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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s94 | supercontig | LSalAtl2s94:617718..626758 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000012621 >EMLSAP00000012621 ID=EMLSAP00000012621|Name=EMLSAP00000012621|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=225bp
MNVLILFCTLLIYVPSSRTNINYLLNDENWIMEQALNEIDSTPDHPNFPT
HHNSYQTNFLNDQESRIYGLTFDSEMPFPRNSLISLGPTLIIPFIPTGIF
QLRLPIFFNINRLIAQITGSSTSRSFAADQLEIFQGIENLLSNTFSIDGK
ACLQRIICEISEYPIIHRSFLGFLLQSFLEPQRGSFSLMSDYVEAQRKGI
NRENCWKSYGRCPFTLENILSSPIK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s94:617718..626758+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000012621-708468 ID=EMLSAT00000012621-708468|Name=EMLSAT00000012621|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=9041bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s94:617718..626758+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTCATTCCCGTTTGTGATAGATAGAATGAATGTTCTCATTCTCTTCTGTA
CTCTACTTATTTACGTTCCTTCGAGTAGAACGAACATAAATTATTTATTA
AATGATGAGAACTGGATCATGGAGCAAGCTCTGAGTATGCTGAATATTAT
TTATGAATATTTTTATCTATTGCATCCATTTCCAGATGAAATAGACTCAA
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AATGCCGTTCCCTCGTAACTCATTAATTAGCTTAGGACCTACTTTAATCA
TTCCTTTCATTCCAACTGGAATATTTCAACTTCGACTCCCCATATTTTTT
AATATCAACCGTCTAATAGCTCAAATAACCGGGTGAGTTAAATCCTTTTT
AGTTCTCTTTTAAATCATCAACCGTTGGCTCAAAGTTTTCTTTTCCAAAT
TTCCCGACGGACATCTCATTTTTTTCAATTTTGATATGAGGTGACCTTAA
ATCAAAAATAAGATTAGTCTTTTTCAATTCCCAAACATAATAAAACCCCT
TCTTGATAAATAATTGGGTTCTTTTGATAGAATGAGTTTTTTTTTTTTTT
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TCCGAGTGGCATCCCCTTTTTCCGAAACATATAGAACATGGGGAGAAGGT
GTAATCCCCATCATCTTGAACAGCCCCTACCTAAGAATAAGTAAATATAT
AATATGTAGTACTCTCATCCTCTTTCTTCAAGATCTAAAACCTGATAAAG
TAACTCTGAAGTGAATGTGCCTCCTTCTCCTTTACTCCTTTTATGTTCAT
TATTTGTTAAAAATCAAAAGGATGAAGAAATATTTGTTGAATATTTAGCA
TTCTTTAAAATGCTTTAATAATAAATAAATTCCTTCCATAAATATTGTCG
CGTCAACATACAAACAATCTGAAAGAAAAAGGAGAAAATACTAAATTATT
TTATACTTCATATACGTTGTGGTCTAAAAAGTATCCAACCTCAGCGTGAA
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TATTTATTTTTCAACATAATCTCCATATAACTTTACACACTTCTCCCAGC
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ATCTTTATTTGAATTAAGAGACTCATATTGTTCCAATATAAGTCTCCTTT
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GCTACTTTATGTGCAATTTACACCACACCCAAAGGGTTAATTCTAATAAT
TTTTTAAAAGAAATTGACGAAGATTTGTAAAATCCACACTTAATTTTAAG
ATCAATCATTCTGAATTGCTTTTGTTTGGAGGGGCCACTTGTATATATTT
TTTGAAAGGTGCTCTTCTCCAAAAAAAGATTAGACTTAAATTTATTATGT
GCAATAATGTACCTTCTTATTCATTTATTTTTTCTTAGATCATCAACTTC
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TACTTTCCAATACTTTTTCTATTGATGGAAAAGCTTGTCTACAAAGAATC
ATTTGTGAGATATCCGAGTATCCAATTATTCATCGGAGTTTCCTTGGATT
