EMLSAT00000011886, EMLSAT00000011886-707733 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000011886
Unique NameEMLSAT00000011886-707733
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s837supercontigLSalAtl2s837:147874..169845 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000011886 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000011886EMLSAG00000011886-694652Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000053168EMLSAE00000053168-762096Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053169EMLSAE00000053169-762097Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053170EMLSAE00000053170-762098Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053171EMLSAE00000053171-762099Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053172EMLSAE00000053172-762100Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000053173EMLSAE00000053173-762101Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto773271auto773271Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000011886EMLSAP00000011886Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000011886

>EMLSAP00000011886 ID=EMLSAP00000011886|Name=EMLSAP00000011886|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1392bp
MFRRTKEFCQDRLNDMLLRSSDGXGEESKDYRNSELRQYWMPDAYSLECY
DCNLRFNTFRRKHHCRVCGQIFCSSCSSEYIDGKSLGFNGKLRVCKFCYD
FFHRFLKGLEPGASPRLLEKQPSRESTPSSSLNQSAFYSVGSPFIEEDYH
NQYLDTIQFSLKDPAQLGRLWAQIIDSESGVILCTVEGGFSGQDLIKWLT
SRGESMGPEQAVAIGQALLEANYMTDDFGNREFQNSGTLYRSTQDSFFNV
EDNLNANSNVSETDCPEWLQNIPVSMPEEENDFNERKISSTNSNVSNDIS
VSGKLLSASVLDNITLSNVQNKDLHGGSFLSTYPHEGDNAHPCSLDLIYS
KHIRSTLKYLMAXERLNPEWYNCILYFATKAVSFVKLEHFVRNDNIDIRK
YISIKKIPYGDKEKDSRIFPGVMFQNRPYCGKNIIDNARILLVRESISFN
RVKYASLDNYISQEEEYLKNICSKIKSFKPDVIIVEKTVTYQAKIILSSE
GIAIVQNVKLDLLEKISRHFSTPILSSIDSIPNQPELGSCESYKVQSFVI
NKDYISPDYVILESQSKQELGCTIILRGASKNTLNKVKRLIKQIALFINN
KLYEKSFLENEFVRYDSTLNSHNFPANHLTMSPFIYFLKNDDVKELDVWE
YDEDEVLVEVESNTKGSVVKNSNLNLIQAPEEKWEDLLANFRAGVSDRPL
IDANVGPKIYDFGSKYIKSIAPSYYSNPKPLPVLFSSYSPRSKVFPSYCI
SPCTVDINYYGVNDLPLGFFLETFCFAETSFCPSKGCNASVKDHIRRFCL
DDGVINLRGYLVVSFKYFKVKPLLTALPPNKIEIHPYFPSINSMTVDVRE
LATNGTLLFSKIHEKLNDLETKEMTNNLCDKYKELNNKYEDNYKEFRNTI
DKIKSLIEKLENPEVDEKDKEKHSLSVCRHITGMKQSLSYKLNCWKGKLS
NFLEEKKKEDKSIDRTRSLSGNNSSSDHMDDISNKLVGDDGTGYSSTPSR
LWQNFSSNNSDVLLPNLFPSHIHYSLHSPNYIVIDEKQPSSIVAHVLSTG
DYLEERNKKLSKSFSNGGSMHYVWELSEKYYAQFYCNSYFAWEFEKLRNE
VLMNPKAYAQSLAECEPWKSSGGKSGLHFYKTKDDRFILKEMSNVEFNCF
