTILPLIPIQNVIYNISE
SNDKDFPLTLSIHWAQAKTVTSDLRLNKQMISSHDTTHNSETDYNTIHTN
TEXDHCKEYSLDIVDNETGEIYWEDKAITPFNQNRPLDFKKFSMNESNGQ
VEWENKEHFINCLTGFAIIFNDKSRTEVPLNVTSISLIEKQPELSLCDHV
DLKFIPMNHEQTYDNAEYSAKFQYIPKVKTEIYSITNHNMFIKFGNDIGX
EPVKLSWTNLKSQDVLSSEVSMPQFEIKDLDSCTEYKILITSEKNSNVLF
DQTIKSLVGEHAPMEDHEVNVLINNESIVISWMDQCQLEYVFETCLTPLD
CSLMSNYKALTTNTTELTLNKLEPCRTYMYNIKTEGLLLYNGSFSTEPTS
DIQVDSSFFDFQLSKDEISIKWTGIWPCIKEYRVQLLEDGDTNEKPIFSK
DILSSSNMSFYLEISKDLTLINCNSYTFQISTILFDPSSLVLFSKSFKYS
NGFFPPIQGLDYSRLGPDFLFEWKKPEYCGLKYYIAEILDQDLNVIYKSL
NATESLHLNTSNMMPCSEFQLKLSYIGDGESDTESESSSLKFHTLHSEKI
PINVKEDFNQIEFSIGPINGSGHCVDYYVLTLCRFDSGSCQEKTIRAESV
IQSPSKIVIDGLSSKTSYLYQVTGFNQEGMKXFYDSDHQIDTKSFIKTAN
LRLLLAKENKIILELKSSLFKDHMDPEYSFIANCIEEKSDESFRQSIKSK
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QNVTPTGASIKWSPPSITNGKIGEYLLTIRIICDSTELFGHCLNECFNLI
EDKEYSSNTNSIVLKDLLPHREYSVKISARTTTRNEFSIWSKVYVFRTAP
GNPFVPEIVSVKGVSSSKIIVDFDYPCLTSGITRFDVFVTKSITLKKKYH
RTLKKRIEVGRKRFIVEGLEGGHNYDVQISARVENCYSKQCLKKSKKEEV
FLECAYRCDDGTCINKKWDVRCDFIQDCIDGSDERNCSCNPPKHFQCTNG
YCLESWKRCDGKADCNDMSDEAGCPGCLANQFQCRKSGKCIELSRTCDRK
LDCPDGSDEHDCPYWKKSCWSDEFRCLDATCINSRFVCDGIWDCSGGEDE
RSCDKSSCSSSSEFTCKPRNLHFPHKESICIPLHKYCDGEKDCVDGSDES
FGCECHRIGKFACSSGDECTERLRVCDGTINCKDGSDEHDCRRYDNSSFI
PXTXASTTTTTTISSISSSLSNIRPLYDDYEFYDDLESANQIKETQDKVS
GLNLRIYPEYQSMSIGSDVVIQCRDESDHRFEVFWTRPQKLPMPKNYQDN
GKGRLEIYKLRREEAGVYECKSVNSLVPKGTLGVARAYVHMEYHP
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mRNA from alignment at LSalAtl2s80:264857..278656-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000011642-707489 ID=EMLSAT00000011642-707489|Name=EMLSAT00000011642|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13800bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s80:264857..278656- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTTTCTATATTTCCTACTCTCCTGCGTCATTCTACTCGTGGGGATTCC TGTTGAGGCCTACGAAGAGAATTACGAGTGTTTCGATCCTCCAACTCTAA ATGGAGATAAAAACTCTTTCCTACATTTTGATATTTTAGACGAAGAGAAT GTTCAAGTGTCATGGAGAGAACTCTGGAAGGAGACAGACTGGAGTCTTTG TTTCGATGAAGTTCAAATTGTCGCAAATTTGGATCGAGAAGATGAAATGG CAGTCCTCATTATGGATCCATATGTAAGGAATAATCTTTCTTTTCTATTT ACACTCTAACGATTATACAACATACTTAATTTTGTTGTCTCATTTTGGTA CTTTTCATGGAAGGCGTGGGAATGCAAATAGACCCTGAATTATTTTTCCA TAAAAAATCACAAATAAAATGAATCAATACTTTGACATACATTATGGGGG AATGATTTCTTAGGAAAATATAACTGAATTATATGTAATATAGTATGTAA