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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s900 | supercontig | LSalAtl2s900:149448..157557 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012344 >EMLSAP00000012344 ID=EMLSAP00000012344|Name=EMLSAP00000012344|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=724bp
MRRKAPPKLSVAMPPPNETSAVTIPRDLDSRTTITIGDETFDIEADDLEG
IGVLGRGAYGVVERMRHRQTGTILAVKRITVTVNRVETKRLLMDLDISMR
TADCPYTVHFYGAMFREGDVWICMEVMDTSVDNFYIKAFRGSETPVAIPE
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TKTKLTCNYVRFRTESIRHIAWRFEYNGVAGKFYDYHVATGAKNPTSYSF
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HEVVTVVDTADWSIKISPEPEHKRRIERNDESLSFKCISKGARPPPALSF
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RVKNSLAERLYGRLNNLSPEKIMLKVEPAKILNMLGTMGYRVVSSTTSLS
NTSNKLIWTLERRKPGNGYVRSDL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s900:149448..157557+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012344-708191 ID=EMLSAT00000012344-708191|Name=EMLSAT00000012344|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=8110bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s900:149448..157557+ (Lepeophtheirus salmonis)
GTCAGCTCCCATCAGGTCTATTTTAAAAGTCTTGAAGGTAATTTATTTAC
ATTGTGGGATTAATTTAATTATTTATTATAATTAGCCAATACTCATTAAT
TGCAATATATTTTTCATAATGGTAACATGTTGTACAGTGTATTGTTTTAA
TAGATAAAGAACATTCCTTTGATTTATGATACCTAATTTGGTCACGATAT
GATTCCTTTCAAAATTAAATTATTCATTTTGAACTTTTTCATTGTGATAA
TTAACTTTTGCAACTTGAAGTGTTATCCACGGCTTCTTCAAAGGATTAAT
CATAATAATTTGTTTATATAAACTGACTGTAATTCGTAGAAGAATTCATA
TGTAATACAGATCAAATATTAAGAATAGGAATTATATCTTGCTTTTATGT
TGACTTACCGCTTATTCTAAGAAATACTTAATTAGGCAACTACATGAAAT
TTTAGACGTCAATTATTTAGTATAATTCGATAATGAAAGTAAGGAAATCA
TAATTGTAGTAAAAACAGCTGTAAATAGTATTCATAGTATTAAAATAATA
ATATCTTATTTTTTTGAGATATGTAAATGGCATCACGTACCTAGTTACTT
TAATTTTTGGTACGCTGCCCAGCTCTGTTAATTAATATTTAATAATTAAA
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TATTAAAATTGGTTTTCTTTTCTTGCTTTTTGTTCAAGATTATTTTTATT
GAAATGGTAGTATTTTATTTTTTTAATTTTCTCACGATGGGAGTCATGTC
AAAAAACATTATAATAAGACAATTGCATAAGGGTAGATATTATGTAGTTT
TGGGGCGGTAATATTTMCTTTATTCATCCTTTTCCTTTGAAAATTAAGTC
CAGAGCCCTTACTATTACTTTTTTTTATTTTTAGTACATAACTTTGACAA
TTTTGACAGAATGTTTTTTAATTAAATTTATATTTTTAGAATGACCTATT
TGCTTAAGCTGAGTCAGGTAAGGCCCGCTAAGTAAGATAATATAAATTAC
CAGTGTTTAAAAAAATTTAAAGACATCAATTAAAAAAAATTAAATATTCA
TTATTTTAATGTGTAATTATACAAAATGAGCAGGCATTTTATATATTTCT
TAATATAATAATAATAATATTATAATATGGTCAAGTGTAAATGAATGTGA
