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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s938 | supercontig | LSalAtl2s938:181461..192425 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012579 >EMLSAP00000012579 ID=EMLSAP00000012579|Name=EMLSAP00000012579|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=281bp
MIKGGSMSGAKSYQELVYNSLGSVGYYILTALQFIFPLVAMVSYNIIFGD
TVTKVIVGIFELPEDSIWNSRELLIFLATIFLTLPISLYRNISRLAKISL
ISLLLIGFITITIYVQMNFYHKHMNINDAFWVFMKPAGIPEAIGIITFGM
MCHHNSFLLYESLDEPSIPKWKSVTHVSIFVSVLCMILLGLGGDLFNNYC
WDDHLINASRTLFCIAIMFTYPIECFVCREVLLTVIFGSTYDVVQNMDSK
KSIMYHIGITVLIVTLTYLISLCNPQGDNIS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s938:181461..192425- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012579-708426 ID=EMLSAT00000012579-708426|Name=EMLSAT00000012579|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10965bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s938:181461..192425- (Lepeophtheirus salmonis)
GATGGATTATTGATTACTCCTTAATATTGATGATCAAAGGGGGATCCATG
TCGGGTGCGAAGTCGTATCAGGTGATTTTTCTAACCATTTCCTTCTAGCT
AAAAACCTCTATTTCAAAACAAAATACTCCTCCTAGGAATTGGTATATAA
CTCGTTAGGATCCGTTGGCTATTATATACTCACGGCCTTACAATTCATAT
TTCCATTAGTAGCTATGGTAAGCTACAATATCATTTTTGGAGATACGGTG
ACAAAAGTTATAGTGGGGATATTTGAATTACCCGAGGACTCCATTTGGAA
TTCCAGGGAGCTTTTGATATTTCTTGCCACAATTTTCTTAACATTACCCA
TATCACTGTATAGGTATGTTTGAATGCTGAATGTGTGTATTTAAAGGTAC
CTCTTTCATATTTTCATTATAGGAATATATCACGATTAGCCAAAATTAGT
CTCATAAGTTTGCTTTTGATTGGATTTATTACGATCACGATCTACGTACA
AATGAACTTTTACCATAAACACATGTAAGAACTCTATTTTCTTTTTTATT
TCGATTGTAATATGAGACGTACGGATTTTTACGGATTTGATTGGTTTACT
CTGTCATTATTTCATTTTCTAAATTATTACTACAATATTATAAGTATCAA
ATGATTGATTGAATGATTTGCATTCTATATATAATTACCCTCCCATCGAT
TCCTATACATTTTTGAAGGGTTGTTAAATAGTCTTCAGGAGTTTGTTCAT
GACATTTGTGTTGGTCCTTATTTTTTCGATCTTGTCCAGTCTTAGGACCG
GTCATATCGTTCCTAAAAATCGTCAGTCCTTTGATTTATGATTAAGTTCT
GTTTTTGAGTTTTTTTTCGTGTTTTTCATAAATAAATCAACAAATATTTT
TTTATATATTAAACAAGGATTTTTAATAAACTGTTTTTTAATGCTTTCAA
ACAAGCGCTGTACCTTAAAAGAAAACAAGTTATGCATGGTTTTTGGTTTG
ATTTTTAGACAATCAAAACTCAATATTATTTCTTTTAAAATGCTGTATGT
AAGATATTTAGCAATTAGGTATTGTTTTTTGTAGTCAAAGCTATAAGGAT
TCCTCAATTGATTTTCATTCCAAAATGAATACCGAAATATATTTAAAATA
AGTGGAATAAATTAGGTAAATGTTTTATATACAAGAATAGACACTAGAAG