TGATAAACTAACTTGTAATGTAGTTAGCTATGCATACTTTTTTATATATA AATATGGGATTTAAGAAACAAAAAGTTGCAAAGCATGTCATTTATCGACC TTTTTACAAAGATAATAACCCATCGGCCATACGGCTCAAATGACTCCTAC ATAGAATTATAATGTAGGACTCAAAAAATTGAATATTGTTTTAATCAAAT GGAGTGTCAGAATAAAAATCTTGTCTCAAAGTACATTTATTTATGCATTA ATGATGTTATGACTCGAAAATAATTTCATTTTTAGTAGGATTTCACAAAA ATGATTTTTTTTTTGTGAAATGAGGAGTTGAAAGCTGCTTAAAAAATTCA AATAAGCTTGATGAGGAAAGAAGAGTCTTAGTACTCCTATAATTATCAAA AAAAGTGTAGGGTTGATCTTATCAATTGGTACACATTTGATTATTTTCAA TTTTTCAAAGAGGTTTTGTGAGGACACTTATTGAACAACATCATCTGAAA ATAATGTTTGGCAAAACTTTTATTCAATATCTGAGCCATCAGCTCTAATA ATTGCCTCAATACGAGGCTTAAATCCCTTGGAGACCTCGAATATGTCGTT AGACTAGAGCTTGGTCAACAACTCCTTCTTGATGGAAACCTCTAGAGACT GGACACTCCTGTGAGGAGTAGCACACAGCCTTTCTCTCCTCCAGACACCC CTAGATAGAGTAATGTAAGGACTTTTCTCAGGGCCAAGTTAGTACCTTCT TATCCTGAAGATAAGCATCTGCATTGAGCCACTCTTTCCTCTCCTCAAAA AAGGAAGGACAGAATTCGCCTGTTTCACGATAAACAGTGGTTCGGCTGCA CCCGGGKGGGAGGGGGGGGGGGGCATAGGGKACATTCTATGCTAGACAAT CTTCAAAAATTCACTCCTTTGTTGCACCATTTTACTTGTTCTCGTTTATT TTGTTTTTAATTGAGTCGAAACTTTAAATAGGAATCTTGAGTCACAAAAC CTCTCTTTCACCGAGTTTGAAGACAATCGACGAGTAAATTTCGAAGTTAT TATAATTTAATTTAAGTGTACCAATGGATGAGATCAACTCTATTTGTGAA GCATAAAAACTTATTAGCACTATTTGCTGACTCACTATTATTATAGAAAA AGATGCAAATATACCAATTTATTGGAAATAGAGGGAGGGAGAAAAACAAA GTGATAGTCTCAAATTTCAAAACTATCCCTTAAAAAATTATTTTATCATA AGATAGGAGTTACATTTACTAATTTCTTGCTTTCAACTACTTTCAGATTC AGAAATCCTTGAACGTATCTGTTGTCCCATGTATTGAAAATACATATGTT TTAAAGGCCATTCATGAACCCACGGGAGAGGCTGKGATCTCTTTGGGTAA 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TTCAGTACTTAAAATAATTTGCTTTTTCTTCAAGTTGGCCATTGCATCAC CGGAATTGGGAGACGTAGTACCTGTAGAAAAAAAATTTCGAACAGGAGGA ACGAAGAATAAAGTCCTAGGCATTCAGGTCACAAATTCCACAGCAACAAC CATCACATTAATTTGGAATGAGGACCCTTGTGCAAAAGGATATCAAGTCT CACATTCAAGAATAGTGATCAAACATCAGGGTGAGTCGCACTTAAGTTGA CAAATAGTTCATTCATTATATTATAATATGAAAGATTAAATCATAATTAC ATTACATTATAATTATCACACAAGAATTTAACAATATCCGGATTGAATCA TCGATCTAGACCCTCAGGTTTTCCAAAACACATGTCAAGTATTTTTATGT AATAATCTCGTTCCTCATTGCATTCTTCCCTCTTAGCCATGCTTTTAACG TTTTTGGAGAGGGTAGACATCAGCTCAGGATTTTCTGTAATGTCACTTAG AACTGAGGAGTCCTCGGAATGTTTCAAAAGAGTATGTAGAGCCATGGCCA CTTGCTCATTCGAGGTGTCTTGGACAATAAGTGCAGCAAGTTGTATATGC GTACCCATGGAAGAAAATAAACGAGCAAATTTGGATGGATTTTCTTGAAT GAGTGCAGACATAAGAAAGGAGGCTTTGATTTTAAGTTTGGAAACATGAT CCATGAGAGCACGAATGAGGATAGAGGGTCCATCCAGGGATATCCATTGA