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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s92 | supercontig | LSalAtl2s92:532335..540033 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012565 >EMLSAP00000012565 ID=EMLSAP00000012565|Name=EMLSAP00000012565|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=631bp
MLKNTPYIILSTISLLRIKVIRNICCRSRTHPSPGDSSSIINMTQDKTDV
LERSFSIQDSIDVLQKGTILYKVRDKGVRGVKVYQRKCKLDLENLCVLYY
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MDKGELKSLFEEANGTQGKPDASLSESEFVSFYYSLLKKPELEKIYRKYA
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NSDKNVVYFHMSSFGESKTKKFLEDPHSAQKFVKYNAKQISRVYPSGKRQ
DSSNLKVMYPWNAGCQIVALNYQTEDKQNFL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s92:532335..540033+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012565-708412 ID=EMLSAT00000012565-708412|Name=EMLSAT00000012565|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7699bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s92:532335..540033+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATAATAAACATTGAGCAAACCCATTTATTATTACGTCATCACTAATCAGT
AAGAGAGCGCGTGAGTGATATTATTGTTACAAAAATATTCGTAGCGAGAA
ATTATTAAGATATAAAAATTGCTACGAATTTCTGGCTCATACATCATTTC
ATGAATAACTAATTTATTTTTTGATGATATCTAGTTCTAGGAACACAGTT
ATTATATTAAGGAGTGTTCCTGGAGGGGATCATTGAGTGATTCACACTAC
AGAGCTGCTCACTCTCTCTCTCTCTTCCTCTGCTCTGCACTCTAGGATTT
GAGTTGTAGTTGAGCTGCTTACTTGTATAGCTATAAAGAGAATTGTCGAA
TATTTATGATTTCCACCAATAAAATGAATTGTTCTGCCTGCTCATGAATT
TGAGCGTATGTTAAAAAACACACCCTACATAATATTGTCCACAATTTCAC
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CCATCTCCTGGAGATTCGTCATCAATCATCAACATGACACAGGACAAAAC
GGGTAAATGGTTATTCTTGTACTAATAAGTAATAGATATTATTATAAATA
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ATAGAAAAACCTAATTTGCTGTATAGTACTATTGTAGTGGATATTTCAAT
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TTGTACCTATTCTATTAATAATGTCAATCCAATGACTAATTTAAATTCGA
TTTGATTTTTATGAATATTAATATACAATTGTCTTATAGTAGTTACTTGA
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GCATATTATTTCTCTTTTGTAGAGCACACCCTATTACTCTACAACTTTAT
CGTCAATACCTAGTGCATAATTATGTCCCATCAACACAGAAGTAAGCAGA
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GTCGTAAATTGTGCTTAAAGTAGCCAAAATTGATCGTCACAATAAAAGAA
AGAGAAATTGATAGATTTTATTTGAAATGCCATATGGGGACCAATAAAAG
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ATTGAGGGTACATCTTCTTCTTGTTGTGACAGTAAATTCTTTAACACAAT
ATTCAATAACTTTTCTTAATATTCATTCTGTGTTATTGGTTTAGATATTT
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TGAAACTTTATCTATATGAATAGCTTATAATAATGAGTACGTCAAATGAA
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CCGCATATCAATGGATTGCATATCCATCATTATAGCTAAAAACGCAAATA
