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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s118 | supercontig | LSalAtl2s118:332403..351300 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001132 >EMLSAP00000001132 ID=EMLSAP00000001132|Name=EMLSAP00000001132|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=206bp
MYSLINGAYKYLTEKDEYYVLILGLDNAGKTTFLESAKAKFSLDRKKKSV
FKINPAKITTTVGLNIGRIEVNSVRLNFWDLGGQSELQSLWDKYYAECHA
IIYTIDSNDRERISESKVSFDSMISNENLKGVPLLVLANKQDLPECMGVR
EVKPIFHENDESIGSRETMVLPTSGLTGDGISEGIEWLVQCIERNSVDRP
PDGKRD back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s118:332403..351300+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001132-696979 ID=EMLSAT00000001132-696979|Name=EMLSAT00000001132|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18898bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s118:332403..351300+ (Lepeophtheirus salmonis)
AGCCACACTTTCTGTCTTTTGAGAGATAATAGACTCACTTGATATAATTT
GATCTGTAATAATAATGACATCATTGGAGGTAGGTAATATTTTATGAACC
CGGCGTAAGTGGATAAATACATTATCCTTCCTGACACAGCAGTATTCACA
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TAGACAATGTTGCTCATGACTATTGAGCAAAGAAATATTATTAAAYGTTT
CGAGGCACTTAAAGCATTTGTTAAAAGTCATATTGTCTTTATTGAGGGGC
TTCTCTTGAAGCTCTGATTTCGTCTCATTATCCTCAGTGTCATTTAGACA
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AGTTTGAACATTCGTTGGGAGTCATAGAGTTGTCATTGAACGTATCCTCT
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TGCAAAGTCCCGGAGTGTTTTCCAAAAAGAATGAACATTGTCGACTCCTA
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TGTAATTACTGTTATAACATATTTTATTTACATTGCAGATTGAATTTTTG
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ATTTCTGAGTCCAAAGTTTCCTTTGATAGTATGATTTCTAATGAAAATTT
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ATGCAGCAGAGCAAAAATGTTAATTTTTGATTTTTTTTTCGAGAAAATTT
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AATTTTTTCTAAATAGCTATGAATTTTAAATTTTTTTCAGAAAAAATCCA
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GTATTTGGATTTAAAATGGGACTGATAAAAATAAAAAAGGATTTAAATCT
GTTTTGGTTATCAAAAATCTAGCTTTATTATACGTCCGATCTGATTATAT
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ACCTAGTTATTTCATAGGAATTTTTACCATATACTAATACTTTTTTGTTC
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AGCTAGAGATATCTATGGTCCAAGTGTACCATATTTTTCGATCTCGCTTT
CTCTTCGCGTTCTTTTTTTCATTACAAACTACTCAACTCTAGGGATAACT
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CTCTCAAAATCTTGTTAACGGATTAAATTATCTTAAAACCAACACTACAT
ACATCCTTACTTCATATACAATAGTTTACTCAGACAATGTACATCTTTTG
AGCCTATTTTTATATGTATTTGCTATCAACAACTTTATCAACCTAAAAAA
ATGCTAATGTATAAAGGAAACTATTTTATTTTTTTATTCTCCTTATAGAT
