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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1088 | supercontig | LSalAtl2s1088:53016..73480 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000540 >EMLSAP00000000540 ID=EMLSAP00000000540|Name=EMLSAP00000000540|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=378bp
MFMMTGTNNPALSYQDNESEKDHNVLCSYANNVVSIPSSLAHLRKENESS SSTYSTFIQSALIHFEIIKNIQNGLLSAAQLPHNNYWSNAYHNYYDQQHN QSQQQQINGXGYXASTTNNNGSNPPQGLQYQRNEKLNLESPPTPESILSG EDSNPSSPTNTSLSEERRKSIELSTPVQSHSKVQKIQSRAKEGRECVNCG ATSTPLWRRDGNGHYLCNACGLYYKMNGSNRPLVKPKNSRVSTSKREGTV CSNCKTNQTTLWRRTPSGETVCNACGLYQKLHNTPRPITLKKECIQTRNR KMTTSSTNKSESSXSHPXVYAYNXSHHNRQQDQSQSSTNNTHHNLHLRYQ QQQQQMYHSNNPSQSSLQLATSSSSNFK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1088:53016..73480+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000540-696387 ID=EMLSAT00000000540-696387|Name=EMLSAT00000000540|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=20465bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1088:53016..73480+ (Lepeophtheirus salmonis) CAACAGCCCGCTTCCAGGATACGAAGAAAATACATTGATATTAATAAGTT
AATTTCTGTTGTATGATCTATAAAAATCAAATTATTGATCAAAGTGGTGA
TAATCTCATTATTAGTTCATGATATAAAAGGTGGCATTCTTCATCTTCTT
CCATCATCATCCAACCATCCAGTGAGTCAATCAAAGGACAAACTATTATA
CGAATTTTAGAGACAGAATAACACACTTTTTTCTTCCTGGATCCATGGTG
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TTTTTTTTGTATCTTTTCAAATGATAACTGAATATTTTTTAAAGTGATAA
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CATAATGACATTGCATTCCTTAGTTTGTGAATTAATGTGATACTACCTTT
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GTTGTAAAAAAAAAAACCATTTATTTATTGTCGAAACTCTGCATCTTAAT
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AAGAAAGGTTTTTACGTATGTAGATGATCCACTAGCTCTCCGTTTATTCT
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GTAGTCTGACTGTTGTAATGTTTTTCTTCTTGATGCGTCCTTGCAAAATG
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GTAATAGCGCAAATGTAGAGATATCATTTATTCGATATATTTGACTTCCA
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ACGAGTTTTATAACATCAGTTGAGTACATAAATATATTTATTTAAGTAAG
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AGAGAGTAGAGCGGTCTTGTGGCAAAAAAATAAATCAACTACCTCAAATA
TATTATTTAATACAAAATAATATAAGCAAAGATGGAATACTTGTCTTAAT
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TCTAAAATGGGCTCTCTTAGGCCTTGAATCCCCATCCTTCCTCAATCAAT
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AGTTGCAAATTATTCTTCCTAAAATGCAATTTTTAATAAAAACACTACCG
ACCATTTTAATTAACAGCTACTTATTGATGAATTGTATTAGTAAACTTAC
TCATTTAGTATCTATTTACGAGTATGTGATATAAATCTATGGATTTGAAC
TTTATAATGTCCCACATATTACTCGTCAATTAATTATTTTTATAAGAAAA
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ATCATTGTATTATCTTTGCCACAAGTACTCAAAATCTTCATCTCATTTTT