QEFAPQYFEYIHNSLNPKEKKPSALAKILGIYKIASKNSHTKETHKMDFL
VIENVFYGRNIVEKYDLKGSVRNRLVDTTTPAEGGNLVLMDENLLKISCD
RPIFIRKSCQEKLLHAIDRDTTFLQNAMIMDYSLLVGIDSDRQELVIGII
DYIRNFSWDKKLENLIKKSGLLGGKPGTTPTIIPPKIYKKRFIEAMLNFL
SIQTKYLISCMPTSSHEGDMCTNTHTHLLKIGHRLSFSSSNI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s837:147874..169845-

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000011886-707733 ID=EMLSAT00000011886-707733|Name=EMLSAT00000011886|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=21972bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s837:147874..169845- (Lepeophtheirus salmonis)
GAATGTTTCGCCGTACGAAGGAGTTTTGTCAAGATAGGCTCAATGATATG TTACTCCGATCCAGTGATGGAGMGGGGGAGGAAAGCAAAGACTACCGGAA CTCGGAACTTCGACAGTATTGGATGCCAGATGCCTATTCCTTGGAATGCT ACGACTGTAATTTAAGATTCAACACCTTCAGAAGGAAACATCATTGCCGT GTCTGTGGGCAAATCTTTTGCTCATCATGCAGCTCAGAGTATATTGACGG CAAGAGTCTAGGATTCAATGGTAAACGCCCCTTCACAATAATTGTTTTTT ATATGATTTGAGGCTGGMCATATTTGAAAGGGCCTATTTTAGGAGATACT TGATACCTTACTTAATTTAATATCCCTTTTATTTAATAAGTCTATGTGTA CAACATCTTGGATGTTTCTACATTTCGGGCTAATGTTTCTATGCAAACGA ATAATGTATATTGTAGTGAAATTGAGGCCTCTATTCTCAGTCATAATACC TATAAATAATCACCATACACTCCTTAAATAATTAAATGTTTTTCTATAAT TTTTATTCGATATTTATATTGTCTTTTTGATTTTGAGAAGTTACATTTAT TGGACTTATAAAATAATAAACAATGGCTAATTATTCAAAGAGGTTGTATC TGTGTCCCTTTTTAGAATTCAATAAATTTTTGTCATTATAAAATATATAT TGTAATTTACGAAAGGGGTTTTCTTATAGATATGATTCATTATTGCTCAC TAAAAGCCTTTTTCTTAAAGTTAGAATATTCTGTTAATTTACAATAAATG AAAATTATTTATAGCTTCAAACAGGGGCGTTGCTATTTTTTAGGGTCATT ATATATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNGCTACAGTATCCCCCCCCCCCC TRKCRTTTTTTMRTTTTMGCTAGCGACTCCAAATATWTTTTTGATGATAA TTTCATGCCGTATGTTAAATTAATATGGATTCTTATAAATAAAATATGCA AATATCACCAGATTTTTTAAATTTTTACCTAACTATCTAACTTATGTATA TTTTCCAGGAAAACTTAGAGTCTGCAAGTTCTGTTACGATTTTTTCCATC GATTTCTAAAAGGTTTAGAACCTGGTGCTAGTCCAAGACTTTTGGAGAAA CAACCATCGCGTGAGAGTACTCCTTCGTCATCTTTAAACCAATCTGCCTT TTATTCAGTCGGATCCCCATTCATTGAAGAAGACTATCATAACCAATATT TGGACACCATTCAATTTTCGTTGAAAGATCCCGCACAGTTAGGACGCTTA TGGGCGCAAATCATTGATTCAGAATCCGGAGTAATATTATGTACTGTAGA AGGAGGATTTTCTGGTCAAGACCTTATTAAATGGTTGACTAGTCGGGGAG AAAGCATGGGACCAGAACAAGCTGTAGCGATCGGACAGGCATTATTGGAG GCTAATTATATGACGGATGACTTTGGAAACAGGGAATTTCAAAATTCTGG AACCCTCTATCGATCTACTCAAGATTCTTTTTTCAATGTGGAGGACAATT TAAATGCAAACTCGAATGTTTCTGAAACAGACTGTCCTGAATGGCTTCAA AACATCCCTGTATCTATGCCAGAGGAGGAAAATGACTTTAATGAAAGGAA AATATCTTCCACTAATTCCAATGTTTCGAATGACATTAGTGTCAGTGGTA