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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1 | supercontig | LSalAtl2s1:3496057..3531777 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000003721 >EMLSAP00000003721 ID=EMLSAP00000003721|Name=EMLSAP00000003721|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=311bp
MVSGEEWRTVIHLVSGGTGGTLGAILTCPFEVVKTRLQSSQSSCPGPYVL SSNPWACLKDIVKCEGLSGLFKGLGPNLLGVAPARAMYFCAYSWTKDRVN VCLPVRNRDTPFVHVLSAASAGFTASTLTNPIWLIKTRLQLDRNAGNSYG RIRKCVAQIYHKHGLVGFWKGVTASYWGISETAIHFVIYEYLKTKCLSRQ NHSRTDNKKSLADFAGFMVCGACSKTFATVVAYPHEVARTRLREDGSKYN SFWQTLHIVYREEGHSGLYRGLFTQLIRQIPNTAIMMATYEFSVNLLTRW LKNDGDNIESL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1:3496057..3531777- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000003721-699568 ID=EMLSAT00000003721-699568|Name=EMLSAT00000003721|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=35721bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1:3496057..3531777- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGTTTCTGGAGAGGAGTGGCGAACAGTGATCCACTTAGTATCTGGTGG
TACAGGTGGAACTCTGGGCGCGATTTTGACTTGCCCTTTTGAGGTAGTGA
AGACGCGACTGCAATCCTCGCAATCCTCCTGCCCTGGGCCTTACGTGCTC
AGCTCGAATCCTTGGGCCTGTTTGAAAGACATAGTGAAATGTGAGGGACT
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CTCGAGCCATGTACTTTTGTGCCTACTCTTGGACCAAGGATCGTGTGAAC
GTGTGTCTTCCTGTGCGTAACCGGGACACTCCGTTCGTGCATGTACTTTC
TGCTGCTTCAGCAGGTTGCAATTCTTTGTATTTGTGTGATTGATGCTTAT
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GCCTAATTCATATGTTGGGTTTCTTATATCATATCTGATAATTTTTCGAC
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ACTTTCTGTACAAATTCACAAAACCTCTACTTAATTTAGAAGGAGATATA
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CTCAATTGTGGTGTGCTTAAATCAAAACAAAAAGTATATGTTGGAGGTAT
TGTGAGCAAAAATTAAGTATATGTATTTTTTGGTTGGATATAGATTGTAA
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GTTATACCCCTCCCCCCCCCCCCTACCCCTTATTATTATTTAAAACGACT
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ATACCCATACATATACTCGAAGAAACTGATGTTAGATAAACTACTTGCAC
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TAGATCTGCTCCATCCATGTCCAGGCGCGGAAAAACAGTTTGTTCTTGCA
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CTTATTGAGGTTTTAAGGACCCGACCACCCTGCTCGTCCCTGGGAGACAT
TTTGCTCGATGTACCCTCATCCAACTCAGGATGATCCAGAGGAGAGACCG
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CCGGACACACACTTCACTTCTTGTAAGTGACCAATGTTCTCTTCCTTCCT
CCACGAGGCCCAAACTAAGACACAGTCCATATTGCTCCGCCTTCTGCAGA
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GGCTAGCTTCGCCGACGATCCCACAGTAAGGAGGTCACGTGATCCTGATC
CCATCCTCGTCGCCAATGTTGCGTCTTGACGAACGAGAGAGTCAAACTTA
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CCATATTACTGTAGTTTTTAACACCTTATCCCGGATATTATGAGCATTTA
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ATATTTGAATAAATCAATAATAGCTTACCCTAGTTTTTACCAGAAGAAAG
