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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s179 | supercontig | LSalAtl2s179:395172..466209 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003269 >EMLSAP00000003269 ID=EMLSAP00000003269|Name=EMLSAP00000003269|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=310bp
MDSIYLPTIHSIISDSSSSFSPLPSLSDEEPEDEETIPNYWALLLLLLCV VVVFGNVLVILSVAREKVLQNLTNYFIVSLAVADLLVAGFVMPFSVYVLV NWGMWGLPKIACDFYIALDVICSTSSIFNLVAISANNIPDTNIITEVING TNDVSTTLQEKEFVCAFYNPEFIIYSSLGSFYIPCIVMIFLYALHNRALI SQNAKSRQLIPSKNGSTANKKLSISKSNKDDVTLNQIKEDLSKDNDSCKD INDETNFQHDSIESDPPSSPTSSNGFDFLPKKNRNPTPIELVEYKKKVVY ARISILFILI back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s179:395172..466209- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003269-699116 ID=EMLSAT00000003269-699116|Name=EMLSAT00000003269|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=71038bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s179:395172..466209- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGATTCCATATATTTGCCTACAATTCATTCGATCATATCAGACTCCTC
TTCATCCTTCAGCCCACTTCCTTCCCTGTCAGATGAAGAACCAGAAGATG
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TTTGGGTAAGGAGCTTGAATTTGATAATATAATTAGTGTAAAACTATGGA
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ATAAAAAAGTGGATAGAACCCCCCCCCCCCTGATGCAAACATTTTCGACT
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AACCTCAAAACCACAGTAAGTTCGCAGCGGGATGCCATGACATAGGACTM
CATCCACAAAGGGTGCCATGTGTTCCACCACCGCCTAGTAGCAATCATTG
CCGCTAACGGTGGCTACGTTAAATATTTACAAAGTCTAGTCTCAAGTCTA
TTTATAGTGTTAATTTTGTTTACATTCTATTGTTAAATAATCAATTGGAT
CTTGTTGAAGTTTAAAATTTGGAGTGTTCATATTTTGATGGACCACTTGG
TATGCATAAACTTAAGATAATTTGAGGACGGATATATAATTAAATCTCAT
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GGCCGCGTATAGCCAAGCAGAAATCAATAAAATAATTGAATTTTCCTCAG
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CTTCCACATACGACATATCATTGATATAAAGGAAACCTGATTGAACATTT
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GCTTGTAGCTGATCTATTGACAGGTCAAGACAGCTTAGCTACTCTCCTCC
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TTCTTTCAACATTTCCAAAATACACACGACTTTCATCACTATTTATTAAT
TTCTTATTTATATAACATAAACTGTTCTCAAACTGGGGAATTGACTTTAT
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TTTTTATATTAGTTACAAGCAGATTTGAGAAGACGCGGATTGAAATAAAC
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TGTATCATCATAATTCATGATTGAATCTCACTTATTTACAATAATTAATT
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ACGTACAGATTATGATTAAATTCCTCCAATATCTTTCTTCTTCCTTGATC
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GTGATTGTTTGTCCCGATAAAAGATGTCAAATAATCGTCTGTTTGAACCT
