EMLSAT00000012961, EMLSAT00000012961-708808 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000012961
Unique NameEMLSAT00000012961-708808
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s98supercontigLSalAtl2s98:1150341..1174782 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000012961 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000012961EMLSAG00000012961-695727Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000058213EMLSAE00000058213-767141Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058214EMLSAE00000058214-767142Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058215EMLSAE00000058215-767143Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058216EMLSAE00000058216-767144Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058217EMLSAE00000058217-767145Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058218EMLSAE00000058218-767146Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058219EMLSAE00000058219-767147Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058220EMLSAE00000058220-767148Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058221EMLSAE00000058221-767149Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058222EMLSAE00000058222-767150Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058223EMLSAE00000058223-767151Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058224EMLSAE00000058224-767152Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058225EMLSAE00000058225-767153Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058226EMLSAE00000058226-767154Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058227EMLSAE00000058227-767155Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058228EMLSAE00000058228-767156Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000058229EMLSAE00000058229-767157Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780471auto780471Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000012961EMLSAP00000012961Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000012961

>EMLSAP00000012961 ID=EMLSAP00000012961|Name=EMLSAP00000012961|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1240bp
HFTTGNSKNSRITHNNENIEENEEENRAIFQELILRNIEKVPIFKSTPSQ
DSDDFILDEILKFSDSHSEEELNSPSIKDLHAPPDSTSDHSYEKDSMAKG
EEIENEFDRKNSQRSSAKSLLREHCSSRQGKCRCQPQILNEKDSSGKNAL
HYCSGNQNINSIDQILSADPSLISQKDDEGYTPLHLAVISGNKAIVKYLL
SKGADVDAVDDELHSSVHWATVCGEVDCLEILIQEGAKTATTDIYGAYPV
HYSAQICGKSSDAGADLRRGLIVLKRLIKFGVDVNVKDRDGRQPLMWAAS
SGSSDAILCLVNAGANVYETDKDGLTPLHCTASRGHRDCVEALVGLCGAD
VSIQDYNGCTPLFYSVTLGHLDCTRLLLDYGSDPNVQDKKGRTSAHCGAA
KGQLETLKLLNKSNGNLWLKNIRGDYPFHDAIGSGRKELIRWLLNQKPEA
IDCCNNEGRGALHIAAMNNNVEVCKILIDNYADINIIMRNSKGDLLTPLD