TTATGTTAGACAAACTACTTGTACGACATTTRAACAAAAGMCCTCTTTGA
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TTTAGTATTACATTTTCATAATTACCATGTCCTTGACACTATTTACTGAT
AAAAACAACCTTAATTTGTTATGAATGGCTCTCAACATGCTGAAAATCAA
CTCTAAGTCACAATTTAAAATAGGTATGTTCCTATAATTTGTCTCCTCGG
AATTTTCTAGGCCTCATAAATCGTTGTACGCTGTATTTTCATCTAAATAT
GTATTTAATTTGGTTTTGAATGGCTCTAAGTTGATATCGACGTATCAATG
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AATGACCTCGGTAATTGGGTTAAGATTATTATTAATTATTGATCATTCTT
CATAAATAAAGTCATTTATAATCTCCCTAGCTTTAACGACCGATGATGCT
TTTTCATTATGGTTGTTTAAATATTTGATGATAAATTAGAAATTATTGAA
ATAGTAAACAACTTCTTTTGAACAAGTTCCCTAGCGTATGACGATAGATG
CTGGAGGTAAGGGAATTTGGTAAGAAGAAGTAAAGTTCCTTTTTCTTCGC
GTTGTATTCAAAAGCTTTTTTTTTAAATTCTGAAACAAGCTCGTTTGTCT
TAGGGAATTCTTTACGTCCAAGCTCAGCCACGATATAGAGTCCATGAGCT
ATACAAGTAATAAGTTTCAATTGAGAGTAGCTTCTTTGGAGGCATTCGTC
GCTTTTTTACAGTAGGAACCTCCTTCGCTGATGAAAACTTCAAACTTATT
TTTATCATAGTCCAAACCAAGAGTTTTTTGAATACTCTGGACGACAAAAT
TTGGAATATTAATAGCATTTTCAACTTTTATGTCTTATCATGTTGATTAG
ATGAGGACGACCCAAGAAACGGCCATCCAGAGGACCCATCAATATAGATG
TCATTGATCGCTTCCGATTGTATTTAGTCTTATCTACAGCTATGAAAATA
TCCTTATCTACAGCTATGAAAATATCCTTATCTCCAATTTCTCCTTAATT
TTGTAGATCACAGTCTTGCTGATAACCTTCATTAATCTATATAGAGTCTA
TGTTCAAAAGAGTTACCCATTCAAAATTTAAGCCTCCTACCCTAAACGGT
GTGAATACCCATAAAGGACAAACCTATATATTATATAATTGGTTGGAAAA
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TGTAATCATCCGATTGAATTCAAGTATGCCCTTTTCTGTTTAACAACTTT
TTGCTAACGTGAATCCAACTTCATAATGCCCTGTTCGTAGAAGCCCTGGT
CCCTATTGGCAAAAAACTAGGACTACCAATTTTTGAAGTCCTCTATTGAA
GTCGAATTTGTGCCCCATGTGTGTTGGCCTTAGACTGGAACAGGTGGTAG
TCACTTTGTGCTTGGTCGGGACTGCAGGGTTGATGCATAAGATCTTCCCA
TCTGAGCTCCTGGAGTTACTGACATGTCATCAAAGATGTGTGCGGCTTGG
CGTTGTCTTGATGAAACACTATTCCTCTCCTATTCACCAGTGCAAGCTGC
TTCTGTTCAGTTGTCAGTTTCAAACGGTCAAGTTGTTCACAGTAGAAGGC
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TGTCGTGCAACACAACCGAAAGAGTATGTATGGACCCTGTATACTTAGCA
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GTATAACATGTCGAATTTCTTCCTTTGTGACCTCTATAATCGACGCACGA
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ATATTAATAAACTGTAGTGCTTCTTGCTAGCTGATACGATATAACTTTCA
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AACAATCAATGCTAAGAACACTAATTAGGAAAAAGAAGCCGAAACATCAA
CATTTGACAACAAAATACTGAGATTTTTTTATTTTTTTTTGTGGGTGGAG
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GACCTCTAACAGTGCTCTTGATGCAAACCATGAACAAAGTATGGTTCCAT
ATATTTTTTTAAATTTATATATGAATAAAACAAGTCAACAAAATTTTGTT
TTGTCTATAATATTTTGAAGTCTATATTCAATTTTAATACTACTCGACAA
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GTTATCGTTTTGATTTTTTGAGTATTTTTATCCTTGTTATAGGTTTGAGC
CAACCTTTGAGTAAGAAAAAAATCAGAAATTTACATTAAAGTTAGTTAAT
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TTTTACGGTTTTTGTTTGAAAAGGAATAACACTTCAGTTTTTAATTGGTT
TTATGCAAAGAGAGTTTATTTTAAATATAAATATTTAAATTACCTTTTTA
AAAAAAATTAGGGTTATGTGAAGAAATGTTTAATATTCTGTGATAATGGG
