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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s949 | supercontig | LSalAtl2s949:237717..254179 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012610 >EMLSAP00000012610 ID=EMLSAP00000012610|Name=EMLSAP00000012610|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=238bp
MTIENSRNIAPHVIRDGPKYLSNQSWYFGALSRMDAQDLLMTEREGGVFL
VRDSGSIIGDYVLCVKEESKVSHYIINKIQQGDQMRYRIGDQMFTDLPAL
LNFYKVHYLDTTPLIRPAPKKIERVKAKYDFDGRIEEHQLITNGTTSISS
SNLSDSTQKSKPANHQRKLPAYARVKQARVPNAYDKTALRLDVGDIVKVT
KMSIHGLWEGELNGKVGHFPFTHVEFIDNSESGIEDDC back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s949:237717..254179- Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012610-708457 ID=EMLSAT00000012610-708457|Name=EMLSAT00000012610|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16463bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s949:237717..254179- (Lepeophtheirus salmonis)
AATATGACCATTGAGAATAGTCGGAACATTGCTCCCCATGTGATACGTGA
CGGACCAAAATATCTTTCAAATCAAAGGTAGTATGCGTTGTGAGAATATA
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TATGTTTATCAAAGACCAATATTCTTTTGACTCTGTATTTGTTCAAGTTC
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AAAAATGGACATTATTTCAAAATATACACAAATACTTAATTTGAATTAAA
GCTTAACCGGTCTAGAGTTAGTGCTGTCATTAATTACTTTAATTTTTGGT
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AAAAATACATTAACATGTTGTCATTATTATTTTTTTTTTTTATCCAGCAC
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GAATATACCTACAATCTGCTATTAATGGCAATTATTTAACTATGACTGCA
GCTATTTATATCTATTTTTTAGAGCGNTTATCATTTGCATATCTATTTAA
GCATAAAGGAGAACGGGGATTTTTTATTATTATAATGGACGTAGATTTTG
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TGTGATTCATATCGATACATTTGAGCATAATTACATATCTTTCCATCGAA
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GCTTGATTCAAGGATTTTAAAGCATAATAACATATTGTGATTACAAGGAA
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GCTTCTTGAACATAAATTAACAATCATTTGATGTCAAACATCAGTGTATC
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TTAAAGCATTCATGAAATAATTATCTCACAAATTGAGCACATCGTTATTT
TTGTAGTATATCGCAACCTTTCTTCTAAAAAGAAATATAACAAAAGGCCT
TAAATAAGTTAGTAATTTGCCAAGTCTTTCTAACTATGTAATTATGATTA
AATAATTGTTGGTAATTTCTCACAGCTTAACAAGAACTAATTCGAATGAA
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GTATGAGCTGCAATTCATTTGTCTTATAATGACATATTGAACTGTTGCAA
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TTATTTACTGAAAAAGCACCATCTCATTTTTTTGATTACAACTTCCATAA
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AAATGTGATTCTCCATATTATTTGGTCATGTATTAACTGATATTTTATTA
ATATTTATAATATATTTTTTTAAAGAAATAGTTGGGGAGAAGGGGCGTCA
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AAAAAAAATCAAAAAATTCAAAAAAWWAAAATCCATAGCTATTCAAAGGA
AATTAAATTTTTCTGGAAAAAATTAAAAAAATTTTATTANNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATTTAATATTTAACCTTTTAGTAAAAATC
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CCCCTGCAGACGCCCCTGGAGAGGTAATGACTATCTTCTCTAATTACAAA