AATTACTTTCTGCAAGCGTTTTAGATAACATCACTCTTTCTAATGTACAA AATAAAGATTTGCATGGTGGTTCATTTCTTTCTACATATCCTCATGAAGG AGATAACGCTCATCCCTGTTCCTTAGACCTAATTTATTCCAAACACATAC GCTCGACTCTCAAGTATTTAATGGCGGYAGAAAGACTCAATCCCGAATGG TATAATTGTATTTTGTACTTTGCTACAAAAGCAGTTAGTTTTGTGAAATT GGAACATTTCGTAAGAAATGATAACATTGATATACGAAAGTATATAAGTA TTAAGAAAATTCCTTACGGCGATAAAGAAAAGGACAGTAGAATATTTCCA GGAGTTATGTTTCAGAATAGACCTTACTGTGGGAAAAATATTATTGACAA TGCTAGAATTTTACTCGTACGAGAGTCAATTTCGTTTAATCGAGTTAAAT ACGCATCTTTAGATAACTATATTTCTCAAGAAGAAGAGTATCTCAAGAAC ATATGCTCCAAAATAAAATCATTTAAGCCAGACGTGATAATTGTTGAGAA AACTGTTACTTATCAAGCCAAAATAATTTTGTCAAGTGAAGGAATTGCCA TTGTCCAAAACGTTAAGCTGGATTTACTCGAAAAAATATCTCGCCACTTT AGTACTCCTATTTTATCTTCCATAGACTCTATTCCAAATCAACCAGAGTT GGGAAGCTGTGAATCTTATAAGGTTCAGTCATTTGTTATAAATAAGGATT ATATTTCTCCTGATTATGTCATTCTAGAAAGCCAATCCAAGCAAGAATTA GGATGTACTATTATTCTGAGAGGTGCTTCGAAAAATACTCTTAATAAAGT TAAGAGATTGATAAAACAAATTGCTCTCTTTATCAACAATAAATTGTATG AAAAGTCCTTTCTTGAGAACGAATTTGTGAGATATGATTCTACTTTGAAT TCCCATAACTTCCCTGCAAACCATCTGACAATGTCACCCTTCATTTACTT TTTGAAGAACGATGACGTGAAAGAATTGGATGTCTGGGAATATGATGAGG ATGAAGTATTAGTGGAAGTAGAGTCGAATACAAAGGGATCAGTTGTAAAA AATTCCAACTTGAACTTAATACAAGCTCCTGAGGAGAAATGGGAAGATTT GCTCGCTAATTTTCGTGCGGGAGTGAGCGATCGACCCTTAATTGATGCAA ATGTTGGACCTAAAATATACGATTTTGGTTCCAAATATATTAAGTCTATA GCTCCTTCATACTATTCTAATCCCAAGCCACTTCCTGTTCTTTTTTCTTC CTATTCTCCAAGGTCTAAAGTATTCCCGTCTTATTGCATTTCTCCTTGCA CTGTTGATATTAATTACTATGGAGTGAATGATTTACCCTTGGGATTTTTT CTTGAGACCTTTTGCTTTGCTGAAACCTCATTTTGTCCTAGCAAGGGTTG TAACGCTTCGGTAAAAGATCATATTCGACGCTTTTGTTTGGATGATGGAG TTATCAACCTGTATATTCAATCGTTGGAAAATCCAATACATCAAAATGCT GAAGTTGAKCCTACCAATAAATATCCTCCCATTGTAACATGGAAGTATTG TGTTGAGTGTGAAAAACTTGGTCCTGTTGTAGAACTGACTGAGTGTAGTT GGAATTATTCTCTAGGCATGTTTCTTACCCTCTTAATTTATGAAGACAAA TTGGTTGGGGGAGGTTCAAAGCATGTTTGCTCTCACTCTTTGCATCAACA ACATTATACTTGTTTTAGTCGTGGATATCTTGTTGTTTCCTTCAAATACT TCAAAGTAAAACCATTATTAACAGCTTTGCCTCCAAATAAAATCGAAATT CATCCATATTTTCCATCCATTAACTCAATGACTGTTGATGTGAGAGAATT GGCAACAAATGGTACACTTCTTTTTAGTAAAATTCATGAGAAATTAAACG ATCTCGAAACGAAGGAGATGACCAACAACTTGTGTGATAAATATAAAGAA TTAAACAATAAATATGAGGATAATTATAAGGAATTCCGAAATACTATTGA TAAAATAAAATCCTTGATAGAAAAACTTGAGAATCCTGAAGTTGATGAGA AAGATAAAGAAAAACATAGCTTGAGCGTGTGTCGCCATATCACTGGAATG AAACAAAGTCTGTCCTACAAGTTGAATTGCTGGAAAGGGAAATTGTCAAA TTTTCTTGAAGAAAAAAAGAAGGAAGACAAGAGTATTGATAGGACAAGGA GTTTGTCGGGAAACAATTCATCAAGTGATCATATGGATGATATCAGCAAT