ATATCTCAAAGTACTTACCAAAAAAATAATTATTCACACTCACTTCTTGC
TTGTGTAGAAATGCACTGTTTTACGTACAAAAAGTTCTTTATTTATATAT
ATACATAATCAATTAAAGAATCCGTATAAATGCTCTTTTAACTGATGTAT
TATTTGCTTTTTCTACAGGTTCTCCTCACTATGACTTAACCAAAGTAACA
GAGATTCGAATTGGACATGGTACTGATACTTTCAACACATTAGTCAAAAT
AGCACGTAGTAAACAGTCAGGTGCAGGTCTTCCAAGAGCATTCAATAAAG
TATTTTAAGTATTGATATCGATGTAACTGAAATTAACGGTCATTTTTAAA
ATTACAGAATTTACCTGCTCATTGTTGTTTCTCTATGATTATGGATGATA
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AAAATAACTCCAATTGTCTGTCATTTAAGGAAGTACGCGATCTCATTGAG
GATCTTAATGTTAAAATGGATAAAGGCGAATTGAAATCCTTATTTGAAGT
GAGTTTATCGGGATGAAACTAATGTGAAAGTTATTATAATTATGAAAAAC
TTATTTTAGGAAGCAAATGGGACGCAAGGGAAGCCAGATGCATCACTCTC
CGAGTCGGAGTTTGTGTCTTTTTACTATAGTCTTCTGAAAAAACCTGAGC
TGGAAAAGATTTACCGAAAATATGCTAAAACCAATTCCAAAATATCTGTT
GATGATCTTACTCGGTTCTTCATGAACGAACAAAACACGGAAATGTTGAA
GATTGAGTGTGAGCAAATTATCGAGGCTTATGAGCCATCCAAAAATAAAA
AGTATATGAGTAATGAAGGCTTTATTCAATTCATGATGTTTTCTGAACTC
CAAAATATCACGGCAACCAACTTTATTTATCAGGATATGACGCAGCCTCT
GTCACACTATTGGATTGCATCCTCGCATAACACGTATTTAACTGGAAATC
AAGTCACTGGCGAAAGTAGTGTGGATGCCTACATTAAAGCTCTGAAAGAA
GGATGCCGATGCGTTGAATGTAAGTGGTAATTTACGTATTTCATGAAGAA
TATTTCCAAAGAGAACATTGCCTGACATCTATTTAACATTTTAAAAAGTT
AGCTCCTGGTTATCAAATTAAAATCTACAACTTTATCATCTTAATACCTG
GCAAGAGTGCTGTAGTTTTCTAGGGAAGTGATTACATCTGTGTCTTATCT
TTGCCCATGCAAAGAATATGTATTATAAAAAAATATTTGCCAATTTCTCC
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ATATTGAATGTATTTCAGTATCAATTTTTCTCGATCCAAAAAAGATAGAT
CATATTCTTACTTTGACACTCAACTATTGAAATTAAAGATTCTCAATTTG
AGAAGTTGGTAAATACAGAAATAAGGAAATGAAATAAAGTTGAAAACGGG
AAAAATGAAATGGGATTTTCTTTGTACTTTGTTTCGGCGTTTTACATTTA
GCCAGCCGTGCATTGAGATGATAAAATTGTAGTTATTTATCTTTTCATAT
ATACACTGAATTTTTTAAATTAATTATTAATTGACGTTGGACAATTTTCC
CTCGTACAGTATTATTAATTATTTTCATAGTCTATGCACAGAGTCAGTTA
TACTTTGCAAAGATGAATATGTGAGGCCTTATCTTTCTTGTTATTAATTT
CATTTTTTCTTGGTTTTTAGGAAATAAATTACCAATATTTTTTAAAGAAA
GTAATTTCGAATCCTAGTATTATTTAGGAAAATGAATTCCCGCAGTTTAT
ATATTTTTTACGATAAAATGTGGGACTTAGTGGCTGTGGGCAAAGACGAA
ATTTGATTTTTCTTTTTGTTTGTTTTTATTGTCGAGGTATTTTGGAAAAA
TTTTAATAATACATTTATGACATTTTATTAGAAATGTCTTCAAATTACGA
TGTTCTTATTTTTTACTATTTAATGTGAGGCCTACGGCAAGTGTCCCCAA
GTCTTTCACCTAAAACGGACAAGATATTAATACGTATTTTTATTCTCATT
TTAAGTGGATTGTTGGGATGGAGATGAAAACGAGCCCATAATTTACCATG
GTTGGACACTGACTTCTAAAATTCTTTTTAAGGACGTCATTAATGATGCT
ATTAAGCCCTACGCATTCGACCGTTCAGATTACCCATTGATATTATCAAT
TGAGAACCATTGTAGTCTGGAAATGCAAGACAAAATGGCGGATTACATGA
CTACAATCCTCGGAGATATGTTGTACACTCTACCACCTGATGAGAAGAAA
GACAATCTTCCAAGTCCAGAAGCTCTTAAGCATAAAATATTGATTAAAGC
AAAGAGATTGCCTCCAGGAAAGACTCAGGATGATGTTGTTGAAGATGACG
