EMLSAT00000012176, EMLSAT00000012176-708023 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012176
Unique NameEMLSAT00000012176-708023
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s87supercontigLSalAtl2s87:2579..10248 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012176 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012176EMLSAG00000012176-694942Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000054583EMLSAE00000054583-763511Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054584EMLSAE00000054584-763512Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054585EMLSAE00000054585-763513Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054586EMLSAE00000054586-763514Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000054587EMLSAE00000054587-763515Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto768281auto768281Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012176EMLSAP00000012176Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012176

>EMLSAP00000012176 ID=EMLSAP00000012176|Name=EMLSAP00000012176|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=232bp
MRGIPNNVQEVIHEVNQSKSLNQFGQFFILSGGSLLLFTSLGYFGAAKES
RVLLICYGFLMIVLMSFEVVIISVYAGYTKEFVDVIKQFLRYTLTNFYTG
AERSSDAITMGFNYIMAEMKCCGIDNYTDFKKARIFQKKKEHYYQVLPSA
CCIINPERYPPYFVPEDLNCLAAPTSYNSYFLKGCWDRFTHWINNALNPL
IICMIVLFILELSMLLMVSLLYKAVDRDIKRL
back to top

mRNA from alignment at LSalAtl2s87:2579..10248+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012176-708023 ID=EMLSAT00000012176-708023|Name=EMLSAT00000012176|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7670bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s87:2579..10248+ (Lepeophtheirus salmonis)
GTGTCTTTTACAAGAAAAAAAAAACTTATGCGAGGGGTAAATTATTGTTT TTTTTTCTGGTTTATATGTATGTATGTAGGTGTACCTGTTCATTTTTTTT CTTTTTAAATAAAGTTTGTTTGTTTGTTTTTCTTGCTAAGATTTCTTACC AAATTTTTTAATGAAATGAAAAAATACATACATTACTAGAGCCTCTATCT ATGTCGAAATAGTTAGTAAGAGTATTTATAAAGTAACTCAATTTGTTTCC TAGTTTTTTTTTCTAATTATTGTTTTAGAGAAACTTTTCATTTTCTTAAT AATTACTACTTTTAATAAAAGTTAAATTAAAACATGAAGTAGGCTTACAA TTTAAGAGGAAGGGAAAAAATCTAAGTATGTACAATTTACATAATCTATA TGAAATTAAAGCAAGGTTTGTCTCTCTATCTGTATGTATATAGTGAACCG GTCCACTGTATATAGTGCTCCCTGGTATATATCATATAAATATTTTTTTA AGATTTGAATTAAATATCAGCGCTGCTATGTTTAAATGAATTTTGTTTGT TTTTATTATTCAGCACTCATAAGGCTAAAGTACTCATACATCATCCTAAC ATATTATTTTTTTTCCCAAACTCTTATAATTATTCTTTCATTCTTGAGGA GAGAACACATTATATGATTTGATAATGGTATTATTGTATTGAGTAGTTAC