ATCCCTGACTTCTCAGGGATATAAATCCTCTATTAAATCTACTCTTTTTT
TTTTATTATAATAGAGTATGTAGCACATGATTGAAATTTTTAAGGGTCAA
TTGTTTCGAATCGTTGCCTGTATTTGATATTATCTATTTGTAGAATAAAG
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AATATTTGGAATGCTCACAAATTTTTCATGGTCATAAATTGAATTAACTT
CATCTTATCTAGTTTTGTGAATATTTTTTGATAAGAGAGCTGATCAAAAG
TTACTGTTTAGGAGTCATATWCACCCWTACGACCTCTTATTTTTTGGAAG
GGAACCAATACTATTAGAGTAAGGTTAGGCTACAATACATTCGTGTGACA
AATACTGCAGATTTATTAATAAACTCTTTCTAATGACGTCATTGGGTACA
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ATTTATTTCTTCTATTGATTCCTCATTTATACACGCTATATTTAGGTTAT
TCTCCATCGTTATTTTCTTATATTTGGGGTCCAATGATGTCATCCATTAT
ATCCGTTAGTGATAACTGAAAATCGTTGCTGACTAACCTTGTTATAATTA
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CCCCAAAAAAAAAAAATCGCTCGCATTATATTAGCTTGCCCGCTTCCCAT
ATTTTCTCTTTCTATATCGAAATTGGAGACAGYAAGAGCAGATAGCTGAA
ATTCAACTATCCAAACCATTTTATCAATAAGCAAATTATATTATAAGTAA
ATATGAGATTTCTGTAAAGAAAAAAGAAAATTTAGAGATTTGAGAAGGAA
AGTCAGTTGATGCGTGTGCTCTTTCTTCTTTTTTTCGTTAATTATTTAAT
CAGTCGTGTGTGTGTTAACATCTCCCTCTAAAAGAAGGATTCTTGCCTAT
CTTTGGTGTCAATTGATTTAAAAATGTATAATAGAATAAATATATAAGAA
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CCCCCCCCCTAAAAAAATGATATAAGAGGCAGCTGATATTAACAATGGTC
TTAATTCAGTAATACCGCCTTCTCCTCACACTCTTACAGAAATCCTATAT
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GATATTCGGAAATTAGCACTTTCGAGGATTATGAAAATAAATGTCTCATA
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GATAAGGGGAAAATAAGTTGAAAATCGATAGCCTATGACAAAATACATTT
TAAATTTTTATGTTAATGATGTAACACCTTTTTAGAAGCGTTGAATATTA
CTCCATAAATAACTATGTAGCCTCCATGAATTCACATTTTTCATTGTATT
AGCAAGGTAAATTCTGTTAGCTATGCAAATTTCATCATAATAAAAAAATG
TAATCTTGCTAAGTAAAAAAATATACCAGGTAGCTAAGAAATGTACTTAA
GCTGACAAGTTTTGCAGCTTTCGGTTTAATAAGATTCGACATAATGTAAY
AATTACTTTTTATATAAATTTGAGCCGATATATGTTTTTTTAGGAGGCTG
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AAAATGCAAAGTATTTAATGGGATGTGACTAGGATTGTTCTTAGGGGATT
GACTAGGTCAGATTTTTTTTTTCAAGAGCAATTATTTCTTCTTGTTTTAC
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AATTAAAAGTTCATACTTTGTTGTTTTTACTTTTTTACAAATCTAGTCAC
CGAGGCCGTGACTTCTGCCTTAACAATGTTTGGTAGTTTTTGGCAGCCTT
GCATATGATTTTTACCGATTTGAAGGACCAACATAATCATAATAATATGT
GCTCTACCCAATGGGACGTGAGTAAACTAAAAATGGTATATTATGCCTAA
GGTGGTGTGTTGGGCGGAGCTTATTTTTTTAATTTGAGAAATGAGGAGCT
TTGAGAGTTTTAAATTTTTTCTTTTAGGCTAAAGACATCGTATATAAATT
TTGAACGGGTTTGAAAAATATTTAGAGGTAGCTCAATGGCTCTAAAGTTT
TGAAATTATATGATTTTTGTCAAAAAAAGTGTTTTGACCTGAATATCAAA
TAAGCCCTTCGTGATACAACAAACCTTATAAAACAAGAAATTTAGTTTAA
TCAATTTGCAATTGAAAATATTCAATTATTTTTTTACTAGCGGTTCGTAC
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TATGTCCATCTGTCTAATCGTAAAATAAATGATATCTATATTTACAATTT