AGTTGTGTGATATATACAACCATAGATAACATTTTACTTATAAAGTAGCG
ATATTTTTAGCTTTTTTCTAATATTATCCGGCCTTAGTTTTATTACTACA
GCTCCTACTCAGTATTCAGTGCTAGTGTATTGCTGTTGTTTTCTCTTTCT
TTTTTCTTTTCAAGTCCCTGCTGCTGATGGGAGTAAAATCAGAAAAGAGA
AAGAAAAAATTGTAAATAAATCCAAGAATTGATAATGAACCCTTAAGGGG
AAAAAGCAAGTCTATCAGAGGTTGGATTCCACTTCAATTTATAGAGATTT
CCTTACACAATCCGTCGAGATGCGAAGGAAAGCTCCTCCCAAGCTGTCTG
TGGCTATGCCACCACCCAATGAGTAAATTATTCTATTATTTCTGATTTCA
TGATTAAAAAAAGTGAATCACGGATCCATTTTATTTTCAGGACTTCTGCC
GTGACGATCCCAAGAGATCTGGACTCTCGTACCACCATTACCATTGGGGA
TGAGACGTTTGATATTGAGGCAGATGATTTGGAAGGGATTGGCGTTCTGG
GGCGAGGGGCGTATGGAGTTGTGGAGAGAATGAGACATCGACAAACTGGG
ACCATTCTCGCTGTTAAAGTAAGTATTTTTAATCTCCAAAATCACTCCAC
TCCTTCCTAGGACAACTTTTTCATTAGAATCTATAATTAATTCCTTATTA
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TGCCCTAAGAACAGTCTTGATTTCCCTTCCCTTAGCGTATAACAGTGACC
GTGAATCGAGTAGAAACAAAGAGATTACTAATGGATTTAGACATATCAAT
GAGAACAGCGGATTGTCCTTATACTGTTCATTTCTACGGTGCAATGTTTC
GTGAAGGGGACGTTTGGATATGCATGGAAGTAATGGATACATCCGTGGAT
AACTTTTATATCAAAGCATTCAGAGGCTCTGAAACCCCTGTAGCAATCCC
TGAGGATGTTTTAGGCAAAATTGCTTCTTCTGTCATTCAAGCTCTTCACT
ACCTTCATTCGCGTCTTTCCGTGATACATCGCGATGTGAAGCCCTCAAAT
ATTCTAATCTCTAGGAACGGTGATGTTAAGATGTGCGATTTTGGTATTTC
TGGTTATTTGCACAACTCTCTGGCAAAAACCATTGACGCAGGCTGTAAGC
CATATATGGCACCGGAAAGGATCGATCCCACGGGTAATTTATCTAACTAT
GATGTAAGATCCGATGTATGGAGCTTTGGAATCTCCATGATTGAAATATC
CACGGGTAAATTCCCTTACCAAACTTGGTCATCTCCTTTTGACCAATTAA
AGCAAGTTGTGCACGATCCTCCACCCACTCTCCCACCTAATATGTTTTCT
TCCAGCTATGAGGATTTCATCAAAAAAACGTGAGATCACGAATAAAATAC
CTTATTCAGTAAAATATATTCCTCTCCACTTTTCAGATTGTACAAAGAGG
TGGAACGTCGTAGTAATTACACTGAACTTATGGATCATCCATTCCTCAAG
GAACACATGAAACTAAATAAGAATATATCCGAATTTGTTTGTGAAGTTTT
AAATAAACCCTAATGACTTTTAATTAATTATTTCCTTACCAGAAAATTTG
GTATTCGTAAGAATCTTTTTGCTTCTGTTTAAGATTTTTTTCTTTTCCTA
GTTAATATTAACTTATGATATATATATATTTACATCATTATGTAATTATT
GATAAACGCGCATAATTCTGAAAGACTCGAAAAGAACTTAATAAATGTGA
GCATAATTCATATCTAATATAAATACTATATTGTCATATGAGTTGTATAT
TTTTTTTTGTTGTTGTGTTTATTAAATCAATTTAATTCGTGTAACATAAT
AATATAAAAATGATTTTAAAATAATATTAATCCATCTCTTGATTTCACAT
ATATATTTATTGAGTAGTAGAGGTTATTTTTTTGAGCTAATGGATTCTTC
AATGCTTATGTTCTTTTTTAGAGAGAAACATGTATTCCCCACCCCCCTTA
GTATTCGCGCACATTCAAATTCCTGAACATAGGGGAAAATCTTAAAGTTA
AAGTTCACTGGTGAATGAAACAAAGAATTACGTATTTACGTATCCACAGA
TGTAGTACATATATTTATATTTTTATAAAACCTTAGTGCATCTTTCTTGG
CTAAATATATTTTCCAATTGAATTTGATTACTGAACGAAGATTAAGCTTT
GTTAGAATGATCCTAATATCCTTGTGTATTTTACTATTACCASCAGCCAA
