EMLSAT00000011807, EMLSAT00000011807-707654 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000011807
Unique NameEMLSAT00000011807-707654
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s824supercontigLSalAtl2s824:325989..344019 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000011807 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000011807EMLSAG00000011807-694573Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000052843EMLSAE00000052843-761771Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000052844EMLSAE00000052844-761772Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000052845EMLSAE00000052845-761773Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000052846EMLSAE00000052846-761774Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000052847EMLSAE00000052847-761775Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000052848EMLSAE00000052848-761776Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000052849EMLSAE00000052849-761777Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000052850EMLSAE00000052850-761778Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000052851EMLSAE00000052851-761779Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto776550auto776550Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000011807EMLSAP00000011807Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000011807

>EMLSAP00000011807 ID=EMLSAP00000011807|Name=EMLSAP00000011807|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=687bp
MTGIKLPLNTTYNRTISLHNPGPEPIQVLEMISSGSNDLSLVSPDGEIER
PENSWTIPPFTTKVLMLAKFFARKEKNYTAYIRIRTNATFYPGKFLYVPF
EALVVENVGIFAPDPLLDFGTFVLGIKEEPVSKDCNVYSTSFKKAMQIHL
RFEENLRPKYIAPHLPLASPYLTSVATFSFTPFKEGLFEGFIEISTLDKL
IKVIWKYRALVLNGSLSYDKNSTSFYVRDESNQFLQRKFSLKNNFKVPVK
ITGLKKLYKSSHPSLQSFHPVVLSPYEKKDILVITYNMSKDIDKEDLIQE
STIHILTDVYNLNVTFNIYDGKIQKYLPDSPSQEYLDFGSLGMAVTRDSA
FILTNRNPVNVSILKMNSNCSGCSLECSEELWKKILAGESITFCLRIVTS
ENEGSVQAQIFIKTEYESLTIPLKYRVVRGSLTTVPEDLEFDPVFPGEKA
ELKLTVYSSFAQEMITSDVNTIPKDNSFTFQHGVLRGRNVIMSVEKSYIG
KVIFDPAQECRMTQSCYVGFEMGSKLGQFWLSAFNTTTRMEIMEITEIIV
KILRQRYIFSLNSQKTSTDFYYDDFISRNLPSLVNNVTLSLNTNQIRGFL
FRAKTKMIWPFVVQEEKINFSYTQIGNSSVGYCNLKNPSSVYPLFVHLVT
VPREESPFQILALESEEPIQGLPXLDSKKFKVFYSST
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mRNA from alignment at LSalAtl2s824:325989..344019+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000011807-707654 ID=EMLSAT00000011807-707654|Name=EMLSAT00000011807|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18031bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s824:325989..344019+ (Lepeophtheirus salmonis)
