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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s116 | supercontig | LSalAtl2s116:1272125..1287544 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000970 >EMLSAP00000000970 ID=EMLSAP00000000970|Name=EMLSAP00000000970|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=306bp
MSSSTNTSSSTNSKAEAKTGSSATAKKKTSSSSYGCRPMRLRVVMTGGEK TGKSCIIKRYCEKRFVDKIYVDKKEISVHIFDTSGSNLFRDVRNEFYRDA HGILLVFDVTNRRSFDELSGYIKDVAIELAKDGRTMDNTVVLVCGNKSDL KEIRMIDETEAKLWAELRGFDYAETSALNGDGIADLFRSFFXLVLKSTES SRKTPVAMRKSVSKAPSQHRHSLPIKPSPSPDQLIVIDRLKSSIDPWCQM GLDRSTPYSPEEINKTYRKLAVMLHPDKTEVDGADEAFKILGSARKAIMR ASFVKP back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s116:1272125..1287544- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000970-696817 ID=EMLSAT00000000970-696817|Name=EMLSAT00000000970|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15420bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s116:1272125..1287544- (Lepeophtheirus salmonis) ATGTCTTCATCTACAAATACAAGCAGTAGTACTAACAGCAAGGCTGAAGC
TAAAACAGGATCATCCGCGACGGCCAAGAAAAAAACTTCCAGCTCTTCCT
ATGGATGTAGGCCAATGCGACTCCGTGTTGTAATGACCGGAGGGGAGAAA
ACAGGGAAATCGTGTATTATCAAGAGATATTGTGAAAAGAGATTTGTGGA
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ATTTTCTTTTCATTCTTCAAATACTTATATTTTGATTATCACCCCATAAT
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TGTTWTTTCATTCTTGAGGAAAGACTATCAAAGTATAAAGTGTAGCCGCT
GTTATTAGATTAGTCTAAAAACTAAAAGGACTATCAGTCCGGACCTAATA
TAATTTCTCAGTCTTAGAACTGATCTTTACCATTCTTTTATGGTAAATAC
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TAACCAAAGAGAACAGATACCTGAAGTTTAAAGGAGGAAGTGTGTGGCTA
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TATATTCTCCAATCCTAGCTAGGAGGGAAGAAAATAAAAGGATAGCTAGG
ACCTTTATCGGTATTTAAGATGGAGCGATCAAAAAAGTAATAATAGCGGG
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AGAGTAATTCCTATCAATGCCCTTGTTTGATACGGAGTGGGACTTGTAAT
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CTCTGTTGCAAGACTCTTTTAAATAAGCTTTTTAGTTCTTTTGAACTCTT
TTTTGACACTTTTGGTCCCCCAATCCACTCTACTATAACTTTTGGTTGCA
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AAGTCACTGTCACCTATCACTAGGACGGAATGACGGATGACTACATTTAA
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TTTTTTTTTGATAACGAATGACATCATAGGTACAAACAGTATTTGCCTTC
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TAAGATCTCAAACTTTCATGTCACATGTTTTATTGTCTTCGATTTTGAAT
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TATATATATCTCTCAGACACTTCCACAGGATTATATATATATGTTGAAGT
TTGATTTGATCTTATTTGATATTATTATTATTAATCTAGAATATAATCAG
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CCCGATGTGATTCAAAAAATGTCCTGAAAGCAAACTTTACCACCTGTGTC
TCCCCAAAAACAAGCTTTGTCGATTTAATCGGAAGAGGCAAATTTATTAA
TGGCCACCGCGGAACTGTGCCTTCCTAGGTTCTATTCTTCGGATGTTGAG
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TACCAAAGTTAAATGTATCTTATGGTGTCAACATTGCCGGGTGAGGTGTT