AAAATAACATTGTCTAGTGTTTTTACGACAGCTTGTTTATTTCACCAAGC
CCATAGGATTAAAATATACGAGTCCAATTCGTGTCATTATTAAAGTGAGC
ATTTCAAAAATTAAATCATCAAGGCCAGGGATGTACAAGGGCCACTAATC
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AAATATGCATAAGCTTATCTAAATTTTTTTAGGAGAAAGGTCTGTATAGA
AAGCTATTAAAGGTTACGCGTTCCTACTTTAAATGTAATTATAATGCTTT
TTAAAAATAAGTAATGTAAAGCTTTTAGAGAATATAATCGTCGATACTTA
TTACTTAATAGGTCTATGGAAAAACCATATTTACACAATAATGGAATTTT
AATTAAAGTACGTTATGTTTTTTGAAGTACACCTCTGGCTTGTCAACACA
AATCAAGCTAGAATGTTTTTTCTCAAAATGGAGTGTGTGCTACATTTGTT
GTATATCATCAGATTATTATGATTCACACTTTTGGAGGGCCTGCAAGTTG
CAATGAGAGTGGTCAAAATTGATTTTCACAGTAGAATCATGAGAAATGGA
TATATCATATTTAAAAAGAGTCATATTGTGTTCAATATAAGTCTCTTAAA
TCAACTAAACTATAGCTATAATTATTATATATTTTAACTCATCCCACAAA
TTTGAATAAAAACCCCTATAATTGACTCAAATATGCTTATGAACTATTGG
GCTGTATGTAAGGGGTTGATCTTATTTAGCGGTACACATTTTATTATTTT
CATTAACATAATGCCATTGGTGCAAAATCACATAGGAGGACAGCTTGTCT
CTGACTAGAGCAGACTGTGAGGGTTGGAAAGAGGAAAGAAAATTCTAAAT
TTTCTCAAGGCCAACAAAGATTCAAGCAAAGTTGTGCTCTTTTCAGATGA
AAAAATGTTCACTGTTGAGGCCACTCTGTATAAACATAACAGCTGCTACA
TCACAACGGAACATCAAGACAATGTTATGTTTCAGCTTCAGTGAGACATG
TCTTCAGAACCAAAAATCCAACCGGAACCAGAGTCTTGGGCGTTGTGGAG
ACTGCACTCCAATTTTTGTGGAGAGGAAGGAGCGTGTCAATGTAGATGCT
TACATCGCACTTCTGGATAAGAAAGTGCTCCCTTGCGCCAGAGAAAGTTC
GGGGACAAATTTGTTTTCACTCAAGATGGAGCTCCGTGTCAATACACCCC
TAACACCTAGTCCTTCCTGAGAGAAATTTTTTGGGGACCTCAAATGTGGC
TGCCCTCCTCTCCAGATGAGAACTCTTGGACTACTCTATCNTTCGGGGAC
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TAGTCCTTCCTGAGAGAAATTTTTGGGGACCTCAAATGTGGCTGSNCNCC
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TCAAGAAGGAGTGGACCAAGTCTGACTACATAGTCAAGGCCTGTAAGGGA
TTTTGGCCTCTTATTGAGACAGTTATTAGAGCTGCGGGCTCACATATTGT
ATAAAAGTTGTGCCGATCACTATTGAGATGAGATGATTTTGTTAAATAAA
TGTCCTCACACAACCTCTTGTTGAAAATGTGTACCCTGTATACATAGGAA
GTAAAAAAAATGGGATTTTCTCCTTCTCTTGATTTTTGTTAAAGATTGTT
TTTATCTTGACGATCCATATCTATCTAAACAGTTTGAATGGGAGAAGAAT
GATTATTTATTGACATCTTGGATTTTTTTTTTTTTGGGGTGTTGCTACCA
ACAGTTATCTATTTACTCATTGAACAAACTGTGTTCATGTTAGTTACTCC
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AATATTACATAATCATTATTTCTCTGGGGTTGATCTATGAATATTTAGAT
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CATAAAAAGACAATTATTATCTGATACCCGCTGCAGATGTAGTCCTTTGT
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GGAGGAGGAGGGGGGGGGGGGCAAAAGTGTCAAAAAATAGTTCAAAAGAG
TCTTGCATCGGAGGAAATGGGTTTCTTTCATTGCTGGAGTAAAACATGGC
CTCTCCACAATGACAAGGCTCCACTTTTTTATGGGTCTCTACACAGTATG
GTGTGATACACCGAGATCGCTTCCATGGCCCTCCGGGTCCAGTTTGGCCT
TTTTGACAAAGCCCTTTTTCATCTCCAACGTTTTGGACTTCCTGGAGACG
CCCAACCGCTTGGAGTGCGCCAATGGAAATTGGTCGATCACTTTCAAGTG
TCATTTTCTCGACTTGTACGTAAGCTAAAGAGTCTAAGTTTGTTTTTGTT
TTGTAACTAATTGCTTATGCTTTAATATATCGAAATATCAATTGATCTCA
ATCACTCAACCTTCATTAATTATTGAATTAGTAAGTGTTCAGATTTCGAT
GGAGCATCCTGTATATGTACATTGAGCATTTGAATAATTATGTGCATTAT
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CTGGATTTTAAATACATTACATTTCCTTTATAATAACTTTTTTTTGACAG
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ACATTTGATTCCACTCACAGTACCCATTGCATTGCAATTTGCAATATATA