GTGTGAGTGTGCTCATGAAAACTAGATAGAGTAACACCGAGGATTTCTTG GGGAGTTATTTTCGAAATAAATAACGAAAATGTTATTTTTTAGCCCACGC TTAATTATTCCAGACAACGCTAATACTACTGCTAATATTTCATAAGTAAC AATGCTCAAATAAAGAAGACTGGAAGGGTTCTGGTACTATGAATGCATAA ATTTACATTAAAAAAAAGATATTTGAATACATACTTTTGTTTTACACCTC TTTCTAAATCCCAATTTCTAACCTTAAATTTCAATTCAATACACAAAATA TTTACAAAGTCATTGAGGAATGTGTATGGTCCCCAGTTATTGTAGCCAGG TATGAGGTCAGCAAGTTCTGGATCTCACTTATTTTTTTCCGAGATTTTTT GCACAGCAAAAATGGCAAACTGAAAAAAACATCAAAATTTAAAACAACCT TATGTAACGAGCTTTGTAACTTGCAGTTAACATCGAAAAGGGTGGATTAT AGCCTATAAGCTATTCTACTTGTGTATATGAAGAGCATCACAAAGAAAGA TATTTTTGGCTCCTTCTATTACTATAATGTATGATAATAAAGGGAATAGA GGATAATGGAAACAAAAAATGAAGGTAGAAGGAGAAGAGAAGAGGGGGAG AAAGAGAGATATATAGAAAAAGAGAAGGGAAAGGATGTCTTTTTACGATC AAAAACAGCCTCTTAATGAGATCGGAGGCCCAAATACAAATCATAGGAAA ATACTCTGCTATTTTATACGTCAACTCGCTAAATTTCAGACTGATTTGTT CGACTGTTTATTATTCCATGTGTAATAATACAAAAAAAAAACAGACTTAT ATATATGTATACATATTAGATATATGAATAGACCACTATAAAAACAGAAG TACAGTCACACACACCCCTCCCCTCCAACTAAAATATTGTGTGTGTGTTG TTTTTTTAATCAAGATGCATTTCCTGCCAGATTTGCCAAATAGACCCTGC ACTTCTTTTTCTAACTAGGCCGGACTTTTTTTTAGGGGTAGGGGGAACCA AAATATTGTTTTTCTATATAATCTTCATATGTTCAGAATGATGCTGGCCA AAAATATGCTGCTCAACTAATAAAAACACACCAAATGGTTCAAACTAGAT AGTTATACCCACACTCTAAAATTCTACATATATGTAGATGATAATACTTA ATGAACATAATAATAGTATTAGAAAAAATTAATTACGTATTTCCCGCCTT TTTTTAACTAAGTATATCTTGTTCATTATTGGTCACATTGGATCATACGA TAAGACATTGTAAATGTGTGAGTGTATAATACAAACACTTTGTTGACAGT ATTGCACTTGGAGGGTTCCGACTTGAATTATCATGCATCGAAATTTCAGA GGTATCAAAAGGAAGCAATTCGTCATATTTTACATTTTTACTACTTGAAA GCAACCAAAAAAAAAATTGCGATCTACTCGAGGCCGATATTCTTTTGATT CGTGTTGCACAGGCGTTGTTCGAGCGATTTCGTTCTGGTATAATGAGTTT GAATAATGCGTCACGCAATGGTAGGCCTGTTGTCTAAAATGTCCAAAAAA TCATAGAAACTATCGAGATAGACCGTTATGTTAGCATTGCCCAGGAGCCT AACATCGATCATAAAACTGTTTTGAACTATTTGCAAAAAGCTGGATACAA AAAGAAACTCGAAGAGGAGAGGAATTGTATTTCATCGAAACAACACCAGG CCGCGCACATCTTTGACAACTACAAAAATTCTTTATTATAATATTATTTT TATTTATGTTAATCACTAATACTAAATTAATTATATTGGTCTAAGTTCCA CATATTTCCTTTTATTTTCTGACAATAAGGACATAATTTAATGACATAGA GTTTTGTCTTGCTTGGATAAATTAGCTTATCATTTTCTATTCTCAATTTT GATTTATTTTTAGATCCCAAACAATGTACAAGAAGTGATACATGAAGTGA ATCAATCAAAATCCCTAAATCAATTTGGTCAATTCTTTATATTAAGCGGT GGGAGTCTTCTCCTTTTTACAAGCTTAGGTTATTTCGGAGCTGCCAAAGA GTCCAGAGTTCTACTTATTTGTGTAAGCGATTTATTGTATTAGAGCTGAA TACAATTTTTCTTATTTTGGTAATTTCCTTTCAGTATGGATTCTTAATGA TCGTACTCATGTCGTTTGAAGTTGTGATCATAAGCGTATATGCAGGCTAT ACAAAAGAGTTTGTTGATGTGATCAAGCAATTTCTTCGATACACACTCAC CAACTTTTATACAGGTGCAGAACGATCATCAGATGCAATTACTATGGGTT