EMLSAT00000000970, EMLSAT00000000970-696817 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000970
Unique NameEMLSAT00000000970-696817
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s116supercontigLSalAtl2s116:1272125..1287544 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000970 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000970EMLSAG00000000970-683736Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000004296EMLSAE00000004296-713224Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004297EMLSAE00000004297-713225Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004298EMLSAE00000004298-713226Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780585auto780585Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000970EMLSAP00000000970Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000970

>EMLSAP00000000970 ID=EMLSAP00000000970|Name=EMLSAP00000000970|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=306bp
MSSSTNTSSSTNSKAEAKTGSSATAKKKTSSSSYGCRPMRLRVVMTGGEK
TGKSCIIKRYCEKRFVDKIYVDKKEISVHIFDTSGSNLFRDVRNEFYRDA
HGILLVFDVTNRRSFDELSGYIKDVAIELAKDGRTMDNTVVLVCGNKSDL
KEIRMIDETEAKLWAELRGFDYAETSALNGDGIADLFRSFFXLVLKSTES
SRKTPVAMRKSVSKAPSQHRHSLPIKPSPSPDQLIVIDRLKSSIDPWCQM
GLDRSTPYSPEEINKTYRKLAVMLHPDKTEVDGADEAFKILGSARKAIMR
ASFVKP
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mRNA from alignment at LSalAtl2s116:1272125..1287544-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000970-696817 ID=EMLSAT00000000970-696817|Name=EMLSAT00000000970|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15420bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s116:1272125..1287544- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTCTTCATCTACAAATACAAGCAGTAGTACTAACAGCAAGGCTGAAGC TAAAACAGGATCATCCGCGACGGCCAAGAAAAAAACTTCCAGCTCTTCCT ATGGATGTAGGCCAATGCGACTCCGTGTTGTAATGACCGGAGGGGAGAAA ACAGGGAAATCGTGTATTATCAAGAGATATTGTGAAAAGAGATTTGTGGA TAAGTATGTTCCTACGATCGGGATCGACTATGGGGCTACACGGTAAGAGT ATTTTCTTTTCATTCTTCAAATACTTATATTTTGATTATCACCCCATAAT TTAATTAACATTTTTAGAGCTTTAAATACAAGCATTTATTTAGCGTGCTA ATTTTTTTTTTCTAGTTGCAAATGTGTTTTTTTTTTTTTGTTTCTAAGGC