AGCAGCAGATACAATATATTTCATGGAAAATCTTCTCTCTCTGTGTGTAT GTATATGTATATAAAAAGATTAATCGATCCGTGATTATTATATTATACAG TGCTCCTAATGCCAAAGATTTCAATGACTTAAATTATATATATATTTGTA TATACTATATATATATATATATATTAATGAATTTACTTCAAAATGTGTTA CTTTCATCTAAAGTCAGCGTCATGCTCCATCAACATTCGACATTTCCTTC TCATTCTCTCATTTCTCGGAACACTTTGCACCCGAGTCGGGATCACGGTT TCACAAGATCACGGTAAAGACAATTAACATTAACGGTGTTTATTATTCCA AGGGATGTGTTGTTTTTTTAAAATGATTAATGGAGGATCACTCATTCTTG TTGGTTCTTTGTTGCTTGTAATATGTTAAAAGCCCAGTCTTTGTTGTTGA TGTTGGTTCAATGGTTTTTGATAATGATCCATGCGTAATTGAATAATTAC CCCTTAATTTGTGATATTGTACATACATTATTAGACAATTATTCAAAGTA CTTTGAACCTATAAAAGTTGAAACCCCTCCTCGCTTTCAAAGAAATGGGA TCTGGTAAATAATGAAAGGGAAATTAAACTCATTTCTTCAAAAAAACTAA ATAATAATACTAAGTAAAAACCACACAAAGCATAATATTATATATAATAT ATTAAACCATCAGTCATTTGATGACTAACACACGTTCAGAGGACTCCTTC GCAGCTCTCGTTATCTAGTAAATAACATCAAAGATCCTCAAATCCAAATA AATATAGCGTGGAGTAAAATTCCTCTTATTTTTTAACTTCAAATAGAAAA ACACCTGGAAACTTGGGGGATGTGTAGACCGTATTATTGTAATTCATACT ACAACATACTTAAAAAGATATGTTCTTGTAAAGTTCAGAAAGGTTGTGTA GGTATGGAGTTAATGTGATTCACTATTTTCAGTCACTCATACCATTTAAA TTCTTTAGTTTATTGAGGGTGAAGGAGAGGAAGTTATGTTTCTATAAATA GAAAATCCAGTACATAGGTACTGCATAAGTTAAAGTAAAAATTGAGACAT TCTTGAAGAKGAARAAGTAGGGGGGGGGGGGGGAGAAACAAAAAACAAAA GTCTTTAAACCTTTTATTATTTTTTTTTTTTGTATATATACACATTATAT ATATTTATANGGGGGAAACAAAAAACAAAAGTCTTTAAACCTTTTATTAT TTTTTTTTTTGTATATATACACATTATATATATTTATAAAACTTGTTTTT ATCCCTTACTCCTGAATAATGCATAAGATATGTACATATATATGTAAATA TGTGTATATGAAAAACATTCATTTTCTCCCTAAAGAAGTGTCCTGACAGA TTTGTAAATTGATGGTCGAATGATATGATGAAAAATGTAAAGAAATTAAT CGATAATATGTATGYATGTACCTATTACATGTATAGTGAAGGTCGATGTG TGCTTTTATTTCCTTTTGGTATTGTTGTTATTGCTTAGTAGCTGTACATA AACCTATTTATTTATTTATTTTCCACCCGTAGCTCAAAAGTTTGAGATAT CATATATTTGTTCTTCTTTATAGCTGCTCATTTAATCATTCATTATGCGT ATTATTCAAAAAATACATAATTAATTATAAATAGTGATGCGACGATTCAT TGGAATCGGATAATTGGGTGTTTTTGTCGAATCGGAATAAGGATGGGCAT CAGCAAAATATTGTTTAATTTGCGATTCAAATTCTTATTTATTACGAGTA CTTAAATATTTATTACTTTTCTAAGCTATGAAAAAAAATACCCAGACAAA ATTAAGGAATTTTTGCTTTTTATTAAAAAGTTTAATTTAATTTTTCCAAT TTTTTCCTCAAAAATTTAATTGTACGTGAATAACTGTATTTTTGAAATTG TTCTCCAAAATTTTAATATTTCAATTTTTTTTTCACAACTTAAAAATTTA GTTTTTTTAATTTTTTTCCATTTTTGTAAATAGCTGTAGATTTTTGAGAT TTTTTGTGAACAACTGGATTTTAGAAATGTTTTTCATAAAAATTAATTTT TTCGCATATAGTTGTGGATTTAAAAAAAAAAATCAAATATCAAATTGTAT ATTTCATTTTTTTTTCCTAAAATTTAATATTTGGAATGTAATTTTTTAAA TTTTTTTCCAAATAATTTAATTTTTCAATTTGTATTCAAAAAACTATATA ATCCTATGGACGGCCCTGATAGCAAAATGGTATTTTTTAACTATTATTTA AAATATGAAAGAATCGGAATAGGTAATTTTGACTTGTATCTTATGGAAAT CGGCATCTAGATTTTTTTTTAAATCGTCACATTCCTAAATATAACACGTA TAACCATGAGGAAAAGCCATGGTGTATACATTTGCTTCCTTCAATGAACA AAAATATAAAGTGAAAACCACTTTTGTTGGTGTGTTGTTTTTGTGCCAAA AGAAGACAAAATGATTTCTTTCGTATTTTGTCTGTTCATTTTTAAAAAAT GACTCGCATAACATTATTATTATGACTATACTTTTAGCATAATAGAGCTC TAATGTGTACAAATGAATAGTGGAGTAATTAAAGGGTACATAATATCTCA TTTTGCGATGGCAGTGATTCCCAACCTTTTCATCTCTGCAGTTACGTGGG TCATTTGAGAAGTCCGTGCAAAGTCCGGGAGATAGCACTACTGACACGTA TCAAGGTTATGTTTAGTTAGCAACATCTATTGGAAGAACTTACACAAACT TTCAGCCAGATCGGTCTATTTCCTTCTGTTATGCATTCGTTTGAATCGAG GAAGTGGAGTGATTGTGTTGATTAAACATTACTTTATGAAAGGCAAAATG CCTCAGCAGACTCAAAAGACAGTTGTTAAACATTATATGACTCTGCATCT TCAATTGGAACAGCTTATAAGTGGTTTCAAAATTTTCAGATTGGCCATAT TGGTACAAGTGACACTGATGGTTCTGAACGCCCTATTGAGCTTACTACTC CAGAAATTATTGATAAAACCCATGATATGGTGATGGAGAGAAGAGTGAAG