EMLSAT00000003157, EMLSAT00000003157-699004 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000003157
Unique NameEMLSAT00000003157-699004
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1762supercontigLSalAtl2s1762:10823..31657 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000003157 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000003157EMLSAG00000003157-685923Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000013842EMLSAE00000013842-722770Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013843EMLSAE00000013843-722771Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013844EMLSAE00000013844-722772Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013845EMLSAE00000013845-722773Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013846EMLSAE00000013846-722774Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013847EMLSAE00000013847-722775Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000013848EMLSAE00000013848-722776Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto768933auto768933Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000003157EMLSAP00000003157Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000003157

>EMLSAP00000003157 ID=EMLSAP00000003157|Name=EMLSAP00000003157|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=381bp
MPGDQILQINGEDVKLAPRDHVIQLVRNCKEKSSTRKSAILSAAKKAKLK
NNPSRVRFAESVDINGFNDDPPSSDSVVPLMPNVLKVFLENGQTKSFKYD
ASTTVNDVIESLQAKLGLKSINHFSLVIASRPGAHNLRCLFRVTFVPSDA
SELLRSDPVAFEYLYVQSCNDVVQERFAPELQYDIALRLAALQIHQHVLS
TSGSSNSSNSSSSSSIINNECGLDRFIPTSLRDTMKRKELRKLLTHFLKL
NSSQSNNLLGNTPKSQMGHQQIQTLTALQAKLHYLKIIGELPSYGAKCFS
TNISDSNVETVILISPKFGISQINSLRNSVLSNRRLLYRHRTLSCNNPFW
ESRVLEVTLYYVLKVIIRDTKRKRVVDVVAF
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1762:10823..31657+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000003157-699004 ID=EMLSAT00000003157-699004|Name=EMLSAT00000003157|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=20835bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1762:10823..31657+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATTTGTTACTAGCGGTGGCCCAAGCGTGAAGAAGTTAATGCCTGGTGATC AAATCCTACAAATCAACGGGGAAGACGTGAAACTTGCACCTCGTGATCAC GTGATACAACTAGTCAGAAACTGTAAAGAAAAAGTATCTTTAATCGTGTG CCAACCTCCATTGGATAATGTGAGTGTAAAATTATGACACAACTTTACAA ATAACACTCGTATAAAATCTATATTTAATTCTAAATAGTAGTATTTTGTA AGCTGATAACGAATCTAGAATTCGTTTGTTCGTATAAAATATGTTTTTCA AGAATTTTCATAAATTTCTACTTCAACTATATATACAAGGCAAGGCAGCA AAACCTGGACTCGAGAGATGGATTTAGAAATTCATCAATTAGTTTATATT TTCAATAATAGGCAAAAAAAAAAAATGTTAACATACATGTACTTTTTTCA CACAATATGGCCACCTTCATTATCAATCACAGCCTTTACACATGGCCTGA AGGCCGTGCAGGAGTTGATGACAAACTCATTTGACAAGTTGTCCCACTAT AGAGTTCTTCAATTAGTCCATATTTGGGTGTGAGGTCCGGTTGATTTCTT TCTTAAAAGTACTCCACATCGAAAAGTCCAGTAGATTCAAATCTGGTAAG AATGGCAGCCATATCTCTTTGGACCAAAAWCGAGCCAGGKTATCGGCAGA TAACTTTTGGCACTTGGCGAACGTTTTAGAGGTAGCGCCGTCCTGATTCC ACATGTAGTTAACCTCTGTGCAGTTGGTCTTCAGCCATTGCAAGAGGGTG TACCTAAGCACCTTATACCACCTGGCAAATTTTCTGTCCAGCGTTGAAAA AGAATGGATACCTCTTCTTTTCATCAGAGGCCACAACGCCGAGGATCATT GTTTGGGGCGTATATTTGTTGTCGTAAATTCCTTGGACCTTTTCCTTTGT