TGTTWTTTCATTCTTGAGGAAAGACTATCAAAGTATAAAGTGTAGCCGCT GTTATTAGATTAGTCTAAAAACTAAAAGGACTATCAGTCCGGACCTAATA TAATTTCTCAGTCTTAGAACTGATCTTTACCATTCTTTTATGGTAAATAC AACAGCTCAAAGGGCGTATTTACTAACTATGTCCTTAGAGCCGTTCAACA TAACCAAAGAGAACAGATACCTGAAGTTTAAAGGAGGAAGTGTGTGGCTA GAATTTATTATTATAGGTTTCTAGCTATCACTCATAATTTTCTTGGTTTT TATATTCTCCAATCCTAGCTAGGAGGGAAGAAAATAAAAGGATAGCTAGG ACCTTTATCGGTATTTAAGATGGAGCGATCAAAAAAGTAATAATAGCGGG AAAATGATTAGGAAATCAGTCCTAGGACCACTCCAACATTACTTACCACG AGTTGATTTGCTCATAAATGACGGAAAGTAACGTTGAGGATTTGTTGAGG AGTGATAAGTTCCTATTGGTCTCAGAGTAGACTTGAGAATAAAATAATAC AGAGTAATTCCTATCAATGCCCTTGTTTGATACGGAGTGGGACTTGTAAT TATATCCTTCATGTAAAAGCTGCTTGTAGCTAATCTAATGAAATGTAAGT TACTTTTCTCCGAAACATTCTTCAAATTGTCAGGATTACATCGTTCATTT TCGGTTTCTTTATTTTTACATATCGAAAATGATTACAATTTACAACCCTA AGCCATATTTCTTTATATTAAGGGTCATATAGGCCTATAAAATGTATAAA TATATCATTACAATAGGATACATTGTTGAAATAGTTTCATGTTATTTTAA ATGATAAATGATAATTAGCATGAATTATCCCAACGTAATGAATTTCAAAA TGGAAACTGATTTTGTTTAAATGTAGTAAATAATAGTCTTAATTCCTTGT ATAATTATCGGCCTACTTTGTTGTTTTACTCAGCACTTATTTATCAATCA AATTGTCACCATTTCGATTCCCCATCACTTCAATTTCTTTCATTACCGAG TGGTGGTTCATTGAAATCTGAACACTTAATAATTTAATTATAAATGAAAG TTGAGTGATTGAAATTAGTTCATATTTCAATATATTAAAGCATAAACAAT TAGTTACAAAATATTACAAACCTGAGCTCTCTAGCTTACGTTCAAGTCAA GACAATGACACTTGAACGTTAACGGCGAATATCAATTCGCGCACTCCAAG CAGTTGAGCTTCTCAAGGACACCTGTCAACGCCGTCAGCAAGTCCGAAAC ATTGGAGAGGAAGAAGGTTTCTCTCAAAAAGGCCAAACTGGATACGGAAG AGCTAAAGATAMCAGCCGGGGATAATCCCCTTCAGTCCCTGATGGCACAT GAAAGAGATATCGGGGTATCACACCAGATTGTCCAGAGGTCTATCAAAAA AGTTGGTGGAAAGACTACTTTTGACACCAGCAATGAAAGAATCCCATCTT CTCTGTTGCAAGACTCTTTTAAATAAGCTTTTTAGTTCTTTTGAACTCTT TTTTGACACTTTTGGTCCCCCAATCCACTCTACTATAACTTTTGGTTGCA TGTCAAGGGGAAGGCCTGCTATCTCCGTCATCCAAACACCGAGTCCCATA AAGTCACTGTCACCTATCACTAGGACGGAATGACGGATGACTACATTTAA AACGAATACCAGGCCTTCTGCCGCCGCCTGGAAGTCATGATTGCCGCTAA GGATGGCTACATTAATGATTAAGAGATCTCAGATACACATCTATCAATTT AGCTCTAGGATATTACCTCCCGGGCAGTTTCGCCCAGTAGAAGTTTTGCC CTCATACATATATTATAGAGTAAATGTATCTCCTACGCATAATATAAGAT TTAAAAATAGTCTCCCCCCCCCCAATTGAAGGGATTTCTAATGCATTTTT GCATTCAGAATTGTAAAATGAGGGCATTTAATTAAATTTTAATATAGAAC ATATCAAACGGTTTGAATTCTTTATAATAAGAAACAAAAATTATTCCATA