TCAATATTACTTTTGCATACATACAATCTGATTATTCAAATTAAAACGTG
TACACGAGATATTGTATCAGGAGTGGAGTTATGATTGGTGGGACTAGACC
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TTAACCTAGGGGGACATCTTTGTGTTGTCTTTGTACTAGGGCGCCCTTAG
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CTCTTTTACATAGACATATTGCTCTCTTTTTAGCGTATTTTGGGGTGTCC
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TAAAACTGACACTGATTGAATTTTTTTGGGTGAAATTAATTAACATTTGA
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TGAAATAAGTGAGATACGACAACTGTATAGCTATATTTGGAATAAATAAA
TAAATATGCACTTATAAAAATGATATTTAGATGTGAATATCAAGCAGAAA
AGTTTTTGTTATGAAAATGTCAGGAAGGAATAGTTAAATATAACTTATTC
AATTTTAAGACATTTTCTAACTATTAACTCCCTTTTATTGCATAGTTTCT
TCTCACCATCACAGAACACACTCGATTCTGACTTCACAATTAGGACTATT
TGGTGTACAAGAATAGCCACTAGGGTGCCCTCTATCCAGTCAAAACCTGA
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ATTTTGCTCGAACATTAATCACTAGGTTAACACAAATTTGAGATTTTTGT
TGTGTTTTGCCTCTAATATAAGGTTTAAAGTGTTACACTTTAACACTCCA
GTACAAATATTATKCTCCATCTATATAATARCGGCCCTTSCTGCCATAAC
TTTGGAAGATTATGGATTAGTTTGTCTCTGTGCGTCATTCCAAAGCTATA
ATCCAAGTGGCCAAATGTGTCTGCTTAGCAGCGTCTGCATTATTTTTTTT
CAGGGGGGGTTCTAATTTTTTCCCGATAAAATGTAAGGCAGAGCCTTAAT
TTTAACAAAGGACATTATTATTTTTTTTACCGGTTAGCCATTTGAAATTT
TTCTGTCAAAGTGAGAATTCAATAGGATGAATTTCCTTGCTTCCTACTAA
CACACCTGCTGTTAACTTGACTAGTTTTCTTGGCTTATTGAAATCTTTTT
TTCTTCACAAAATGTCATTTTTGATGATACCACAGATGACGTTACTTTAT
CGTTTTCCATCATGACTTACGCAATTTTTTCTTCCTTTTGCAGAATTTAC
CTTGTGAATTCACTCTTTCAGTTAATTATTCACTAATATTCAACGCCTCT
AGCGGACAAANTAAAAATATTGCAGAGACCACTACTTTATACAAATACTG
ATGACGTTGTTTTTTGTTTCGTTGCATTATTTTTAGGTTTAGACTATCCT
ACAATTATCATAATGTTCCGTCAGGGATGCCACTCATAATTTTATAATAT
CCCTAGATATCCCTCTAAAAATCTCAAGAATCAACACTGAAATCCCATGA
AAATAATAATAGTTTACAGAATATTAATATAATTTGGTACTGTCCTTGAA
TCAATTATAATTTATCATATTCATCTTCCTTCAATATATCTGCTGATAAG
AGTAAATAATCAGTTTAGGTATGTGTTTGAGCCTATCGTTGATGAATATT
CCCTTTTTGTAATTTTCCTTATTAAGGAGGCTTGCCAGTTCGAACATGTT
CCACCGTTCTTTTTATTATATTATTTAGCTGCACTTAAAATCAAACGAAA
CGAGAACGAGATAATTAATATAATCAACCGAAAGTAATCAACTATTGTTA
CTTGTATCTATAAAATCAGTTGATTTTATAGATACAAATTAGCCCTAACG
TATTGTCAATATTCCAAGGAGTGATATCTCTGGTTCCGTCCCCATCCAAT
TTAGAAAATCCTACCTCTGTCCCTGGATGCATGAATAACCATGTATTATT
ATAACTATACTTCTTTAAATCTGGATTGCTATTTCTAGTTCGGTAAATTA
ATGAATGTATAATCGTACAAACTAATACTCAAACAATCGTATCTTATCAG
TAGGAAAATGTACTTGAAGCATATTTTGTATACTATTAAGTTATATATAC
ATAGAGATAAACGCTGATAGATAGGGGATCTATATGTCGAGATGTACTCA
GAAGCATAGGATTATAATCATACAATAACTATTTATTAATTATTGGTTAG
ATCCTGGAACGTTAGCAGGATTTTCAGTTGTATTTCTCGTTTGTTACGAG
GGGGTTATATGGTTACTGAAGAGACTGTAGAGTCACGTTTTAATCTTGTC
ATTTCTATGATATGATAATCATTACTCCGTGTTTTAATTATAAACACCAA
TACTAATTAATATATGTTGTAGATAAATACATTGATATATCAAATGCTTA
TCTATAAATGAGCCTATTACTCTTATATAACATATTAAAGAAAATGTAGA
ACAAGTACTACAAGAATTGAACTTCTTTTTTATTCTCAAGGATAGGCTAT