TCAATTATATAATGGCTGAGGTTAGTAGCAATTCCTTGAATATGTGGTTG ATCTATTTCAATGCTAATTATTTTAAACTATGGCTAYACGAAATGTACTA ACAACCTATGAAGTTGAACAGATTTTATGTTTTTGCCTCTGTTTTTTTGT AGTCATCGAGATTACGCCAAAAGTTACAGATCGATTTTAATCAAACTTGG TACAAAGATTATATATGATCACAGTAACAAGCCATGAAATTTTTAGAGTT CAAGATAAAATGTCAAGGTAACACAAAAAGTAAAAATTGCAACTTTGGAA CTAATTAAGATACAAAACTCAATTAGATTTTAAGCGGAGGTTTACGCTCT ACTGAGTGCCAATTCCAGTTATTAATGTTTCATCTGACTAAAGAAAATAT TTTATTTACTTGACAAACAAGACGAATTGATTCATTCGCTAATATTAGTM AACTAAGAGGGCACTCGATAGAGCCCAAACCTCCGCCTATGCTCACTTTT CCTCAATGAAATATCATTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACA TGTTGAATTTAATGAAATTTAATATCTATAGCATTCATATTTTAATATGT GTTATATATGCATATATATACTTAGTGCAAAAATGTGCATTAGTTCTCAA CAATATGAATTTGATTCCAAACTTACTTATAATCATAACAATTTGCTCTA GATATGATGTCAACATTCCTTTATTGTAGAAATGATGCCAGCATGCTGAG TTAGGCCTATTTCTTTGTACCAGAGATGATTTCAACTCTGTATCTCAATT TTTTACATTTTGTGGGACTTTGAGTTTTAATCTTACCCTTGGATTTTTTT GCTATATGAAGCCTCCTTATTAAACATACATAATGACACCAATTTAAGCT CTATATGTTCCAAAATTATTGCCGATTATGTATTTTTAACGTTTTGTGCT ACCTCTACATTGACCTCTCAAGATTTACAACAGACAAAAAAACAGAGCCA AAAACAAAACCTCCCATCAACTTTGTTGGTGGAGGTAATTATAATTTAAC TAACTTTTCATCAATTTAATAAGCGTTTCTAATTTAGATTTACCGTATTT TTCTCTCTCTCTTTTAGATGAAGTGTTGTGGCATTGACAACTACACAGAT TTTAAAAAGGCAAGGATATTTCAAAAGAAAAAGGAGCATTACTATCAAGT CCTGCCATCTGCTTGTTGTATTATTAATCCTGAAAGATACCCTCCTTACT TTGTACCAGAGGATTTAAACTGTTTAGCCGCCCCAACATCTTATAATTCA TATTTTTTAAAGGTAATGCATGTCGAAATAGATATTTTTGCTGCTAATGC TTGATAAAAAATTATATCAAATGTAATCAAGGGCCTATGCAGGATTTTAT TTTGGGGTGGTCTTAATATATTTGCAAGAAAGTTAAACATTTTATACCAG ACCTCCAGCCCAACCCCTGTAAACACCCCTGCTAATGATAATTAAAATAA TTCGATCCTTCTTTCCTTAATATTACCGAATGTCATAAATATTCAAATTT CATTACAATAAATTATTATTTTTTCGTGTTAAACAAATGTAATGAAAAAA GTCCAATNATCACGTTTGAAAGATGCAAATTAATGTTATTTCAGGACTTA AGAACCTAGTTTACTTAGTTAAAATAATCATAATTATTTTCAAGTAAACC CTAATTCTAAAGTAATTTTAGCAATAGAAACTTTTAAGCAAGACATGTGC TTTTTTTTAAATGGGTTTAGATAACATACATAAATACAGATAAGCTGCAG TTTACCAAATTTGACAGGTACAATCTTTCAAAGTGTGACATATTTTTGAT ATCACATTTCAGATATCTGATGAAATTATAATTTAAATTTAAAAATCGGT CCTGTAAATTGAGTATTACTGGCTGMTTTGAAATTCTACACAGCGCAAAA ATGTACCATTATTTTTCTTTTTAGTTGAACATTAAGATATTTTTAGTGAT TAGCTATCTTTTTCTGAGGGGATGTCCGTTTTTTTTTTAAATTTCTGAGG AGTGAACTTCCTTTCCTCCTACATACAATATATCGCCGGATTGAACATTT GCATGTGCACAAAAAAGACGGAGAGTAACCCTATGGATTTATTGCGGTTA TAATTGTAACTCCTTGTTTGACTCTGAGTAGAATTGAAGATAGACATCGG AGTAATTCTTGGAAATATCCTTGTTTATTCCCATCTCCTCCTCCTCCCCC CTCATCACAGCTGCTTAGTTTATTTTTAAATGTGGCTTCATACCCATTAA