TCTTTATTTATTGCATTTTTATGTTTGTATTCATGTGGAATTTAGTCATA
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TTATATTGATTTTCGGTGAGTAAAAGTATTAAACTAATCGTAAAATTTAT
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ATATCAGCTTAGGGAACTTTGTTTTTTTTTATAGAAACACCCCTTTTCTT
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TTTGCATTTCATCCATTTATATAAATATTTATTTACACCATTAAAAAGTA
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TGTAGCCGGACTAGGAGTTCCTACAAATTTTTTGACTCTGGCAAAAATGT
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AAATTTTGGTCCGAAACCCCACACATCGTTGACTGACGTCCAATATTTCT
TAGGCCGGATACAATTCTAGTCTGGATTCTATCCTACAACTAATCATCTC
CTACTTCTCTTAATAAAATATGTTGATTAATCCTTTGGAGCACCAAAAAA
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TATGAGATATTATATTTGAAGGGGGCCATAATGTGGCCGAAAATAGTCAC
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ATTGATTATAATGCCCATAAATGGTCTAAATATGACGATGAAGTTAAAAA
TAAATAAATTGGGAATAACAATGATTAGATTCATAGAATTCACATTACCA
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TGTATCTTGAGGCAAGTTCAAGTGTGCCGCACGATTTGTGACAACCATAC
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TGGTGCGCCTTGGTTACAAAAAGTTTGGGAACCACTGTCATTGGGGACAT
CTATTACGAGGTTTCGTGTGCTATCATCCAGTTAGGCCTGATAATTAATT
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TAAAGTTTTATCTTCCAAAGTAATCTTCACTCACGAAGGAGGTGGATATG
TCTATGAGGGAACTGATGTCTGTGTCTTTTTGAGTGGCCAGCTATATGAG
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TAAACAGATTCTGGCTTATCTTGAGACATAACTTGAACCATCTTTTCTTT
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AAGAGCTAGAAACAGAAAAAGTCATACAAACTTATATAAATTGGCGAAAA
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TATTCAAAACAATGAGCACGATTTCGCTCAAAAATTTTGAGTGCCCCTCA
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TAATTTTCATGGGAAGAATAAAATCAAATTATTATGATCATTATTTTTTC
ATAGATAAAAGAATTAAAGAATTAATGCATAGTTTAAATTCAGAACAGAT
GTGATGAACAAAGGAAATTATCTCTACTTTTTAAAATCTACAATGGAGCA
ATATTTCAATATTAAATTCAGCTCTAATTTTGATCAAATTTCATAAAAAA
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ACAAACTAATTTGATGATACACTTCCAAAGAGTGTAGCAGTTTTTTTGAG
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TTAATATTGTTGCAAATACACTAAATTTGACCGAATATCTTTTTTTAGAA
GAGAAAGGTTTTTGACTTTTAACTTTTTTTGCTTAAGTAGAAAATTTTTC
GCTATTTGAAGGGGATACTGCATCTCCGGCCCCCTCCCCCACAATTGTCC
TTTAGGGAAGGGATTAAGGGCCGTAGACTAAAACTTTTCTAATTTTGACA
GAACTTTTAAAAGTTGGTAACTTTTGACAGAATGTATTGGACCAAGTTTT
TTATATTTATAAAAGTATAATGACCTTTTATATCAAAAAAAAAAATTATG
ACTTTTTAATTTAAAAAAAACATACATTTTATTTCCGCTATTTAAAAAAA
AATTATTTCTAATTTTGACAAAAATAGTTTTATATTTAATATTACAAACT
TTGTGAACAACACAGCTATCTTCTATACTCATTTGACTACAAAAAAAATT
GTTTTAGAGAAGGGGTATACCCCTCCCCCCTCACACACACACATCCCTCT
GTAGTCACGCCCTTGTACCCTCTCAACCTCGACTGTCAAAAATAAAAATT
TGAAAGAAACATATGTTAGCTAGTCTTCAAAAAAATTCTTGTTCTCAACT
GTTAATTGTTATTAAGAGAATAGTTATTAATTATTATAAGCATTGAATTG
GTAATCTTATTAATGACTGAGGATGAAATGACACGAATTATATACTAAGG
TCCTTGATTTTTAAGAATTAATATAAAAATTAAAAGCTAATTGTGTAGAA
ATGGGACCGATTTTAAACCCCATATTAAGGACGGATACAATCTTAGACTA