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GAGCTCATCTTGTGCTATAAATTTTATTTTTTTCAATTTTTCAAAAATAA
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GAGCACACACCCTCTCCTACAGACGGGCCTAGATACATAGTCTAAGATGT
GTGTCTATGGAGAGGAGGGCAGCTACTTGTTTTGGTTCGGAAAGTTGTCT
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ATAATTAGCCGTTGGACTTCAATTTTATTGTTACATATAGGAAAATAGTT
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TAAAACTTTAGACTCGCCCTCATTGAAATAAAGGACAACGGGGATAGTTG
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CTGTTTATTTTTATAACATACAGTTGGAGAAAATAAGTGTTTGACTTTTA
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GGAAATGAAGAGTATAACCCAGATAACATTACGTTTTTGGGCGTATTTCT
CTGCTAAGGGCAAAGAAGGACTTCAATACATCGAAGATAGAACGGACAGG
ACGATGCACCTAGTAAATATTCGGTGACAACCTCTTTTCCTCAAGAAAGG
GCATTGAAAATTCTTTGTGTTATGAATTTCCCCTGTATTACCCAAACATA
TTGCCAAAGCAACGAAAAAGTGGCTCAATAAGAAGCACATTAAGGTCAGT
AAGTGGTCTAGCCTGTTTTATGACCTCAACTTCAAATAAAAAATTCCTTC
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TTTTTTTATTTTATATTTTTTCGTTTTTCAACAAAGTCACTTTTTAATAC
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TTAAAGTAATTTTCAGAAAATTATGGAAATTTCTTGTTCAAATAATACTG
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TTATTGTGGATTATTATTTGTATCTAAAAATAGATATTTGCATTGTTGTT
TGGTAAATTTTTCAAACTATAAATAAAACTTATTTTTTTAAAAATACAAA
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TATTGATTTTTGTTATTTTATATAATGAAAATGCTTTTTAACTTATTTAT
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GATGTTGAAAGCACCCAATAAACCAAGAACCAAATCTTCRGCAGTTACAT
TATTGGCTGACTTCTGGCCTGCATACATGTTGCCCTCCAACACCCTTGAC
CTCAACCCCATGAAATCTCCAGTCTTGGGGTGTATATCTCTGCTAAGGGT
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GTATTACATCCTGGGAAATGCCTTCAAAACCTACCAATTCTTTTCATCTA
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ACCATGTAATACTTTGGATGAAAYCTGTGGCGAATGCTCCTGTTTCAACA
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CTCAGATAAGGTATGGTTTAATAGTAGAGAATGAGAGGTACGTATTAGGG
AATAAATGCATTGTTAAATTCCATATGATGGATAGTTGCGGCGTTGGCGA
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CTATAATCTCACATGACTTATATTTATTAAATAAAACAAAAATATTTGAA
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TATTGTTGGTTTCCCTTTTTAATATGCTACGTTAATGTGTTGATGATATT
TCCATCAATCGATAGTATTTACTTGTAAATCCCGTACCTTGGAGGAAGAG
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AGATATAGTCTTTTTACTGACGTCATGAATTGCATCATAAATAAAGGAGA
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GACTTAACACTTGCAATGAATATCACTTAATGCCATTGATAAATAGGAAT
ATGTAAATTAAATTAAAGTTATATATGCTGTATATCCCTAGCTATCTAGG
ACATTAATTTGCATAATATTTTTTTGTTTTTTTGATTACTTGATTGGGAA
CCAAAAAATTATTCTTTCCATTATGGTAGTTAATTTTTATATGCCTGCAA
TTTGGAAATAACATTTTATAATGAAGTAACAACGTTTTAAATTGTACATA