TCGAACAACTACTTATTATCAAATTTTAACTTGTTAAATATCATTATCAA
ATATGAATAGTATCATTATCAAATATGAATAACATATTAATAATATTTAA
AGTGGCATTAGGTAGATTTAAAAAACACACTTGATATATACGTATAAAAA
ATATATTTAAAGAAAAAGAAGTCTAAATCAAATGTATCAACTGCTTAGTT
TTTACAATAATTATAATTTACAATGTTTTCAGACCCATAACTAGACCTAC
TTTTCTTCTAAAGGTTAACATTTTTTTTTCTTGAAATTTTTTAAAAACCT
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AAAAAACTAACAATTTATTTAACATCTAAGTTATTATTCCACTCACCGAT
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AGTTCATAAAAGCTATTGCTAGAGGAATTTACTCTACATTTTTTAAATTT
GCATTTAATAATAAGTTTATATACTTATATATGTATATCCAAAAGTTCCT
CCTCCAACAGCTGATATGAAATGATTCAATAAGAGCGCCCTCAAACGATC
TATATTAATCTATGATCACACACCTTAGTAGTATTCACAGGTCTGGAGGG
AGTCAGATTTATAAATAAACGAGTTTTAAGCACAGTTGGGGCGGCGGKTT
AACGTCCGGAAAAACTTTTAAACGATAATTGTAATGACTCTAAACATTCT
GAAATGTGAAAATCTAAGCTCAAATCAAATTTTATATCACAAGAAAATAA
TTCTACGAATTAATTTGAATTTTTTGACATAAATTGGACTTCCTCTTACT
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GTTGTTATTCTCGTACATCAAAGAGKTCCTACAATTTGAAATGTGCTTAC
GATTCGGAGGTTTTAGTAGAATAAAGTTTAAAACTATATTTATATTTAAG
CAGAGGTGTTGCTAATTTTCATCATTTGGGGGGGACTAGGCCCCAAAAAT
GTTCAACACCGTCATACTTTTATAAATAGGTTTGTTTTAAATATATGATT
AACATTTTGTGGGAGCTTTTAGAAACTTTTTTCGGGGACTTGAGCCACCC
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TAACCAGTGTTACTTTCGTTTTGTTTTGTCATATTTAATACCGTCTTTTT
CGGATTTAGCTTCGTATTTATTTCGTCAAGAAAATATTTTTTTTTTAAAC
CGACTCAACATTTAAAACAAAATACTACGTTTCTTCTCGTCATCCTCATA
CAAATAACATTCGTTAACACTGGGCATAAGCATTGTTTTGTGTGGACACG
ATTCCCAAATGCCCCCTCAATTAGGAAATTGAAAGCTTTTGTATAGGTGA
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ATCAGAAACTTGTAGCAATGATAAATAGAGTAATTCTGCAGTTTTCACTC
TCTTTTTTTTGCCTAATCAGGGTTTCCTCTCACTAATAAGTCGTCTATGT
ATGAATTATTATTTATTCGTATCAGTCTGAGTCACATACTACGTCCTTTC
AAATCATTTTTTAAAATAATATTTACTCTCTCTAAATATACACATACATC
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TGGTGGCGTTGTTGACAAAGATAGTTTGCTATAATACATAACATAACATA
TGAATGTATGTATGGGGATAGATAGGAAATTCTAGATAAGATTTCTAACT
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ATGATTATATTTATTGTTTTCATGTTGAGATTTTTACTTCTATACTTAGA
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AGTTCAAAAATTCATAGCTATTTACAAAATATTAAACTTTTTTGATAATA
TTCCAAAATCCATAGCTGTTCAGAGAAAAGTTAATTTTTATGGAAATAAA
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TTGTCAGGTATAAAATATTTAAAAAAAAAATCAAAAATGACATTTTTTGG
AGAAAAATTTCCAAAATCCACAGTTTTTTTACAAAGAAATAAAATTTTTA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCCCCCCCCCCCGGGGATNSCCACTATWT
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GGCCTTCAATGAGTCCAAATTCGGGTGGCGAGTAGCACAGGCCTTCTTCT
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TGATAATCTCCTTGACAGACCTACCGGCGCGGAGGAGAGTGTCAACCATA