TATGGCTCTGAGATTCACTCATGATCCTATTCAAATGGATAAAGGAGTCA
TGGAAATTGGAACAAAAACCAAGCTAACATGTAATTATGTTAGATTTCGT
ACTGAGTCTATTCGTCATATTGCTTGGAGGTTTGAATATAACGGAGTCGC
TGGAAAGTTTTATGATTATCATGTCGCCACGGGGGCTAAAAATCCGACTA
GTTATTCATTTATTACCATTCCGGAGGATGGGGAAATCAATGAAAAAGAA
ATAGAAATTATTCTAAATGATTTCCGTGCCCCAGAAATAAAAATCACATG
TGAAGTAGACGGTGAGTAGATTTATATGAATGCGTTTATTTGATTGTAAA
TCTTTTTTTATCGTAACATTGAAATAGCATTGCGAGATAATGGCTATGGT
AAACTTCATCACAGCACCAAGGAGGCTCATGAAGTTGTTACTGTTGTAGA
CACTGCTGATTGGTCCATTAAAATATCCCCGGAACCTGAACACAAAAGAC
GAATTGAGAGAAATGACGAATCTCTTTCATTCAAGTGTATCTCCAAGGGA
GCTCGTCCTCCTCCAGCTTTAAGCTTTTCTATCAAGGGTCAAAACTTGTC
AGAATTCGAAGAGTTGGCCGTTGTTCGTCATAGTTACGAATCTCAGGATG
AGATTGTCGTTGAGGGACAATTAAATAAACTTACACCAGATTTATTTGAA
AATGGAAATCTGCGGCTTGTCATTAAATGCTATGCTAAGTACGGKGATAG
CGTGTTGGGGAAATCAGAGTTGGAAATGATCCGTGCAAACTACATGGATG
AGTCTAATGAACAACCGAGCTATCAGCGCAGAGGTAAAGATGCTGCTTAT
GATGAAGATAAAGTATTAGAAAAAAGATTTCTAGATGTAAGTGACCCTGC
TCGGAGTGTACATCCTACCATGTCTTATGATAGTTTTGATGGATATGCTA
TCTTGATTGCAGATAATTTGATTCCTGATAATGACTATGTAACACCTCAT
GTGACTCTTCTTGGAGAGTTACCTCCAAGAGTAAAGAACTCTTTAGCAGA
AAGGCTCTACGGAAGACTTAACAATTTAAGCCCTGAAAAAATTATGTTAA
AAGTGGAGCCTGCTAAGATACTGAACATGCTTGGTACCATGGGCTATAGA
GTTGTTTCCTCGACAACTTCTCTATCAAACACATCCAATAAGCTCATTTG
GACATTAGAGAGAAGAAAACCTGGAAATGGTTATGTTCGGAGTGATTTGT
AGCACGCTGAATTAAAGTATTCCTAATCATAAATTAAATATTTAATACAT
TATTATGGTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTGTTATACCTCATTWTTGAAAAA
TAAAACAATGATAAAAAATGTACTTAAAATAATTTACTCCTAAAGTAATA
TACATGTATTTCCATAATAAAATAAATTCAACTAAATACATATACTATTC
TTACAAATTATTCTCATGATAAATGCGACATCACATCACAAAATTGGCAT
CTGAGGGTGGAAGGAGATTGATTTTTAATTTGACTTCTTGCTCCAAGTTA
GCTTTCTTCGCTCTTGTGTGCCATACCTGTATTTTTTTATGAGACTTTGG
TTCCAAATGTGAAATATCTGGTATGAGATGCTTTATAAATTCTGACTCTA
ACTGTCCTATTTTCACTCTATAGCTAAATTTAGCTCGTGKTTTTCTTAGC
AGCAATTGCAAATTTACAGCGAMCCCTGCCATATCCGTTGCAAATGCTCG
ATAAGGAGACCAAGCGACATCCCATCCAACAACCTTCCCATTATCTACTC
GTGGTTTTTCCACAAGAAGTCCTCCAACAAGTGCAACCGGCCATACAGAA
ACGGTTTTAGTATCTCTCATTGTAGAAAAAAGTTCAAGAGAGTATGTGTT
GTCATCATCTCCAAAGTAGACAACACCTTTAAGGTCCTCTTGATTATTTT
TAGCAAACAGATTTCTTAGATATTGAATGCCTTCATTTCGTTGTATAACT
CCTCTTGGTTTACTCCAATGAGGATCCATATCTTTTAACTTTGCTTGCTC
AGGTGTTAGAACATACAATTGAGTATAAGATACTCCACAATTATTAAGAA
AATTTGTCACCAATGTGGTGGGTATCTTAGCATCCTCAACAAGAATCCAG
TGTAAATTAGGCACTAATAGAAAGGTGTGACATAGACGTGTTAATTCCGC
AAGCTGTTCAGGTCTTCCATAAGTCGGAGTAATTACGTAAATAGTGGGTA
TATCTGGATCATTTAGATTTACATTAACACCAGCATTGGCTAATTTCTTT