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TGGAAGTCAAATCTTGTCAAAATCTTCAAATTAAGGTATGGGATCGTTTT
ATTGTTATATAAATTTTGCATTGAGTTTGAAGTTTTCATATTTCATAATG
TTTATAATCATTTTTAGTTTCGACGTGATACTAAGAGTGTATCTGCAGAC
AAGTAGTTCCAGACCTTTAACAGTCCATATGTAATTACCGGGTAGTCCAT
AAAAATTTGAACACTTAATAATTCAATAATTAATGAAGTACATATCATAA
GCATTTTATTGAATACTAGCAGTAGCACAAGGCATTACTCGGAGTTATTA
GCCATTGACAAACTTAGAAACCTTGCTTTATTTATATGCCTAGAAGGTAA
CTCCTCAATAAAGCATTAGTGTTACCCTACATTTTCATATTCACATTGCA
CACTCACTCGTACCGGGTGGTCCATTAAAATCTAAACACTTACTAATTCA
ATAATTAATTAAGGTTGAGTGATTGAAATCATTGCATATTTCGATGTATC
AACGAATAAACAATTAGTTACAATGCAAATTTGAGATCCCTAGCTTTCGT
ACTAGTCGAGAAAGTGATACTTGAACGTAATCGACGAACTTCTATTCGCG
CACTCCAATAAGTTCGGCGTCCCAGGACAACCGTCTACGCCATCAGAAAT
TCTGAAACTTTGAGGAGGAAGAATTACTTTATCAAAAAGGCCAAATTAGA
CTTGCAGGAGTTAAAGAAAACAACCCTGCTCAAACCCTATTGTCCATGTG
GGTCCATCCGAAAGATCTTGGGGTTTCGCGTCAGAATGTCCAGAGGGCTA
TCAAAAAAGTGAGTCAAAAGCGCTTTCTGAGGGTGAAGGGGCCACTTTTC
ACACGAGTAAGAAAATAAACCACTCTGCTCAGTTGTAAGACTCTTTTGAA
TGGTACTTTTGAGTTCTTTTGAACTCTTTCTTGACACTTTTGGCCCCCTA
CAGCCCTGATCCCAACCCCTCGACTACTCTTTTTTGGTGCATGCTGAGGG
GAAGACCTCCAGGGTCTGTCATCCGAACTCCGAAGCCCTCAAAACCACTG
TTAGCCAGGAGTGGGACTCCATGCCCAAGCATTAAATGAGCAGCGGGTGC
TAGGCCTTCTGGCTCCTCCCAAAAGCCAACTTTGCCCTGCTAAGGTTCGC
TACATGCATGATTAAGAGAGCTCAGACACACATCTATTTATAATACTAAT
TTTGTTGACATTCTACGGCTCATTAATAAATTATATCTTGCTAAAGTATA
AAATTGAAATTGTTTAGATGATTTTAAGGGGCCACTCGGTATTATTCAAT
AATTAATTAGATGTGTTCGCACCAAAATAAAAGGTAATTCTAATTCACCC
AATCAATGTTCAGAATACTGATTTAGGGAAGGAAGTAGAACTTTGACAGC
TGTCAACAAAATGTATTATAAGTACAATACATTTAGTATTAAATAAAGAG
TTAAACCTCGAGACATTTTGATTTATAAAACAAATTACAAGGCCTTAAAT
TTCATTAATCATTCAATCACTTTATTTATAATTATTTGCTACTTATTATT
CATAGGAACATTAATGATGCCTTCTGGGTATTTATGAAGCCAGCTGGTAT
TCCTGAAGCAATAGGGATAATTACATTCGGTAAAATATATCGAACTTTTG
TTTATTTAAACAAATAAATGATATTATTGTTTTTTTTACAGGCATGATGT
GTCATCACAATAGCTTTCTCCTCTACGAATCCCTCGATGAACCCTCAATC
CCAAAATGGAAAAGTGTAACCCATGTATCCATCTTTGTATCTGTTCTGTG
TATGATTTTACTTGGACTTGGTGGTTATTTCAGCTTTGGTTCTTCAGTTC
AGGGTAATTATGTATATTAGTTATCATACATCAACAGGAGCGCCTATAGT
TTAATATTTAAATAAGTGTTAAAAAATAGCAATTTAATATAAATTTATGA
AAATTATTATTAATAAAATAAATCCCCTTCATTTATTTAATGAAAATAAT
ATTTAAAATTTAATGAAGCTAGGTGATTCCTCTGTTCGGCAAGCTTTTTT
CCAGGTCGAGTAATCCTAGGGAAAACTTTGGAATGCCGAATTTAGCAAGA
GTGAGCTTTCCTAGATCCCTGATTCCCCTTAAATAACAATATGTGTTTGT
TGAAGTTCAGTTTGTGTTCCATTTGTTTTTTCTGGGGGTTCGAGCATTTT