AAHTKGNKGCAKYIKLHGGLSSTKLANKDTLHKALTLGLAKEKETTLSPE
DLVPDRHRPESTTLECTADDYLQPIYKQPKGHDQTLIDNDQDQIYEFSKD
DDLPDHLIHPAYDYNSENDHNELSSPSVIESLLTHVDEDHIVENATSPRE
KATTQRADSVTLDVKESGSESPITVLQLPISSNKSCIPLPEMNPIHTQTE
NLYENVTKETQTTFFDDNQNDEENTSKTDSGENDDNFGEEEGGKRLELPE
KENNATKEEENNECEASEKNNESNNDNIIPEEHDPSKEEDALRNTSGSRE
GTQRYDEPCEEEDKSVSLRDGDRASSIIDEISDDSTRINLPTMDDSGIGG
ERSQDEDSHLDSNSFLKKKEFRKSSLLRTPRRLKPTGKLLMTMLEDYDRD
TNHSEYYSEDEKVEDPLIGQSSSSSIHGGDFRPSTVHGRSDVHSDSETRN
RGAFHLHRRPVRESYRYQNKLRSYQIKPRKGSAISITQAVQMSLRKYKME
RRIFQDLLELKRLQIRAGRANEHVLVKRLSDNYNKSIQDLGGLKKHDGPF
TFKEFEKYLYGQLRSTQYGRPSSLPFLYSKFGDTDSNQAGRSIQNPRPNH
HLRRIQESHAKLIPKVCKTRDDIERLYRTLRTHGIDSSSLRHSFESCSLG
SPNVHPADCTHLSHRCHHAAHAYSGIPCFRKSKQKSIILPKIDDGHTHSL
LASTRIRNVLIHELCFRNMFDQVNICDDSYDDFPILDILF
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mRNA from alignment at LSalAtl2s98:1150341..1174782+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000012961-708808 ID=EMLSAT00000012961-708808|Name=EMLSAT00000012961|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=24442bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s98:1150341..1174782+ (Lepeophtheirus salmonis)
CATTTCACAACAGGAAACAGTAAAAACAGTCGAATTACACACAGTTTAGT AATGTTTCTTTGACTAGGCAACTGAATCTCAGACTCCCCTTCAAATCATT CTTTCTTCTCATCAAACATGTTCGAACTTCGTTCAAAACACTATTATATA GATAATGAAAATATAGAGGAAAATGAAGAAGAGAACCGGGCCATTTTCCA AGAACTCATACTTCGAAACATTGAAAAGGTTCCGATTTTCAAATCAACTC CTTCCCAGGATAGTGACGATTTCATTCTGGATGAAATCCTTAAATTTTCA GACTCACATAGTGAAGAAGAGCTCAATTCACCCTCGATTAAGGATCTACA TGCTCCTCCGGATTCAACCTCGGATCACTCCTATGAAAAGGATTCAATGG CAAAAGGGGAGGAAATAGAAAATGAATTTGATAGAAAAAACAGTCAAAGG AGCTCTGCCAAATCCCTCCTTCGTGAGCATTGCAGTAGTAGGCAAGGGAA ATGCCGATGCCAAGTATGTTCGAACTTAGTCAMCTATGATATATGATTGA TTTTAATATTTTAAATGATTGCACAGTACAAAATTTGTTTGCCTTCCTGA ANGATTTATCATTCAGGAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGGGAATATTAT ATGACAATCAGCTAGGGATTTTAAATATGATAAAAGTAATATATCATGGC CTCTACTGTATCATCTACAGATACCACCTTTTTCGATATCTTTTTACGGT ATTTTTTTTAGTTGACATTATTGAAGCCTTGTTCCTGGCTTGAAGATGCT GTATTTTTGCAGATAAAAGTTTATTTGCCGCTACAAAATTGATACAGATG AATGATAATGATTTTGATGAATGATTTTAGTCAAAGGCATTTTTTTGAAG GCAAAAAAAAAGTGAGTCTTGAGTGATTTTTTATAGAGGAATGTTCTCCT CAGCCCAGTTATAATATGAGGCGGACACATCCGCAACATTTGGCACTTCA AATGATGTCAATGCACCAATTTTCTATTAAATCGGCCTAGAATGAATTTT AAATGAGATCGATCAAGACCCATTTATATCGAATTTTTGTATTGGATCAG TCCAGACCGATTGATTCTCTGATACTAGCCTGGACCAACTTCTTTAAAGA ATCTGATGAGTTCAGTCCAACAAAAGTAATTAGAGTCTCAGACCGGTCTA TGAATTTCAAATCGACTACAATTTAAAGTTGAATGATCTTTATTGATTAA TTTGGCACTCCCAAGCAATGCTTCAATAATTTTTGAACTCATTTTTTTCT AATAATGTAAGCAAATAAATGTATTCACATTTGCATTATGTGGTGAAACA CATAATTTTGCTACAAGAAAAAAATTAATGAAATTACTGCAAGCACACTA TTAATATTTACTCAAAATTTATGCCTTTTTATCATGAATTTCCTTGGGAA