GTGTGTGAGATTGCTAGTGCTGTGGGCATCTTGAGTTGGAACCTTATTTC CTTTCATTTTGCGACCACAACTGCTGAGGTGTGAGCTGGTGTATTGTCGT GATGGAGAAGGACTTTTTTGTGGGCCAATCGTGGGAATATTTCTTGCAAC TCGGGTTTTAAACCATCCAATAACCATGAATAATATGCACATGTAATAGT TTTACCCTTTTCTAGATAGTCGATGAGGAGTATTCCTTGCAAATTCAAAC GAATGCTAAACAGAATGAAATCGACGGATCTGACTGAAAGTTGGCGTGTA TTCTTCCAAAAGATGCTACTAACTAAACATAACCTCAATACGCCCCAGAG GTGCCATCTCTTTGACTTTGCACGGACTTTTCAAACAACTCTCGTATATA TATTTTATATCTTGCGGCATATTAAATATGATACACTTATTATATTTCTA TATTGTTCCTGTTTTTGGTCAGTTGGACTTGAACTGATTAAGTATAAATA AATATTATAGTATTACAATGAATTCATCTGACTTAGTAACTGTCTTTAGA GTCCTATAATACTACATATACTAAGTGTATATTTCCTTATCTAGAAGCAC CGACTCATTAAGCCCAAAATAATTAGTTCTCTTTAGAGAAATTGATCGAT TGATGTTTAATTTATTACACATGTAATTGTTCACTGAGCCTTTGAAAATG 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ACAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTTCTAGCTTACGTAMAAGTCGAGAA AATGACATTTGAGCGTGATGGACGRGTTTCCATTCCTGCMCTCCAAGCAA TTGGTCGTCTCTAGGACCACCATCTACGCCGTCAGCAATTCTGAAACATT GAATAGGAAGAATGGCTCTGTCAAAAAGGCCAAACCGTATCCGGAGGAGT TAAAGAAAACACCCCAGGCAAATCCACTCAAGTCCATGAGAACCCATGCA AGAGATCTTGAAGTTTCACACCATACTGTCCAGAGAAAAAAAAGTTAGTG AAAAGAGCCTCGTGACTTTTGACAGCAGCAATGAAAAAAAACCATCTCCC TCCTTGCAAAACTCTTTTGAACTCTTTAAAAAAAAAGCACTTTTGGTCCC CTAAAGTCCTGATGTCAACTCCTTCTGCCTTTTTGGTGCATGTCGAGGGG AAGGCCTTCAGGGTCAGTCACCCAAATACCGATGCCTTCAAAGCCAGCAC TGGGACGCCATGACAGAAAACTATATCGTAGCGAGTACCAGTCCTTCCGC CTGGAAGCCATCATTGCCGCTAAGGACTACTACATTAATGATTAAGAAAG CTCAGACACACATGTACTTATAGTATTACTTTATATTGTTGGAATTCTAT TGTTAATTAATAAAGTGTTCAGATTTTAATGGACTACTCGATATGTATCC AAAAATGAGAAGTAAACAGCTCACAAACATGTTACTGAATAATTCCTCTA AAATATGTACATTCTGGAATAAGAATTATCATAATTTTTTGTTTAATTAG GCAAACCTAAGGATCTCTCTTTTCTTATTAATGTTTGCCTACAAAGGTCA CTGAACTCATTTTGAAGTATATTCTTTAATTATTACAAGATTTGAATATA TTCATTATTATTTTATACGTGTGATGAACGTCTCATATTTCTAATATAAA 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GTCATGACGTTTCATTAAATTTACTAGCATAAGTCTATAAGTCTCACTTG GTATGAAGCAAGGACATAGGAGGAGCGTCCGCAGTATAATTTTTTTTTTA AATTCAAATATAAAATTGTTTGCTCTACTGAATAAATTGCCCGAATGAAA AAAAAATTACTTCTATTTTGGCTTAAATTTTTTTCATCCTGAAGAAAAGA AAATCTAGTAAAAAGCAAATATTCCTTAATTTGGGGGGCTATAGCCCCTC CAAGCCTCCCCCTGCGACTGCATAGACAAAAGTTATTTCAATGTCGATCC TCAATTATACTCTAAGTCCAACAAGGACTTACACTTATAACTCATTATCG TTCCTCTCCGTCATTCATACACTCATGGTTACACTTTCTACTTATCATTC TGTCATTTTTGAGAAGAGAGTTACCATAAACTAAAAAATGCTTAGGATTG ACATCCCTATTCAGAAATATAAGTTAAACGTGCTCAATCCATACTTAATT AATTTTAATTAAAGTACTAAGTATTATAGAGCTAAAATAACTCTTTTTAT TTTCTATTCCTTTACAGGCTTTTCCCAAAGATTCGCCTGAGAGCTGGTAA GTCAAATAATTATTGTATTAATGATGAAACAAATTGATATAATATTATAT TCTTGTGTCCTACAACATATATTCAAATATTGATGTTTGTAGTGTAGCTA TTCCCAACTCTGTCGTTGTCATTGTGGGTGTGAATGTAATTTATGATTAC TATTATTGTCTTGGAAATTTGCCAGCTCAAATGCAGACATTTCCTCGAGA AAGACCTCAGAGTATACATGTTATGTAGTTTGAATAATATTATTAGTGTA ACCTTTAATCATACTAGAGTATTCGTTTTAATTGGTGGTGGCTCATTTCA TGAATTTTTCTATATATTTTTTGAAAAAAAATATCGTTTAGTCGTCTTTC 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