TGAGGTTCGATAAATAATAAAATTACGCAATAAAAGGATATATTTTTGAT
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TCAAACTTGGTGGTTTATGCCAAAAAAGGCAAAATCAACAATTATGTCCT
TACATGAAAACGCGATAAATCCCAATTATTTTTGTTATTGCAGATAAATT
TTACTCTGGATTCACTTGCCTTGGTCGGAACTTTTTCCTCGAAATGAAAT
GATACTTATCGCAAATAGGGCAAGGATTCTTAACTTTTTTTTAGTGATGT
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TTTCAAGAGCAAAAATACTTCATTTTACTCAACTGTTTGCAAATGATAAG
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AGGGCTTTGGCTGATTCTGTAGATGCTATCCACATCGAGTTTTGAGATAA
ACTGAACTCGTACAGTTTTCTTGATGAAAAACTGAGGATTCCTATAAATA
TAAGGTCCAAGTTTTGGTTTCAGATTACGTTGAAGATGCGCTGGCTTCAT
TCCACTATTAACCAACTTCTCTTGACAGAAAAAAGACACTGGCTCATGGG
AGGACTAGAGCTTGTGGACATTAATCCCATTAGGACTTATTCTTCCGAAT
ATTGTCTAAAATCTTTGGAGAGGCAGTGTTACTAACTTCCTGGTCACCAG
TCCTTCTGTGTTCTCAGTAGAATAGATACCGCCCTTTATCCCTTAAACAA
TTTTTGTTCCACATTTGTGAAATGCCTACAAAACGTTGGTCAAATATAAT
ATTCAATAAATATGCTTTTATCTGAAACTATTTAAGATCTACTAGGAATA
TGTTCATTAGCGTGACTAGGTATGATTATTATATTGTTTCAAAAGATCCA
GTAAAAATGTAATCAATATCTTTGATACCACAAGCGAGTAGTAATGAGCT
ATTTGATTAGTTCCGGACCCTAAACTTTAAAATCTGTTGCTACTAATAGT
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ACCACATATATCAATGATAAATTTGTTTATAAAAATAAGGCGTTATCTTC
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GACAGATTATATAAAATCCGCTCAGTCTTTGATCATTTCAGAGAAAACTT
ATACATTTCAAGAGATTCTTAGTATTGATAAGCAGATGTCTCCAACAAAA
TGAAAATGTCTCTTCAAACAGTATGCGCCCGCCAAACCTCAGAAATGGGG
GATAAAATTTTACTATTATGTGGTGCTTTAGGATATTCATATAATTTCGG
GGAGTATGTAGGGGAAGAAATCAATCGTTCGAGAAGAAAAGATGATGAGC
CGAATTAAGGAGCATCCTCATATTATGGTGCGGTTAAGCTGAAAGTTTCT
AATAAATGTTGGATATAAATTGTTTTTTGACAATTACTACAATTAATTGA
AATTATATAATTGTCCTTCTAAACAAGGCATATTTTCACAGGGAATGGTT
AAGCGTTATAGGTTGGCAAATTACAAGCTGAGAAAGATATGGCATGACAT
GGACTAGGTTTTTTTACCGGAATGGTTAAAATCATCTATGGTGTCGATGT
AACATGCGTACAAATTTATTATTGTAATGTTGTATTGTTGCTCTCATCTC
TGACAAGTGAAACTCATGTTTCTACAGTTCAGTTCAAAGGGTTGATTAGT
TGAAGATGTCATTTAATAACTCATTTTACTTGTAGTAAATGTGGCGTAGC
ACTTAGTTGTAACAAAGATCACAATTGTTTTCTTAAGTTTCATACAAATA
TAAAAAAGAAGGTTTTTCTTTTCACGCATGAATAGTACTTTTTTTTTTTG
CTTACGTTTTGATATTACGGCTTAAGTCAATCAATTTCTTTTTGTTTAAT
ATTTTATAGAAATAAATACTTTGTACCAAATACACCATTTGTTGAACTTT
TTTTTTCAGCATTCTTTATTTGGTTTATATATTATACGGAACATATACTT
ATATAAATAAACCGGAGCAATTGTGTAAAAAGTACCTAAATAAACATTAT
AGTTTATACATAATGCTCCGGTGAAGAATTTCAACAAATATTATAAAAAT
CAATCTTCAAAAAAAAAACTGTAAACATGCGAATTAACAATTATGATAAA
TATTTGTTAAAATTTCTTAACCTTTTTTTTAAATACTTCGGTGATTCCGT
GAAATTGATGGAGGGTACCGGATTTCTTCTCCTGCAAAATTCCATGACTC
CCGCCCTGCTTCAAGAATTTTCATTGTGAAAGAGATATAGAAGGCTGAAG
CTGTCAAGATGATACCTCTTAACTCATCCTCCCGAAAGGCTAATAGTTAG
TTAGTCGGCTGGCGATGTTGGCTTTACAATTAAGAATTGCAAAGTCAAGA
GCCCTTCTTACCTCAGAAGTTCCACCCTTCTTCTTTGAAATTCCAAAAAG