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TAGGTGTCGACGAATATACCATTTGCTTTGACAATATAGAAGATAAGTCC
CCTACATATCCTCCGTCTTACTCTCGGTTTTTCATGACCACTCTCACACG
AAGTTATTTAATACTTAAACTTTCTCGCTTAAAGAATAAAATAATAACAA
TAACAGCTTAAGAATTTTTTTAAATATAGTTTGATGAGTTAGGGAGTACT
TAAGCTCGTTAATAAACCTTATTTATTTCTCTAAATTTTAAATAAAGTAT
TTATCTTTCCTTTGTCTTTTTAATCTGAGTTGAACTGAACTCCTGCGAGA
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TAAAAAATTAGTAAAGAAAAAGGGTTGGTATCTTTCTTCCTTTTGTTGAT
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ATATGAATTAAAATATAATTACAATCTTTTTCTTCACTAATACTATTTTA
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AATGTCAACTCTAAATATTCATTAAGATAAAATTTGTAGAGCAATTTTTA
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TGTTTATTGACCAATGACTAACTTACGAAGATAAGGATGAGTTGACATCG
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CTTATAAGAATCTTTCCATTTCTCAGCCTTACCTTAGACGTTTGGACGTT
GATTCTTTCAACAACTATTTCCATAAGGTCCCACAACATACTAACTGTTT
TGAATTCTAAAGTTAGCACCCATTTGAATGGTGTCCTGATTTCTTGTTTT
TCGGTTGTGGTAGGAATTTCGCTTTTTTTAATATTTTGTTTCTTCTCTTC
TCCCACTCGACCTTGGTCAATGATTTTGAATTTTCTAAGTTTAATGTTAT
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CTTTTACACGTGCTTCAGTATGCCCATTGCTTTCAGGGAGATAAAGACTT
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ACAGTAAACCATAACTAAATAATATTTTTCCCCGATTTGAAATATATATA
GCAACACCTCTTCAAACGTGCGATTGATTGGTTCATTTTCACTCCATATA
TCTTATTTGGCTTGTGATGACTGATATCGTTGGGATAAGTCACATGAATT
AACTTTTTCTTCTATTTCCTTATCAATCATTTGACCAATACACCGTTTGA
CGAGCTCTTTGTTCGGTTCGTACGATCCCTTGATGACTGTCGTGTAAAGC
ATTTAATATAGACTTACGTAGTCTAATTGGAACAACTATTCTTCTTTCAT
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CGGAAAGGAATATAATAATTTTGGCCATTTTTCTACGATTTAGAAAATAT
TTCTGTCATTTTTTAAGATATTTAAATTTTATAAACGGTAAAGTGAGTAA
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TATTACCTCTGATAACCTACAAAATACTTATTAGTTTAAATTTAATCAAA
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TGTTTTCAATCTTTAATTAATGATTATCTAAACCTCAAATGTTTATTTTA
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TTGCAATCTGATTGAATACACGAATGCAACTGGAAGAACTAACATGAAAA
TAATTTTTTTTAAATTAATTCCGTAATAGTGTTAGCCCTTACTATATACG
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TAATTTTTTTAATGCTGAAATCTATAAAGTTAGGTCGTATGCATAGGACA
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TATTGAAAAAGATAATGTTATTTCAGCAACAGATAGAATAAATGAGAGGA
CAAATTGGATGGATTAACTTTTGATCAGGTTATGTTATAATTCAAAGATC
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TGCAGAGGAAGACATGGTGAAATATGTAAATAAATTCAAAATTAAAGAAT
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AGAATTGATGTTTACTATCCTTTAGCTATATGGATAATTATATTTTATCT
AAATATTATTTTTTATTTGTAAATATTTTTAACAATTAATTAAATATAAG
TATTAAATGTAATAATTGTTTAATTCATATTTATACTTTTCACTACTATT
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TAATATAATGTCTGTTTATTATCATCTTAGATACAATTTTAAGATTTATA
CAATAATTTCCAAGTAACTATTTTTCAATTTGATGTTAGCTACAAAAAAA
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TAGGGGAACACATATTATTTCGAGTATTATGTTGAATTGTGTAGCTGTAA