TTATCATATATTATTTTATTTTAACATTTATAAGATTTATGTTACAAAAT
TACAGGGTGCAGTTTTACAATTAAGCATTTTCGAGAATTGGGCATAAACC
TTATTATTCCTTAAATACGTAGAGATATTTACAAATCCAGTTATTTGAAA
ACGTAGGGGCCCTCCATGAACCTAATCATGCAATTCAAACAACCTCAGCC
TCAACCACAGACTCCAACCTGGCGTGGAACAAGCTACACCCCTTGATTAG
GTGATCTTTATTCATATTATTCACAGCCTCAATAATGAAGGCTCTCAGAG
AAGCTCTCTCTCCAAGACGCCCCACACGAAATAATCCAAAGGATTGCAGT
CCGGGGAGTTGAGGAGCCACATTTTCTGGACCAGAACATTTCCAAACTGC
CCGAAAGCCAATTTTGTACCTAGATCGATCTGACTTTTTTCTGGATGGTG
TTTCCATCCCTCCATACTCCTTGAACACTTTTGTGACAGTGTACACGGTG
GCAGAGGACAATTTGACAAAGTCGATGATCTCTTTGGGCGCACGTCCTGC
ACGAGGGGTGACAATGATCGCTGCACTACGGCCGTACTAGGAGGACATTT
TCGACGCTTTGTAAAAATAACTTATTCAAAATTGTCTGCTAAAKCTGTTA
AACTGGCTTTTAAAACTTTACGACTAAAGGTTCCCAAGAAAAATCGATTT
ACAAAAATTTCTTATTGGAAAACCGCACCCTGTATACATATATATAATAA
TAATAATTTTTTTTTTGGGGGGGAGGGGAGAGGGACTTAGTTTTACGAAT
TTTTAAACAAAATCCAAAAATTAAAACTTCAAAAATCCATGGCTATTCAC
AAAAATATAGAAATTATTTAGAAAGAACTTTGAAATATTAAATTTTTGAA
AATAATTTCAAAAATCCATAACTATTTACAAAAATTATTTTTTTTAGAAA
CAAATTTCAAAGATGTTCACAAAAAATTTCAGAACTGGAAATTCAAATAT
TAAATTTAAAAAAAAGATTTCAAATATTAAATTTTTTTGCAAAAATTCAA
AAGTTCATACCTCTTTTTGAAGCATTAAATTTTTTGAAAAAAAAAGAAAA
AAGAAACACAGAAATCTATAGTAATTCATAAAAATTTATAAACAAATAAC
TTTATTTTCGCATTAAACTTTTTGTCCAACGTCCTTGATTAATTACACAA
GTAAGCAAAAAAAAAAGTCGGAAGCAATTGTTTTTATATCAAAGGAGTTT
GTAAAGCGTAAATAATTAGGGTTTTCCTTTATCAAAGGGTATTTGGTTCG
AAGAGGTCTATTTCAGATGAGATATTGATTTGATTTGATTATTATGGAAC
ATAATTTTCTCGGAGCTAAATGTAGAATTTTTTAAAATTATCTAATGATG
AATTATCCTTATAAGTAAAAATATATAAAAAAATTAAATATATAAATAAA
AGTAGGTAAATAAATTAATTGCTATACATTAGACTCGGTATTTCCATGAG
TAATTAGGCGTCGGCTAAATGACAAATTTTGCTTAAGTAAAGTTGAAGAT
AACTCCCCAAGAATTCTTCGCTATTATTCTCTATTTATCATGTGCATACC
TACACGTAACTACTCAATAGTTATATCAATAGGGCATGAGCAAAGAAAAA
AATATATACTGGGTAAAGAAGGTTGAGTGATTGAAATTAATTCATTTTTC
GATTTATTAAAGAATGAACAAGTAGTTAAAAAACAAAACATACCTAATAT
TCCAAACTTACGTAAAAGTCGATAAATTGACTCTTGGACGTGATCGACGA
AATTCTATTTGCGCACTCGAAGAAGTCGAGCGTCTCCAGGACACATGTCT
ACGTCGTCAGCAAGTCTGAATCATTGGAGAGGAAGAAGGACTTTCTCAAA
AAGGCCAAACTTGTCCTGCAAGAGTTCAAGAAAACAGCCCATGCAAGAGA
TCTTGGGGATTCACAACAGACCGTTTAGAGAGCTTTCAAAAAAGTGGGTA
GAAAGAACTTTGTGAAATTTTATTTATAAGTTCTAATAATAATAATAATA
AAGAAATATCGGTTAATGTGTTAGCCATTTTCGCCAATCATTCGATCGAT
ACAGACCCTAAAGGATTTGCAGGCTTTGCCCACTTCCACGGCGGAGACTT
TGTTTCAGTACTTGATGAAGGAGGTCTTCAATGATGAGTCGATGATGTCG