AGGGTTGTAAAAAACAATAAATGAGGCTTAGAGTTATATGAAATTACTAA TAATAGCATAAATGTGATAATAATTGCCTTTAAAAAAAAACTTTGGTTTG TTCATTTTCAATAACTTCATAAATTGCATCAAATTGAATGAGACTCCTTT TCGGGGCCTCAAAGTTGATGTTTTTAATACATAAAATTACAAATTACAAT AGTAATTACAAATTTCCAATAAATCTTCATTAAACTTCATCAAATGGCTT TAAGAATAAAAAAAATATATAACATATGCATTGAATACTACTTGATCCAG GGGTAGGCAACCTTTGAGACATGGAGTGCCAACTTAAATATTTCTAATCA ATGAGTGTGCCACTATCAATAATAATGGTAAAAAAACACAAACTACGGTA ATATGTTCTAAATTGCGCGTKCCAGTCAATKCSCCTRTTCGTGRCASCAG CCTATGGCACGCGTGCCATAGGTTGCTGACCCTTGCAATAGAGGGATACA ATTTTGATAGACAGTTAGGTTCGAGTCCTCTTGTTCTTTGGTCCCATTTT GATACCCAATGATTATTATTTCCCTTCATTTTAATGAAAAGGGGATTTTC ATTGTTGTAAAACTTGGTTGTTTAGTTCCCCAAAATGGTCGACATCAACA ATGCTGACTTCAAGTGAAAACGCTCTATTATATAAAAAATTTCAAAATAA ATAAATAAAAATATAATCTCAAACTACTTCATCCGTAAAGAAAAACCATA GTCACGGCCCTCTTAGAATTTAGAGTCCCTCTCTTTGGATATAGATCTAG TTATGGGATTGCGTTATATATAACTAATCGATTGGATATAAATGTAATTG AATTTAGATCTCTATAACTATTTTACTTATGATATTGTAAGGACATAAAA ACACAATTTAGAAAAATCAGAGCATACCAATCTGAAGAACTTGATAGTAC CTAATGTTATATATAATATTTGTAATTAAGAAATAGTGGACTCTTGGCCA ACCTGCTCTTAGGTCATGTTCTGAATGTAGGATGATACAAGGAATAAGTC TACCGTCGATCGTCGTATACTTTTTAACCTACATGAAAATCTAAACTGTA CCAAAAAGGATGTGATTGAACCATGCTCAATTAAATCTAAATCATTAAGA ATATTGTTTGACATATCACTTTTGCTACATAGCACCAACAGAGGTGGATA GAATAACTGTCGTTATTGCTATAATAGGGATTGTAAGTAGTGTCGTGTCA GTTTTTATGTATTTGGTCTGGTTCTATCATTCCTTGGTACCGCCCCTTAA GTAAAGCGTATGTTATAAAATGTATATATCAGGGAAGTTACGTAACTCAA GATGAGTAAATACAAGATTTTGTTGTGAAATTTTTTTTGATGATGATAAA GCAATGGGGGGGGGGGMGTATAGATATATTTCAGGTTATATATACATATG CCTTCATATATATAGTCTCTTTTGACTTCTCAGAGGGGGGAGATAATTAG TTTCAGGTTTTAATACAGAACACGGGGCCAGAGGTTTGCTTTAATTTTTA TAGGGGAGTATCCTTCTATTATTTTAATGGAATTTACTTTTTATTATAAA AACACTTAGGGAAATATTTCAATAAAATTGTGTACCTACTGCCTAAAGTC ATCGTATCCATGCAGTTTTAGAATATTATATATTGGATAKTCAATCCAAG AAATATTTATACGCATATAATAATATATTTAAATTTGGATATTACGTTTC TTAGAAGTCTTAATTCCATTCTTATTTTCATTTCCAGGGTTGTTGGGATC GCTTCACTCACTGGATTAACAACGCTCTCAATCCATTAATAATATGCATG ATTGTATTATTTATCTTAGAGCTAAGTATGCTGCTAATGGTAAGCCTTCT TTACAAGGCTGTTGATCGAGATATTAAACGATTATGACACGGAGAAACAA CGGTGATTGTTCAAGATCATCGTTCCAAAAAGACAACTCCAGAAATTGAC AACCTTCTTAATGAAAAGAAGTCTAAGGAAATAGAATCGAATCGTGAGGC TTCAAGAAAGTTAAAGGAAAAGAAACGATCTTCGTCAGCAAAGCTAATAG AGGACCATTATGAACTTGTGGATGCTCCACTCATTGATTTTAGAAGAGAG ATTGATGGAGAGAATCCCACATTTTTGCCATAGAATTGAGCATAGAGAAC AAACCAAGTAAAATGGCAATTTTGGTGCTTTGGTCAGACTCGTGATAGGT TGGTGCTTGGATTTTCATGAGCCATTTGTCCAAAAGCGATAAAGTTACAA TTTGTGTACAGGAGTCAAAC
back to top
Add to Basket