AACAAGACCTTTAACATATTTTTCTTCTCCATTCATCAGCCCTTTTATAT
TTATGGATACAAAATATTTCAGGATATAGATGGCAGGGSAGKCTGCAAAT
GCATGAAGTGTGTTATTATATAGTTTTCAGCAGTACCTGCAGGCTTTAGT
ATATTTAATACAATCTGTGGAGGTTTGTAAATGGACGGCAAACTTTTTAT
TATCATTTATTACTCTCAAGGAGAACCTTATTTTTCTTTTTCAACCCATA
GGGAGGCCCAAACGCTTACTATGCATCTCCCAGAGTCCATTCACAGCTTC
ATCAAAGTTCAGAAGGAATTGAAAAGACCAATTAAATAATACATGTTCTG
ACAAATTATTTTTATTTTATGTTTTTCACACAATAAAAACATTTTCAACC
CGAACAAAAAAGTATTACAGGTTAATCATTACTCCATTGTTTATGTTCTC
AAGGTATCATTTGCAAAATATATATTTTTTTAGTCAAATATGTGTCCCTT
TCTTTCGAGTATGAACATATTCCCCATGTCATATTTAAGCTTAAACGGAA
GATTATTTTTCAAACTTTTTAAAAAACTTGTTAGGAAAGACAGTGAGAAC
AAAAATAAGTTWATTTCCAGTTAATTATAACTTAAACCTANNNNTTTTTT
TAGTCAAATATGTGTCCCTTTCTTTCGAGTATGAACATATTCCCCATGTC
ATATTTAAGCTTAAACGGAAGATTATTTTTCAAACTTTTTAAAAAACTTG
TTAGGAAAGACAGTGAGAACAAAAATAAGTTTATTTCCAGTTAATTATAA
CTTAAACCTACAGTATTTATTTAATATGGCCTTTTTCACCTTCCATGTTG
ACCTTATGTAAGCTTCACGAAACAAACGGATATAATTTCCTGACGAGTCA
GCCAATGCACTTTTGATGGCGAACTCCAAAGATCTTACAAAACCTCGAGG
TTTGTTGCAGGTATTGCCTAGATGGAATCATCCAAAGGAGCTGGAATAGC
ACATGTTCTTGCATATATGCAAAAAAGGGTTGCTCTAGAAGCTCATCTCT
TTTGTGGCCGKCGTAATGAGATGTTTCTTCCTTCTTATTCTTCATTGGGC
TCCCAAGATATATTTAATAAATGACATTCATTTTCTTGGTAATAATGCGA
ATTATCCTCACTGGATTTCTCGCAAACCAAATATTTATACACAGAACTAT
AGCTCTTGTTCTTAATGTTCATTTCAAACCTAGGCCAGACTTTCTAGAGA
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GTCTGATATTAAGGCCATTTGCAATCTCCATTGGGATTTTTTGGGGTATG
AACATTTCCTGCACAATTTTTTTTTCTTCTGTTTTGTCGTTTATGATATC
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GAATGTATGGATGTCTTCCGAGAATGATCTGCTTTAGCAGCTCTATAAAG
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GAATTGATTTTTTTCCCCTCTGACGAGGCTTCAAACTTTAAGGTTCCAAA
TCCTTCCTGAAACAATTTGTTGGGGTCTCTCACGGAGGAGCATAAATTAA
TGGAAACTCATGAGGTTAAATTGGAAGTTGAGACAATTTGATACTGATCT
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GTCTACAAGTGAAAAATATTGATGGAACTTGCAAAAGGATGCTTCAGAAG
TGGGTGTTTTCGAATTCAGAATTTGTTAAGTATTTAGAGTTTACCTCAGA
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AATTATGATTGAATTTGTTTTCTTTCTTTTCAACTGGTGAAATGTAAGAC
TTTTATTTGTTCTTTAGATTTAGATTCATTTATGGGGAAACACTCACTTC
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ATTTACCAGATCTAAAACTATTTAAAATCCAAGCATAAAATATCAAATAT
TCGAGAAAATATATATCGGCAATTTGCAATTTTAATATATTTCTTAATTA
GTTTGCAATCAATGATGTGTTTTTTAGTTTAATTTACTTATATATCTTGT
TCATCGCTATTTAATGTATCTTTTATTAATTTGAATTTATATTACAACCT
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CCTCGAGAATGGAAAAACACTTGTTGAAAGCCTTGGCAACATTGTAAACA
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GGACGGGGGTACGTAATAATGGCTGSACTTGGKTCTTATTCAAATAACAT
CTCATAGATTTTGTGTTTTTTCTTATACAATTTTGTCAGCTTAATCTGAT
