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Associated RNAi Experiments
Homology
BLAST of EMLSAG00000000576 vs. L. salmonis peptides
Match: EMLSAP00000000576 (pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s1097:72539:86425:-1 gene:EMLSAG00000000576 transcript:EMLSAT00000000576 description:"augustus-LSalAtl2s1097-processed-gene-0.1") HSP 1 Score: 214.927 bits (546), Expect = 5.274e-73 Identity = 105/105 (100.00%), Postives = 105/105 (100.00%), Query Frame = 0
Query: 1 MKGFFFKLLLLLAAFISSCNGIKAHRLIKRSLMNGTFSLSEALNATELEQEEEALREDEEERDRLLEQHNDVPPYFNKIFNKRLQCRDIGYLRSFTGISHSKDSS 105
MKGFFFKLLLLLAAFISSCNGIKAHRLIKRSLMNGTFSLSEALNATELEQEEEALREDEEERDRLLEQHNDVPPYFNKIFNKRLQCRDIGYLRSFTGISHSKDSS
Sbjct: 1 MKGFFFKLLLLLAAFISSCNGIKAHRLIKRSLMNGTFSLSEALNATELEQEEEALREDEEERDRLLEQHNDVPPYFNKIFNKRLQCRDIGYLRSFTGISHSKDSS 105
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of EMLSAG00000000576 vs. GO
Analysis Date: 2014-04-02 ( Blast vs. GO)
Total hits: 0
Match Name | E-value | Identity | Description | |
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BLAST of EMLSAG00000000576 vs. L. salmonis peptides
Analysis Date: 2014-05-10 ( Blastp vs. self)
Total hits: 1
Match Name | E-value | Identity | Description | |
EMLSAP00000000576 | 5.274e-73 | 100.00 | pep:novel supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s1097:7253... | [more] |
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Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1097 | supercontig | LSalAtl2s1097:72539..86425 - |
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Description | augustus-LSalAtl2s1097-processed-gene-0.1 |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Note | Hypothetical protein |
Cross References
External references for this gene
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at LSalAtl2s1097:72539..86425- Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAG00000000576-683342 ID=EMLSAG00000000576-683342|Name=EMLSAG00000000576|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=gene|length=13887bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1097:72539..86425- (Lepeophtheirus salmonis) ATGAAGGGATTTTTTTTCAAACTACTACTACTCCTTGCCGCCTTCATTTC
CTCTTGCAATGGAATCAAAGCACATCGACTTATTAAGAGGTCCTTGATGA
ATGGGACGTTTTCTTTGAGTGAGGCACTTAACGCCACAGAATTGGAGCAA
GAGGAAGAGGCTCTTCGTGAGGATGAGGAGGAAAGGGATCGGCTTCTAGA
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TTTTTTGTATTAAAGAACATTCATATGGATTATACATAAGGGTATATGTG
GCACATAAACATACAAATCACCAAACATATGTTTTTTCCCAAATTGAATC
TAAATTACCTTCATTAAACTAATTATCGTTTGTTTCTATCAACAAATTAC