AAGCATTCAAAATTATAATAATATGTAGGACCTCTTAGGTACATACAATT GCTACTCAATGTCCTTGAACCAAATAGGGGGTTGGCATTTTTATTTTTAG AGGTTTTTTATACTATACGAGTTTATATGTACATAACGAAGTCAACAGAT TTAATCTTTGGACTTTCACTTAGTTTTTCGTCTTATCAAATGAGTACATC AATCCTGCTTGCATTCCTAAGGAACTAGGCAAGCAATGTGTGTAAAATGC ATTTGCATTGCTCTATATTAAAAATACACAAGTATATAATGTATTTTGCT AAATTTTTATGGATTTAAATTATAATTATTTAATGACATTCAGGGGCGTC TGCAAGATTATATATATATATTATTTTTTTGGGGAGGGCGGTGCTTGGTT TTTGGATTTTTTAATTTTTTAAATCCAATAATTAAAATTTTTGGGGAAAA AAATACAATAATTATTTTCAAATATTAAATTTTTTGAAATTTAAAAAAAA AATCCACAGCTACTCACAAGAAATTGATTTTTTTTGAAAAAATTAATTTC AAATATTAATTTTTTTGAATAAAAAATTCTAAAAATTCAGTTATTCACAA AAAAAAAAAAATTAATAAAATTAAATTTTTTCGAAAAAAAAAAAATCCAA TATTAAATTTTCTAGAAAAGAAACAAACATTCCTTAATTTAGGGAGGCTA CATGCCCTCCAGCCCATCCTTTGTGGTCGCCCCTGACACTTCAAATTGAT ATTTTTTATAATAAGTTTTTGTAAGAGGTAAATTAGACTATCCTTTTATC AGGTTTTTATCACCCTGCACAAAGACGTTGCAGAAAATCAAAAAATTAAC TTTGCCAAAGTTTGAGACCTCTTAAAATGCCTTTTTTAGCGGAGTATTTT CATTCGAAACTCTATACTTTTTTAATCAAGATATTAAACAAAGAGTAACA TAATTTACATCTACTTAGGGAGATGTCCCCAAGAGTTATTTATGAGTCAA GGGAAGGGTACTAGTTCAGTAATTTGAAAACTTTTTTTGACAAATTTTAT ACGACACTTTTATTTATTTTTTCTGTATAAAAAGTACATTTTTTTGGAGG AGGTGGGGATTTTAGGTAAAAAAAATGGAGTATGTAAAATATTGTTATAA CTTAAGGAATCTATAACTACCGGTTTCGATGCAAATTAAGTATAGTACCG TTTTATATGCTTCAGTAATCCCGTACATTTATACTGAGTAGCACCAGTGA AATACTGGAATAATTTTATAAAGTTTTTCATCGAACCAGTTTTATAATAT GAAAGGAATTTTCTTTTAAATCAAAAGCTAAAGCATCGACAATAATGGTT TTTTTTTTCTTCAATAGGGCATATTGAACTAAAAAAACCATTTATAGAGG CCACAAGATGGCGAATAGATCATGAGTCTAGCACTATAATTAGAGATGTA AACCCTGTGAATTGCTTAGCTGACCCGTTTTTTTGGAATTGGTAATCTGA ATCTAATTTTTCTTTTCCTTAGCAGTTGTCATTATTATTTAATTATTGAG TAGTCAACTTCTTTTTGGACTATATTTTAATTCTGATTGAACATTCGTGT GTGTTGATACAAGACAAAAAGTAAACCTGAGGTTTTTTTGCAAAGTTATG ATAGTAAGTCCTTGTTGGACTCAGTGCAGAATTGAGAATCTCTATTTGAG TAATTCTTGATAATGTCTTTTTTTATTTCCTTCTCTCCTTCCTCCTTTGT CACAGCTCATTGTAGCTGATCTAAGGGAATGTCAAGAGTGTCCTTCTTTC TCTCCTCTAAACCATTCTTCAAATTGTGAGGGTTGCCATTTTGATTTTCG TTTTTTTTTTTCATCACTGGCATTTAATACTAGAAGCCTGTAAGGGAAGG CTCAAGCGCGCCCACTACAAATGTGGTGGAAGAAATGAGAAATTATTTCA ATAACATAACTTATGGTTCAGGAAATTATTTAATTCGAATATCAAGCCTA TCACAGTCCTTATTTTAGGTAAAGGTATATATTTAACTATTTGAATGTAA TAAATGGGTGTGTTTTTTTCATAAAAAAATGAGAAATTACCTTATGAAGC ATATGTTATGTCATCGTAGTAATTTCTTAATTTTGATACCACCGTCTCTT ATATGTATATAGTATTTGTTCTAGAACTTATCGTGTACTTTTGTAGATTT TTTTAAATGCTACTTGATCTAGAAAAAAAAAATTGATCTCTCATAATATA TGAGACTGAAAAAAATCGGTCCATAAATTGAGACTGAAAAAAAATCGGTC CATAAAGTGAGACCGAATCAAATCGATCTACAATTAGAAACTGAAAAAAT AGGTCCACGGTCTGATTTTGCAGTCTGGACCMTAAAATCGGTCTAGAAAA ATCAATTAAGACCGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAAATCAGTGCTGGAACA CTGGTAATTTTAATACCTCAAAATGAAATGTTTTATCAATCTATAGTTGG TATACATTAATGTATTTTAAGAAGAAAAAATTGTAAATTGTACAAACATC