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TAAAGACTCGTTTTTAACATCCTTTGCGTTTAGCTAAGGCTAAGAGAGAT
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TTTCTCTCAAGCTGTAATTATTATTTTTTCACCCTAGAGGTGTTAACATT
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GGGTTTTGAATTTGTCGAATAGTTTATTTACTAGATATTTAATATGGATA
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GAAAAAAGGATATTAATATTTCCTCATCATTCCGTTCTAAACCTAAAATA
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TATCTAGTTTAGACACAACTAGATTTTAAACATAACATCTCGCAACTTTA
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TATATATAAGAGTGGGATTTAGAATATGTATTCATTAGGTTCGTACACAG
TCCTCAAAAGGTTAAGTAGGATCCCTCAAAAGTTAAGCATTTATCTTAGG
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CTTCCTTTAAAATAAATTATAAAAGAAAAATATTATGTCGATTTTTGGTG
TAGGAACGGGCAAAGCAGAACTATGGCTTATAATCCTATGGACCCTTCCC
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CTTTTTGCCCAATACTCCATTAAAAATTTGCCTAAAGTTTCAACTACAAA
CAATACCTGAAATTGTAAAAGGTCCAATGGGTAATGAGGCATAGCTCTAC
TTTGGCTCCACCAAAAATAGACCTACTATAGTTATATTTAAATTCATATT
TACTTATTTCATTATACATTTTTAAATAATTTATACCAAAGACAAGCAAT
AATGCACACATTAGAAAATAGAAGCTAACACTACGACCACGGATGATATA
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AGAGGTAGAGGATTACTCAAATTATTTGTTTGTCCACAATATTCACTGGA
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CTTATATATTTGGTCATGTCTAGTCTTGTATTAGGAGCGGTCCTATCCCT
CCTTAGGACTGTCAGTACTCAGAAAGTTGCATCGCTAACTACAAAATTCC
CTATTTATTTTGTTATCAGGTGTCGATTCCCTCGACTGACTTGACGTTAT
GGCTAWGTCATCTTTGATTYTTTTCGATAAATTAACATAGTAATAAGTTA
CGAGTCTAGTATGCTTATGCTCTTTTTCCAAAAGGAGAGGAATACAATTT
CTTGTCTTATTATTTCTATGAATACATTTTGGCTTTCAATTAGAAATATT
CTTTAGCCCGAAAGCCAATCACAGAAGATTTTACCTCATAAGAAACAGAA
GGCTTGAGCGCCTGTCAGAACCCCCTGAAAATAGCATCAGAACTTCTTAT
TTGATACCATAAGGTCAATGGGAAAAACTTGCACCAATTTATAGTACTAT
TTCAGGACATCATACAAACCAAGATTGAGAAAAAAATTACTTTGGAAACT
GGRGGTTATACTCAAACACTCACCCCCCCCCCCCTCCCCCTCCATTATTT
TAAGGTAAATATTTTTATGTTACAGATGAGTCCTACTTAGAGTTGAGTCC
ATCCTTCATGTCAGTCTTCATTAAGAAACACAGTATTATTTGTGTTTTTT
TACGACACACATGAAAGTAGATACTAGAAATACTAGTGTGACAAAGTTTT
TCTTCAGGAGGTTGTTATCGACTTAAGTTCACGTGAGCTATTGTAAGGAA
TTTTTGATACCTTTATATTTTCTTTTATCTGTAGTCTTTTTCATGATTTT
CAAAAAATATATATGTATGTTAGAGGGGCCACGCAACAGCTGATGTGAAC
TTATACGATACCAGCGCCCTTAAACAGCCGATACAGTAAATACCTAGAAA
TAAAGAGACTCTGAAGAAAGAGGCAACAAACATATCTATATGATAACAAA
GTATTTCCTTAAATACTTAAATCCTTGCGCTCTACAAACCATCACCACTA
CTTATTTTTTTTATCGAGAAACTATCAATGAGTTAACATAATTTAGATAT
ATGTTTATTTAATTTCGCTATTATTTTTTCCTGTTTTGTCGCCTAGTTAC
TTAAAGTATTTTGACCAAGAAACATGAACGGAACCCCAGAGTCCTTTGTT
CTAGATTATCTGACTTTGGAAATAGTTGTCTTTTAATATGCTTTAGCTAT
ACCAATGACTTGCATTTCATCTTATATGCATTGTACATATATACAGGGTA
GTTGGGGAGAATATATGGACTACCTTTAATTGCATGCTGATCAATAAGGG
AAGCAAGAAGAAGTTTGAGATTTTATTTATAAGTTCTAATAATACAAAAA
AGAACATAGAATATGTTGGCCATTTCTGCCATCATTCGCTCGATACGAGG
CCTAAAGGATTTGCATGCCTTTATCACGTCTGTGTGGGAGACTTTGTTCC