TCTTTTTAACCCTTTGTAGGCCTTTGTAGAAAATTGCACTTAAGTTAAAG
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TAAATTAAGCCAAATAAAGGTTTTAAACTAGAGATAGCATTCCTGGATAT
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ATGTAATGTATTAACCTTCCTTCTTTTCATTAACTTTTACAGTTTTCTAT
GTATTTCCATTCCTTTCTGTCATGAACAAAAAATGTTCCCTTCATTCATT
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GAATTAATTAATTGTACACTCTGATACCTTTCCACATATGTACATTGGAA
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AACTAATCAATGACTCTCTCCAAATCCCATCAAATCTATTATAAGCTCTA
CTTAGATGTTGGTTTTTGTAGGTTTTTTCTTGTATTTAGACATTCATAAT
CCTTATGATAATTAATTAAAATAATTTCACTTACGTAATTAATTCACCAA
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TTACGATCTGCAGTTTGAATCTTACCCTTATGTGAATTGTAGTTGGCTCA
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ATTGAAAAATCACGGTCGAAAGTCTTCATTTGTATTAATATTAATTTTCT
TTCTTTGTAATCTAGGATTTCTCCGACTTTTGAGTCAGTTTGGAAAGGAA
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ATCCATATTCATTTTCGAGAAAATTCATCCTGGCTTGATTTTGTATTAAT
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AGTGAAAACTAGATTACTCTAAATAATTATTACTCGTACATGTACAGCAC
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GTTATTCTTTTCTTATTTATATCGTAATTCTATCGTATGCTCTATTTATG
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AAATGCTTTAGGAGATATACGTACTCATCAGTCTCTATTTTACTGTGTAT
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AAGGACAGCACATGTCATATGAATTGATATGCTCATAAGTATTGAGTAGT
AATGTGTGAGATTTATCATGAAATARGGAGAGTAACACTGAAGATTTCTT
GGCAAGTTATCTTGTATATTGTTAAATCAAAATTTGTKCTKCCGCCAGTA
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TTTTTGTAATCAAAGCAAAAAAATTATCCACATCTTAACAATTTTCCGGT
GGGCAATCATGCTGGATCGCCATAATACCATAAGTCTCGCTCTCGCCTTC
TTCTCGCCCTTCATAGTAATCCTKTCCCTATTAATTTGATAACAATATTA
AGATTTCTAAAGCAATCCTATTGATATACGCTATTTTACTATGTAGGGCA
AATAATTAAATTACACAACTGCAGATGCAATAAATATTATTAGTTTGAAA
TGTAGTAATTTATATTCACAGAAAGAGAATAAAATAACTTCATTCGAACT
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GGTAGAATAATTTCATTGATATAAAAATATATGTGTTGTTTTAAAGCATC
GACTGAGTTCACTGAATTGATTAAATGATTGGTTTAAAACATTTTCGCAA
AAGAAAGAAAAATATTAACTCCTTTGTGCAATGATTAACTCGTAAATTCT
TTGTAGCTTCTGTACTACATCTTTCTTTGTTAACAGTTGGAATTAACATA
AAATATATTTCCCCCTTATCACCTCTATACATATATATCTCTATGGAATT
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TATAGTTGAGAAGATTTGACTAACTATGTACAAACTGATTTGGGGCTTTT
TCTGCTCCTTTTCCTATCAAAAGTAGGGTGATACATAGAGAGAGGATGCG
TTTATTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAGTCTAGAGATTAGAAAAGGAA
AACGAATGATGCGTTTGTCTTTTCTTCTTTTTGTTCATTATTTAATCTGT
AATGTTATGTTCACATCTCCCTCTACAAGAAGAATTATTGCATATTTTTG
GTGTAAACTGATTTAAAATGCATAATTTTATTAAATACTAGGATGTACAC