ATGTGTCCCAAATTATTAGAAATGGTGAATTTATTACTTGAAGTAGATAG
AACAGGTTATGTTAGGATAAATTTTACCTTTTTTATACCTTTTTACTGAC
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TAGTTGAGGTATTAAGAAATACTCATTGTGAAGACATTGATCTTTTTCTG
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AAAGTAATTGAACCTTATTTTATTTTAGACTGAGATAACATTTCTGAGAA
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ACAACGATTGTTTTAATGCAATTGTAGAGCTAATCTTGAAATGCTTAACC
AGCTCTATCTACTTCAAGTAATAAATTCACCATTGCTACTAATTTGGGAC
TCATAAATTGTAAATATGGATATCATTTCTTTTACGATCAGATAGATGGA
CATATAGCAAAAAAACCAAGTTATGGCAGTCTTTGCACTCAGAGCTCAAC
ATTTCTCAAATTGAAAAAATAAGCTCCACATATGTGGTGTNNNNTCAGAG
CTCAACATTTCTCAAATTGAAAAAATAAGCTCCACATATGTGGTGTGGTA
GTATTTAGTTTGGGGGTGCAACATAAATAAATTAAAATCGTATTCATTAT
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AAAATTAAATTTATTAATGTATTAAGTTACTAAAGCAAAGTTTGTTTGAT
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AACGGGGAATGCATATGCATTAATTATAAAGTACAGTGAATATAACTTTA
GATGAGCTTTAGAAAACAAGTGTGTGTAGCTATTGATCAGCTCGTCATAT
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TTTCAATATGGAGACGAACAGAAGCACAGTTGCCTTTATGAAGTCTGAGG
ACAAGTTGTGATCACATCCTTCAGGGCATCGACATTGGCTGAGAATTTTT
GACCGTCTTGCCCTCCAAAACACACCAAACAGCGAAGTCCTGGGGGTTCA
CGTCAGTTGAGGATGAAAACAAGAAGTCTGCCGTCCAGAAGGCAGCCATG
TTCTCTTTGCAGAAATGCTGCACCTTCTTGGGTAAACACATAGTTTTTCC
GGGTAACATGCTCTTCAACCATGGGAAGACATGGCACCTGAGGACCTTGT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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AATACACGTCAAATTGCCCATCCAGATTTTACCTGTTCACTTTGCTAAAT
AATTTTCCCAAAATAATCTAGTACCACTGCTTCACCACAAAATTGATGGT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCTTTTATTTAATAGTTTATATTTCTG
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TGCTGTAATCTTCAACTTGAGGTCGGAAACTTATCAAACCATCCTCATAA
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CCCCCCCCCCCCCTCCTTCTCTTTCTCTCTCCTATCCTCCCTCTCAGGTG
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AATGAAAGGGGGGAAGGGATAAAGTGTACATAAAATACAGTATAATCATA
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GACTGATTTCCTAATCAGTCTTCCTCGCTCCCCCGCCAGTCTTTTTTTTT
GTCTGTCCCATCTTTTTTACGATTSAACGGTCCTAAGGAACGATTATTCT
GCCCTTCAGTCCTATCTATCCTTTTATTTCTTCACTTCTAGCTAGAATTG
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AACAATTTTAAATAAAAGCTGAATCCCTTTTTTCAATTATTACTCAATAT
TCTCTCTTTAATTACGACCTCGATTTGACCTTGAGAACGGGAGCACGTCT
TGATGACAGTCTTATCCACCCGGATCTCGGACATCAACTCAGGTTTTGTG
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CTTTGAGGGCCTTGGTGTTTGGATAAGGGACACTGCAGGCCCTCCCCTCG
ACAAGCACCCAAAAGGTGTAGTCGAGATTTTTGGCCTTTTTGACAGAGCT