TCCGAATTGATAGATATATTTTCTAACTCCTCTAAAGAAGTTATCCACGG
GATTCATATCGGCAGAGTTAAAGAGCCAGGTATGGGGGTCCAAAAATGGC
ACCTTCTCTACTTTCGACAAGTTTTTGGTCTTGTAGTCAATATGAGAGAG
GTTAAGTCTTGTTGAAACAGGAATTAGACACCATTGGGCTCAGCTTTCAT
CCAAAGTATAAATTGGTCAGAAAGGGGTTCAAGGTACCTGTTCCCACCCA
ATTTATCTCAAAGAAGCGGGGAGCATGACTCTGTCGTTTATTCCAATGAA
CCAAAGAATCATGATGCTCCCTCGAAACTTTATTTTAAAGACGTGGGTGA
CATTATCTCTCTCCTTGCCCAACCATCTGTCTTTCTGGATGTTGTGAGAT
CTGTTGACAGTCCATTGTTTCTCATCCGAATAAAAGATTATTCAGTTACA
ATGGGACTTCAAATCTTTCAGCAATTCTCTTCCGTGTGCAGTCAAGGTTG
CCTTTTTTTTGCCTGTAAGGATATGCCTTTTGCATAGGCGGATGACTTCA
TCCTCCGGTCAGTGTTCATGGTWCTAGAGATTTTTKCAAGGSTTWCCTNC
AAGGTTGCCTTTTTTTTGCCTGTAAGGATATGCCTTTTGCATAGGCGGAT
GACTTCATCCTCCGGTCAGTGTTCATGGTACTAGAGATTTTTGCAAGGCT
TACCTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTGCGAGAACGTTAATTGGRGTCCCAGG
AGATGCCTTTWTGGACCGTTTCACACCTACGAGGAATAGGGGAGGTCGTT
TTTATCACTTCGGGACTTGTGCCCCTATATCTTAAATGCTTCCTTCTCCT
TCCTATGGTTCTATACGTCGTAGACTTTTTGGATACCAAAGCCTATAATC
ATTATTGGATATATATTATTTTACCGCCACACGATGTCACCCTCTGAAGT
CTTATTTACAAACTAATATGAGTAAACAACGCTCATGTCTTATTCATTCT
GAGTATTCCGTCATTCAGAGTGAAAGAATAATTGTGATTCGTACTCCTGC
GAACATGGTATCTTAAGGATAGCCAATGAAAAGTTAAAAAGATTTTATTT
ATATTTAGTTTTCTTATGTTAAAAGTCTAAACTAAAATGATCCATTTTAA
AAATATAATAAGTAAATTTCTATTGTAAAACCTCTTTGTATACAACCTTT
TTTGTTGTTTTCTGTTCATTTGACGCAAATATAATATTAATTTAGGTACA
TTTAAATGTTTTTTTCAAATGATTGACCTTGTGATGTATTTATTTTCATT
GTCAATGCTAATTTAATTGTGAAATTTTCTTATAAGTGAAAATGGAAACT
CATCCCGACTGATGTTCCTTCTTCACTTTGTAATAGAATAATGTTTAGTT
ATACTTAATCAGTGCAACTCCATCCAAGCAATTAAACAATCATGAAAAAT
AAAGCGGATTTTCTCTTTGCTTGTGTCCATCTTTGATGCTCCATTAAACT
ATACTGAGTCAAGCAATAAAAAAAAATTGTCTTGGAAGTACCTTGAATGA
CAAATTTTATATTTATAATCCCATCTAGCTTAACCCCATTGGACTTATTC
AACAAGAGATCCAGATTACTAAATATATTTATCAGGAAAATAATATATTT
ATTTTTACTAGACCTATTATGTAAATGATATACATTAGGGAGCACTGTAT
ACAGTGCACCTTGTATACACGTTTGGTTCTATATGCACATACCTGCAATA
GTTTATTAATACGCCTTTGTCGTTATTTCTTAGATCTAAATTACGTTTAT
TAAAATAAATTAAACCAATCTTTAATTGATATCTGCTTTTAAAAAAATAA
AATCAATATTTTTTTTAAAAAATAACTAGAACCAAATATTATTGTATAAA
TAAAACCCCTTTTATCCATACTTAAAAATAAACTTAATTTGGGACAAAAC
CAATTAAAAAACTGAGGTGATATTCCTTTTCAAACAAAACCAATGAAATA
GAAAGGTTTTTTAATTTTAATAAAAATTTTCCCAAGATAAGTTGATATTA
AATTCATTATTTTTATATATTTAAAATCAATATAGAATTTGCCAGAGAAT
AAGCTGATGTTTAAATGGATTACTGATTTTTCCCTTTTAAAAGTTGTTTT