AAAATATGTAAATCTTGCTAAGGAAATACGAAATCTCCGTCGAAAAAATA
TTGAAAAAATTACTATCACTGTAAACAGAATATAAAGCTATATGTAATCA
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AGCTAGAGGTAGGATGAGTGCATGAGTTAGGAAACCTGTTCAAGGCTTGG
AGTAGGAAGAGGGGTTGAGGTTGATAACGGGTTAAGGTAAGTAGAAAGTT
AGTTGTAGGTAGAAGTGCTTGAAAAGTAATCAATAATTAATGAAGGTTTT
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TCCATATGTCAAAAGAGCTTCTTCAAATATATAATTATAAACAAGTAATT
TTTCAGATGAAATTCGAATGAGTATGTAAATTACCAAAGGTACTTTTGGA
CATTCCCTACAAGAAAGAAAAAGTGATTTGGATAACATGTTACATATTTT
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TATTTAACAACATAGATTTCAAAAAAATCTTTGGAAATTCTCATTATTCC
CATAGACTGATCCTTACGAAAGGCCACTTCTTGGAGATAAAATCCAATCT
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CTTAGATCATAGTTAATATAATAAGTAGGTAAATAACACTTAAAAACTTG
ATAACAATGACGTCAATTGGTGTATCATTTATTTATATAGATATTTGAGA
GAAATGCGAATAAATATTTGAGAAATTCGTTTTAATAAATATCTTAGGCT
ATTAATAAGTTAAATTATATTTAAAAAGTCTTCTCAGGGCCAATTTTAGT
CAGTCTAACTTATTGAACACACTAAGTTATAGGTAATATTATTGAGTACC
TCATCCAATCTCATAAATTTGAACATGAACCCCATAATTGACCAAAGTAA
GTCTATGAACTATTTTGCCTTTAATATATGAATAAAATGGGAATTTCTCA
ATAATTTGACTATACACCAGCGTACTTTGTAGTTGATGAACCATATTTGT
TCTTAAACACTGAGGTATTTTTACCCTAAAAATCTTTCATCAAGTTCTTG
ATTTTTGGATGCTAGAAGTGCTCTTCATTGTAACCATCTATTATCTTAGT
AGCTTTGAGAAAAAAGATGAATGCCTTCTCAAATGTTTTCATTCCCATAG
TGACCATCTACAGAGATATACCCTCTCTTCTCTTTTTATAATTTCGATTT
TAAAAAAAAGTTTTAGTTGAATCATAATTCCAGATGGGAAGAATTGACCC
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AACAAATATGACTTCTATAAAAGAAATGAGCCTTATAGAATCAATACAGA
AGTTGTGTGAGCAAAAAAATGCAAACTTTCTTTTCATAGATTACTCAATA
GAAAGATAGGAATGAGAAAAAATACTTATCTGCGACCTATACATTAGTTG
TAAGAAATGTTAGTAATTTCATGAGGTTTTATGCATATGGAATTTCTATA
AAGAAATTTGGAAAAACGATATCCTCCGAAAGTTAATCAGAAGTGCAGAA
AGCAATCAATCTTTATTTTCTGAAGCAAATACACTGCGCTTTCTTGTTTG
TTCTAATACGGAAGCCCAGACGCTTCCTAGTATATTCACAGAACAACAGA
GTTCTTGAGGACGTTGAGATAGATCTTCTTAGTGAACCTTTGCATTCACT
GGGAGAAGAAGGGTGGTATGAAGTGCCCTCAGTCAAGACAACGCTGAGTA
CCATGATGGATGTGGGTTGCTTACTCTTCTGCTTTGAAACGACTTCGACC
TTGCCATAGGTGATTCATCTGTCGATTTTCAGTTACTATGTCCGTGCAGT
ATCTTTTTTTTTCGTACGAGGAGGAATCTTGAAATGCTCCACGATCTCTG
TGCAGCGATTGCCCTCGGGTAGTGGCAGNGAGGAAGKGAGGAGCAAKTTC
TGTMCAGCCATATTCACCATCATCGTGCTTACAGAGTAATCCTTGGTCAG
CTTTTACATAGGCTTTGTTAGATTCACGGAAATTGACCTTGAAATCAAAA
TTTGTTTGGATTTATCTTTAAGACGCTTATTATTTAAAAAAATAATTTCT
ATTGTTTAATTTTCCTAATTTTTTTTAGATAATTTATATTTTTTCACATA
TAATAACTGACCTTATAATTGATCTAAATTCTCGAAAAGTTTTCAAAATA
TCTAAATTTCAAAAAGATATATATGATTTATTAAGTACAATTAGGCATGC
TTGTTATTATAAAAAGCTGGAACTTAATTTGAAGTTGAGGAATTCAGAGC
ACTCATCCGAAATATTTGAAGCCGTTTGAAATTATATATATTGTCAACAC
TTATTTTTATGTATATTTGTATTTTACGTTGTCAGTTGAAGTAGCCAGTA
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TGAAATGAGGATAAGTTCCTCCAATAAAGATTTCCTAATAATATGTTTCA
TATAAGAGCAGCTTCTTAAACAGAGCAAATCACTTCATTATTAAATTCTA
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