AAGATGAAGAAGATGATGAAAGAGATGAGAAAAAGAAGAAATCTACAAAA
AAAATCTCGAAAAAATTGTCAGATTTAGTAAATTATATTCATGCTGTTCA
CTTTCCCGGCTTTCCAAACTCTGATAAAAATGTTGTTTATTTCCACATGA
GTTCGTTTGGAGAATCGAAGACGAAGAAATTTTTGGAGGATCCTCATTCT
GCACAAAAATTTGTTAAATATAATGCTAAGCAAATATCTAGGGTATATCC
CAGTGGGAAAAGACAGGATTCATCTAATCTTAAGGTTATGTACCCATGGA
ATGCAGGTTGCCAGATTGGTACGTTTACAATTACTAAATTGTGTACCTAA
TAAGTAATACCCATGATAATTTTGAATTTATTTCTTTTAGTGGCGTTAAA
CTATCAAACGGAGGACAAGCAGAATTTTTTATAACCGGGCAAAATTTAGA
GATAATGGAGGTTGTGGATAKGTTCTAAAACCCTCTTTTCTCAGACGTCC
AGATCCAGACTATTCTCCCAGTAGTCCATCAAATTTGATTACTAAGCCAT
GGAATATGACGATAAGGATCTTAAGTGGTCAGCACATCCCAAAACCAAAA
GGAAAGATTGAAGGAGAGGTAATTGATCCTTATGTCAAAGTCCGGATTCG
AGGGCATCCAGATGATCATTCTAGTGTAAACAAAGCAAAAACAGAGCCGG
TTTCAAACAATGGTTTTAACCCCGTCTGGAACACAGCTTTTCATTTCTCT
ATTAAAGTACCATCCCTTGCGTTCTTAGAGTTCAAAGTAAAGGACCATTC
GAAGAGTGGACCAGACAAGGATGTCGCATCTTTTATATGTCCAGTCAAGA
ATATTAAAGAAGGTACGGTTAATATTAATATTATTGAACTTATTATTACA
ACATACTACTTTTTATTCTTATAGGATATCGTCAAGTCCACCTTGAGGAT
TATAGTGGAAAAATTCTTAGTCCATCCGCCCTTTTTATACATATAAAAAT
TGACAAGGCGTAAACATCATAGTTGTTATGATCAATTACCCCTCCTTAAG
AGTTTTCTCTTGGTTGCCTAACGCTGTCTATATATTTATAATTATTTTGA
TATACAAGTCTAGAATTATATAATTATTAATTACCTTAATGAAACATTTA
AATAATTATTGGCGTAAATCAGCTTACACATATGTTCTGTTTTAAATAAA
TATTTTATTATATTTTTAACAATAATATTTATTGATATATTATTTTTTTG
TCTTTATTCACATTTATAAATCTAAAAACATAAGTTATTTATTTTGCAAT
ATCGTCCTCAAATAGTTTTCGAATGAAATTGGATTAACCACCTCGAGGAG
CGTCAAAATAAGGAGTGTGGAAAAAGTTAAATACTTTGGGTTCTAGGATA
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TGAATACGCAACTAGACTTAAGTATAACTTCATAAATGAACTTTGACGAA
TAATGATAATGATTGCAAGGACCGCTGTTGGGTATGGATGTACTAGTCTA
TGAATGGAAGAAAAAAATGGCAGMCCTCGACGGAACAGACTTGACAACGC
AATTGTGAAATCTCAAAATACCAACATTTGTTCAACACGAGATGGGGTTG
ACTAACTTGGAACATTCGATCATGATCGTATCTGAACAGTAGTTGAGATT
TACTGATCTATCTTCTTAATTTGTTTATGGTCCAGATAATTGAAAATAAT
TAAGTAATTAATTTACTCTAGTACTACGAAATCTTCCATCTTGATCGAAG
AAACGAAAACTTATCCGGATAATACCTCCTAATTGAAATGCTACTAAAAA
CCGTGTTGATATTTTGTGACTTCCCTAGAGGGAAAATTGATCTTGTTCGA
TTGGTTTATCGATCCAAACKCCACATCCAGCATCTTTCAATGCCAAATTA
AAAACCGATTTAGCTTCTTGATAATCTGAAGCCATTTGCTTCACTTCGCT
ATATCTACATGGAGAACGGAACGGCACTTTCAATATTCTTCCATTCAAAT
CCAAAAACTTTTGGAAAACTAATGGAACAATAATGTTAAGAAAGTTTATT
CAATAATACCAATAATTAAAAAGGAAAAACTTACGCATCTTTTTGCTAAG
TCTTGAAACACTATCATTTATTGTTTTCCCTGTAGAGCCATTCACAATCT
CGGGTTGACCCTGATCCATAACCCAATTAACGCTGTAGTCGTGTGCTTTT
GTGGCCTGACGCGTTTCAGGGGATGTAGTAGCCAACAAATCTGCATTGTT
CATTTGAAATCCTTTAGGCAAATCGCTAATGTGAGGTTCAATTCGATCGT
AGAGTGCTCGCTTCATATGACCTTAAAAAAACAAAAATAAAACTGATATA
TAATTATATAACACATTTAAAGAAAGGAACACTTAGTTTCTAGAAAAAC back to top
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