AGACCTTTATTATGGAAGCCTTCAACAGTTGATGCTGTTGTGTGAATTTG
CAGAGATTTTCCTCTCTAACTCCCTCGAAAAGAAGTAATCCATGGGATTC
ATAACGGGGGAGTTAGAAAACCATGTGTGGGGTCCTGGAGAATGTTTCAC
GGCTTAATTGGTGATTTTGCCAAGAACTTTACTTGGAGTCCCAGTAGATA
CATTTACAGACTGTTTCAGGCATACAAACAATGTAGGAGTGCGTTTTTTT
ATCACTGCAGGACTTGTGGGGTTTTCTCTTATTTGCCGTTCCTCCTTCCA
GCAGTTGTAGATGTAGTAGACACGCATTATGTATCAAGCATCTTCTTCAT
GTCTGCTGGACGTTGTCCCGTGCATGCAAATTCAATGATTGTGTTCTTCT
ACATCGTAAATACTTGTTTTGAATTAAAAGTTTTGCAACTAACTTCAAGC
TAAGGCTTAACTTCTCAATGTAAAATTGAAATAACCGAGTTGTCCAGATT
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TTACTTTTGAGGGATCACATAGGACGGTACTTTATCACTTTTCCTCGTGA
CGTATTGAACTTTTTCTGAACTATGCAGAATTTGCCTTGTCAATCAGGGA
GGTTGCTTAGTTAGTTATAGTGTCATATTCACAACACCCTCAACTCTCCT
AGCGGTGAAAAACTTGTCACAAAAACAACTATTCAGAGATCACAAGGTCT
TTGCATTGACAGTTGTTTTATAGCACTGGTCCTGGGGTAAAATATGCTTT
TGGAGAGCAATAAAAAGGGAGAAAAGAAATGAACAGTTGACTAAACGCCG
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GGAAGGTACGGATATAGAGTTAATTTAGAGAAAATAAAGTAATTATATAA
TAAAAGAAAAAATTATATAAAATAATGATTTTTAACAACGGGTGTAAATC
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ATAAACCTTAAGGTTACAAGGTAGGTTATCACATTTATCATGTGTGTGCA
TTTCTAGTCTATTTATACTTAAAAACTCTACACATTAGAATCTACAAACC
TAACCAACTCAGCAGGTCAAGATAAGGAGGTTTTGTTACTTAAAATGTAT
CTTGTTTGTAAGAGTGAAGATTTTTGAAAAGCACGAAAATGACTACAGTG
ACAAATCTCCCCCCCCCCTCCCCCCACAAGATATATTATAAATCACAGAA
CCTCTTTATTTTGGGAGGGAGAGTTGTTCAGGTTTGCAAAGTTCTTATAA
ATGAGTTGTGTGTACAGGTATAATAAATATGTTTATTATAACACCTTATT
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GGTGTTGATTCCAAAAAGTATAGAATAACAGTAATCCTGTCTCAAATCAC
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AGAATCCTACATATTTAATTTTACTTGGATTTTAGATGCAGCTTTTTACA
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AGTAATGCTATAAATATTGTGAATTTTTTTCAGTCTGAAATTATTTTCTG
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TTTATTGGCGATATTATATTTTGCACTTGAACTTGCAAAACTTACATTTT
TTTATAACCTTTTCATTTGAATAATTTTTTTAGGAGAGTTTTTTTAATTA
TTTTTTAATAATATTTACCGAATAAATTTTTTTCAAATTATATAGTATAG
ATATTTTTCAATTAATAAATTCTTAGCGGACATAAGAGATTATCAATTGT
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GAGGGAGTTTTTCTTTGATGAGCGACTACGTGGAGGCACAAAGGAAGGGA
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GAATTTGTAACCACATGTTATAATTTATACATATCAAGCTGCATTAAAAT
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GTGTATGAGGAAACTATGAAAAAAAATTATCTGCAAGGTGGTGTGACGAT
GCGTAGTTAGGGGGCGCAATATAAATAAATTAAACTGGTTATTCCTTTTT
AATCAATCTTTCTTGTCCCCCCACAAAAAACAATTTGGTATTTAAATTCA
GGGAGTTGTATTATTTTATGCAAGACTTTCGATCGTTTTGTAAACAAACT
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TTATATACTTGAAGTTCATTCTAAGGAATTACTTGAGTTTCGACATTGGG
ATAAATAGCTCTGTAGAGTTTTAATCTCAGCTGATAGAGCAAGAAGTAAA
AGGTCTGGAGGAAAGGAAGGAAAAGTGTGCCACCTAATACG back to top
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