CAATATTATTCCTATTAGTGAAGAGAATCTCACTTTTGAGGGAGCGAAGA
AATCCATATTAGCCCAATATGGGCTACCATCTTCCACCAGGATAAACAGA
TTCGTCGACATGATGGCTTATACTTCGGGGCTCTCAAGCATGGAGGTCAA
AGATGATGTTGAATGTCTTCTGGATTCTGATATCTAAAGGATTTATGTGA
AAGTTTGATTGAGAGGCACTAATAACGAATGCTCAAAAGGAACAACATGG
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GTACGGCAGCGAAGGAAGTTACAAACACTTCTATTTCTACTGTCGAGAAT
CACTCTTCTTCTCCAACTGTCGCACTTTTGATAAAAAGAGATCTAGTCGA
GCTTTTTTGAAGTACTCAACAACTGCAAAATTTAAAAAAAGTATGTTATT
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TGCGTCTGATACTGAAATGGGAACTGTTTTGAGAACTGTAGCAGAGTTTA
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TGGTTTCATCCACGTTGATATAATTGTCCCGTTCACACTCGTCAAAGGAA
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ATCCCAATTCCAAATATCCCTGCTAGTACTATGGGGGCGGGGGGCTTGGT
TTTTGGAGATTTAAAAAAAAAAATCCATGGCTTTTCACAGTAAATTTATT
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AACTTCTCCTCCGTTTGTTTCTTGCCAGCGTTCACAAGTGCACGGACTAA
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AAAAACCTTGATTTATGTAGCTAAAATGAAGTATAGAGATTTTTTCGCCG
TTCCCGGTATATTATTAAAGTAAAATGTGTATGTTTCGCCTAATAACTCC
GGGCAATACCGGATACTACAGCTAGTTTATTAATAAGACTCTATGACAGT
TCATGTACAGAAAATCAACATTCTATTAATGTAATTTCTACAAATTTGAA
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TTAAGACATGCATAGCATACGATATATACATATGTAACTACTACGATTTC
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TTCAAATTACAGGATCCCAGGAAATATCAGAATCCCGTTGGTGAACAATA
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AGTAATTTCGTATTTCCCGCTTCTTTTTCTTTTTAATTTTTTAAGTATAT
CTTGTTCATTATTGGGTACATCGAATCATACGATAAGGCGTTGTAAAGGT
GTGAGTATATACTGCAAACGCTTTTTGAATATCATTGCGCAAGGATTAAG
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TCATTCACAGAAATCCTGATCTTCCATCTATAACAAATAATCAGGGGTAC
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TCAAACTTTCTCCCATTATTAATGTGGGCGTTAAACGGCCTATTAGTATG
TTCAAAACTACAAATATGGATCATAGATAAAAATTTATGGAAGGAAATCT
TTCAAAAATCTTAACTGGTCGTTATAATATTGCAAATGAATTATAAAATT
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GCTCATTTTTCAAAAAAAACTTTAGTGCTCTTTTTTGCCCATTTGCTACA
AAAATCGCTCCAAAATCCTAAGTCTATTTATTAACTAACAATGGAAAATC
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CACTGCAGATGTAATCCTATATTATGAGCTGGCAAACAAGGGTTTTTTCC
CTCTTAAGTTGAAGGTTGTTTTTATGCTTGACGGTGAACAAATGTCTTTC
TAGGTTGCATTTTTTGTAAGCTTCGATTCTTTTTTAACAATAATTACACC
AAGTAGCTTTTGAGTCCGCAGTAAGAATTTGGCACAAAAGTATTTCTCCT
TCGTTACAAGATTCAAGAGGGAGATTTCAAGAATCAATTTTGAGCCAAAT
TTTCCCTTCTTCTGATGGGCTGTAATTGGAATCTTGCTTCCTCACACATT
CATGTATGTATTAATAAATCTGATTGCATTATATGCATAGTTTTCCCTCC
AAAAAAGATAGAGTTTTTCCAAGGTTAATAGAAATATATTTATATTAACT
TGAAGTGTTTTTTTTATTGTTTTCCTGCCTAATGATGGAAAGGCTTTGCA
TCTCCATTTTTCGAGCAAACTGCTGTGTAATCCAACCAGTACCCAATTTT
TCTCTTTATATTTCATACCACTTTAGAAAAATGAGCAATTTTCAAGACAA
ATAATGCAAGAAGAGCAATTTCTTGAGTAATGAAGCGATTGCTCACAAAT
CCTAAGTCTATTTACAAATGATATCTTGTTGAAGTTTAAAATTCAAAGTC
TTCAGATTGTAATGGACCACTTGATATTAAAATGAAGCTTATATTATGAA