ACAACATATATATATTTATAAATTTTAGAGGGGTAGGCTTGAACCCTCAA AAATAGGGGCTTMCAAAGCCCCTATATATAACATTCTTAGCTGTAAGATG TCCCAAAATCCTGAGTCGTTATAAAAATACTTTTTTGCAAGCAACGCTCA TATTCTATTGGATGATATTTTGAAGAAAACATCAGTATTACACTTACATA ATAAGCTATGATTCTTTCAATTTTCAAAACTTTGGAAACCCCTGTTATAC AAACCCTTAAAATTGTTCAAAACTCAAAAGTTGTCTCAAATCTATAAAAT AGTTAAAAAACTCCAAAAATTCAAATCGAAAATTACTCACAAATGGTGTG AAAAAACTTAGTATAGATTTGTAATTCACACTTCAAGTACTACTAGAAAT AGATATTAAACTTAAAAGTTATTTTTAATATACAGGTGTTATTAATAGAG TACTAGAGTAGGTTTAACCAGCGTTGCCCGGTACTTTAAGAAATCAAAAT TAATTAAGAACTCTTCTGCTTAATGTAAAACAAAAAATAAAGATCAACAT TCTCATGTTGGTTTTATGAGTATGAGTAAACTCTTCTTTTACGCGATGAG 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AGGTCTCGGATCACGTTTTTCACTGAGCTACGTCAATCCATTTCTTTATT TAAAAAAAATTATACTGACCTGTACCACACAAAAAAGTGGTCAGAGAGGC TTCAAACCTTTTTAAAGTTAGTTTTTTGATTATATGAAGTAGAAAAAATC TATGCGTAGAAAAAATATCAACTCGAAATAGGATAGTCTCTTGTATATAT ATTTGTAACTCTTTGACATTTTTGTGTGCTATGGAACCTTTTTATGAATA ATTAAATATTATGATTTACGTAGCTCAATGGAGAACGCACTCAGGAGTAA TTATTCTCTAGAACTGAATGTGTGTAGATTCACGCTCGGTCGTTCGTTCC TAGAGAAGAAAATATACTTCATCATAATGAATATGATGATTTTAAAAAGA TTCCTGGGTAAGATGGAGTAAATGTAATCCTTAATCAGTGCAACTCCGTC TGACCAATTAAAGGAACTTAAAAAAACCATTTTGAGATGAAAACCACGAG ATTGAATGTTTCTTCCTGGGAAATCCCAACATATTTTTTGATATATATGT AGTATGTTCCAACTAAATAATTATATTCTTACAGTATATAATTAGGAGCT TTTGGTATATAGGGGGTATAGAGGAAATATTTTTATTATTACCGGTTACT AGTTATATAGTTCCTTGAATGGGGCTTGTTCTCCACTCCTCAAAGTTTTG TTCAGCTATGGGATAAGAGGGTCATTACCACACGTTCTAAACTTTATATT ATATTGCAACTTTTCATCCAAAAAGACAAAGAAAAAAATGCCCAACATCA ATTAGATGTACATTTTTAAAACGTAGGTTTTTTTAGATACAAACATGTCA ACTCTAGACTCATAACAGATGCATTCATTCATTTGTCTACGTGTGAATAC TCTGTTTATGAAGCATTTTCCGACTACCAAGATTGATAGAAATGCAAGGT TAGACTATCATTTAATCGGGATAGCTAGAATTTTTAATTTGATGTGTCGT ACCGACTGCTGGGCAAGACAGGCAGATTATAACATAACACGCAACCAATC ATACTCTATGACGTCACTATTGCTGGAATCTTCAATTTGATGTATTGTAC CGACTGCTGGGTAAAAAAGAAGTATTGTGACACAACACGCAACCCCTCAT ACACTATGACGACTTCAATATTAAAAAGCGTAGTGGAAGTCAAACATCAG TAGTACACGCGTAATAGTATAACTTTATATTTCTATTAAGTAGGTTGACT ACAAAAATTGAATAACATTTGTTTTCCTATTCCCTCCTTTTTCTGATTGA ATCATATAAATATTAGAGTATTGAATCATATTAGAATATTCTCCAATATA TATATTATAAAGATATTGGATATTTTGCCCGATATATCGGTTTCTGATAT ATTATCCCACGTCCAATTTCAAGGTAAATATGTATGGGGGTTGGGAAGAC CCTTGGATAATTAAACTATACAACAAAATTTGAACTTTCTTTGTTTTAGT GATTATTTTATGTTTGTTTTTTTATCGAATTGGTAAATTTTGCTATTACG GCATACGTATAATTTTTTCATTTGTAGTGCATACTAAAGGTTCAGATTCC TTTTTAAATATAGAAAAGAAGCAAATGAAAAAATCAACATATAACTTTTT TTTTTAAATGATTCCCTAGTTTCAAAAACGTCTTACCTTTTAAATTATCA GAGATATACATATATTATTGAGACTGTCGTAGTTTTGTAGACTCAAAATG TTAAAACAATCTGAGTAAGAAAGGAATTCGGATTTTGGATATTCTTTAAC AACAAATAACTATATGTTTTAAAATTATTCAAAATATATTTATTTCGTTC AAGAAATTTTCTACATTTTAAACTATATTTAATTATCTTTTCAATATATT 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