CGTAGATACCCAATATGGGNCTTGAAGTAACAGCATTTCATCTTGATAGA
GTCTTAGTGATTTGAACTTTCCACCTGTAGACCATTCAGTGCTATTGAAG
TGTATGCTTTCCCAAAATATTGAGATGGTGAAAAGTAATAAGGCAATGAC
CAATATCGTCTTCCTATGACGGATTTGAAAGAACCGAAGTCGTGAATAGC
ATTTGAAATAATTTACAAAGTTCAAAAACGTGTTGTTGTTATTCATCTGG
AAAAAAAACATATCCAAAGTTTTAATTTTGTAAAAAAAACTATGGGCGAT
AAATAACTATTTAGCAACTTTATTCAAAAAGCAATAGCTTTGGAACTAAA
TCATAACATATTTTTAACAATATAAGGATATTTGAACTCCCAGTATCATC
AAGCATTACTAGATAAGCTTGATATTTTTAGTAATATCAATATATTCAAT
TTTTTAACAATTTGATAAACATATTATTTAAAAAGAAGAAGACTAGGATA
CTCTGTTCTGTAAGATGAAGGGGTTGCCTAAATCAGGAAGCCAACTAATT
ACTTTTTTAACTGAATGATAGGAACAACAATACAAATAGCCTTTTGAGAC
TTCAAAACGCCTATGCTCCAAAAAATCATTCCAATGAGTATCTTCACATA
GGTCAGGACATACCGTTTCAATCTGTTCAAGGAACGGATTATTAGATCCT
ATAAAAACAATTGCCTCCTCCCTCCTTGGATTAAACAGTATTTTCCAAAT
TAATTTAGGGACCGGAATAAGTTCATCTTCCCCTAAGTAAATTGGAATCT
TTACACCATTTTTATTGGGTAATTTTAATACTCCATATGTTCCAGTATAC
ACGACGAAATCTTCGGATAATAAACTAACATAAAGTCTAATAGACCCCTC
AAGGACCTTCCAATTACCATTATTGATAGATTGCCACATTGGGGCGACAT
TTATATAGTGATACGTAGCATCAGCAAGAGAGTTATGAATCAAATCAAAA
TCTCCATCAGGAGTTAAATGTCCTCTTGCTAAATAAAATGATCTTCGTAT
AGAAAAAAAATCATTTTGAGCTCCAAATATTTTAATAAATTTATCTTTTT
GAGTTCGAAGTTTGTACGATGTTGAGGCTGAGCTCTTAGTGAAAAATTGG
GAGCCCTCTTTAAAATATGAGGGACGAGAGTCATCCTTCTCAAAAGTCCC
AAAAGATGAAAGAGAACCTTGAATGGTATGATTGGAAAACCATGTGGTTT
CATCCGCTATATTATGGCATACAGAAAGTTGAGTAGTAAAATTTGTATCT
GAGGTCCATCCAATATCAATCATTACATTGGAATAGGATATAGGGCCACA
TGGCTGAAGACGTGTCTTTGTACTTTCACGAATTTTTCTTGTACATGTCA
AAGTTTTCCAAGATGTATCGTTAGGCGATAATTCTATCCTTTTTTCCTCT
CCACTTTCAGGATCGATATAATCATGGATAACAAGAGTTGTAGTCGAATT
TTTATTGTTATTATTATCTGCTATTGGGTTACATTTGGTTGAGACCCGAG
TTTCACGTTGTTTATTGAATCGAAGTGCCCCTCCAGGACAACCTGTAAAA
CATGAGATCAGTATAATTATCATCATTAACATTTAGATGCAAACAAAGTA
AAAAAAATACATCCCTATAATGAATTCTTCTCCATTGATAGGAGTTTCCA
TGAGTAATAGCCCATTGTCAGATCTAAATTGAATAGGAGGATATCTGACA
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TTTGTATTTTAAACTTTCTTTATCACAAGAGGATCGAGTCTTTCGGCTCT
CTCCTAAAATAAGGAAATGAAGAATTAAAACCTCTAAAACGAGGAATCGC
GGCCAAAGAACTCGAACAAGTAACATGATTTAATGAAATAGATTTCACTG
ACTGACATCAATTTTGGATTAAGAAAACAAATTGCATCTTCACAACAAGT
AGTATATACTTCAGTGCAAATAATAAGTACGAATTCAAATAAATTAAAGC
AATAGTATCTTTAAGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTGTTCTGTTCAGCCCAC
ACTTCTGTCATTTTTACCCCTCCTCTCGACTCATTTTTTTTATTGCATTG
CATAGCATAGCTAGCAGTGAAACTGTTAAGGAACGGGGCGAGGAAAGCCA
TTAGTTCATTTAATCCCTCAATTATAATGAAATTACCAACCAATTTGAAG
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