TTAATTACTCAAATGCCATAATTTCATAATTAAATACTATGTATTTCAAG TAAAGGAAGACCTTAAATTATATAAGGAAGATATATTCATACTATAATAT ATGTATGAGGACGAAACTTCACAGGGCAGAACTTCCCAGGGCGAAACTTC AAAAGGCGTAACTTCCGGTCACGTATTTATAGTATTAATTTTGTTGAAAT TATATCTTGTTGAAGTTTAAAATTATAAGTCTGCAAAATTTTAATCAACT ACTCGGTATTTCCTTTTTGAGGATCACAAACATTCAACATATGTCTACAT ATTTTTTGTGCTCATCAATTCACCTTAGGATTGCTAAGAATTCAATTTTA AATGAAAAGGTATTTCTTTGTGTAGGTAGGTTAATTTTGGATTAAGTTTT TTTTTTTTTGATAACGAATGACATCATAGGTACAAACAGTATTTGCCTTC CGCATACTCATGTAATGAATCAAAGACAAAAAAAGAATTGAAGTTTATTA GTGTTTATTTTGCAAAACTTACACAGAAACTAAAAAAATTATTTGACATT TTTAAATTCTACAATATTAACAAACATTTTTCCAAATTGTCAATTATATT TATCCGGTATTCGAAAATCTTGAATAGAGTTGGAAGAGAATGCGAGGTTG TAAGATCTCAAACTTTCATGTCACATGTTTTATTGTCTTCGATTTTGAAT TACAAATTTTGTATTTTGAACAAAGGATTTTCAAGCCTTTAAATCACTTT TATATATATCTCTCAGACACTTCCACAGGATTATATATATATGTTGAAGT TTGATTTGATCTTATTTGATATTATTATTATTAATCTAGAATATAATCAG TAGATATTTGAAGATCAATATAATTATATAAAATAATTTACATTGGCGAC CCCGATGTGATTCAAAAAATGTCCTGAAAGCAAACTTTACCACCTGTGTC TCCCCAAAAACAAGCTTTGTCGATTTAATCGGAAGAGGCAAATTTATTAA TGGCCACCGCGGAACTGTGCCTTCCTAGGTTCTATTCTTCGGATGTTGAG AACTGGTTCCGGAGAATTATGCTTGATTTTGAATTGAGTGGGATTTGTCA TACCAAAGTTAAATGTATCTTATGGTGTCAACATTGCCGGGTGAGGTGTT CAATATTATTCCTATTAGTGAAGAGAATCTCACTTTTGAGGGAGCGAAGA AATCCATATTAGCCCAATATGGGCTACCATCTTCCACCAGGATAAACAGA TTCGTCGACATGATGGCTTATACTTCGGGGCTCTCAAGCATGGAGGTCAA AGATGATGTTGAATGTCTTCTGGATTCTGATATCTAAAGGATTTATGTGA AAGTTTGATTGAGAGGCACTAATAACGAATGCTCAAAAGGAACAACATGG ATATTTGAGAGCACAATCAATACTTATGACTAAGAATTGAGCAGATATGT GTACGGCAGCGAAGGAAGTTACAAACACTTCTATTTCTACTGTCGAGAAT CACTCTTCTTCTCCAACTGTCGCACTTTTGATAAAAAGAGATCTAGTCGA GCTTTTTTGAAGTACTCAACAACTGCAAAATTTAAAAAAAGTATGTTATT ATCATTCAAAATTTGGATTGGATGCAACTGTGTGCTCTGGTCCTGATTGT CATTTTAATTCATTGATTTAAAAAATTAAATTGTCCTCGGTTGCATGGCT ACTCAACTTTCATTCTGTGACAACTTGTTACGTTTAACCCTTAAATTAGA TGCGTCTGATACTGAAATGGGAACTGTTTTGAGAACTGTAGCAGAGTTTA ATTGCATAATTGAACATGTTAGAGGAAAATTAAACCACACTACGGATATT CTTTAAAGAAACATAACCAAGATCTACTTAAGTCCCAATTTTCCTTAAGA TGTCATTGACGATCAAAGACTCCATGATCCTAAATTGTTAAATTTAAAGT TAAACCTTATCTCAAGTGTGTTTCAGGAACTTTACTTGCATACTTTTTTT GTGTCGTAGTGTCCTCTCCAGAACTTCGCCGACGAATTATTCATTMAAGC CACAAAGATAATCATCTTGAATTTCTACACTTGAGCTAAATTACATTTTC