ATAGTTCAATCCAGGATTATCCAAGAATATAAAAAGAGGTAAAACCCCGA
GAAATCTCGTAAAAACGAGATCCTGGGAGAGAAACCTACTAGCTACGTAC
ATAAATAGTAAAAAGATGAACTGTTGAAGTTTGGAATTTGACAATGAGAT
GATCTAACATAATAAATGCGTTGAAATAAGGAAGCTATAATAATGACCAT
ATTTTTTAAAAATAACTTATCCGTTCCGCCTTTGTTTATCAAAATAGCAA
CAATTACGTATTGCTTAGTTAAAATTAGCCTGATCCTAAAAACATCATTT
ACATATATTATTATTTAACTAATTAAAATATACAGTTTCCGCTCACTAAC
GATAGTTTGCCAAATAGCAAGGCTGTTGAAAGCTTTCAAACATATTTTTT
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TTGTAGATTTTTCATGAGTAAAATTTAAACGAGAGGTTTTGTGAGGGCAT
TTATTTGACAAATAATATTTTTAATTGAGTCGAAACTTTAAAAAAAGGAA
TCTTGAGTCACAAAACCTATCTTTCACCAAGTTTGAAGACAATGGAAGAA
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CAACCCTGTATATATAATTCTTTCAGCTTGAGTGAGACATATCTTCAGAA
CACAAAATCTAACCGGAACCATGATCTTGGGAATTGTGACCAGCACAGGT
GAAGTCTGCCCTTCCATTTTTGTGGAGAGGAAAGAGAGGCTCGATGCAGA
TGTTTACATCGAACTTCTGGACAATAAAATGCTACTTTGGCCCAGAGAAT
AGTGAGGGGACAACTTTGTTTCCACTCAACAAGGAGCTCCGTGTCATTGC
CCCACTAAAATTCAGGCCTTCCTGAGAGACAACTTTCCAGACTTTTGGGT
CCTCAACATGTTGCCGCCCTCCTCTCCGGACGTGAACTCCTTGGACTACT
CTATCAAGGCGCCTATGGAGGAGATGTTGTGTGCTACTCCTCACGAGAGT
GTACAGTCTCTAGAGGCTTCAATAAAGAAGGAAAAGGACCAAGCTCGAGK
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ACATAAATGTTCTGATAAAACCTCTCGTTCAAATTTTACTTCAAAAAAAT
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GATAAAAAATATATTATTGTTTAGAATATGAGGTCTTTTTAAATTAAATT
CTGATACTTTTTGACGTCATGTTTCCACCTTGATATTTTTCAATTTAAAA
TGATTTATTGCACTCATTTTTGAACGAAGTGTGGGATATTGGTTGACTTA
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TTAACTATTGTTAAGCTGTAAAGAAATCTCAACAATCGTTTCATACTTTG
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CGAAATATGATCCTTCTAACTTGATCATTCATCTCAGGAGAGCAGATTCG
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TTATTTGAATTTGTACGAAGCACGATATTATATAGTGATATTATTTATTA
CGAATAAAGCCTTTATCGTTACATTAGAAATGTGAACATTATTAATATAG
TTTATTAAATTATTACAACGTATGTTTATAATAGTAAGTTAAATAAGAAT
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AATATAGAAGTTATTAATATAAAATAAAACAAATAGATTCAACAAATTAT
TAGTGATATTATACATATATAAAATGAAAGGAAACACTTTTATACAGAAA
TAAATATACTTATTTGCAGAATAGAATATGCATTGGCAATGCAGACAAAA
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GTAGGTTATATGACTATCCATATAGATTATAATCTATCACAAACTCCGCC
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AGTTGATAATTCAGATATTTTTATGTATCTCTTTAGTTCTTATAGCTGTA
TACGATTATTCTGTGGAAGATTTGGAGGAATTTATGTTCTTTTGAGTATA
GAGACAATGATTTAAAATGTCAGAATTCATTATTAAAGACCTTTATGGGA
AGGGGCATATACACAGTGAACGATCTTTCCATCAAAGAAGATAGAGAACA
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GGATCAGAAAGCATGTGGCTAGAATATCCAAATAGAAAAATATGAACTGC
TAGGGGAAATGGATAGATACAGATCCAATGAATTGCATACAGGCGGAGGG
GGAACATTTTAAGGTATTTGACCAATAAAATGAATCACATTCATTATTCA
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ACACAATAACTGTTTTCCTATTCTAATCTCAAAACAGTAATTTATTTGAC
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GACAGGAATACAATTTCGCGTTGATCCTTCATTGTATTTGGCCACCTTAT