GTTTTATGGATTTTATTTCGAATTATTTTATTTATATATACCAAGAAAAA
ATCCGCTTATCCTCTTCACAATTCCCCTTTTTAATGCGTATTCAATATAC
ATACATCCATCTACATATTTCAGTACATAGGATGTACTTGTTTTATATAA
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GATGTACCCGTTTTYTATATTTTATACTTAGAAAAACTTGTTAAGCTATA
ATTTATTATATTTTCTCTGTAATAATGATATTTTAAATGTAAAATATTTT
TATATATATCTTTATAGCAGTAATTCATTTTCTCCATCCAAAATCATTAA
ACAGGCAGCTGATATGAACAAAAGTCTTTCATGTTTACCATATGTCTCTT
TCTCATCTTCTCCTTGCACTCATAAAAAAACCCATTTCTAGWGATACAAT
AAAGGTAGCGAGGTGATGTATATCTATAACATGAAATTCATAGGAAATTC
CAGCTTTACATATATTGTAGAATGCAAAATCCTTAATGCAAAATGATATT
ACAAAAGATTCATCTTCATTCATCATAAAAGCTTATTAAAGAAACACMAC
ACAGTCAAAGTAATCTTGCAATATTGTTAATATTATTATTATAATTATGA
AAAAGGTTGCAATACAAAGTTTGTTAAAAATGAAGGATATCCCTTCATAT
TTAAACTACTAACCTACTACGAGGTTTTTTTTTAAATCCTCAAACTTCAA
AACATTATGTTTGACTATAAATGAACACAAAATATTTTATTATCAGCTAC
ATACCTATATATTTATAATTTATTTACTTTTCTAAACAATTTTTACACAT
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ATTGTAAATTTGTCATACTCGAGTCTTTTTGATCGTTCTGATCGTGAAGC
ATATCTAAAAAACAATTTTGGATCATTGAATTCTTAAATAATTGAACGCC
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CGTTCCTAATGAAATTGTTAAGTTCTCTTCTATTTGTTTAATATCATTCA
TCAATCACCCGTTTGCTTTCAACCAAGGGACATTTTTGAACATAACAAAG
TATKTTCTCTTCAATAATCCTATTTGGAGCTGAGAATTTTGAGTTCAAAT
CAATTTTCTTAACAACATCTGAGCCAAGTCCTGATTTATATGTTAATATT
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AAATGTTTTGGTTATCTTCTTGACCTCCAACTGTTGAGGCACTGCCACCA
GAACCATTAACATCATCACTCTAAGCTTAATCCACAACCGATACCTCAAG
AGCAATTCTAGTTACTATTGGTTTTTACATCTTCGAATTGATCTTCAGAT
AAACATTGCAGTAATTTGAAGGCTTTATTTGATGTAACCCTTKGTGATCC
ATCCTGAGAAATTTAGAAGTAATAAAATATAGGAATCACAAAAACAAAGT
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AGCTTAGTATATTTGTATGAATGAGATGAAATTAATAAGATAAAGAGGAG
TTGAAGAAAATATGAACTTCGGACTGTCATTGTTATAGATGAAAAAAAAA
AAAAGATGAAACAAGATTGAGTGACGTCATCAAAGACGGAAATTTATAAG
TCTTCGGACTGTTATGAAGGATTGAACTGTACCAGACCAAGGATGAACTG
AACGGAACTGTAGTTTTCAGTCTTAAATAAGGACTAACACAACACTACTT
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GCAAGCTTCATCAGTGCATTAACCGAACCCCTTGGTGATTGTAAAAATAA
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AATTTCCCACGAAAACATAATTTAATAAATATTGGTGCAGAAATGTATCA
AATTCCACCCACATCTTCGATCTTACTAAAACAGTTGTCCATCAAGGGAA
AGTTTGCGAAGTTATCATTCTCTGTTTGTCGTTTCTATACAAGTAGGTCT
TTTTAAATGCCTCAAGGTAATCTTCCGCTTCGATGATGTTGACTTCACCG
TCCTGTATTTCTCGATTGAGAGCATAGAAATATCAGCCATGTACGCCAAA
GTGATTTTATTCTACTTCTGATAGTGTCATTTGAACGGATTGTTTTTTCG
ATGGGTAAAAAGCCGAGAACAGGCAGAGTATTCTTTTCATCAAATCTGAC
TCTCTTCCCCTTCAATTCAGCAAGAGTTGTGTTCTTGAATTTCCTATTTC
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TTGCTTATTTAGGCAGTACAAATCATATATTAAGGACGCAGACTCCCATA