TCTTGCGATTCAGGGCATTGTCGTATGATACAGGAGATGGCATAGAGTAC TTTGACGCGCACGGAATCTGAGCTATCCGAGGAATCCAGGAGTTCTAGGA GGAGATGAAGGAATCCATCCTCCGCCATGTGGGTTTGACAGTAAGGATTG TTTTGCGTGAGTTCTGCAATGAGATGGGCCGATTGGGATTTGAGAGAGTC 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ATATAGTAAAATAATTTCAATTTCTTGCCTCTGGGTTAAACTCAGTGACG GGTAAGTTAACTTATCTTTTTAACTGGTTAATTACTAGTTTATATTTTAT AAATAGTTGAGTAAAAGTTAATTTTGAGTTTAATTTTTTTTAACTAGTTA AGTTTAAGTTAATTAATTTTTGAGTAATCTAAGTTAAATTAACTTACTTA ACCTTGGGTATGTTAATGATAATTTCCATATTAAAAAATAACTATATAAT TTAAAGTAATTGAGAGATTTATCAAGGTTGCATAATAAAGATTATTCTGT CGGTCTGTCTGGGATTTTTTCTACTTCCAATTGAACGATCAAGAAAAAAA TACAGATTCAAACTTCCATCAACAGGCGAAAAAGCAATGTGAGCGAAGCT TGCTTCGTATGATAACTACAAGAGGAGACTAATGTTTTCTACAATAATTT TGTAAAAAAACAAACAACTATTTTACTAATTATTTAAACTGATGAATTTG CCCTTCAAAAATAAAATGGCAACTTTAGATTGTATTTGTACATAATTATG TAGTAAATTTAATTTCAAGAATATAAAAAAACTGTATCCTCCATTGATCT TTGAATAATGATGGATGTAATTAATTCATAACGATAATTATGTATTCGTA GGTTAGCTGCTGAATAGAAAGGGATGGAAAACTTCTTCCCTACTGTATCG AATGCCTATGTTCTTAATTCATAAACTTAAAAGGTGCAAAATAATTTAAT TTTAAGTCATTACATTTAATTGCATGTATTCATGCTTGGATTTGAATGGT TTTGGAATAAGAATAAGTCTTATTTAAAAAAAAAAATATTCCTCCAATAA TTTTTTATTGAATATATAACTAATTCCTTGGGAGGAACAAGGTTCTTATG TTTTGTCCCGAAATGGAACTAATTGGAAACATCAGTCATACTGTATTGAT 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ATGAATCCATTGTCATTTCTTGGATGGACCAATGTCAACTAGAGTATGTG TTCGAAACATGTCTTACTCCATTGGATTGCTCATTGATGAGTAATTATAA AGCATTGACAACGAATACAACTGAATTGACCTTGAACAAATTAGAACCAT GTCGAACGTATATGTATAATATAAAAACTGAGGGATTGCTTTTATATAAT GGTTCGTTTAGTACAGAGCCCACTTCTGACATTCAAGTTGATTCTAGTTT CTTTGATTTTCAACTATCCAAAGATGAAATTAGTATCAAATGGACAGGAA TTTGGCCTTGTATTAAGGAGTATAGGGTTCAATTATTGGAAGATGGGGAT ACCAATGAGAAACCCATTTTCTCCAAAGATATTTTAAGTTCATCCAATAT GTCATTTTATTTGGAAATTTCTAAAGATTTGACATTAATCAACTGTAATT CCTACACTTTTCAGATATCTACTATACTTTTCGATCCTTCTTCCTTAGTT TTGTTTTCTAAATCCTTTAAATACTCTAATGGATTCTTTCCTCCCATTCA AGGACTGGACTACTCTAGGCTAGGACCAGACTTCCTCTTCGAATGGAAAA AGCCTGAATATTGTGGACTTAAATATTACATTGCAGAGATTTTGGACCAG GATTTAAATGTGATCTATAAGTCATTGAATGCGACAGAGTCTCTACATTT AAATACATCCAACATGATGCCATGTTCTGAGTTTCAATTAAAGTTAAGCT ATATTGGAGATGGAGAGAGTGACACTGAGTCAGAGTCTTCTTCTCTGAAA TTTCATACCCTACATTCCGAAAAGATTCCTATTAATGTTAAAGAGGATTT CAATCAAATTGAATTTTCTATTGGTCCTATCAATGGGTCGGGGCATTGTG TGGATTATTATGTTTTAACGTTATGCCGTTTTGATTCAGGTTCTTGCCAA 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