ATGTTGAAAAATTCATTGAAGAATGCATTTCATGTCAACAAACGAAGCTT TTCTGAACATCCGAGCCCACTTCCCCCTTCGATCCACCATCAGCGATACT TGGTTTCATCCACGTTGATATAATTGTCCCGTTCACACTCGTCAAAGGAA AGCACTATACCTTGAATATAATTAAGTGGTATACAAGGTGGCCGGAAGTG ATCCCAATTCCAAATATCCCTGCTAGTACTATGGGGGCGGGGGGCTTGGT TTTTGGAGATTTAAAAAAAAAAATCCATGGCTTTTCACAGTAAATTTATT TTAAGAAAAAAAATGATGAAAAATTGAATATTTTGGAAAAAAATGGTAAC AACTTCTCCTCCGTTTGTTTCTTGCCAGCGTTCACAAGTGCACGGACTAA AATTCGTTGGTCATGTTCAGATGGTATTTTCCGGGCTTCTAAGACACTAA GGAAGATGTTTGTTTTAAGTACTTGACCGGGACTATTTTACCACATTCAC AAAAACCTTGATTTATGTAGCTAAAATGAAGTATAGAGATTTTTTCGCCG TTCCCGGTATATTATTAAAGTAAAATGTGTATGTTTCGCCTAATAACTCC GGGCAATACCGGATACTACAGCTAGTTTATTAATAAGACTCTATGACAGT TCATGTACAGAAAATCAACATTCTATTAATGTAATTTCTACAAATTTGAA TGAAGGTGAATACTCATTCTAAAAATGGGGTGGTAAATTATATAAGTTTA TCTAATACAAATTGAGGTCAAAGAGCGTGTGTGTTCTTCATTACTACTCC TTAAGACATGCATAGCATACGATATATACATATGTAACTACTACGATTTC TAATGTCTTGGGGAATTGTCTTTTAGTGAGATAACGGAAAATTGCCTATT TTCAAATTACAGGATCCCAGGAAATATCAGAATCCCGTTGGTGAACAATA TATATACTCTAAAATGCAAGTATTTTCAATTATATTAGTTTGGGTAAAAA AGTAATTTCGTATTTCCCGCTTCTTTTTCTTTTTAATTTTTTAAGTATAT CTTGTTCATTATTGGGTACATCGAATCATACGATAAGGCGTTGTAAAGGT GTGAGTATATACTGCAAACGCTTTTTGAATATCATTGCGCAAGGATTAAG 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TGAAGTGTTTTTTTTATTGTTTTCCTGCCTAATGATGGAAAGGCTTTGCA TCTCCATTTTTCGAGCAAACTGCTGTGTAATCCAACCAGTACCCAATTTT TCTCTTTATATTTCATACCACTTTAGAAAAATGAGCAATTTTCAAGACAA ATAATGCAAGAAGAGCAATTTCTTGAGTAATGAAGCGATTGCTCACAAAT CCTAAGTCTATTTACAAATGATATCTTGTTGAAGTTTAAAATTCAAAGTC TTCAGATTGTAATGGACCACTTGATATTAAAATGAAGCTTATATTATGAA ATAGTTCAATCCAGGATTATCCAAGAATATAAAAAGAGGTAAAACCCCGA GAAATCTCGTAAAAACGAGATCCTGGGAGAGAAACCTACTAGCTACGTAC ATAAATAGTAAAAAGATGAACTGTTGAAGTTTGGAATTTGACAATGAGAT GATCTAACATAATAAATGCGTTGAAATAAGGAAGCTATAATAATGACCAT ATTTTTTAAAAATAACTTATCCGTTCCGCCTTTGTTTATCAAAATAGCAA CAATTACGTATTGCTTAGTTAAAATTAGCCTGATCCTAAAAACATCATTT ACATATATTATTATTTAACTAATTAAAATATACAGTTTCCGCTCACTAAC GATAGTTTGCCAAATAGCAAGGCTGTTGAAAGCTTTCAAACATATTTTTT CCAGACAAGTTCGCCTTAATCTATAGATACTTATCTCTTGAGTGTGAATA TACGTATATACAAGGTTGATCTTATCCAGTGGTACATGTACATTTTAAAA TTGTAGATTTTTCATGAGTAAAATTTAAACGAGAGGTTTTGTGAGGGCAT