TATTACTATGAATAAATTTTGGCAACCATATATAAATAAAAATGTATAGC
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AGCAGTTTTATGATTGACTTATTTGTCTAACTACCAGATGATTTSGAGCC
ATTTTTTCTATTTCTTTTTTTTTAAATAAAGGTTGCATGATACAATAAAA
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CACTATTCTATGGCAATGTAGACAAACTATTAATATGTAAAAAAAAACTG
ATACCCCATTATTGCCCATTTTTGATACTATAAGTATAAACTAGATAAAA
GACTAGTCCAAAGTTTGAATTATTTATTATGACGTAAATTAGAACATTAA
TATGATTAGTTAATTCCAATAAGTAAAATCGAAACGGGATTGATTACATT
AATTTATCTTAAACAAACACTCGATTTTATTATTTTTTTATGATAGTACA
CTCGTCAGGAACATATATTTACTATTTCAGCTAAATCATAAATTTAGTTT
GTTTGTGAGAGGCATAACGTTTAAAAGTATTTTGCTTGTTCGGCGATTTT
TGTTATCTCCAGTGTAATTATTGGGCATTGTTTTCGATATTATAACCATA
TATCCATGATTTGTCACCAATTATGACCCTTTTGAGCAAATCAGGATCAT
CATTGACGTATGTGAACAGCTCAAAAGCGATGCTCATGCTACGATACCTT
TGGTCAAAATGAACCAGTTTCTGAGCAAACGTCGCTGACACTCGTATTGT
GTTTTTCAAGTGTTTTTTTATTATTCACCGTTCTTTTATATGCACAAAGC
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TCATTTAAGAACTTTCAAAAATTTCCATCAAAGAGGACAGATGAAAAATA
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GAGCTCACCAAATTTGAAAAGTCACCTTAATTTTTGATTACACCTCGTAT
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TTATTATTATAATGACAATTATTCATGAAGTCTTAGTATGTATATATAGT
AGTCATTGACTAACGATAGTTACAATAAATTGTTGATAAATACGGAACAA
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TGTATTGAGACTAAAATTAGAATCTAATGCGAATTTTTATTATATATTAG
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TATTAATAATTTAGCATCAAGTAGTATTCAATGCAGAAGTTAAGTCTTTT
TTTATTCTCAAAGTCATATGATGAAGTTTCATCAAGATTTATCGGAAATT
TGTGTATATGATTTTGTAAAATTTTTTTGGAAACAAATTTAAAATATTAA
ATTTTCTAGTAAAAAGTAAAATTGCGTAATTATTTTCTTTTTCTTTGTGG
GGAGGATACAGCCCCTCCAGGTCACCCCCTGCGGACGTTTCTATCCTTTG
TCTTCATTTAACCATTTGATGCGAGTTTTATCAAGGTTTATTGAAGATTT
GTCCATTTTATGCAGTAAAAATATCAACTTTGAGCCCTCAACATGGGGGC
ATCTTCAATTTCTATGCAATTTGTGACGTTGTAAAACTAGATTTTCTTTT
AAAGAACTTGTATTCATTTCATTAAAACTTTTAATAATTATGAATTATAA
GAATCCTTAGTAACAAATTTAAATACAAGTTATTGATATTAAAATTTTGG
ACATTATGTTATTCATAAGACATAAACTAAATAATTTTTATAATCAATAG
GATATACGTGGACAAAAAAGAGATCTCTGTGCACATCTTTGACACCTCTG
GATCCAATTTATTTAGAGATGTCCGAAATGAATTTTATAGAGATGCCCAT
GGAATCCTCTTGGTATTTGATGTGACGAATCGCCGGAGCTTTGATGAACT
AAGTGGTTATATCAAGGATGTTGCCATTGAGCTGGCAAAGGATGGTCGTA
CGATGGATAATACAGTCGTTCTGGGTAAGTGAGTTATGATTAAATTMCCT
ATCCAATACTCATATTATTTTACAAGTTTGTGGTAACAAAAGTGATTTGA
AAGAGATCCGCATGATAGATGAAACGGAAGCAAAGCTCTGGGCGGAACTG
CGTGGATTTGACTATGCAGAGACCTCAGCTCTAAATGGTGATGGAATTGC
AGACTTATTTCGTTCCTTTTTTMCTCTTGTTCTCAAATCCACGGAATCAA
GTCGTAAAACACCGGTGGCCATGCGGAAATCAGTGAGTAAAGCTCCTTCA
CAACATCGACACTCCCTTCCTATCAAACCATCACCTTCACCTGATCAACT
CATTGTGATTGACCGACTCAAATCCTCTATTGACCCTTGGTGCCAAATGG
GCCTGGATCGCTCCACCCCTTATTCTCCTGAAGAAATCAACAAGACCTAT
AGGAAACTTGCAGTAATGCTCCACCCTGACAAAACAGAAGTAGATGGTGC
TGATGAGGCCTTCAAGATCCTGGGATCCGCTCGGAAAGCTATAATGCGTG
CAAGCTTCGTCAAACCATAA back to top
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