AAACTAGTTGGAGATGATGGAACAGGATATAGCTCTACTCCTAGTCGCCT TTGGCAAAACTTCAGTTCAAATAATTCTGACGTACTTCTTCCCAATTTGT TTCCTTCTCACATTCATTACAGCTTACATTCTCCAAACTATATTGTTATA GATGAAAAACAACCTTCTTCCATTGTTGCTCATGTTTTATCTACGGGTAA GTAGATTCTATTGTACAGTATACATAGTTGCTAGTACATATTGTTATGTA CTGCATAACATATAGATTGTTGCTTTAACCCTTAATCCTTTTTGTTGCAC AAATGCAGCTTACACAAAAAACGCATATGGTACATCTGAATTTTGACCCC TATTAATGTCAGCTTCCTATTTAATGATTTCTGAGGGAGAAAATGAATTA CTGCTATAATGAGGAGAACCTTCTACATTTTAAATTAGCCTTACTACAGG GATATATTGTAATTATATTTCAATTCATTTATATTTATTGTATTATGTAT CAATCAATCAAAAACACGAAAGATAGACGATAGTTATTGTCTTAGAGGAA TATGTTGACACGCCACGACTAATTAAATACCACTATCCAACAAAATCACA ATTTTTTTATGCACAAGAACAGCATATGCTCAACTTAGTACAATTAGATC CCATGATTACAAATATGGTATTATATTTGTTTCTCATAGCCTCGTGGCCT TCAGAAGAAGGCCATACATTTTTTTGTTATTTTTGAGGTTCAAAGTTGTT CTAAGCCTTCAGTGTTGAAGATAGGGATAAATTATGTTAATATATTTTAA AGCCGAATGTTAAAAAATTTTAAAACCTATTTTCCATAAATATTTGTATG GCCCAACTACAAGAGATAGAAACAAAGAGAGAGAAAAAGAAATGATGTAG AAACAAAGAGAGAGAAAAAGAAGAGATATATTATAACATTGGTTATAACA ATAAGCATGTCTGAAACTGTATAATTAAATTATTTCAAGCTTCATGGACA CAAGAGAACTCGTTGCATATCCGTAGTGAGTAAGGGATTCCAAAAAACGG AACATTCAAGGAAGTCTTCGGAGCAAATCCTTTTTCTTTTTCTCTCTCTT TGTTACCATCTCTTTTCTTCTTCTCTGTCTTTGTTTCTATCTCTTCTTGC TGGGACATACGAATACTTATGGACTTTTATTATGAAATCAATTAAAAAAT TAGTATTTTCCTTTAAATATTATCGTGGCCTTATCTTAAATTGACAACAA TATAAAGCATTTTTGGAGAGGCTATTTAAAAAAAAATAAACTTAATATTT TCGGCTATCAAATGCAATACTTTTAAGCTTTTTGAATTGATTCGTCTTGA AGCTACGGCCTTCTTAACAAAAATTATCTATTTTCCACTTTACACAAAGA TAGCACGTGTTAAAAGTATAATGTAGATATTTTAAAAATGGTTTTATAAT TTTTTAACATTCAGCTGTAAAATATATTACCATAATTTATCCTATCTTCA ACACCGAAGGCTTAAAACAGCTTTGAAATTTAAAAATAGCAAGAAAAAAA AATTGGCCTTTTTCTGAAGGCCAGGAGGCTATGAGAGAAAAAATAAGGCC ATATTTGGAATCAAGGGATCAAATTCTATTAAATAAAGCATATACTGTTT TTGTATCATTTTTGCTGTTGGACAGTCTAATTAGTGTTAAATCGATCTAA 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AAGAGAATGAGCATTGATTACACCATGGAACACCATTTTTGCCTGCAACA ACATTTACTATTGTTATTTAGAACACGAATATGACCATTAAAACTTTCAA CATTGATAGGGTTGGCCTTTAAAGCCGTTTTGTAAAAATCAAGTTTTTAG GGTATGACTACGGTTCAGTGCCATATTTCGACATGAAATAACTATATAGA TAAAAATCAAAGAATAACAAATTGATACAAACATTTCAGTATTTGAAAAA GGAATTATTCATTTCTTTATCATGATTACAATTAATAAAAAAATGGATAT AATTACCAAAAAATAAAGTAAAATGAAAGACCTTACTTAGAAGGTAATAT CTTTTTTACTTTTTCTTCAAGTACTTTATATCCTAGGTGAAGCTATAAAA TGTGGCCCACAAAACTTTTTCTTTTTGATATTACTATAAAAAAAAGACAG ATGGAAATTTTTAATATTAATATTTAATATTAATAATGAAACACCATTTT ATTCACATGKCCGCCGTAGCTGGCCTTACAGTAGCCCATTCTGTCGACCC AATTTTTCAATACATTTTCGATTGTGTGAGCTTCAATAGCTGCAATGGCG