TTATTTGACAAATAATATTTTTAATTGAGTCGAAACTTTAAAAAAAGGAA TCTTGAGTCACAAAACCTATCTTTCACCAAGTTTGAAGACAATGGAAGAA TAAATATCCAATTTATAAAAATCTAAATTAAGTGTGCTACCAGATAAGAT CAACCCTGTATATATAATTCTTTCAGCTTGAGTGAGACATATCTTCAGAA CACAAAATCTAACCGGAACCATGATCTTGGGAATTGTGACCAGCACAGGT GAAGTCTGCCCTTCCATTTTTGTGGAGAGGAAAGAGAGGCTCGATGCAGA TGTTTACATCGAACTTCTGGACAATAAAATGCTACTTTGGCCCAGAGAAT AGTGAGGGGACAACTTTGTTTCCACTCAACAAGGAGCTCCGTGTCATTGC CCCACTAAAATTCAGGCCTTCCTGAGAGACAACTTTCCAGACTTTTGGGT CCTCAACATGTTGCCGCCCTCCTCTCCGGACGTGAACTCCTTGGACTACT CTATCAAGGCGCCTATGGAGGAGATGTTGTGTGCTACTCCTCACGAGAGT GTACAGTCTCTAGAGGCTTCAATAAAGAAGGAAAAGGACCAAGCTCGAGK CTGCAAGGAATTTAGGTCTCGTTTTGAGGCAACTATTAGAGTTGAGGACT CACATATTGAATAAAAGCTGTGCAGAGTACTATTTTCAAATGAATTTGTT ACATAAATGTTCTGATAAAACCTCTCGTTCAAATTTTACTTCAAAAAAAT TAAAAATAACAAAATATGTACCATTGTATAAGACCAACCCTGTATACAAA GATAAAAAATATATTATTGTTTAGAATATGAGGTCTTTTTAAATTAAATT CTGATACTTTTTGACGTCATGTTTCCACCTTGATATTTTTCAATTTAAAA TGATTTATTGCACTCATTTTTGAACGAAGTGTGGGATATTGGTTGACTTA ATCCCTACCCTTATAAATTTAAACAAATCTCTCTGCACAAGGATAGTTGT CTACCTTCCATCAATTAAAAATATCCATTTTTCAATGGTTGAGCTTTTTC AAGAGCCCACTTGATTTTATAGTCCTAGATAAGGTTTCCTAATGGAGATG AATAAAGGATAGAGTTGGACCCAAAGCTCTAACTTTTTTGAGTCCATGTT TTTATTCAAATATCAATGTTTATCAGTGGCATTGTTTAGTATTTAATGGA AGGGTTAAGACTGTTTTTTATTCTTAAAGCAATTTGATGTCAATATTTAT TTAAATGTTGTTCATTTTAATTTATAAAAATATCAACTATGAACACCCAA GATGGCGTTGCCTTCATTTAGGATGCACGATATGACGTCGGGGTTAACGC TCTAATGCATTTGTTTACTTCATTGTTTATGTATCAATGACGTCAGATAT AGAAGGTGCATGAATAACTTTTAAATTATGATACCACATACATATCTAGG CTTTACACTACCAAGGCATAATCATGCATGGAGCTATCTGGTTTTTGTTT TTTGTTTTTTTTTCATTATTTCCCTCTTGAAGAAATTGAGTAATGAATTA TGGCTCTTTTTCCCCTTTTTTTCAAACAATTACTCCTTTTATATTCCCAT TATGTAGGAATAAAAAGTGCGTGTAAGTACTCCAGGTCTCTAGAACTCCA CGCCAAACTAAAATATGTAGTATATTTTGCTGTTAGCTAACGATGTATCT GTTCTTTCTCTTCTAATCAGTGTCATGAACGTTGATTAGTTCAATTAGAA TTAACTATTGTTAAGCTGTAAAGAAATCTCAACAATCGTTTCATACTTTG GATGAACTGGCTAACTACCAACTGATTTTAGGCCTTTTATATCTTTTGCT TTGGAGGAAAGGTTTACCAGATGCAATAAAGTTAAAGACGTGATAGAAAA CGAATTTTTATCTGAGACTGATCCAAACTGAACTTTTTTAAAGGACCGAA TTAGTTCTATCGAAGGAAGATTATAATATTCTCACACCGATGAAGGTTTT 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