TTTTGCAAGCCAGCAGTGCCGGCGGKTGRGGRATTGATTAAMTGTGAACA TCTTCTTGTCCGAGAAAATTTTCACAATTTACCAATTTGCCTTTATCCAT TTGAGGATTTTCTTGTACTTCTCAAGTCTTTTGTTTGTTTTTCATCCCCT CTGTCAGAAGGTGGTGTGGGGTCTTTGTTAAAGAAACTATTCTGAAATTG TGCTTTATAGCCCTCCTGATGGTCCTAGAAACCTCGAAGAAGTCGTTGGT GAGGCGATTAATCAACTTAAGGGTATTCTCAAAATTAACAAGAACTTCAT ATCTCTCTTTGAATGATGTTCTACTTTCTGACATCCTGGAGAGGTCTTTT CCATTTTTTTTCATCTTGGCTAACTTAATACCCAGGCCCCTAGAACACTT AACTACATACTTAATCTTCATTACATCAACTTTAGCATCTAGAAGATTTA GGATGCACTGCCTTTTGATTGTTGCTCGCTGATGATGATGAAATGACTGA ATGTTTAGTATAGTTTATTTATGTAAAAATGATGGCAGAAACAGAATATT AAAAAATAATCACTAAACCTTTTCATAGTAATGAGAAAATAAACATTAAT TAATAGTCCAGGTTTTGCTGCCCAACCTGTTAACATATTTTTTTTCTCAA CATTACACCTTAACTTGACCTTTTAAAACCAACTACTTCTGTAAATTAAA GCCAAATGATTTATGCTTCAAATAAGTTACTTCTGTGTAAAAAAAAAAAG AAGAAAAACTAAGAAGTTATTCCATTTGAAACTAAATCATTAAAATATAG CGGTTTTTTAAACTTTAAAAGGTATTTTCTTAGAGTGAAAATTATTGCAT ATCTAAAATATGCCCATATTTGGAGTTAGCATATAATTTAGAAAAATAAA ACTAACTTTTATACCAATTAATGATTGTTTAATTCACATAAGTTAGCTCA AACCCAAGGTTGATAGGAATACAAGGTTAGACAATAATGTAATCGGGCTT GTTAGAATTTTTAATTTGATGTATCGTACCTACTGCTGGACAAGACAGGC AGGGGTTGACAAAACATGCAACCAAACATAGTCTATGACGTCACTATTAC TTAAATTATCAATTTGATGTATCATACCGACTGTTGGATAAGAAAGACAG ATTTAGAAAAAAACACGCAACTACTCATACATTATGACGTTAATATTAAA AAAAGTGGTGGAGGTCAAACATCAGTCGTACATGCGTTATGCCATAACCT TGTATTTCTATTAACGTTGGCTCAAACCAACAAAAAGTATAAAAATAATG AGAAACTTGAAAATAAACATTTTCGAAAATCGGATTTTATTCAAAAAAAT TAATCACAGATTCATGTTCAACTTGTCGGGTACTACAAGGATTGAATATT AAACTTATAAGATGATTCAAAGAGTAGAATTTTGTTGACTTGTTTGGTGT ATTTAGTTGTAATACTAAATATGCAGTCAATTTAAGTAATTCTATTTTTG GACTTTGTACGTATTTACTCACGTTGTACTTGGCTCTTATTTGCATATAT TATTATATGTACAGGGTGTACAATAAAAAATTCTTGTGTCTGTAAATAAA TATTAAACCGTTATTATGTTTTGTTTTATAAATCAACTATTTTCAATGAA ACCTTGCAAAATTGAACCTTTATAATGAGCTTTCAAAATTCATTATAAAA GCCCCTCGCATCAGTCACAATTTCAATAGTGTCGAAAACCATGATACCTC CTGATTTTTTTTTCATTTGGAAATGAGTTCTACTTCTTTGCGGTGTCTGT TTTAACCCTTTACGCACGTATGTGACTAATTCGTCATACTACAATATAAG AATAATTAAAGAAGTAGAACCTTGAAAGAGAAAGAGTCCGGTAGAGAAAA 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AAAAAATTCATACTGAAGGGGAGCCAAATTGAAAAAAGATCTTAAATCTA TTTTTTAGAACAAATACAAAATCCAAAATTCCCTTATAAATGAGCTATTC TCAAAGTTAATAGAAATACAAGATTATACCATAATGCCTGTAAGACTGAT CATGACTTCCACCATGCTTTTTAATATTGACGTCACAGTGTATGAGTGGC TGSTCGTTTTMTCAAAAWCTGTTTTTCCTACCCAACAGTTGGTACTATAC AATAAATTGAACATTCTAGCAACAGTGACGTCACAGACTATGAGTGGTTG CGTGTTTTGTCAAAATCTGCAAAGCCTTGCCCAGCAGTTAGTACGATACA CCAAATTGAAAGTTCTAGCAAGCCCGATTACATGATGATCTAACCTTGTA AATCTATTAATCTTAAAAAAAATAGAATTATGTTAATTCGTAGATGAATG ACTATAAAATTTTCGGATCACCCCCCCCCCCTTTTGAAAAGCGMGCCACT TTGTAACTGTTGTGAGTCACCATCAGGACATAGGTCATTTTCTGCAGGAA ATATATAATTAATAAAAAAGAAGCAAGTAATCATTATTTTGTTTAGTGAG TAATATCACATTTACGTCGTACGTACATTTTCTAAAATAAATGACATCAC CATGGTACGAACAAAAAAATAAGGATTCTCTCTCAGCTGTTTTTGTTTTT TTTGCAAATGCATTTAATATTGTTATGTATATATTCTCTAGTGGATATAT TTAGCATGTTTCTACATTCTACGTTGTTCATTCATAATCAGAGTATATAC AATATATATATATGTAGAGCTGTATTAAACAGTATCCGCATATATACAGT AGACTGTACCCTTATGACAAAAGTTGGTGATTTTAAATTGTCGGATAGTT TTTATTTATTCCTTTAAACAAGAAAATAACCATTAAACGTCACAAAAAAA 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