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TAACAATTGTTTTTAATTTTCTTTTTAGTAATTTTTTTGGTAATAATTAC
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TGGAATGATTAAGAGACTTCTATAAAGTACTCGAGAGATGAATAATTTCC
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TAATTTGCGATTCCCATTCTTATTTATTACTGTTGTTCAACTACCTTTTT
TTTTCTTTCCTAAATTAWAAAAAAAATNAAGGAATTTTTGTTTTTTTCTA
GAAAATGTAATATTCCAATTTATTAGTTAAAGAATTTAATTTTCGGTGAA
TGACTATGTATTTTTGAAATTTTTCTCGAAAAAATTTAATATTTGAATAT
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TTTTTTTATAATCAATTTTCTATAAGTTTCTATGGGTTAAGTTATAGTTG
TGGGTAGAGGTGGYTTCGGCCTAGGCCCAAGCCCGAAAGCACTTTGTCCG
AACCTTATTTTTTTAACCCCGAAAAGCCCGTAGCCCAAACCTTCCAGCCT
GACATTTATATATAATATCTATATAAATCAAATAATTCATTTACCACTAA
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GTACTTGAATATTCTTTCGTTTGGAAGAAAAAATTGAAAGATAAATGAGT
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CCCTCTCCCTAATTATAATCATGCGGAAGCTCCTGTTGTGTCATATTTTA
CATAATCAATGAGTAATTACATTCTCAGGTTTTAAATATATTTCGCTCCC
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TTCTTTCTACGACCTCTGACTACATGTACTAGTTCGAGAAACATGTTAAA
AAATTTAATTAAACTTAATAATATCCTTATCATCAACTTTCTGGTCATTT
TCATGTAATGAACAAAATAAAAATGGTGATGATGGTTATATTAAAATTAT
TCCATGCGTATAAAGTACTGTACGTATATACAGTATTATGGTGATGAGGA
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CCAACTAAAGATGCTGTTCTGGATGAAGCAGCTTTAAATGTCAATAATAA
CAAGTTGTTTATATAATTATTTCATATCTTATTTTTAAACATTTACCCCT
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AGTTGTCCTCCTTGGTGGTGTACACCTTGGAGAAATCAGCCTTAAGATAA
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ATCCAAGGAGTTCAGGTTTGACGATGATCCTATGACCAGACCCCCCCCCC
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GTACATGGTCCCCTCGAACAAGATGGGTGGTAACACTTTACCATCTGAGC
CCAGATAGCACAGGGGGGTCATCATCCTTGACAGAGGGGCTAATGTACCC
TTCATTGCCTCTATTCAAGTGTTTGCTTATACAGGGGTCATCAATTTTTT
TTAAACTGTTGGCCTGATATCCGAAAAAAATGACGAGCGCAGGCCGCTTA
ATCATTTTTATTTGTAACTTGTAACAGTGACCTACGCATTTTCAGAAAAC
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TTTTGCTTCATAGTGAGGCTGAAGATTGTACTCTTTCAAAACTGTAATAC
TTTTGCTACATAGTACGCAACTAGCTTTCTGTTGTCTKCTCGGTTTCCAC
TTTTCTTTTTTTATTAGCCATAATGACGGGCGAAGAAAACGATATCTAAG
AATGAAAGAACGGGAAAGATACGTAATTGTGTGATACCCAAATGGAGATG
GTGGAAATGAATGTGGCTCCCGCTAGTGTTAGATGTGCATTGAATNNNNN
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ATTTGATCACAAAGCTTCGAATTGCATACGTTTTATTAAGCAAATGGAAT
TATTGTTGGTGGGCCGGATCTGAAATAACGGAGTTCATTTTACTTCACCT
TTATAAGGAATTACTCAATCAAAATGTAGAAATGAGATTTATCCAATATT
TCTCGAGTTCTCTTTAACTAGTAGTATAATTATAAAATGAAGGGAGCAAT
GAGAAGAAAATGTAAAAAATATATCAAATAAATTTACAAGAATATAATAT
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