TATTGCATGTTCCAACAGATAATTGAGAGATGACTTCTTCTTTTGAAAAA
AGGTGTAAAAAGATATATATTTTCACCTATTATTTAAAGATATACTTTGA
AAAAACAATGGCTGTCATATGAGTAGGAAGTGTTTTAAGCTGGAATTCAA
TAATAGAGTTATATATATATTATGTACATATCTTGGAGGTGTAGTATTAC
TATTGAAAAATACTCTTGAGTCATTCAACACTTTGTTTGAATAAGAATAG
TAATCCATATCACCTAGAATAATATGTGGTGTGAGCCTTTTGACTGATAC
CATAAATTGCATCATAATTGAGGGCCATGTCATATTGGGTGCTTATAATT
TATACATATTAGGATCTGATGTATAATCAATCTATACATTAGAGGGATAG
ATTTTTGCTGGTCAGTTTTGACATGCAATCGTTTTCATTGATATTATTGA
AAAAGGGTTTTTATTTTTATAAAACTTGGTTAGTTAGGCCTAAAAAATGG
CCAACATTCACTGTGATGACGTCAAATAAAAACGTTTTATATCTTATCTG
TCCTTAATATTGTAGTTACAATCGATCACGTCCCTTTACAAATGATCATT
TTCGCTCATAACATAATAAATTACCTTAATTTACCAATTGAATTATAGTT
TAGTGAAGCTTTAAGTATCTCCCACGTACAAAAATAGCAGGCCATTATTA
TTAATTTAGGCCTAATTATAGTATATATTACAATTATAATAATTGGCGAT
AATTGATTGATTATGGCATCACTGGCTGYTATCTATGGMGACGTAATTGG
GMAAAGATTATTCTATTGGATATATTTCCACCTTCCCTTCTCCAAATATA
TATATAAAAATACTCCAAATCAGTTGGTAGTCAGTATTTTCCACCGTTTG
GGATTTTTTCCTTTAATTATAAGGAATCGTTTACAACTTATTAACAAGAG
CTAATTCAACTTCAACCAATTAACGTTCAAAACACTAATAAAGGCGTTGA
CAAAATGGCACCAAACAAAAGATTACTAATTTTCATGTTAGTACGGTAAG
GGCTTTGTCCTATATGACTGATATCATTTGATGTATTTTCTGTATATTTA
TTGTAGGTTACATACTCATACGTAAGATATTGAAAATTTGGTTTGTTTTG
ATATACTTTTTGCAATGTAATTAATTTCCCATAATTTATAGTCTTATAAA
CTTGTTTCTTCAGTTCTATAATGGCACAAAAATAATACTGATTTTGATCT
TTGAATATATCTGATCCGGAATACCATTTCCATCATGAATACCTCTGTAT
ATTATATATAATAGGTACTGATACAAGGTTTCATTCATGCCATACCTTCA
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TTTAAAGTAATCATTAATCATGAAAGTAAACTACAAATTATAGGATTTGA
TCATCCTTGAGGTGTGGGGGTTTATAAGTACATCTTTATAATGAAATATG
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CTCTGTGTCAAGTTAGTTTAATATTTCCAATTACATACATGAATCTCAGT
ATCAATATTTATCCATCATTTTTTACAGAGAGGARAGTAAGGTATCGCAT
TACATCATTAATAAAATTCAACAAGGCGATCAAATGCGCTATCGCATTGG
GGATCAAATGTTTACGGATCTTCCCGCCTTACTCAACTTTTACAAAGTGC
ATTATCTCGATACAACGCCCCTCATTCGACCTGCACCAAAAAAAATCGAA
AGAGTTAAAGCCAAATATGACTTTGATGGAAGAGTAAGTTATCCTGTATT
AATATTTATACGCTATTCATTAGATAACGAATGAGTAAATAGCTATTTAC
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGATCTA
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GTGGTGGACTGCAAGAAACGCTCTTGGTCAGACCGGATCTATCCCAGTAC
CTTATATAGTCAAGGTATATAAAATACATAAAATGTTTTCCTATATTTGA
ATTTAAGCACAACTTGGTAAGGTGTGTCTTATCAAAAGGAAGTATGTGCT
GATGTAAATCATTTACTATGTTCTGTACATATGTGTTTACGGTACTCAAA
TACTTTAAGGGAATGAGCACTTTCATAAAAGGCTTATGAAAAATGTGTAA
ATAACCTATTGTGATATATTGGACGTACATAATTCCTACACATTATCTAG
TCTTTGGTTTAATTCATTCATAAATTATCAATTATGGGATCATCTTAAAG
ACAAATATTTCTCTGTGCGTACTGTATATCATTTCCTGTATTTGAATATA
TATTATTCTTATCTCTTGTATTGCTAGATAAAGAGTGGAACTATTCGGAA
ATTAAATACGCAGAGAAGCATTGGATATTGCAAATATTTAAAAGTAAACT
TGCTTCTGACCATGCTTTAAAATGTCTAATAAATTATTTATTATGTTTTG
TATAATGTATTTTAACAAGTTTTATTTATTATTTTAACAGATCGAAGAGC
ATCAGTTAATCACCAATGGAACTACTTCAATAAGTTCATCAAATCTATCA
GACTCTACACAGAAAAGCAAACCTGCGAATCATCAGGTATTCTGAATGTT
AATTATAATTTATTTTGTATTCTTACTTCACTTTTTACTAATAGAGAAAA
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