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GATAATTTTTGGGGCCAAGCCATCTTAAATGAACTAACCATTTGTTACAA
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TATATTTATTGTATATTTAATGCCCATGTTCTTGGATATAAAACAAGCAT
AAACATTTTGCGCCAAGAAAAGAAGTAAATTTTTAAATACCATTTCTTAT
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TTGTCGGCATGTTAGGATCGTGTAAGATATCTACAGACTTATTTATTACA
TAGATAGGTACATAATATAATATAAAAGGTCGTATAAGAAATGAGTATTA
CTCATGTTACACGTTGGGGAATGTGTAATGACAAGACATTATTTGCAAAA
TAGAAACGTATAATAATAATATCTCACTTTTTTTTTGCCTCTTTGTTTTT
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TATAATTTGTGATTTTGTACAAGTTGTAACTTGTACAAAATAAATGGGAC
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GTACTTGGGATGAGGATAATGCAATAATTGAACATTCCATGGATGATCGA
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AACCTAGTATCATATGGCATACTATAAAGTTCAAATGCCCACAGTTATAT
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AAATGATAGTTGGCATTATAATAATGGATTTTAAGAGAAAGAAGGTGCAA
CTTGTACAATTTTCTTATACAAGTTGAAACATGTACACATCCTACATAGA
TACAGCTCAATATTTTATATACATATTTTGATCAATTATAGGCTTTGTAG
TCAAATTTATGGGATGTGGTGGGATACCCCAGAATATAGACTACCTTTTA
GAACCAGGGTTGTTTAGAGGGGCAATGGGGATCATTTGTCCCGAACCGTA
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ATAGATATTATATACAAAAAAGGTCATTTAAAAAAAATACGCATACAAAT
TTTCTAAAAATAAAGATTTTTCGCCTATTTTCTATTACAAAAATTACTAC
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TGTCGTAGGCAATGATTTGGTCTTCCATATATAATCAAGACCCCCTCCCC
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GAAAATCAATTTGATATTTAATTCTTAAATTGTGATGTTACATTTTTGCA
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GATGACGGCTGACATCATTTATAGTTTCTATTGACGTAAATTAATTAGTT
ATATATGTATCACATAAAGACTATTCTTCCCCCATTATTCTCTTTCTTCC
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AATAGAAATGATAAAAATCAAACTAAAAATATTTCTCCTTGTTATTTCAT
TTTAAACCACCCATTGAAATACGTACATAGATAAAAATCCTTTCATAAAA
AAATAAATATAACCATCAATAAATAAATAAACACGGAACATTAATAGAAT
AATTAACAACAAAACCTATATACTTATTAAATAATCTAGAACAAAAATTA
TGAAAATTCCAATATATTTTTTTACTAGGAAAATTCAATTTTCTAGTAAA
AAGCAAACATTCCTTAATTACGGGCTKCAGCCTCTCCCTCCAACCCCCTA
CAGACACCCCTGTCCCAATATTCCATTGTTATATTTGAGTCAATTATAGC
TTTTGTATTCAAATTTTAGGAATAGTTTAGATATCTATGAATTTTAGCTA
TAGTTTTGGAGTTTAATTTGATTTAAGAGACTTATATACGCCCTGATATT
ACCTTGCTATAATATAATATTATAATAGGTGTTTGTTTGTATATTTGTCC
GCTAATTAAAAGGCATGCCCAGGATATTTATTTCAAAAACGGACACAATT
ACAGCCTTTATACATAAATTAAAACTTGTTTTGAGTTGCGAACTTAAGAT
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TTCGCTTGTAAGTTGTTTTTTTTGTCATAAAAAAAGATTGATTCACCGTG
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AAATTCAAAAAACGAACATATATTAAATACGAATAAAAAAGGGAATTATG
AAGAGGATTAGGGATTTTGTCTTAGTATGTTACTAAAAAAAATATATAAA
ACGGGTTCATCGTAGTATATATATACTATTATACAATATTATTCATCAAA
TTATTTTTCTCAGCCTTGTCAATCTCTTATTAGCCATTTTTATGAAGAAA