ACTCCAATTTCGTGTTTAAAATAGTCAATCGTCTCTGGATGGTTGGTGTA ACATTTATCCTTGACGGTTTTCCACAAAAAATTGTCCAACGGAGTCAAAT TGCAGCTACGAGGTGGCCAGTTGACGTTGCCGTTTTGGCTTATGATGCGT TTGTCGAAGACAATGCGCAAAAGATCCACTGTAACGTTGGCTGTGTGGCA CGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGGTAGTTCAAAATCAAACTGCT ATTTCAATTTAAAAAAAACAATTTTTTTAAAAAAGGTCGATATTGATTGA 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TACTAATACCGATATTGCCTAAGATCCTGGAAATTAAAAAAAACAACAAC TTGGAATCCCGCTCACCTAGTAGCTAGTCATTTCTTACAAAATATGGAAT TATTATTAAGTACATTTTAGAAAATGGTCACAGCTTAGCAAGAGCTAAAA TCTATAGGGATAAAATAAATAGGAAAATCGACAGCTGACCATAAAATACT GTGTAAATAGTGAGGTAATGTCATGTAAGTTGCTAAATTAATACTAATAA TAAAAAATGAATGGTTGAATTAAAATTATAGAAATCTTTTAATAATTTTA ATAAATTTGGAAGATTTAAGTATACCACATAAAATATGTGTACAAAGATT GTTGAAAATGATTACTCTGGATTCTTCTGAGATTTTGTCTAAATATGACT GTATATTGGCCTTGAAGTTGTCATTGTCCTTCCTTTCGACCATTATTTAC TTTTAAAAATCTAGGAAATTCAGATCTGATGAAGAAAGAGACTAATTGTC TTTGTCTCAGTTTTTATACAAATATTCCACTATGAAAGGTTGCACTGAGG AGCTGCTCATCCTATTACAAGCAAACCTCTTGGTTAGGTAAAGAATTGCA GACTCATGATGTTATACTTGCCTTTTGAAACTTCCAAATGGCATCTCGTT TGATCTTCACACCATCTGGTATCCGGTGATTGAGAAGGATCATCACTTTT TTTTGTAATCTTTCAACTCCATACCACTCCTCTCATCCATTTGAAGGAAA AAAATAATTTAAAAAAAAAAAAACTTTGTTTACATTGTAACAACGAATCT AACACCATTTTTTTAATTGTATTTGACTATCAGCTGTCGATATTCTTTTC TACTACTCAGTGTTATGAACATTGATTAATTGAATTGGAATCATCTCTTC GTAAGCTTTGAGGACTTCTCAATAATGATTAAATTATTAAACCATAGTTT GGATAATTGACTTACTACCAACGATTTTTGGCCTTTTTTGAAGTTTCTTT TTCTATGAAAGGTTGCATGATACACTAAAGGTAAAGACTTGTGAAGTGTC AATAAAATGTTTGAAAAATCCTATTAGATATTGTTAATTCACCAGAAAAA ATTATTTGTTCACTCATNNNNNNNGTGAGGCAATTTATTTGATCTAAAGG TTTAAATTTGAGACGGTAAAAGTCGTGTAAAAATGGTCAATTTTGACCTA AAAATGACCTTTTTGATATTTGTTAATACTTTTTACTGATAACTTGATCG TCATTTGGTGTGGATGACTCAAAATATTTTAATATGTATTTCTATAAATG ACATCAGTACCAACATCCTCCATTAATTTAATGATGGTTCCTCGCGAAGA GATATGTTTACCCGTGTATTTCTCCATAAATTTTTTGAACGTAGATGATT AGCAATGGATAAGGTTATATTACATGCAATAAGCATCTTTGTGAGATAAG AGTTAAAGTCTGACTTGATGTATTCATCATTAACTTGATTTTTTAGATGA ATATCCATGCTCTTGATATGAGATGAGGATAATGAGTGGCGTGTAATCTA GACGGGGGACTAAAGGCACATTTATATCGAAAATCCGACAAACCATCTGT TTCTCATCCGGTAAGTATTTTCCAAATTCCTGGGTCTCCATTTTCAGAAA TCCAGACAGAAGGCGATGTTATTTTAGGGATTTTATTCAGTTCTCTATCG ACTATCACCATCTAATATTATATTGATATTGAATAATAAAAGTGGGAATG ATAACGTTCTTGATTGATAGAAGAAGATGTATATTATTTAATCAATGATG CCAAAAGTATTTCTTCTCCTCGCACGCTTTTTTATTCTTACCAAAATTAT CATTCTTAATTATATCATATTTATTATGAATTTAAAAAATGGAGTGCGTT 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