CGTTCCTAATATATAGGTGAATCCATATTTTACGTATTCGTCAGACAGCT
TTCTTTTTTTTTTTGCTCGACATAGCTATCAAGAAGGGATTGAAAAATTA
GAAGAAAAAAACAAATGATGTACAATCCCTCCAGCCACAAGTCGACTACT
GAGTGCANATCTGCAGCCCATATAATAAAGCTTAGCAATGTTCCCTGATC
ATCTGCAGCCCATATAATAAAGCTTAGCAATGTTCCCTGATCATCTGCAG
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GTCCGACCGAGCCCCTGGGTTTCAACCGAACCCAGGTTAAGAACCACTGA
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TTTCTCGGTTTCTTTTTGGAGGAAAGGTTGTGTGATACAATAAAGATAAC
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ATTTCAAACGCCCGTAGTAGTACATACTTATTAATGAGTATTGTACATCT
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TGAAAAGCTTTCAGTCACCATCCTTTGATAAAAACCCTGAGAGACAATTA
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TTAAAAAGGGTATTAATTGTTATTTATTAATTAAAAAAATACTGTGTCCA
GTCTCACTCCGACAGTCTCCTTGCACACAAAAGCAAACTAGAATGATTTT
TTATAAATTAAGTGTGGATTACTTTTGAACTCTTTGACAAATTACACATT
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ATTGTTATTTAAGCCGTAAAACACAAAAATTACCATTAAAATCTTCCACC
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ACAATTAGTCAAATAATATCGACTTAATTATAGCTTTAATGCTTATTTAT
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TTGGCCTTTTTTGTAGGGCAAATCTTCTGAAGTTATAATATAAGGTGTCT
TGGATATAATATATATAAATTGAAAGGAATATGAGCTTCTAAATAAGATA
ATTCATTTTACTTTATTTTTGTATGACTAAACACATTTTGTTGGACTTTA
TTGAAAATAACTTAATAAATAATTTATCTTTTAAATGCTGGATTGTTTTA
TCAGTTATTACCTTTGATTTCCATTTAAATAATAATTTCACTTAAAAAAT
ATGGATTTGAATCGAAATTGTAATATGAAATCATGATTTAAAAAAAAACT
TTAAAGGCCAAACCTACCGCTGTTGAAAATTTTAATAGTTATTTTAGTAT
TGTATTTCTTATATTAGCAATAATAAATGTGCRCTTTTGCCGTCAGGTGG
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AATTTATTTAATTGATTAACCATAATGGTTAAAATTGATACTGAGTAGAG
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AATTAATTTCGAAAAAACAAAATCTAACGCCAATAGATATTCAACATATT
CTATAGCTTTATAATATTGTTTTCAGATTATTAATTGCTTTTTCCTTTTT
CATTCTCCAATTTAATTCATTAAATATTACTTAAAATTATGTTTTAGCAC
TGTGAGGTCTCATCGTATTGAAAGATTAGAATATGTAAGTATATAATATT
AGAAAGTACCTCATTATAGAATGTATACATTAGTATTAATAGAATCGTCT
ATCAGTAGAAACGTCGTAAGTTGATAAGTCAAAATGGTGCAGCCGACAAA
TGAAGTGATTTATCCACAAATTAAGGCGAATAAAGCTGGTCAAGTTACAG
TACTTAAGAACTTTAAGGGAGGAGTGGAGTCCTTAAAATTGGAAGAAAGA
ATTGAGGGTTTGAGGAAGAAAATTTAATTCATCATGTTCAAAGTTGAGGA
TGCCTTACAAGAAATGCAGATGATATTCAACTCAGAGATGGAATGGAAAG
AAGAGGAGGCCAAGATTGAGGAGATTATTCTTCAAGAAGTATCTGAAACA
GCCGAGAAATTCAGGCTATCGATCATAAAACTATCCAAAAATTCCATAAA
ACCAAAAAAATTAAAGCCCCCTCTCGTCCAAGAAGTAAAAAAATGCAAAG
ATAAATAACGATTTGAACCCAGAGAGACTCACAAAAGACTCGACACTGGT
TGAAGTTAGATCATGTCGGACAATTAACGAGCTCTACTATTTCACAAATA
AGACGGGGCAAATTAGGAGAACAGAGCAACAGGGATATTAAAAATTTGTA