AAAAAATGTAAGATTCTTATCTTATTTAACTATTTTTGCCACTTTATTTT
TTTGCACTTTCCCCCCCCCCCCCTCCATCATTTTATTTATAGTGAATATA
TATATAAAGTTTCCTTAATTGAATACATGCATAATTTCATTAGTCTGTTT
GACAGTGCAAATTGCTTTAAAAGGTATTTAAAGGCCCAAAAATTAAATAA
GAAGTTTTGTTTTATCTGACAAATCATCAAAAAAAAAATATATATATATA
TATATTGGTATAGAAAAAGAAAGAGATTTTGAGTAATTAATGTCACAAAA
GATTGGATTTCCAAAACAAAAATCTGCTAAGAAGTATAAATTGATTGCAC
AATCACACCTAATTACCATTATTGCCTTTTTCTCTTTTTCTTAATTAAAT
CAATCTCCTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCC
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CTTGACTCTGATTGTCAAGTGGGATCGTTGAGATAGCGTACTGAAACTAA
GAGTGATAAGTTTTTTTGTATATATCACTTATATTATGTTGGAGAAAAAG
TAGTTTCGTATTTTTTGCATTATTTCAATACTTTACAAAGGGGCATTACA
ATCATCTGATTTCAGCCAAGTATGCTCCGTTCTGGCTTATAACTTTTTGA
TTAATTGTTGCCAATGAGATTCCAACTTCATAATGCCCTTTTCGTAGAAG
CTCTTGCCCCTATTGGCAAAAAAAACAACAACAAAACACTTGGATAACCA
ATTTTCACAGGCCTCTATTGAGGCCAAATTTGCACCCCCAAGTACTTAGC
CATAGACAAGAATAGATAGTAGTCAATTGGTGCGAGCTCCCGGAGCTTCT
GACGTGTCATTGAAGATGTGTGCGGCCTGGTGTTGTTTTGAAGAAATACG
ATTCCTCTACCATTGGAGTTTCTTTTTGTATCCAGCCTTCTTCAAATGGT
TCAAAACGATTTGATGATCGATACTCAGCTCCTGGGCGATGCTACAACTA
CTTACATCATGGTCTATCTCGAAATTTTCCATAATTTTATCGACATTTTC
GACAACAATCCTTCCAGTGCAGGGTGCCTCATTCKCCTCCACTACGCCAG
AACGAAATCACTCAAACCCCTGTTGTGCAATACGAACCGAAAGAGTATCG
GCCCCGTATACATCACAAATTTTCTTGGTTGCTTTCGACGCGTTTTTCTC
TTTTAGGTAGTACAAATGTAAAATATGATATGAATTATATCCATAGGGTA
TGGAGGTCTCTCCATACTTGACATATGATAATTCACTACTGAACCAGCCA
AGTGTAATACTATGCAAAAGTGTTTGTAGTATATACTCACAACTTAAAAA
TGGTTATTCGTATTATCTAATGTGACCAATCATGAACAAGATATACTTAG
TTCAAAATGGGCGGGAAATACGAAATTATTTTTTCTCAACCTATTATGTT
TGTGGTGAGTACACACTAAAACAATCTGTAAAAAAATCAGGAAAAGTTTA
AACAACTTCAAAGTCCCAATTAATTAATTGTGTTCATTTTTGATAATTTA
AATGCCGTTTGCGACGTCTCCAAAGGGTTATATGTCAGAATAATTTGTTC
ATAAAAATTAAGGATAATTATTCTTAAAAGAATATAAATGTTCAGTTTTG
ATAAAAATCCTGTTTGCTTGCTTTTGTATTGAGGATCCCCATTTCAAGAG
TTTTTAACCCGACCCCATGCAAATGTTTGGATCAGAACTGTATGATCATT
TTTGTAATTATAATCCTTGCTGATTTTTAAGAACAAAAATGTTGGTTTTT
TTTTGAAAATCGTAAGATTTTTTTATTTTTAATAGAGATGATTGTTTTTG
ATTTTTGAGCTTCTGGTTAGCAATGGAAATATTATTTGAAGNNNNNNNNN
NNNNNNNNNTTGCTGAGGTGATTAAACAAAAATGATTTTCTCTTAATCGT
ATCATCTCTAAAATTAGAATGTTAACTTTTGGAAAACGCATCTTTTTACC
TCTTCTTTGATGAGGCAATTTATTTGCAACACTGGAAGATGGTCCTAAGG
TAACAATTACCCTTTAACCTCATGTTTAATGATCTACTGATCAAATGTTT
TTTGCCCAAGAAATGGTTAAACTCCTCAATTCGAAGTTTTCAGTATGTAT
CAAATATGATACACGTGACATTTGCGGGTTAAACTAATTTTATTGTTTGT
TTTTAGTTTCTTTGTTGAACTGATTATTTAGTGATTGTTTGTTTTGGTTT
CAAATTCACATTCACGAGTTTTCATGTATTTCACTTTCATAGTCAACTCC
ATTCTATCGTTTTTGTTTAATTTTTTTAAAATATAACTATGTAGATTGTA
CATAGTTATATTAAAAATAGATCAATGACATAATTTCATTAATTAATTTA
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GATCCTTTGTTGCATGTCTCACAACAATATGTATATATGAGTAATTATTA
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