TAACCTATAAAAAGAGTAAAAATACTCAAAAAGTTAAATAAAAAATCAGA
TTCAATACGAAAAAAACTAAATGTATATAAAATGTAAGTTGTCATGTCAA
AGATTTTTGAAGAAGTATAATTTTGTTGAATAATATAATTTGTCTCCTTC
TTAAATTATGTTTTAATATACTGCTTATTATTTCAGGGGATCTCTTTAAT
AACTACTGCTGGGATGATCATCTAATCAATGCGTCGAGAACCCTCTTCTG
TATTGCTATAATGTTCACGTATCCAATCGAGTGCTTTGTGTGTCGCGAAG
TACTTTTAACAGTCATTTTTGGAAGTACATATGACGTGGTTCAGAATATG
GATTCAAAGAAATCAATTATGTATCACATTGGGATCACTGTTCTTATTGT
GACATTGACTTATCTTATATCCTTAGTAACAAATTGCCTTGGAGTTGTTT
TGGCATTAAATGTACATATATACATCCATAGACTTGTAAATTTTAAGTAT
TTTTGTTATGTTACCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAATGAAATGGTAA
CCCTGACAATTTTGAAGAATGTTTTTGCCTTGTGGGCCGGTGTACTGTTT
TGTTGGAAGGTGTAATGTCTTTCTTGGGTTACTCAATCATTCCATGAATG
TAAATTAAAAGTTCAAAAACACAACCAGTATAATAAAATAGCTGTTTCTG
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TCCTCCTTAGTAATAGTCACAGCTTTGTTAAATAAAAAACAGAGCTTTGA
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TTTCTTTTTAGGGTATCCTGGCAGCCATTCCTCTTGCTTTTATTTTCCCG
GCTATTTGTTATCTGAAACTGAATGGAGATAATCTCACCAAAGTACAAAA
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AAAGAGGAGTTGAATTGAAACAATCGTGTAATGAATACAAAAAAAAAGAA
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TTGGGCATGCTTCTTTTCAGCCTCATTCATTTCAGGGACATTTTCATATA
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ATGAATCTCGCATTGTATAAGTGCGATCGATTTACACTAGATGTTGTTAG
AAAGATAAGTTTTTGAACTTAAAAGTTTTTAATTAGTTTTGTCATTGTTT
GAATCAATATTGTTTCATCTGAAGGATAAACATTTATATTATATTATAAT
GAAAGTAACAGGAACTAATATAATTCCCAAGGCCGATTCAAATTCTTTAA
TATTTTATATAATAATTGAAAAATAATCTTTTGATATAAATTTCTAAGAA
TGGCAATTGATAAATTTAATCGCCTTCCTTTATTTAATGTAAATAATATT
TCCCCGGCGAGCCTTTTCTACGGCAAACTTTTCGTAGTGACTGATATACA
ATGGTGATGTCACGTGAAAACAATCGATTAATTTCATAGAAATATTACCT
TTGTTTACAAAAGTTGTAGTGGGAATTATCCTTAGCCCCTCAGGTTCGGG
CACCCCTCCTGCTGAATTTCGGTCTGTAAATCCTAGACTCTTACAAGAGT
GGTATAGTTTTTACAGAAGCAAATAAAACTAGTCTGGTTTATTGAAGTAA
TTGACCTCATTTGAAATTTGAACAACACCAATTCCTTTTATTTATTGGTT
CCATTTTTGCCCCCCTCCCGTAGTTTTAATATTAATGAAAAAAGGGGTTT
CATTGCTATAAAACTTGGGTGTTTAGACTCTCCAAATGGGTGACATCAGT
AATGTTAATGCTACGTGTAAGTGCTTTAGAGAAAAAATAGCCTAAAGTTG
ATCAAAAAATGGAAGAAAAATAGTGCACGCTCCATGTATAACGTATTCTT
TGGTTTATCATACCGACTGATTAATCAATCATTGTGTTTTATAGGGACCG
GAGACTTGTGATCATTCGTTTTACAGGGACTATTGTAGTGTAATCCACAA
GGAGATAACATAAGT back to top
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