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TCCCGATCCTGTATATACCTTAGATTAATTTGTAGCTCCGTATATTTTAA
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AATGCAGATAAGTTAATGGTGAGCAATAAGACTCCAGAACAACCCACTTT
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ATAGCTGCATTCAGCTGCCAACTTTTGAATTGAATCCCAGTGCCCCTGGT
GATGAGTTAGACACCAGGAAACAAAATATTGCATGCTCCATTTAACGAGT
ATTCTATTACTTAGTTANTGATTAAGTTATAACAATAGATGGTGTGTATA
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CTCTCACCTTCTTCACACGCTCTACTAAAATCCTATCTGTAATTATGACT
CGGGGATCACTAAGACAACGAGTTCATTATACTCAAATAACGACTCGTCA
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TGAGAGGCACCTTGGTAAAAAAAAGTACCCCGCTTAATGAAGAAAATAAT
TTTTACACATTAGGTACCAGTTTTTACAAGTAATCTGTAGATCTTAAAGT
ATACATCGAGCGGGGATCAAATTGTCGCTAAAATATTTTTCTACAAAAAA
CAACACAAAATATAAATTTTTAGTTTTTTTATTGAAAATCAATTCATTCG
ATATAATCACCGTTGGCATCCATAATGGCCTCAATACGGCCTCTGAACAG
GCCGCAGGCTCTTCTGACCATCTCATTGTCCATGTTGCCGAATACCTGTT
TGATGGAGTCCATCAGGCTGGCCTTGGTGCTATGGGGATGTCTGTTGGTA
TGTCTCTCGACATAGCCCCAGACAAAATAGTCCAAAGGATTAAGGTCAGG
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TTAACCACATCATGGAGATTTTGGACACATGGCAGGGTGCTGAGTCCTGT
TGCCACACCCAGGGCCTGTATCCAGGGCAGAACCACCTTCTCCATAACAT
CCAGGTAGACCTCTGTATTGACCTTTAGACCCGTTTCAAACATATGTGGG
GAGGCATAACATGACTTACACTGCTGACCACCTCGAACTTGGTCTTCATT
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GTTGACTTTCTGNAGTTGTCCTTTGCCTTCTGGGTCAAGATCTGGCCCAC
CTGCATCTTGTAGCTCCTGCACCTTAAATCCTCAGATACACAGTCCCTTA
TTGTTTTCTCATGGCAGCCCAGATCCCTCGCCATGGCCYTCATGGACCTG
GTAGGGTCATCCTCAACCATCTTCTTCACCTTGTCGACAAAGTTGGTGTC
TCTGACCTTCCCGTAGGCGCCCTCCTCCTTGGGYGCCCTCTTTATGGTGG
CATCAACATAGATGGTGTCCTCCATGACTACGGCGGGSCTCGAAAGCTCC
YCGTTCCACTTATAGCTCTTTATCTCCTCATATGATGACGGCATGATACT
AACTGAACTACGTATCGTCAGCTGACGAGAATAGCTTTCTTATTTGGTAA
CTGGTTTTTTATTTGATAATGTCGTCTTCAAGTTATCAAGGTTTAAAGTA
GGCGGTAATTTGATCCCCTCTCCCTATATAAACGAACTTAGCTCTAACTT
ATATTCAATTTATGGAACGAAGGAACTATTTATTTATAAAAAAACCATCT
TCTTTATATAAAAAGACATTAGTATTGGCATCAAATTTATCATAAGTCAT
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GTGTTAAATGTGAGAATGTTGCGCCTTTCAACAGAAGAACAGAAAAGCTT
ATCTTTTTCTTCACAATATAATATTCTTGTCACTACAAATCTGCGGATAT
TATTACAATAATGTTCTGGGTAGGAGTCAACTGGTATGAATTATACGCGG
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AATATGTTTAATTAATGTCTAAATCATTCTAGCTTGGTTTGTTGTTGACG
TGTCACATTATTTTACTTTTTTTTGTAAATATATGTGTCATATTAGGCAC
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TCGTTCTAATTCCTCAAAAAAAAAGCTTCAAAAGCGTTATTTTTTGCTCA
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ATTTTCAACAAATAACACGGATTTCGTGTTCTTAGAAAAATAATATTCAA
CATTTAAGCTCTTTTTCGCTCTAATTCCTTATCAGTTACAACAAAAGAAA
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