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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s87 | supercontig | LSalAtl2s87:33379..41665 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012177 >EMLSAP00000012177 ID=EMLSAP00000012177|Name=EMLSAP00000012177|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1044bp
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KVETINALQAELETKLIEMEEFQSRILEISSLNTPNKEEKLNLEIDIFSK
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VNFRVNVPSFEVGERIFNNCRNAYFASFKKWKFLSSTLSQDALL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s87:33379..41665+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012177-708024 ID=EMLSAT00000012177-708024|Name=EMLSAT00000012177|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8287bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s87:33379..41665+ (Lepeophtheirus salmonis)
AAAATATGAAGAGCCGTTTGGGAGCCGAAAAAGCCGGTTCTCTAAAAATA
CCGGGATTCACATCAATATGGTGAATTAGTTCTTTTAGTCGATGAGTTGC
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TGCATTGAGTTATAACTAAGTGTTCATCATGGGTCCTATAGAAAGAGTCA
AGGATCTATCAAATAAGTTCAGGGAGGATATAAAAGCAATTGAAGATCGT
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ATTTTTTTTTAACTTGATTTTTATGATTTGATGACTATTGTCTACTTTTA
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ATGACTGAAATTGGTAATAAAATGACTAGATTCAATGTTATTCCCAAATT
GGCTCATTTGATTGTTAACACATTAAGTTTGCACAAGGATTTGATATTAG
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TGATAAAGGTGATTTCATAACAATGATTGATGCCTTTAAATTGTGGTATG
AAGTTCCCATGAAAAGGCGAGGCATGTGGGCCCTTGAAAATATGATCAGT
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GGATCATTTTCAGTATATATACTTATGTCTCTACTGATGAAGTGGTGAAA
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AAGATAATTGCTTAAATTCTTATTTTATTTCTACTTAAAAGGGTGCAGAA
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GTAAATGAGGTTTTTGTGATTCCTAAATGGTTAGCTCGTATGAGAAAAAA
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TGTTTAATTGATATTCTTTAAATTTTCAGCAAGATGCGCTTTTATGATGG
CGTTGATGGTACAATTATTTCCGTATTACATACTTCCAAATCAACTTCTC
ATTTTTCATTCACCGATTTATTGTCCAATGATACATTTTTTCTTCGATTA
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GTAGAGGGGGGGGGGGACTGTTACGTGTATAAAATTAAGGTTCATCTTAG
CTATTGAGGGCTCCTTAACAAATCAAATTGCACAAGGCCTAAACCCCAAT
TGGTTAAGGATCATTGAAAGTTTGATTTAATAAAAAATAAGTTTACTTTT
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TTAATTAACACTCAAATAGTATAATCTCAAATCTGTAACCTTATAGGAGT
GAAAATTGTATTTGAGGGGTTCAGCTCTTCATTTGATTTGAAAGGTCATT
TTAAACAAATACGACAAGTAGAAATAATAAACGGTGTTGTTATTGTAAAA
GAAAAAAAAGCACCCTGTCTTAGCTTCACAATTTTTGGTGAATTAGTGTC
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ATTATCATTAATGATGTAAATCCGGTGATTTTTGTAGCTGGCTCGTAATT
TATAATTGGTAATATAAAGAAGGAAGTTTCTTTTCCTAAGGAGTGATCAT
TATTATTTAATTCCTGCTGAGTAGTTAACATTCTTTCCTAAATAAATTCA
ATTATATTCAAAACCTAATTGAACATGTGCTTATAAAAGACTGGATTTTC
ATAATTAATCATCACTCAATGTATTTTATCCCTATGGATTTCCCGCTCCC
TCCTTGGCCCGATCAACACCGGGTAATCCTTGCTTTTATTCTATATAGGT
ACATACATACAAGCACCAAAGTATAGTATATAAAATCAATAGGTATCCAA
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CCCAAAAAAAAAATTGACAAATTTTTACTTTTCCCTAGAAAAATTTAATA
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GTTTATTTGGACTGATTATTCGGTACCTTTGTAATTTGTTGGGTTATCTT
CCAAGCATGCGTAACTATGGGAGTGTTGCCGTACACAATACCTGTTTAAG
AGTAATTCTAACGAACATAATCTTTTTTTTAAATCAAACCCAGTAGGCTA
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AATAAATTAGGTACTTTAACATTCGATTCAAATAGAG back to top
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