TGGATTTCAAATTACAAAGTATAATTTCATCCACAACAACTCTAGACACT
CCAATAATATGCATCAGAGGATATTTAGATGAAATATACAACAATTTCTT
CAAGCACCTCCTAACGCGACGGTATGGGTTCTTTAATATCGTCAAAAGCA
GGGAGAAGAGTTTTCAGACTGGCATCTCCATCTTAGACTACAGGGATAAG
AAGCAGAGTTCAACACTATAGATAAAAACTATTTGTACACCCTATGCTTG
ATCAAGGATACAAATAATAGACGTCTACGCTAAGAATTTCTCTGTCAAAG
TGAGCCAACCATGAAAAGCTTATTTAGATAGCCATGACCTGGAAGGTAGC
TTTATCTATGGAATGAAAAATAAAAGACAAAAAAAAAAGTAGATGTTGCA
TCCCTTTATACTTACAAAGATCGACAAAAACAAAAACAAATCAGAATATA
ATTAAGAAACATCATAATCGTCCAGAACATAAACGTAAATGCTATAGATG
TGGCGAGTCAAATACATTACATCGACCTTTTAAATGTCCGGCTAAAAATG
GGACGTGTAAGAAATACAAAAAGAATGGCCATTTAGAGAAAATATGCTTA
AATGAGGCTAAATCTTCAGTGCAGAGCAAGGCCAAGCCAATTAAAACGTC
GACGATCTGAGTGAAAACTTTATCCATCGATTACGTCACTCCAAATATCG
AGGCTGAAGTTTATCAAAGGTCAGGCACACGTTTTATTATGAAAGCTCTG
CTTGATACAGGAGGTACTGAGTCTCTTATTTATCACAACTTGGTATTGGA
GTACAATATCGAAATTGACTCAACTAAAAGACTCTCTGTCACAGCAGCGA
AAAAAAAGCATACTTGAGATGCGTGGGCGCCTTCTGTCTTCGTATCAAAA
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TCCGTAAGGCTGTATTGACTACAGTGGATACCCAAAATATAAAAAGGGAC
GTACCTGGAATGTCAAATGAAATTAAACAGTTAAAATCAAGCTGAAATTC
ATTCCAAGAGCTAGGCATTACCTCTAGAATCATTGCAATAATCTTCAACG
TTAAGGGCCTTTTTAGAAAGGTGAAAGATTTAGGCATTAAACATGAGCTC
GTATCCCCATACTCACCCCCATCAAACGGGCATGGAGAGGGTGCCGTAAA
ATCTATAAAGATTATCCTACAAAAATCTTATAACTGGGCTTTATTTCGTT
CATCACTCCCGGAATAGAGAAATACACCCAGATCTGACAGACTCAGTCCA
ACCCAATGGGTATTTGTCTACTCACAAAGAACTCGGGTTCCAGTATTACC
CATTGTCTACAATTGCCGTTTACCATCCGACTTTGTTATTAGTCATATTT
ATGTTTAATCAGCATATTAATTATTTTTCTCTAATACATGAAATCCTTTT
AATGTTGTTCGTTAATAAAAAAAATTAGAACATTTTTTTTTGTAAAGAAA
ACTTTTTAAAACAGTCTATTTATATTTATACCTCATAACTATTAAGCCCA
AATGTGCCATCACTTTCAAATGCTCATGTTATTTGGATCCTCTGATTTCT
GCAAAAAGTTTTTTTTTGTCTAATGAATAAATAGAAGACAAAACATTGTT
TTCTTTTTTTTTTATGACAATTATTGTAAAAAAAATCAATAATTTTAATC
CACTTTTTATTAGGTCATAATTAAGTTCTTATTGATTGTTTTTGCTAGTT
TTCGCTTTAATAGACTTTCTCATTCAGAAAAAATTTGAGATATTGTAACG
CTTGATACACACGGGTCAATTCTAACGGGTTTTTTTATTCTTATTTATTT
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TAATCTTATAATCTAGCTATAATAAATTTCCTAAAACATACGCGTACACC
TTAATAAAGTTTAAAACTCCTCCAGTGTCGTTATTTTTCCTTGACCTCAG
AGTGTAGAAAATATGTTGTGCCTTTGTAAAAACAGTATTAACTTTTTGAC
TGTCTGTCTCGCTAAAAATGTCAAAAAGTAATCACTTTGGAGCTTGGACA
AGAAAAATGATCTAAAACCAAAAGAATGTCGCAATATATTATAATAAAAA
GAAGGCATTCCCAAAAGATATGATTAGCAGTCTCCATTATTCAGCATTAA
GGGCATTTTCCATGTTCGTCTTTATAAAATTTACGTCCAACCTCCAGGGT
ACCGGATAATTTACAATAAGTAAACCATTTTTCTGCCGATGTTATAAGAT
TGCTATTAAAAGCTCCAATAACTTCATATATATTTTATTTTTCTTCGTTT
CAGATATTCAATAAAAGGCTTCAATGTAGGGATATTGGATATTTACGTTC
CTTCACCGGCATCTCCCATTCTAAAGATAGTTCATAA back to top
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